Метаболический статус пигментных эпителиальных клеток сетчатки человека (H-RPE) отражает их здоровье и функцию. Здесь представлен оптимизированный протокол для изучения метаболического потока H-RPE в режиме реального времени с использованием респирометрии высокого разрешения.
Метаболическая дисфункция пигментных эпителиальных клеток сетчатки (РПЭ) является ключевым патогенетическим фактором заболеваний сетчатки, таких как возрастная макулярная дегенерация (ВМД) и пролиферативная витреоретинопатия (ПВР). Поскольку RPE являются высокометаболически активными клетками, изменения в их метаболическом статусе отражают изменения в их здоровье и функциях. Респирометрия высокого разрешения позволяет в режиме реального времени проводить кинетический анализ двух основных биоэнергетических путей, гликолиза и митохондриального окислительного фосфорилирования (OXPHOS), путем количественной оценки скорости внеклеточного подкисления (ECAR) и скорости потребления кислорода (OCR) соответственно. Ниже приведен оптимизированный протокол для проведения респирометрии высокого разрешения на первичных пигментных эпителиальных клетках сетчатки человека (H-RPE). Этот протокол содержит подробное описание этапов создания биоэнергетических профилей РПЭ для определения их базальной и максимальной ОКСФОС и гликолитических способностей. Воздействие H-RPE на различные инъекции лекарств, нацеленных на митохондриальный и гликолитический механизм, приводит к определенным биоэнергетическим профилям, на основе которых можно рассчитать ключевые метаболические параметры. В этом протоколе подчеркивается повышенная реакция BAM15 в качестве разъединяющего агента по сравнению с карбонильным цианидом-трифторметоксифенилгидразоном (FCCP) для индуцирования максимальной дыхательной способности в RPE. Этот протокол может быть использован для изучения биоэнергетического статуса РПЭ при различных состояниях заболевания и проверки эффективности новых препаратов в восстановлении базального метаболического статуса РПЭ.
Пигментные эпителиальные клетки сетчатки (RPE) существуют в виде монослоя пигментированных эпителиальных клеток, стратегически расположенных между фоторецепторами и фенестрированным эндотелием хориокапилляра. RPE обладают высокой метаболической активностью и выполняют множество функций, включая (1) фагоцитоз пролитых фоторецепторных дисков, (2) рециркуляцию зрительного пигмента для поддержания зрительного цикла, (3) транспорт питательных веществ, метаболитов, ионов и воды, (4) поглощение света, (5) защиту от фотоокисления, (6) секрецию основных факторов для поддержания целостности сетчатки и (7) формирование наружного гемато-ретинального барьера1 . Дегенерация РПЭ связана с метаболической дисфункцией и митохондриальными дефектами, что приводит к слепоте глазных заболеваний, таких как возрастная макулярная дегенерация (ВМД) и пролиферативная витреоретинопатия (ПВР)2.
Два ключевых биоэнергетических пути включают гликолиз, который происходит в цитоплазме, и окислительное фосфорилирование (OXPHOS), которое происходит в митохондриях. Во время гликолиза одна молекула глюкозы превращается в две молекулы пирувата и чистое производство двух молекул аденозинтрифосфата (АТФ). В отличие от гликолиза, OXPHOS производит гораздо более высокие уровни АТФ (~ 32-38 молекул АТФ на молекулу глюкозы). Примечательно, что OXPHOS потребляет кислород и требует функциональных митохондрий, тогда как гликолиз происходит в цитоплазме и не требует кислорода.
До внедрения методов на основе флуоресценции или фосфоресценции для изучения митохондриального дыхания уровни кислорода измеряли в пермеабилизированных клеточных суспензиях в камерах, оснащенных кислородным электродомтипа Кларка 3. Хотя электрод Кларка намного дешевле, чем респирометрия на основе флуоресценции, и работает в неадгезивных клетках, он имеет относительно низкую пропускную способность, при этом каждый дыхательный ход длится около 15-20 минут и требует гораздо большего количества клеток для каждого образца3. Таким образом, метод респирометрии на основе флуоресценции в значительной степени заменил электрод Кларка и стал популярным методом в области метаболизма и митохондриальных исследований.
Этот протокол описывает высокопроизводительный метод респирометрии на основе флуоресценции с высоким разрешением, который кинетически измеряет OXPHOS и гликолитические биоэнергетические профили живых клеток. Поскольку процесс OXPHOS потребляет кислород, биоэнергетический профиль для OXPHOS создается путем картирования изменений скорости потребления кислорода (OCR) с течением времени4. В этом методе два флуорофора встроены в гильзу картриджа датчика, которая соединена с волоконно-оптическими пучками, которые излучают свет, возбуждая флуорофоры. Изменения в флуорофорном излучении измеряются высокочувствительными флуоресцентными датчиками и передаются через волоконно-оптический пучок для преобразования в показанияOCR 5. Флуорофор гасится кислородом, что позволяет определять уровень внеклеточного кислорода в анализируемой среде, известный как поток кислорода или OCR. Другой флуорофор представляет собой датчик pH, чувствительный к изменениям оттока протонов, который преобразуется в меру скорости внеклеточного подкисления (ECAR). Во время измерений волоконно-оптические пучки со встроенными флуорофорами опускаются на 200 мкм над монослоем ячейки, создавая переходную микрокамеру, которая обеспечивает быстрые показания в режиме реального времени. Как только обнаруживается 10-процентное изменение уровня кислорода или протонов, датчики поднимаются вверх, позволяя большему объему среды смешиваться с переходной микрокамерной средой, восстанавливая значения OCR и ECAR до исходного уровня. Каждый сенсорный картридж оснащен четырьмя портами, позволяющими последовательно вводить до четырех соединений в лунку во время анализа. Измерения могут быть собраны до и после инъекции соединений в каждый порт, раскрывая ключевую информацию о метаболическом статусе клеток.
Изучение этих двух различных метаболических путей может привести к важным открытиям относительно метаболического статуса RPE после воздействия различных патогенных стимулов и, таким образом, может быть использовано для проверки эффективности лекарств в восстановлении метаболической целостности RPE 6,7,8. Появление высокопроизводительной респирометрии и наличие специфических митохондриальных ингибиторов стимулировали больше исследований в определении биоэнергетических профилей RPE и выявлении дефектов метаболизма и митохондрий во время болезненных состояний 6,7,8,9,10,11,12,13 . Респирометрия высокого разрешения выявила ключевую роль метаболического перепрограммирования RPE при патологиях сетчатки, таких как AMD и PVR. Двумя ключевыми цитокинами, участвующими в патогенезе ВМД и ПВР, являются трансформирующий фактор роста-бета-2 (TGFβ2) и фактор некроза опухоли-альфа (TNFα). Индукция эпителиально-мезенхимального перехода (ЕМТ) TGFβ2 сопровождается митохондриальной дисфункцией, подавлением OXPHOS и компенсаторным увеличением гликолитической емкости в RPE6. Совсем недавно было показано, что провоспалительный цитокин, TNFα, индуцирует значительное повышение регуляции базального OXPHOS и снижение гликолиза в H-RPE7. Введение диметилфумарата значительно подавляло TNFα-индуцированное воспаление в H-RPE и восстанавливало морфологию митохондрий и базальные биоэнергетические профили7. Расходящиеся метаболические профили, индуцированные этими двумя факторами роста, стимулируют интригующие механистические вопросы относительно участия метаболического перепрограммирования в заболеваниях сетчатки. В следующем протоколе описаны этапы оценки OXPHOS и гликолитических биоэнергетических профилей в H-RPE с использованием респирометрии высокого разрешения.
Этот оптимизированный протокол для респирометрии высокого разрешения H-RPE включает использование BAM15 в качестве разъединителя вместо обычно используемого FCCP. В то время как в предыдущих исследованиях по респирометрии РПЭ с высоким разрешением использовался FCCP 9,24, BAM15, по-видимому, индуцирует более надежную индукцию максимальных уровней дыхания в H-RPE по сравнению с FCCP. В то время как FCCP и BAM15 безопасны для использования в клетках, BAM15, как сообщается, имеет меньше побочных эффектов в нормальных клетках по сравнению с FCCP или карбонилцианид-3-хлорфенилгидразоном (CCCP)25. Kenwood et al. показали, что BAM15 деполяризует митохондрии, не влияя на потенциал плазматической мембраны, тем самым индуцируя устойчивую максимальную частоту дыхания митохондрий при низкой цитотоксичности26. FCCP, с другой стороны, деполяризует как митохондрии, так и плазматическую мембрану и проявляет более высокую цитотоксичность26.
В протоколе есть несколько важных шагов, в том числе обеспечение того, чтобы ячейки были должным образом покрыты сливающимся, ровным и однородным монослоем RPE во всех экспериментальных лунках микропланшета. Зрелые RPE сильно зависят от OXPHOS для выработки энергии, и, таким образом, клеткам следует дать созреть в течение не менее 1 месяца, чтобы гарантировать, что RPE генерирует правильные базальные и максимальные показания OCR во время анализа. Дегазация планшета для клеточных культур в течение 1 ч при 37 °C в увлажненной печи (без CO 2) перед помещением его в прибор имеет решающее значение для точных показаний ECAR, поскольку CO2 может влиять на pH анализируемой среды. Важно не забывать увлажнять картридж датчика за день до анализа, чтобы убедиться, что он обеспечивает надежные показания OCR и ECAR в день анализа. Следует позаботиться о том, чтобы надлежащим образом восстановить наркотики, подлежащие инъекционному введению, и аликвотировать восстановленные запасы наркотиков в меньшие объемы для длительного хранения, чтобы свести к минимуму циклы замораживания/оттаивания. Крайне важно приготовить 10-кратные растворы лекарственных средств, которые разбавляются в соответствующих анализирующих средах (например, разбавляются в анализирующих средах стресс-теста Мито для стресс-теста Мито), чтобы учесть разбавление от инъекции лекарственного средства в каждую лунку, заполненную анализирующей средой. С каждой последующей инъекцией лекарственного средства в каждой лунке появляется больше среды, и, таким образом, объемы загружаемого лекарственного средства увеличиваются с каждой инъекцией, и следует следить за объемами, указанными в протоколе. Важно выполнить проверку качества по завершении эксперимента, исследуя сенсорный картридж, чтобы убедиться, что остаточное лекарство не видно, и наблюдая за пластиной для клеточной культуры под микроскопом, чтобы убедиться, что сливающийся и однородный клеточный монослой остается.
Изменения в этом протоколе включают введение различных наркотиков в порты и определение того, как эти наркотики влияют на показания OCR и ECAR. Одной из популярных модификаций является инъекция экспериментального препарата по выбору в качестве порта А перед инъекцией обычных препаратов Mito или гликолитического стресс-теста. Этот тип протокола дает представление о том, как острая инъекция выбранного препарата влияет на последующие параметры OXPHOS и гликолитики. Другие модификации включают изучение различных типов клеток; это требует первоначального устранения неполадок оптимальной плотности посевных ячеек и оптимизации анализируемой среды путем обеспечения того, чтобы базальные показания варьировались от 50-100 пмоль/мин для OCR и 10-20 миль в час / мин для ECAR. Оптимальные концентрации вводимых препаратов необходимо определять для каждого нового исследуемого типа клеток, наблюдая за реакциями OCR и ECAR на серийное разведение лекарств.
Ключевым ограничением протокола является то, что жизнеспособность клеток со временем уменьшается, поскольку клетки не находятся в инкубаторе CO2 в их нормальной питательной среде, и, таким образом, анализ должен быть завершен в течение 3-4 часов, чтобы обеспечить максимальную жизнеспособность клеток. Кроме того, воздействие митохондриальных токсинов, вводимых в каждую лунку, может со временем еще больше снизить жизнеспособность клеток. После завершения анализа клетки должны быть лизированы для оценки содержания белка для нормализации показаний OCR и ECAR, и, таким образом, те же клетки не могут быть собраны для последующих анализов молекулярной биологии.
Альтернативы Seahorse для биоэнергетического профилирования включают Oroboros Oxygraph 2k (O2k)27, BaroFuse28,29 и Resipher (Lucid Scientific)7. Oroboros O2k представляет собой закрытый двухкамерный респирометр, в котором используются полярографические кислородные электроды типа S1 Clark. В то время как Oroboros O2k производит высокочувствительные измерения метаболического потока в режиме реального времени, устройство является трудоемким, поскольку оператор должен вручную вводить каждый препарат30. BaroFuse – это новая многоканальная микрофлюидная перфузионная система, которая использует давление газа для проведения нескольких параллельных экспериментов по перфузии и связана с системой обнаружения кислорода для измерения OCR. Преимущество этой системы потокового культивирования заключается в том, что функция и жизнеспособность тканей сохраняются, в отличие от Seahorse, где жизнеспособность клеток уменьшается при более длительных анализах. Resipher использует высокочувствительные оптические датчики кислорода для измерения OCR, когда клетки находятся в 96-луночной пластине в инкубаторе, что позволяет проводить непрерывные измерения OCR в течение нескольких недель или месяцев. Примечательно, что эти приборы не измеряют ECAR, и, таким образом, Seahorse имеет преимущество одновременного исследования как OXPHOS, так и гликолиза.
Изучение биоэнергетических профилей OXPHOS и гликолиза в режиме реального времени становится ключевым фактором в характеристике здоровья и функции RPE. Респирометрия высокого разрешения позволяет эффективно сравнивать метаболический статус нормального и больного РПЭ, тем самым открывая новые возможности скрининга эффективности лекарств при заболеваниях сетчатки, таких как ВМД и ПВР. Будущие направления респирометрии высокого разрешения на РПЭ включают оптимизацию протокола для изучения биоэнергетических профилей высокополяризованных монослоев РПЭ, выращенных на поперечных фильтрах. Calton et al. (2016) успешно достигли этого, разрезав треугольный участок поляризованного монослоя RPE, выращенного на поперечных фильтрах31. Дальнейшее расширение методики включает изучение биоэнергетических профилей индуцированного плюрипотентного РПЭ, полученного из стволовых клеток (iPSC-RPE), выделенного у пациентов с различными дегенеративными заболеваниями сетчатки32. Изучение того, как патогенные цитокины, участвующие в ВМД и PVR, влияют на динамический характер метаболизма RPE, может выявить метаболические уязвимости, которые могут помочь в идентификации новых лекарственных мишеней.
The authors have nothing to disclose.
Это исследование было частично поддержано грантами: Fight for Sight Leonard & Robert Weintraub Postdoctoral Fellowship (D.Y.S.); Программа постдокторских стипендий BrightFocus Foundation в области исследований дегенерации желтого пятна (M2021010F, D.Y.S.); Министерство обороны, Программа исследований спинального зрения под номером VR180132 (M.S.-G. и L.A.K.); Национальный глазной институт Национальных институтов здравоохранения под номером R01EY027739 (L.A.K.). Выражаем благодарность донорам программы BrightFocus Foundation «Исследование макулярной дегенерации M2021010F» за поддержку этого исследования. Схемы были созданы с помощью Biorender.com
2-Deoxy-D-glucose | Sigma | D8375-5G | Reconstituted in the Glycolytic Assay Media from its powder form and used in the Glycolytic Stress Test (Port C injection) |
96 Well Non-Treated Plate, 5/Pack, Sterile | VWR | 229597 | BCA Assay 96-well plate |
Antimycin A from Streptomyces sp. | Sigma | A8674-25MG | Inhibitor of Complex III of the electron transport chain (part of the Port C drug injection together with rotenone) |
BAM15 | Sigma | SML1760-5MG | Uncoupling agent used for the Mito Stress Test (Port B injection) |
BCA Assay | ThermoFisher | 23225 | To determine total protein content in each well |
Calibrant Solution | Seahorse Bioscience | 100840-000 | Solution used to calibrate the probes of the sensor cartridge |
Cell Lysis buffer 10x | Cell Signaling Technologies | 9803S | Dilute 10x Cell Lysis Buffer to a 1x solution using deionized water and add 1 mM PMSF before use |
D-(+)-Glucose solution | Sigma | G8644-100ML | Supplement to be added to the Mito Stress Test assay media and also used in the Glycolytic Stress Test (Port A injection) |
DMSO, Cell culture grade | Sigma-aldrich | D4540-100ML | For reconstituting all mitochondrial drugs except for 2DG |
FCCP | Sigma | C2920-10MG | Uncoupling agent used for the Mito Stress Test (Port B injection) |
GlutaMAX | Gibco | 35050061 | Supplement to be added to the assay media for both the Mito and Glycolytic Stress Tests |
HEPES solution | Sigma | H0887-100ML | Supplement to be added to the assay media for both the Mito and Glycolytic Stress Tests |
H-RPE – Human Retinal Pigment Epithelial Cells | Lonza | 194987 | Primary human fetal RPE cells |
Oligomycin – CAS 1404-19-9 – Calbiochem | Sigma | 495455-10MG | ATP synthase inhibitor used for the Mito Stress Test (Port A injection) and Glycolytic Stress Test (Port B injection) |
Parafilm | Bemis | PM996 | To seal the plate once the cells are lysed to prevent evaporation in the freezer |
Phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF) Protease Inhibitor | Gold Biotechnology Inc | 50-153-2823 | Used at 1 mM for the 1x Cell Lysis Buffer solution |
ReagentPack Subculture Reagents, 100 mL | Lonza | CC-5034 | Passaging reagents for primary human fetal RPE cells. Each kit contains 100 mL Trypsin/EDTA, Trypsin Neutralizing Solution, HEPES Buffered Saline |
Rotenone | Sigma | R8875-1G | Inhibitor of Complex I of the electron transport chain (part of the Port C drug injection together with antimycin A) |
RtEGM Retinal Pigment Epithelial Cell Growth Medium BulletKit – RtEBMTM Basal Medium (00195406) and RtEGMTM SingleQuots Supplements (00195407) | Lonza | 195409 | Media for primary human fetal RPE cells |
Seahorse XFe96 Analyzer | Agilent | High-Resolution Respirometry Instrument | |
Seahorse XFe96 FluxPak | Agilent | 102416-100 | This contains the 96-well Seahorse Cell Culture Microplate, the sensor cartridge and the calibrant solution |
Sodium pyruvate solution | Sigma | S8636-100ML | Supplement to be added to the Mito Stress Test assay media |
Steriflip-GP Sterile Centrifuge Tube Top Filter Unit, 50 mL process volume, 0.22 µm pore size | Millipore-Sigma | SCGP00525 | Tube top filter unit for sterile filtration of the assay media |
Synergy H1 Plate Reader | BioTek | Plate Reader for measuring absorbance at 562 nm for the BCA assay | |
XF base medium without phenol red | Agilent | 103335-100 | Base media for running the Seahorse assay |