Mapping Alzheimer's Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Nana Matoba; Ivana Y. Quiroga; Douglas  H. Phanstiel; Hyejung Won

doi:10.3791/60428

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Mapeo de variantes de la enfermedad de Alzheimer a sus genes objetivo mediante el análisis computacional de la configuración de la cromatina

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

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Mapeo de variantes de la enfermedad de Alzheimer a sus genes objetivo mediante el análisis computacional de la configuración de la cromatina

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04:41 min

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January 09, 2020

DOI:

10.3791/60428-v

DOI:

10.3791/60428-v

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04:41 min

January 09, 2020

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Nana Matoba^1,2, Ivana Y. Quiroga³, Douglas H. Phanstiel*^3,4, Hyejung Won*^1,2

¹Department of Genetics,University of North Carolina, ²Neuroscience Center,University of North Carolina, ³Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, ⁴Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Summary

Presentamos un protocolo para identificar las implicaciones funcionales de las variantes no codificacionales identificadas por los estudios de asociación del genoma (GWAS) utilizando interacciones tridimensionales de cromatina.

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Alzheimer’s Disease GWAS Chromatin Configuration Computational Analysis Target Genes SNPs Hi-C Gene Expression Cell-type Expression Gene Annotation Enrichment

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