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Mapeamento variantes da doença de Alzheimer para seus genes-alvo usando análise computacional da configuração de cromatina
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Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Mapeamento variantes da doença de Alzheimer para seus genes-alvo usando análise computacional da configuração de cromatina

português

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04:41 min

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January 09, 2020

DOI:

10.3791/60428-v

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January 09, 2020

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1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Summary

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Apresentamos um protocolo para identificar implicações funcionais de variantes não codificadoras identificadas por estudos de associação em todo o genoma (GWAS) usando interações tridimensionais de cromatina.

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Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

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Matoba, N., Quiroga, I. Y., Phanstiel, D. H., Won, H. Mapping Alzheimer's Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration. J. Vis. Exp. (155), e60428, doi:10.3791/60428 (2020).

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