Mapping Alzheimer's Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Nana Matoba; Ivana Y. Quiroga; Douglas  H. Phanstiel; Hyejung Won

doi:10.3791/60428

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Cartographier les variantes de la maladie d'Alzheimer à leurs gènes cibles à l'aide de l'analyse computationnelle de la configuration de la chromatine

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

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Cartographier les variantes de la maladie d'Alzheimer à leurs gènes cibles à l'aide de l'analyse computationnelle de la configuration de la chromatine

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04:41 min

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January 09, 2020

DOI:

10.3791/60428-v

DOI:

10.3791/60428-v

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04:41 min

January 09, 2020

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3 Views

Nana Matoba^1,2, Ivana Y. Quiroga³, Douglas H. Phanstiel*^3,4, Hyejung Won*^1,2

¹Department of Genetics,University of North Carolina, ²Neuroscience Center,University of North Carolina, ³Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, ⁴Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Summary

Nous présentons un protocole pour identifier les implications fonctionnelles des variantes non codantes identifiées par des études d'association à l'échelle du génome (GWAS) utilisant des interactions tridimensionnelles de chromatine.

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Alzheimer’s Disease GWAS Chromatin Configuration Computational Analysis Target Genes SNPs Hi-C Gene Expression Cell-type Expression Gene Annotation Enrichment

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