Summary

Kwantificering van het niveau van 8-oxo-dG met behulp van ELISA-assay om oxidatieve DNA-schade in MCF-7-cellen te evalueren

Published: May 24, 2024
doi:

Summary

Dit protocol beschrijft een efficiënte methode voor het kwantitatief detecteren van DNA-oxidatieve schade in MCF-7-cellen door middel van ELISA-technologie.

Abstract

8-Oxo-7,8-dihydro-2′-deoxyguanosine (8-oxo-dG) base is de overheersende vorm van vaak waargenomen DNA-oxidatieve schade. DNA-stoornissen hebben een grote invloed op de genexpressie en dienen als een cruciale factor bij het stimuleren van neurodegeneratieve aandoeningen, kanker en veroudering. Daarom is nauwkeurige kwantificering van 8-oxoG van klinisch belang bij het onderzoek naar methodologieën voor het opsporen van DNA-schade. Op dit moment vormen de bestaande benaderingen voor 8-oxoG-detectie echter uitdagingen op het gebied van gemak, doelmatigheid, betaalbaarheid en verhoogde gevoeligheid. We gebruikten de sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) -techniek, een zeer efficiënte en snelle colorimetrische methode, om variaties in het 8-oxo-dG-gehalte te detecteren in MCF-7-celmonsters die werden gestimuleerd met verschillende concentraties waterstofperoxide (H2O2). We bepaalden de concentratie van H2O2 die oxidatieve schade veroorzaakte in MCF-7-cellen door de IC50-waarde in MCF-7-cellen te detecteren. Vervolgens behandelden we MCF-7-cellen met 0, 0,25 en 0,75 mM H2O2 gedurende 12 uur en haalden we 8-oxo-dG uit de cellen. Ten slotte werden de monsters onderworpen aan ELISA. Na een reeks stappen, waaronder plaatspreiding, wassen, incubatie, kleurontwikkeling, beëindiging van de reactie en gegevensverzameling, hebben we met succes veranderingen gedetecteerd in het 8-oxo-dG-gehalte in MCF-7-cellen geïnduceerd door H2O2. Door middel van dergelijke inspanningen willen we een methode ontwikkelen om de mate van oxidatieve DNA-schade in celmonsters te evalueren en daarmee de ontwikkeling van meer geschikte en gemakkelijke benaderingen voor het opsporen van DNA-schade te bevorderen. Dit streven is klaar om een zinvolle bijdrage te leveren aan de verkenning van associatieve analyses tussen oxidatieve DNA-schade en verschillende domeinen, waaronder klinisch onderzoek naar ziekten en de detectie van giftige stoffen.

Introduction

DNA-oxidatieve schade is een gevolg van een onbalans tussen de aanmaak van reactieve zuurstofsoorten (ROS) en het cellulaireantioxidantafweersysteem. Het gaat voornamelijk om de oxidatie van DNA, purine en pyrimidinebasen 2,3. Deze oxidatieve modificatie van DNA-basen brengt niet alleen de integriteit van het genoom in gevaar, maar omvat ook een breed scala aan pathologische problemen, waaronder kanker, neurodegeneratieve ziekten en hart- en vaatziekten 4,5. De guaninebase in DNA heeft het laagste reductiepotentieel en is het meest vatbaar voor oxidatie6. Daarom dient 8-oxo-7,8-dihydro-2′-deoxyguanosine (8-oxo-dG) als een primaire marker voor het beoordelen van de mate van DNA-oxidatieve schade 7,8. De nauwkeurige kwantificering van 8-oxo-dG is een cruciaal punt geworden bij het aanpakken van verschillende aspecten van het optreden en de progressie van de ziekte en de beoordeling van multifactoriële oxidatieve belasting.

De traditionele methoden voor het detecteren van 8-oxo-dG, zoals hoogwaardige vloeistofchromatografie met elektrochemische detectie (HPLC-ECD), massaspectrometrie en gerelateerde technieken met koppeltekens, vertonen een hoge gevoeligheid en specificiteit 10,11,12. Deze technieken hebben echter vaak complexe operationele vereisten en hoge kosten, die hun wijdverbreide toepasbaarheid en bruikbaarheid bij monsteranalyse met hoge doorvoer belemmeren. Met de voortdurende vooruitgang van wetenschap en technologie is er een verscheidenheid aan nieuwe, efficiënte en nauwkeurige methoden ontstaan. De toepassing van deze nieuwe technologieën stelt ons in staat om het niveau van 8-oxo-dG nauwkeuriger te kwantificeren en biedt krachtigere instrumenten voor een diepgaande studie van het verband tussen oxidatieve stress en ziekte. Onderzoekers hebben bijvoorbeeld nanoporietechnologie toegepast om DNA13 kwantitatief te detecteren en te sequensen, DNA-schadetypes te identificeren met behulp van een single-click code-sequencing-strategie14, high-throughput sequencing-methoden te ontwikkelen en 8-oxoG-gebaseerde biosensoren te creëren door biotine-streptavidine te integreren met ELISA15. Onder hen is ELISA, met zijn erkende voordelen op het gebied van specificiteit, high-throughput screening en kosten, een van de ideale oplossingen voor 8-oxo-dG-detectie. Daarom is het van cruciaal belang om een hoge-doorvoer, zeer gevoelige, gemakkelijke en snelle methode te ontwikkelen voor het detecteren van 8-oxo-dG.

De ELISA-techniek (Enzyme-linked immunosorbent assay), ontwikkeld in 197116, heeft zich de afgelopen 50 jaar snel ontwikkeld en is nu een van de meest gebruikte detectiemethoden op het gebied van biologie en geneeskunde geworden 17,18,19. ELISA-technologie vertoont een hoge gevoeligheid en specificiteit, heeft een korte reactietijd en is gemakkelijk te gebruiken, waardoor het een algemeen erkende keuze is voor grootschalige monstertests en high-throughput-analyse20. Als gevolg hiervan is ELISA op grote schaal gebruikt voor kwantitatieve of semikwantitatieve analyse van verbindingen, eiwitten, antilichamen of moleculen in cellen 21,22,23. Het is bijvoorbeeld gebruikt bij de detectie van biomarkers die verband houden met verschillende ziekten, medicijnresten en biomoleculen24. ELISA’s kunnen worden onderverdeeld in vier hoofdtypen op basis van experimenteel ontwerp en principes25. Deze methoden omvatten directe ELISA, indirecte ELISA, sandwich ELISAen competitieve ELISA 26,27. Hiervan werd sandwich ELISA, die twee specifieke antilichamen gebruikt, één voor het vangen van het doelmolecuul en de andere voor detectie, gekozen voor de studie in dit artikel. Het experimentele principe van sandwich ELISA is als volgt: eerst wordt een specifiek antilichaam geïmmobiliseerd in de putjes van een microplaat om de betreffende analyt vast te leggen. Nadat de standaard of het monster is toegevoegd, bindt de doelanalyt zich aan het geïmmobiliseerde antilichaam. Vervolgens wordt een gelabeld antilichaam toegevoegd dat een ander epitoop op het antigeen herkent, waardoor een sandwichstructuur wordt gevormd. Na verwijdering van ongebonden antilichamen wordt een substraat toegevoegd. Onder de katalytische werking van het secundaire antilichaam vindt een kleurreactie plaats en is de intensiteit van de kleur positief gecorreleerd met de concentratie van de doelanalyt in het monster. Ten slotte werd de optische dichtheid (OD) gemeten om de concentratie van het monster te bepalen. Sandwich ELISA heeft de voordelen van een verhoogde gevoeligheid en specificiteit voor doelmonsters, waardoor het geschikt is voor het detecteren van lage concentraties doelanalyten en complexe monsters28. Bovendien kunnen de verkregen resultaten worden gekwantificeerd voor verdere analyse. Deze factoren maken sandwich ELISA tot een veelgebruikte detectiemethode in zowel wetenschappelijk onderzoek als klinische laboratoria29.

Deze studie was gericht op het kwantitatief detecteren van 8-oxo-dG in MCF-7-cellen om de mate van DNA-oxidatieve schade in de cellen te bepalen. Deze studie bestaat uit twee hoofdonderdelen: het construeren van een MCF-7-cel DNA-oxidatief schademodel en het detecteren van 8-oxo-dG met behulp van ELISA. Eerst werden MCF-7-cellen in vitro gekweekt en behandeld met verschillende concentraties H2O2 voor verschillende duur. De levensvatbaarheid van de cellen werd geëvalueerd met behulp van een CCK-8-test om de halfmaximale remmende concentratie (IC50) van H2O2 in MCF-7-cellen te bepalen. Op basis van de IC50-waarden is een geschikte H2O2 behandeltijd en inductieconcentratie gekozen. Om monsters van MCF-7-cellen te extraheren die door oxidatie waren beschadigd, werden celmonsters en supernatanten verkregen en toegevoegd aan enzymgekoppelde putten die eerder waren gecoat met 8-oxo-dG-antilichamen. De 8-oxo-dG die in het monster aanwezig is, zal zich binden aan de antilichamen die aan de vastefasedrager zijn gebonden. Vervolgens werden 8-oxo-dG-antilichamen gelabeld met mierikswortelperoxidase toegevoegd. Het reactiemengsel werd bij een constante temperatuur geïncubeerd om een volledige binding van het monster en het antilichaam te garanderen. Het ongebonden enzym werd verwijderd door te wassen en vervolgens werd het colorimetrische substraat toegevoegd, wat een blauwe kleur opleverde. Onder invloed van zuur werd de oplossing geel. Ten slotte werd de OD-waarde van de monsters van de reactieputjes gemeten bij 450 nm en was de concentratie van 8-oxo-dG in het monster evenredig met de OD-waarde. Door een standaardcurve te genereren, kan de concentratie van 8-oxo-dG in het monster worden berekend.

Protocol

1. Constructie van een H2O2 -geïnduceerd DNA oxidatief schademodel in MCF-7 cellen Herstel van MCF-7-cellenBreng de cryogene buis van de celcultuur, die 3,5 x 106 MCF-7-cellen bevat en wordt bewaard in een koelkast van -80 °C, snel over in een schuimdoos met vloeibare stikstof. Pak de buis met een tang op en plaats deze ongeveer 1 minuut in een waterbad van 37 °C met constante temperatuur om de geconserveerde cellen te ontdooien.O…

Representative Results

Zoals geïllustreerd in figuur 3, geeft de X-as de concentratie van H2O2 aan die wordt toegepast op MCF-7-cellen, terwijl de Y-as de levensvatbaarheid van de cel aangeeft. Behandeling met 0,75 mM gedurende 12 uur verminderde de levensvatbaarheid van MCF-7-cellen tot 67%. Gelijktijdig met de toename van de concentratie was er een significante afname van de levensvatbaarheid van MCF-7-cellen, met name bij een concentratie van 1,5 mM, waar de levensvatbaarheid afnam tot mi…

Discussion

De ontwikkeling van ELISA-methoden is van groot belang voor zowel bestaande als nieuwe methoden voor het opsporen van DNA-schade. In vergelijking met traditionele HPLC- en massaspectrometrietechnieken is deze aanpak niet alleen gebruiksvriendelijk, maar vertoont het ook een hoge gevoeligheid en voldoet het aan de eisen van high-throughput screening30. Dit maakt het mogelijk om 8-oxo-dG te monitoren in grootschalige ziektescreeningsstudies, waardoor een beter begrip van de correlatie tussen deze bi…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dit werk werd ondersteund door het Jiangsu Higher Education Institution Innovative Research Team for Science and Technology (2021), het programma van het Jiangsu Vocational College Engineering Technology Research Center (2023), het Key Technology Programme van Suzhou People’s Livelihood Technology Projects (SKY2021029), het open project van de Jiangsu Biobank of Clinical Resources (TC2021B009), het project van het State Key Laboratory of Radiation Medicine and Protection, Soochow University (GZK12023013), programma’s van het Suzhou Vocational Health College (SZWZYTD202201) en Qing-Lan-project in de provincie Jiangsu in China (2021, 2022).

Materials

0.25% Trypsin-EDTA(1x) Gibco 25200-072
Cell Counting Kit-8 Dojindo CK04
Cell Counting Plate QiuJing XB-K-25
CO2 incubator Thermo 51032872
DMEM basic(1X) Gibco C11995500BT
FBS PAN ST30-3302
GraphPad Prism X9 GraphPad Software statistical analysis software
H2O2(3%) Jiangxi Caoshanhu Disinfection Co.,Ltd. 1028348
high-speed centrifuge Thermo  9AQ2861
Human 8-oxo-dG ELISA Kit Zcibio ZC-55410
L-1000XLS+ Pipettes Rainin 17014382
L-20XLS+ Pipettes Rainin 17014392
liquid nitrogen tank Mvecryoge YDS-175-216
MCF-7 CELL BNCC BNCC100137
Multiskan FC microplate photometer Thermo 1410101
PBS Solarbio P1020
Penicillin-Streptomycin Solution, 100X Beyotime C0222
Trinocular live cell microscope Motic 1.1001E+12
Ultra-low temperature freezer Haire V118574

References

  1. Cooke, M. S., Evans, M. D., Dizdaroglu, M., Lunec, J. Oxidative DNA damage: Mechanisms, mutation, and disease. Faseb J. 17 (10), 1195-1214 (2003).
  2. Dizdaroglu, M., Jaruga, P. Mechanisms of free radical-induced damage to DNA. Free Radic Res. 46 (4), 382-419 (2012).
  3. Cadet, J., Davies, K. J. A., Medeiros, M. H., Di Mascio, P., Wagner, J. R. Formation and repair of oxidatively generated damage in cellular DNA. Free Radic Biol Med. 107, 13-34 (2017).
  4. Jackson, S. P., Bartek, J. The DNA-damage response in human biology and disease. Nature. 461 (7267), 1071-1078 (2009).
  5. Jaruga, P., Dizdaroglu, M. Repair of products of oxidative DNA base damage in human cells. Nucleic Acids Res. 24 (8), 1389-1394 (1996).
  6. Fleming, A. M., Burrows, C. J. Chemistry of ROS-mediated oxidation to the guanine base in DNA and its biological consequences. Int J Radiat Biol. 98 (3), 452-460 (2022).
  7. Delaney, S., Jarem, D. A., Volle, C. B., Yennie, C. J. Chemical and biological consequences of oxidatively damaged guanine in DNA. Free Radic Res. 46 (4), 420-441 (2012).
  8. Wang, B., et al. Cross-sectional and longitudinal associations of acrolein exposure with pulmonary function alteration: Assessing the potential roles of oxidative DNA damage, inflammation, and pulmonary epithelium injury in a general adult population. Environ Int. 167, 107401 (2022).
  9. Chiorcea-Paquim, A. M. 8-oxoguanine and 8-oxodeoxyguanosine biomarkers of oxidative DNA damage: A review on HPLC-ECD determination. Molecules. 27 (5), (2022).
  10. He, L., Liu, X. L., Zhang, J. J. Simultaneous quantification of urinary 6-sulfatoxymelatonin and 8-hydroxy-2′-deoxyguanosine using liquid chromatography-tandem mass spectrometry. J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 1095, 119-126 (2018).
  11. Lam, P. M., et al. Rapid measurement of 8-oxo-7,8-dihydro-2′-deoxyguanosine in human biological matrices using ultra-high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Free Radic Biol Med. 52 (10), 2057-2063 (2012).
  12. Machella, N., Regoli, F., Santella, R. M. Immunofluorescent detection of 8-oxo-DG and pah bulky adducts in fish liver and mussel digestive gland. Aquat Toxicol. 71 (4), 335-343 (2005).
  13. An, N., Fleming, A. M., White, H. S., Burrows, C. J. Nanopore detection of 8-oxoguanine in the human telomere repeat sequence. ACS Nano. 9 (4), 4296-4307 (2015).
  14. Xiao, S., Fleming, A. M., Burrows, C. J. Sequencing for oxidative DNA damage at single-nucleotide resolution with click-code-seq v2.0. Chem Commun (Camb). 59 (58), 8997-9000 (2023).
  15. Kong, W., Ji, Y., Zhu, X., Dai, X., You, C. Development and application of a chemical labeling-based biosensing assay for rapid detection of 8-oxoguanine and its repair in vitro and in human cells. Chinese J Chem. 40 (19), 2329-2334 (2022).
  16. Engvall, E., Perlmann, P. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Quantitative assay of immunoglobulin g. Immunochemistry. 8 (9), 871-874 (1971).
  17. Boguszewska, K., Szewczuk, M., Urbaniak, S., Karwowski, B. T. Review: Immunoassays in DNA damage and instability detection. Cell Mol Life Sci. 76 (23), 4689-4704 (2019).
  18. Gan, S. D., Patel, K. R. Enzyme immunoassay and enzyme-linked immunosorbent assay. J Invest Dermatol. 133 (9), e12 (2013).
  19. Ahirwar, R., Bhattacharya, A., Kumar, S. Unveiling the underpinnings of various non-conventional ELISA variants: A review article. Expert Rev Mol Diagn. 22 (7), 761-774 (2022).
  20. Li, D., et al. Magnetic nanochains-based dynamic elisa for rapid and ultrasensitive detection of acute myocardial infarction biomarkers. Anal Chim Acta. 1166, 338567 (2021).
  21. Tabatabaei, M. S., Islam, R., Ahmed, M. Applications of gold nanoparticles in ELISA, PCR, and immuno-pcr assays: A review. Anal Chim Acta. 1143, 250-266 (2021).
  22. Berlina, A. N., Zherdev, A. V., Dzantiev, B. B. ELISA and lateral flow immunoassay for the detection of food colorants: State of the art. Crit Rev Anal Chem. 49 (3), 209-223 (2019).
  23. Amber, K. T., Bloom, R., Hertl, M. A systematic review with pooled analysis of clinical presentation and immunodiagnostic testing in mucous membrane pemphigoid: Association of anti-laminin-332 IGG with oropharyngeal involvement and the usefulness of ELISA. J Eur Acad Dermatol Venereol. 30 (1), 72-77 (2016).
  24. Gervay, J., Mcreynolds, K. D. Utilization of elisa technology to measure biological activities of carbohydrates relevant in disease status. Curr Med Chem. 6 (2), 129-153 (1999).
  25. Tabatabaei, M. S., Ahmed, M. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Methods Mol Biol. 2508, 115-134 (2022).
  26. Aydin, S. A short history, principles, and types of ELISA, and our laboratory experience with peptide/protein analyses using ELISA. Peptides. 72, 4-15 (2015).
  27. Hayrapetyan, H., Tran, T., Tellez-Corrales, E., Madiraju, C. Enzyme-linked immunosorbent assay: Types and applications. Methods Mol Biol. 2612, 1-17 (2023).
  28. Eldahshoury, M. K., Hurley, I. P. Direct sandwich ELISA to detect the adulteration of human breast milk by cow milk. J Dairy Sci. 106 (9), 5908-5915 (2023).
  29. Tsumuraya, T., Hirama, M. Rationally designed synthetic haptens to generate anti-ciguatoxin monoclonal antibodies, and development of a practical sandwich ELISA to detect ciguatoxins. Toxins (Basel). 11 (9), 533 (2019).
  30. Ito, E., Iha, K., Yoshimura, T., Nakaishi, K., Watabe, S. Early diagnosis with ultrasensitive elisa). Adv Clin Chem. 101, 121-133 (2021).
  31. Larsson, P., Parris, T. Z. Optimization of cell viability assays for drug sensitivity screens. Methods Mol Biol. 2644, 287-302 (2023).
  32. Gunawardana, C. G., Diamandis, E. P. High throughput proteomic strategies for identifying tumour-associated antigens. Cancer Lett. 249 (1), 110-119 (2007).
  33. Zhang, S., et al. Development of a das-ELISA for gyrovirus homsa1 prevalence survey in chickens and wild birds in China. Vet Sci. 10 (5), 312 (2023).
  34. Li, Y., Sun, J., Shang, H. Effect of hogg1 expression level on oxidative DNA damage among workers exposed to nickel in stainless steel production environment. Zhonghua Lao Dong Wei Sheng Zhi Ye Bing Za Zhi. 32 (8), 578-581 (2014).

Play Video

Cite This Article
Nian, L., Li, X., Du, J., Liu, S. Quantifying the Level of 8-oxo-dG Using ELISA Assay to Evaluate Oxidative DNA Damage in MCF-7 Cells. J. Vis. Exp. (207), e66888, doi:10.3791/66888 (2024).

View Video