В этой статье описываются протоколы построения и эксплуатации стадии охлаждения для массовой иммобилизации C. elegans на их исходных пластинах для выращивания.
Подходы к микроскопии in vivo с высоким разрешением могут выявить тонкую информацию и мелкие детали внутри модельного животного Caenorhabditis elegans (C. elegans), но требуют сильной иммобилизации животных для предотвращения размытия изображения при движении. К сожалению, большинство современных методов иммобилизации требуют значительных ручных усилий, что делает визуализацию с высоким разрешением низкопроизводительной. Иммобилизация C. elegans значительно упрощается за счет использования подхода к охлаждению, который может легко обездвижить целые популяции непосредственно на их культивационных пластинах. Ступень охлаждения может устанавливать и поддерживать широкий диапазон температур с равномерным распределением на культивационной пластине. В этой статье задокументирован весь процесс построения ступени охлаждения. Цель состоит в том, чтобы типичный исследователь мог без труда построить операционную ступень охлаждения в своей лаборатории, следуя этому протоколу. Показано использование ступени охлаждения по трем протоколам, и каждый протокол имеет преимущества для разных экспериментов. Также показан пример профиля охлаждения ступени по мере приближения к конечной температуре и несколько полезных советов по использованию охлаждающей иммобилизации.
Оптическая микроскопия высокого разрешения является незаменимым инструментом для изучения in vivo биологических структур на субклеточном уровне. Многие биологические исследования требуют визуализации с субмикронным разрешением для определения тонких анатомических деталей, включая морфологию нейронов1,2, структуру мембраны3,4 и локализацию белка 5,6. Изображение с высоким разрешением требует времени экспозиции от нескольких миллисекунд до секунд, в зависимости от способа визуализации и зонда 7,8. Для достижения оптимальных результатов важно тщательно планировать и проводить эксперименты на основе микроскопии. Решающее значение для этих усилий имеет эффективный метод подготовки животных, который облегчает визуализацию с высоким разрешением.
Нематода C. elegans является широко используемым модельным организмом для изучения многих биологических процессов9. Это маленькое животное обычно культивируется на агаровых пластинах нематодной питательной среды (NGM), и они быстро размножаются путем самооплодотворения, что делает их хорошо подходящими для крупномасштабных исследований. Их прозрачность и широкий спектр методов маркировки позволяют легко визуализировать их внутреннюю анатомию10,11. Тонкие структуры у C. elegans идеально подходят для изучения биологических процессов на субклеточном уровне, таких как регенерациянейронов 12, дегенерация нейронов13 и делениеклеток 14. Такие исследования требуют визуализации с субмикронным разрешением и иммобилизации животных, достаточно сильной, чтобы предотвратить размытие изображения. Сильная иммобилизация особенно важна для методов, включающих несколько изображений в пространстве или времени, таких как стеки 3D-изображений (т. е. z-стеки) и покадровая съемка. Любое движение животного между экспозициями может затмить результат. Для C. elegans сильная иммобилизация обычно включает ручные манипуляции с отдельными животными и установку их на предметные стекла с помощью анестетика15,16. Эти трудоемкие и трудоемкие процедуры очень затрудняют проведение крупномасштабных экспериментов. Стратегия иммобилизации, при которой животные непосредственно и обратимо иммобилизуются на своих первоначальных культивационных пластинах, может обеспечить высокопроизводительную визуализацию с высоким разрешением.
Охлаждающая иммобилизация C. elegans была показана в нескольких исследованиях, но широко не используется. Обычно его комбинируют с микрофлюидным устройством для дальнейшего сдерживания животных17,18,19. Однако микрофлюидные устройства сложны, требуют значительной оперативной подготовки и не могут быть легко интегрированы с типичными рабочими процессами твердого культивирования в экспериментах C. elegans. Таким образом, микрофлюидика не получила широкого распространения для иммобилизации C. elegans. Здесь, в связи с недавней публикацией20 Лаборатории Чунга, представлено введение нового подхода к иммобилизации охлаждения с использованием термоэлектрической ступени охлаждения (рис. 1) для устранения этих недостатков. На стадии охлаждения типичная 60-миллиметровая пластина для выращивания полистирола может быть охлаждена до любой целевой температуры (установленной T) от -8 °C до комнатной температуры. Такой подход на стадии охлаждения может легко и обратимо обездвижить всю популяцию животных с минимальными усилиями пользователя, устраняя 98% времени обработки животных20.
Ниже описаны процедуры построения ступени охлаждения с нуля. Ожидается, что за исключением обработки деталей и 3D-печати, вся процедура займет 4 часа без использования специальных инструментов или опыта. Затем далее описываются три различные стратегии охлаждения с различной скоростью охлаждения и усилиями пользователя по иммобилизации C. elegans на типичном вертикальном микроскопе. Предпочтительная стратегия может зависеть от пользовательского приложения. Подробно описаны протоколы для этих трех стратегий охлаждающей иммобилизации.
Стадия охлаждения, изготовление, сборка и использование показаны в этой рукописи. Большинство компонентов являются готовыми товарами, которые можно приобрести в Интернете. Некоторые компоненты, такие как медная пластина и сапфировое окно, требуют индивидуального заказа и могут занять до 1 месяца. Другие компоненты, которые могут быть напечатаны на 3D-принтере, легко изготавливаются в большинстве научно-исследовательских институтов (дополнительная таблица 1). Процесс сборки требует всего нескольких инструментов и может быть быстро выполнен неспециалистом за несколько часов. Таким образом, большинство биологических лабораторий должны быть в состоянии легко внедрить это устройство.
Стадия охлаждения и подход к охлаждающей иммобилизации обладают несколькими значительными улучшениями по сравнению с существующими методами иммобилизации, подробно описанными в оригинальной публикации20. Короче говоря, стадия охлаждения обеспечивает сильную иммобилизацию больших популяций C. elegans всех возрастов, включая эмбрионы и дауэры, на их типичных культуральных планшетах при стандартных рабочих процессах микроскопии. Это устраняет необходимость в сложных аппаратных настройках, таких как микрофлюидик, обеспечивая при этом более сильный эффект иммобилизации. Кроме того, он сводит к минимуму возможное воздействие токсичных химических веществ на животных и исследователей, поскольку химические вещества не используются, обеспечивая при этом аналогичный эффект иммобилизации. Эти технические возможности позволяют широко применять это устройство и подход ко многим экспериментам, требующим микроскопии in vivo с высоким разрешением на большом количестве животных.
Во время сборки устройства есть несколько важных шагов, в том числе нанесение термопасты и широкая лента для крепления сапфирового окна к медной пластине. Термопаста обеспечивает высокую теплопроводность, заменяя зазоры материалом с низким термическим сопротивлением. Для достижения желаемых характеристик охлаждения пасту необходимо правильно вводить между всеми примыкающими/контактирующими поверхностями, включая холодную поверхность Пельтье на медную пластину, горячую поверхность Пельтье на медный блок охлаждения и медную пластину на сапфировое окно. Широкая лента, нанесенная на ступень, изолирует медную пластину, предотвращая нагрев воздуха и конденсацию, которая приводит к ржавчине. Это также укрепляет связь между сапфировым окном и медной пластиной. Таким образом, как нанесение термопасты, так и широкая лента требуют особой осторожности.
В реальном эксперименте по иммобилизации охлаждения параметры, представленные в этой рукописи, такие как напряжения и время, зависят от конкретных свойств пластин культивирования и стадии, таких как количество агара в пластинах, эффективность стадии, а также температура и влажность окружающей среды. В будущих модификациях может быть установлен контроллер обратной связи, такой как пропорционально-интегральная производная (ПИД), для активной регулировки входного напряжения на ступень охлаждения для достижения желаемой температуры и ее стабилизации.
Существует несколько ограничений этой стадии иммобилизации на стадии охлаждения, подробно описанных в оригинальной публикации20. Короче говоря, животные, выращенные при разных температурах, обездвижены в разной степени, что может потребовать дополнительной тонкой настройки. Кроме того, этот текущий каскад охлаждения не предназначен для инвертированного микроскопа. Кроме того, визуализация или просеивание непосредственно на культивационной пластине может привести к загрязнению пластины.
Мы разрабатываем новые версии охлаждающей ступени, подходящие для различных платформ визуализации, включая составные вертикальные микроскопы и инвертированные микроскопы. Эти новые конструкции позволят напрямую обезвреживать животных на культуральных пластинах во время визуализации на этих платформах. Для визуализации на этих ступенях охлаждения будут использоваться объективы погружения в воздух на большие рабочие расстояния, аналогичные вертикальной конфигурации. В настоящее время воздушные иммерсионные объективы могут иметь числовую апертуру до 0,9, что обеспечивает разрешение около 300 нм для визуализации зеленых флуоресцентных белков. Таким образом, комбинация нового охлаждающего столика с микроскопом может позволить регулярно получать флуоресцентную визуализацию с субмикронным разрешением.
Мы также даем несколько полезных советов по использованию ступени охлаждения в соответствии с нашим опытом. Например, люди должны проверить, нет ли пузырьков воздуха внутри узла водяного охлаждения. Пузырьки воздуха ухудшают охлаждение горячей поверхности Пельтье и, таким образом, снижают эффективность охлаждения ступени охлаждения. Если присутствуют пузырьки воздуха, следует включить источник питания 12 В, чтобы вода текла, и все компоненты потока воды должны быть встряхнуты. Пузырьки воздуха могут вымываться из захваченных областей и вентилироваться через бак насоса. Исследователи должны следить за тем, чтобы трубка потока воды не сгибалась и не пересекалась при сборке узла водяного охлаждения. Изгиб или пересечение труб может препятствовать достаточному потоку воды и снижать эффективность охлаждения. Трубные соединения должны быть правильно подогнаны и плотно залегают. При необходимости вместо нее можно использовать мягкую трубку другого диаметра для обеспечения герметичности. Пасту не следует наносить, даже если соединение недостаточно плотное, так как паста может привести к засорению при использовании в будущем. Влажность в помещении влияет на эффективность охлаждения и приводит к образованию конденсата и льда на ступени охлаждения. Перед размещением культивационной пластины на стадии охлаждения рекомендуется использовать бумажную салфетку для удаления конденсата или использовать радиатор для быстрого удаления льда, образовавшегося на сапфировом окне. Вентиляторы бака насоса и радиатора могут вызывать небольшие вибрации в микроскопе, если они работают на одном столе. Вибрация микроскопа размывает полученное изображение, поэтому ее следует избегать. Для механической изоляции бака и радиатора можно использовать подушку, а можно разместить на отдельном соседнем столе. Ступень охлаждения может стать ступенью нагрева, изменив электрическое соединение с Пельтье.
The authors have nothing to disclose.
Мы выражаем благодарность Ною Джозефу (Северо-восточный отдел биоинженерии) за обработку медных пластин.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |