In diesem Artikel werden Protokolle für den Aufbau und Betrieb einer Kühlstufe beschrieben, um C. elegans massenhaft auf ihren ursprünglichen Kultivierungsplatten zu immobilisieren.
Hochauflösende In-vivo-Mikroskopieansätze können subtile Informationen und feine Details im Inneren des Modelltiers Caenorhabditis elegans (C. elegans) aufdecken, erfordern jedoch eine starke Ruhigstellung der Tiere, um Bewegungsunschärfe in den Bildern zu vermeiden. Leider erfordern die meisten aktuellen Immobilisierungstechniken einen erheblichen manuellen Aufwand, so dass hochauflösende Bildgebung einen geringen Durchsatz aufweist. Die Immobilisierung von C. elegans wird durch die Verwendung eines Kühlansatzes, der ganze Populationen direkt auf ihren Kultivierungsplatten leicht immobilisieren kann, erheblich vereinfacht. Die Kühlstufe kann einen breiten Temperaturbereich mit einer gleichmäßigen Verteilung auf der Kultivierungsplatte aufbauen und aufrechterhalten. In diesem Artikel wird der gesamte Prozess des Aufbaus der Kühlstufe dokumentiert. Ziel ist es, dass ein typischer Forscher in seinem Labor problemlos eine betriebsbereite Kühlstufe nach diesem Protokoll aufbauen kann. Die Nutzung der Kühlstufe nach drei Protokollen wird gezeigt, und jedes Protokoll hat Vorteile für verschiedene Experimente. Ebenfalls gezeigt wird ein Beispiel für ein Kühlprofil der Stufe, wenn sie sich ihrer Endtemperatur nähert, und einige hilfreiche Tipps zur Verwendung der Kühlimmobilisierung.
Die hochauflösende optische Mikroskopie ist ein unverzichtbares Werkzeug für die Untersuchung biologischer Strukturen in vivo auf subzellulärer Ebene. Viele biologische Studien erfordern Bildgebung mit einer Auflösung im Submikrometerbereich, um subtile anatomische Details aufzuklären, einschließlich der Neuronenmorphologie 1,2, der Membranstruktur3,4 und der Proteinlokalisierung 5,6. Ein hochauflösendes Bild benötigt je nach Abbildungsmodalität und Sonde eine Belichtungszeit von mehreren Millisekunden bis Sekunden 7,8. Um optimale Ergebnisse zu erzielen, ist es unerlässlich, mikroskopische Experimente sorgfältig zu planen und durchzuführen. Entscheidend dafür ist eine effiziente Tierpräparationsmethode, die eine hochauflösende Bildgebung ermöglicht.
Der Fadenwurm C. elegans ist ein weit verbreiteter Modellorganismus zur Untersuchung vieler biologischer Prozesse9. Diese kleinen Tiere werden in der Regel auf Agarplatten mit Nematodenwachstumsmedium (NGM) kultiviert und vermehren sich schnell durch Selbstbefruchtung, wodurch sie sich gut für groß angelegte Studien eignen. Ihre Transparenz und ein breites Spektrum an Beschriftungstechniken ermöglichen eine einfache Visualisierung ihrer inneren Anatomie10,11. Die feinen Strukturen in C. elegans sind ideal für die Untersuchung biologischer Prozesse auf subzellulärer Ebene, wie z.B. Neuronenregeneration12, Neuronendegeneration 13 und Zellteilung14. Solche Studien erfordern Bildgebung mit einer Auflösung im Submikrometerbereich und eine Immobilisierung der Tiere, die stark genug ist, um Bildunschärfe zu verhindern. Eine starke Immobilisierung ist besonders wichtig für Techniken, bei denen mehrere Bilder in Raum oder Zeit verwendet werden, wie z. B. 3D-Bildstapel (d. h. Z-Stapel) und Zeitrafferaufnahmen. Jede Tierbewegung zwischen den Aufnahmen kann das Ergebnis verfälschen. Bei C. elegans beinhaltet die starke Immobilisierung typischerweise die manuelle Manipulation einzelner Tiere und die Montage auf Objektträgern mit einem Betäubungsmittel15,16. Diese zeit- und arbeitsintensiven Verfahren erschweren groß angelegte Experimente sehr. Eine Immobilisierungsstrategie, bei der die Tiere direkt und reversibel auf ihren ursprünglichen Kultivierungsplatten immobilisiert werden, könnte eine hochauflösende Bildgebung mit hohem Durchsatz ermöglichen.
Die kühlende Immobilisierung von C. elegans wurde in einigen Studien gezeigt, ist aber nicht weit verbreitet. Es wird in der Regel mit einem mikrofluidischen Gerät kombiniert, um die Tiere weiter zu fixieren17,18,19. Mikrofluidische Geräte sind jedoch komplex, erfordern eine umfangreiche Betriebsausbildung und lassen sich nicht einfach in die typischen Arbeitsabläufe der Feststoffkultivierung von C. elegans-Experimenten integrieren. Daher wird die Mikrofluidik für die Immobilisierung von C. elegans nicht häufig eingesetzt. In Verbindung mit der jüngsten Veröffentlichung20 des Chung Laboratory wird hier die Einführung eines neuen Ansatzes zur Immobilisierung der Kühlung vorgestellt, bei dem eine thermoelektrische Kühlstufe verwendet wird (Abbildung 1), um diese Mängel zu beheben. Mit der Kühlstufe kann eine typische 60-mm-Styropor-Kultivierungsplatte auf eine beliebige Zieltemperatur (T-Set) zwischen -8 °C und Raumtemperatur heruntergekühlt werden. Dieser Ansatz der Kühlphase kann eine gesamte Tierpopulation mit minimalem Aufwand für den Benutzer leicht und reversibel immobilisieren, wodurch 98 % der Verarbeitungszeit der Tiere entfallen20.
Im Folgenden werden die Verfahren zum Aufbau einer Kühlstufe von Grund auf beschrieben. Mit Ausnahme der Bearbeitung von Teilen und des 3D-Drucks wird das gesamte Verfahren voraussichtlich 4 Stunden dauern, ohne dass Spezialwerkzeuge oder Fachwissen erforderlich sind. Anschließend werden drei verschiedene Kühlstrategien mit unterschiedlichen Kühlraten und die Bemühungen des Benutzers, C. elegans auf einem typischen aufrechten Mikroskop zu immobilisieren, weiter beschrieben. Die bevorzugte Strategie kann von der Benutzeranwendung abhängen. Die Protokolle für diese drei Strategien zur Kühlung der Immobilisierung werden detailliert beschrieben.
Die Herstellung, Montage und Verwendung der Kühlstufe wird in diesem Manuskript gezeigt. Bei den meisten Komponenten handelt es sich um Standardartikel, die online gekauft werden können. Einige Komponenten, wie die Kupferplatte und das Saphirfenster, benötigen eine Sonderanfertigung und die Herstellung kann bis zu 1 Monat dauern. Andere Komponenten, die 3D-gedruckt werden können, lassen sich in den meisten Forschungseinrichtungen problemlos herstellen (Ergänzende Tabelle 1). Der Montageprozess benötigt nur wenige Werkzeuge und kann von einem Laien in wenigen Stunden schnell durchgeführt werden. Daher sollten die meisten biologischen Labore in der Lage sein, dieses Gerät problemlos zu implementieren.
Die Kühlstufe und der Ansatz der Kühlimmobilisierung weisen mehrere signifikante Verbesserungen gegenüber bestehenden Immobilisierungsmethoden auf, die in der Originalpublikation20 ausführlich beschrieben wurden. Kurz gesagt, die Kühlphase ermöglicht die starke Immobilisierung großer Populationen von C. elegans jeden Alters, einschließlich Embryonen und Dauers, auf ihren typischen Kulturplatten unter Standard-Mikroskopie-Workflows. Es macht komplexe Hardware-Setups wie Mikrofluidik überflüssig und bietet gleichzeitig einen stärkeren Immobilisierungseffekt. Darüber hinaus minimiert es die mögliche Exposition gegenüber toxischen Chemikalien für Tiere und Forscher, da keine Chemikalien verwendet werden, und bietet gleichzeitig einen ähnlichen Immobilisierungseffekt. Diese technischen Möglichkeiten ermöglichen die breite Anwendung dieses Geräts und Ansatzes für viele Experimente, die hochauflösende In-vivo-Mikroskopie an einer großen Anzahl von Tieren erfordern.
Es gibt einige kritische Schritte während des Baus des Geräts, einschließlich des gesamten Auftragens von Wärmeleitpaste und des breiten Klebebandes zur Befestigung des Saphirfensters an der Kupferplatte. Die Wärmeleitpaste sorgt für eine starke Wärmeleitfähigkeit, indem sie Spalten durch ein Material mit geringem Wärmewiderstand ersetzt. Um die gewünschte Kühlleistung zu erzielen, muss die Paste ordnungsgemäß zwischen alle anstoßenden/berührenden Oberflächen eingeführt werden, einschließlich der kalten Peltier-Oberfläche zur Kupferplatte, der heißen Peltier-Oberfläche zum Kupferkühlblock und der Kupferplatte zum Saphirfenster. Das breite Klebeband, das auf der Bühne angebracht ist, isoliert die Kupferplatte, um eine Erwärmung durch Luft und Kondensation zu verhindern, die zu Rost führt. Es verstärkt auch die Verbindung zwischen dem Saphirfenster und der Kupferplatte. Daher erfordern sowohl das Auftragen von Wärmeleitpaste als auch das breite Klebeband besondere Sorgfalt.
In einem tatsächlichen Experiment zur Kühlung der Immobilisierung hängen die in diesem Manuskript angegebenen Parameter, wie z. B. Spannungen und Zeiten, von den spezifischen Eigenschaften der Kultivierungsplatten und des Stadiums ab, wie z. B. der Menge an Agar in den Platten, der Effizienz des Stadiums sowie der Umgebungstemperatur und -feuchtigkeit. In zukünftigen Modifikationen könnte ein Feedback-Regler wie ein Proportional-Integral-Derivat (PID) installiert werden, um den Spannungseingang zur Kühlstufe aktiv anzupassen, um die gewünschte Temperatur zu erreichen und zu stabilisieren.
Es gibt mehrere Einschränkungen dieser Kühlphasen-Immobilisierung, die in der Originalpublikation20 sorgfältig beschrieben werden. Kurz gesagt, Tiere, die bei unterschiedlichen Temperaturen aufgezogen werden, sind unterschiedlich stark immobilisiert, was möglicherweise eine zusätzliche Feinabstimmung erfordert. Außerdem ist diese aktuelle Kühlstufe nicht für ein inverses Mikroskop ausgelegt. Darüber hinaus kann die Bildgebung oder das Screening auf einer Kultivierungsplatte direkt zu einer Kontamination der Platte führen.
Wir entwickeln neue Versionen des Kühltisches, die für verschiedene Bildgebungsplattformen geeignet sind, einschließlich zusammengesetzter aufrechter Mikroskope und inverser Mikroskope. Diese neuen Designs ermöglichen eine direkte Immobilisierung der Tierkühlung auf Kulturplatten während der Bildgebung auf diesen Plattformen. Für die Bildgebung auf diesen Kühlstufen werden Luftimmersionsobjektive mit großem Arbeitsabstand verwendet, ähnlich wie bei der aufrechten Konfiguration. Heutzutage können Luftimmersionsobjektive eine numerische Apertur von bis zu 0,9 haben, was eine Auflösung von etwa 300 nm für die Bildgebung von grünen Fluoreszenzproteinen bietet. So könnte die Kombination eines neuen Kühltisches mit einem Mikroskop routinemäßig Fluoreszenzbildgebung mit Submikrometer-Auflösung ermöglichen.
Wir geben auch einige hilfreiche Tipps für die Verwendung der Kühlstufe nach unserer Erfahrung. Zum Beispiel sollten Einzelpersonen überprüfen, ob sich Luftblasen in der Wasserkühlung befinden. Luftblasen degradieren die Kühlung auf die heiße Peltier-Oberfläche und verschlechtern damit die Kühlwirkung der Kühlstufe. Wenn Luftblasen vorhanden sind, sollte die 12-V-Stromversorgung eingeschaltet werden, damit das Wasser fließt, und alle Komponenten des Wasserflusses sollten geschüttelt werden. Luftblasen können aus eingeschlossenen Bereichen ausgespült und durch den Pumpentank entlüftet werden. Forscher sollten sicherstellen, dass der Wasserdurchflussschlauch beim Zusammenbau der Wasserkühlungsbaugruppe nicht verbogen oder gekreuzt wird. Das Biegen oder Kreuzen von Rohren kann den ausreichenden Wasserfluss verhindern und die Kühleffizienz verringern. Die Schlauchverbindungen sollten richtig sitzen und fest sitzen. Bei Bedarf kann stattdessen ein weicher Schlauch mit einem anderen Durchmesser verwendet werden, um die Dichtheit zu gewährleisten. Paste sollte nicht aufgetragen werden, auch wenn die Verbindung nicht dicht genug ist, da die Paste bei späterem Gebrauch zu Verstopfungen führen kann. Die Raumfeuchte wirkt sich auf die Kühlleistung aus und führt Kondenswasser und Eis auf die Kühlstufe. Bevor Sie eine Kultivierungsplatte auf die Kühlstufe stellen, wird empfohlen, ein Papiertaschentuch zu verwenden, um Kondenswasser zu entfernen, oder einen Kühlkörper zu verwenden, um Eis zu entfernen, das sich auf dem Saphirfenster gebildet hat. Der Pumpentank und die Kühlerlüfter können im Mikroskop kleine Vibrationen verursachen, wenn sie auf demselben Tisch arbeiten. Mikroskopvibrationen verwischen das aufgenommene Bild und sollten daher vermieden werden. Ein Kissen kann verwendet werden, um den Tank und den Kühler mechanisch zu isolieren, oder sie können auf einen separaten Tisch in der Nähe gestellt werden. Die Kühlstufe kann durch Umkehren der elektrischen Verbindung zum Peltier zu einer Heizstufe werden.
The authors have nothing to disclose.
Wir danken Noah Joseph (Northeastern Bioengineering Department) für die Bearbeitung von Kupferblechen.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |