Cet article décrit les protocoles de construction et d’exploitation d’une étape de refroidissement pour immobiliser C. elegans sur leurs plaques de culture d’origine en masse.
Les approches de microscopie in vivo à haute résolution peuvent révéler des informations subtiles et des détails fins à l’intérieur de l’animal modèle Caenorhabditis elegans (C. elegans), mais nécessitent une forte immobilisation de l’animal pour éviter le flou de mouvement dans les images. Malheureusement, la plupart des techniques d’immobilisation actuelles nécessitent un effort manuel considérable, ce qui rend l’imagerie haute résolution à faible débit. L’immobilisation de C. elegans est grandement simplifiée en utilisant une approche de refroidissement qui peut facilement immobiliser des populations entières directement sur leurs plaques de culture. L’étape de refroidissement peut établir et maintenir une large plage de températures avec une répartition uniforme sur la plaque de culture. Dans cet article, l’ensemble du processus de construction de l’étape de refroidissement est documenté. L’objectif est qu’un chercheur typique puisse construire un étage de refroidissement opérationnel dans son laboratoire en suivant ce protocole sans difficulté. L’utilisation de l’étape de refroidissement suivant trois protocoles est montrée, et chaque protocole présente des avantages pour différentes expériences. On y trouve également un exemple de profil de refroidissement de la scène à l’approche de sa température finale et quelques conseils utiles sur l’utilisation de l’immobilisation de refroidissement.
La microscopie optique à haute résolution fournit un outil indispensable pour étudier les structures biologiques in vivo au niveau subcellulaire. De nombreuses études biologiques nécessitent une imagerie à résolution submicronique pour résoudre des détails anatomiques subtils, notamment la morphologie des neurones1,2, la structure membranaire3,4 et la localisation des protéines 5,6. Une image haute résolution nécessite un temps d’exposition de plusieurs millisecondes à secondes, selon la modalité d’imagerie et la sonde 7,8. Pour obtenir des résultats optimaux, il est essentiel de planifier et de mener soigneusement des expériences basées sur la microscopie. Une méthode efficace de préparation des animaux qui facilite l’imagerie à haute résolution est cruciale pour cet effort.
Le nématode C. elegans est un organisme modèle largement utilisé pour l’étude de nombreux processus biologiques9. Ce petit animal est généralement cultivé sur des plaques de gélose à milieu de croissance des nématodes (NGM), et ils se reproduisent rapidement par autofécondation, ce qui les rend bien adaptés aux études à grande échelle. Leur transparence et un large éventail de techniques d’étiquetage permettent la visualisation directe de leur anatomie interne10,11. Les structures fines de C. elegans sont idéales pour étudier les processus biologiques au niveau subcellulaire, tels que la régénération des neurones 12, la dégénérescence des neurones13 et la division cellulaire14. De telles études nécessitent une imagerie à une résolution submicronique et une immobilisation animale suffisamment forte pour empêcher le flou de l’image. Une forte immobilisation est particulièrement cruciale pour les techniques impliquant plusieurs images dans l’espace ou le temps, telles que les piles d’images 3D (c’est-à-dire les piles z) et l’imagerie accélérée. Tout mouvement d’animal entre les expositions peut obscurcir le résultat. Pour C. elegans, une forte immobilisation implique généralement la manipulation manuelle d’animaux individuels et leur montage sur des lames avec un anesthésique15,16. Ces procédures à forte intensité de temps et de main-d’œuvre rendent les expériences à grande échelle très difficiles. Une stratégie d’immobilisation où les animaux sont directement et réversiblement immobilisés sur leurs plaques de culture d’origine pourrait permettre une imagerie haute résolution à haut débit.
L’immobilisation au refroidissement de C. elegans a été démontrée dans quelques études, mais n’est pas largement utilisée. Il est généralement associé à un dispositif microfluidique pour immobiliser davantage les animaux17,18,19. Cependant, les dispositifs microfluidiques sont complexes, nécessitent une formation opérationnelle importante et ne peuvent pas être facilement intégrés aux flux de travail typiques de culture solide des expériences de C. elegans. Ainsi, la microfluidique n’est pas largement utilisée pour l’immobilisation de C. elegans. Présentée ici, conjointement avec la récente publication20 du laboratoire Chung, est l’introduction d’une nouvelle approche d’immobilisation du refroidissement utilisant un étage de refroidissement thermoélectrique (Figure 1) pour remédier à ces lacunes. Avec l’étape de refroidissement, une plaque typique de culture de polystyrène de 60 mm peut être refroidie à n’importe quelle température cible (ensemble T) comprise entre -8 ° C et la température ambiante. Cette approche de l’étape de refroidissement peut facilement et de manière réversible immobiliser toute une population animale avec un minimum d’effort de l’utilisateur, éliminant 98% du temps de traitement des animaux20.
Ci-dessous, les procédures pour construire une étape de refroidissement à partir de zéro sont décrites. À l’exception de l’usinage des pièces et de l’impression 3D, l’ensemble de la procédure devrait prendre 4 heures sans nécessiter d’outils spéciaux ou d’expertise. Ensuite, trois stratégies de refroidissement différentes avec des vitesses de refroidissement variables et les efforts de l’utilisateur pour immobiliser C. elegans sur un microscope vertical typique sont décrites plus en détail. La stratégie préférée peut dépendre de l’application utilisateur. Les protocoles de ces trois stratégies d’immobilisation du refroidissement sont décrits en détail.
La fabrication, l’assemblage et l’utilisation de l’étape de refroidissement sont présentés dans ce manuscrit. La plupart des composants sont des articles prêts à l’emploi qui peuvent être achetés en ligne. Certains composants, comme la plaque de cuivre et la fenêtre en saphir, nécessitent une commande personnalisée et peuvent prendre jusqu’à 1 mois pour être fabriqués. D’autres composants qui peuvent être imprimés en 3D sont facilement fabriqués dans la plupart des établissements de recherche (tableau supplémentaire 1). Le processus d’assemblage ne nécessite que quelques outils et peut être effectué rapidement par un non-expert en quelques heures. Ainsi, la plupart des laboratoires biologiques devraient être en mesure de mettre facilement en œuvre ce dispositif.
L’étape de refroidissement et l’approche d’immobilisation du refroidissement possèdent plusieurs améliorations significatives par rapport aux méthodes d’immobilisation existantes, soigneusement détaillées dans la publication originale20. En bref, l’étape de refroidissement permet une forte immobilisation de grandes populations de C. elegans de tous âges, y compris les embryons et les dauers, sur leurs plaques de culture typiques dans le cadre de flux de travail de microscopie standard. Il élimine le besoin de configurations matérielles complexes, comme la microfluidique, tout en fournissant un effet d’immobilisation plus fort. De plus, il minimise l’exposition chimique toxique possible des animaux et des chercheurs puisqu’aucun produit chimique n’est utilisé, tout en fournissant un effet d’immobilisation similaire. Ces capacités techniques permettent une large application de ce dispositif et une approche à de nombreuses expériences nécessitant une microscopie in vivo à haute résolution sur un grand nombre d’animaux.
Il y a quelques étapes critiques lors de la construction de l’appareil, y compris toute l’application de pâte thermique et le ruban large pour fixer la fenêtre saphir à la plaque de tonnelier. La pâte thermique assure une forte conductivité thermique en remplaçant les espaces par un matériau à faible résistance thermique. Pour obtenir les performances de refroidissement souhaitées, la pâte doit être correctement introduite entre toutes les surfaces aboutissantes / en contact, y compris la surface froide Peltier à la plaque de cuivre, la surface chaude Peltier au bloc de refroidissement en cuivre et la plaque de cuivre à la fenêtre saphir. Le large ruban appliqué sur la scène isole la plaque de cuivre pour empêcher le chauffage de l’air et de la condensation, ce qui entraîne de la rouille. Il renforce également la connexion entre la fenêtre en saphir et la plaque de cuivre. Ainsi, l’application de la pâte thermique et du ruban large nécessitent des soins supplémentaires.
Dans une expérience réelle d’immobilisation de refroidissement, les paramètres fournis dans ce manuscrit, tels que les tensions et les temps, dépendent des propriétés spécifiques des plaques de culture et de l’étage, telles que la quantité de gélose dans les plaques, l’efficacité de la scène, la température ambiante et l’humidité. Dans les modifications futures, un contrôleur de rétroaction pourrait être installé, comme une dérivée proportionnelle-intégrale (PID), pour ajuster activement l’entrée de tension à l’étage de refroidissement afin d’atteindre la température souhaitée et de la stabiliser.
Il existe plusieurs limites à cette immobilisation de l’étage de refroidissement, soigneusement détaillées dans la publication originale20. En bref, les animaux élevés à différentes températures sont immobilisés à des degrés différents, ce qui peut nécessiter un réglage plus fin. En outre, cet étage de refroidissement actuel n’est pas conçu pour un microscope inversé. De plus, l’imagerie ou le criblage sur une plaque de culture directement peut introduire une contamination dans la plaque.
Nous concevons de nouvelles versions de l’étage de refroidissement adaptées à différentes plates-formes d’imagerie, y compris les microscopes verticaux composés et les microscopes inversés. Ces nouvelles conceptions permettront l’immobilisation directe du refroidissement des animaux sur des plaques de culture lors de l’imagerie sur ces plateformes. L’imagerie sur ces étages de refroidissement utilisera des objectifs d’immersion dans l’air à longue distance, similaires à la configuration verticale. De nos jours, les objectifs d’immersion dans l’air peuvent avoir une ouverture numérique allant jusqu’à 0,9, ce qui fournit une résolution d’environ 300 nm pour l’imagerie des protéines de fluorescence verte. Ainsi, la combinaison d’un nouvel étage de refroidissement avec un microscope pourrait permettre une imagerie de fluorescence à résolution submicronique de routine.
Nous fournissons également quelques conseils utiles pour l’utilisation de la phase de refroidissement selon notre expérience. Par exemple, les individus devraient vérifier s’il y a des bulles d’air à l’intérieur de l’ensemble de refroidissement par eau. Les bulles d’air dégradent le refroidissement à la surface chaude de Peltier et dégradent ainsi l’efficacité du refroidissement de l’étage de refroidissement. Si des bulles d’air sont présentes, l’alimentation 12 V doit être allumée pour faire couler l’eau et tous les composants du débit d’eau doivent être secoués. Les bulles d’air peuvent être évacuées des zones piégées et évacuées par le réservoir de la pompe. Les chercheurs doivent s’assurer que le tuyau d’écoulement de l’eau n’est pas plié ou croisé lors de l’assemblage de l’ensemble de refroidissement par eau. La flexion ou le franchissement des tubes peut empêcher l’écoulement adéquat de l’eau et réduire l’efficacité du refroidissement. Les raccords de tube doivent être bien ajustés et serrés. Si nécessaire, un tube souple de diamètre différent peut être utilisé à la place pour assurer l’étanchéité. La pâte ne doit pas être appliquée, même si la connexion n’est pas assez serrée, car la pâte peut introduire des sabots lors d’une utilisation future. L’humidité ambiante affecte les performances de refroidissement et introduit de la condensation et de la glace sur la platine de refroidissement. Avant de placer une plaque de culture sur la scène de refroidissement, il est recommandé d’utiliser un mouchoir en papier pour éliminer la condensation ou d’utiliser un dissipateur thermique pour éliminer rapidement la glace qui s’est formée sur la fenêtre en saphir. Le réservoir de la pompe et les ventilateurs du radiateur peuvent provoquer de petites vibrations dans le microscope s’ils travaillent sur la même table. Les vibrations du microscope brouillent l’image acquise et doivent donc être évitées. Un coussin peut être utilisé pour isoler mécaniquement le réservoir et le radiateur, ou ils peuvent être placés sur une table séparée à proximité. L’étage de refroidissement peut devenir un étage de chauffage en inversant la connexion électrique au Peltier.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Noah Joseph (Northeastern Bioengineering Department) pour l’usinage des plaques de cuivre.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |