Este trabalho descreve protocolos para a construção e operação de uma etapa de resfriamento para imobilizar C. elegans em suas placas de cultivo originais em massa.
Abordagens de microscopia in vivo de alta resolução podem revelar informações sutis e detalhes finos dentro do animal modelo Caenorhabditis elegans (C. elegans), mas requerem forte imobilização animal para evitar borrões de movimento nas imagens. Infelizmente, a maioria das técnicas atuais de imobilização requer esforço manual substancial, tornando as imagens de alta resolução de baixo rendimento. A imobilização de C. elegans é muito simplificada usando uma abordagem de resfriamento que pode facilmente imobilizar populações inteiras diretamente em suas placas de cultivo. O estágio de resfriamento pode estabelecer e manter uma ampla faixa de temperaturas com uma distribuição uniforme na placa de cultivo. Neste artigo, todo o processo de construção da etapa de resfriamento está documentado. O objetivo é que um pesquisador típico possa construir uma etapa de resfriamento operacional em seu laboratório seguindo este protocolo sem dificuldade. A utilização da etapa de resfriamento seguindo três protocolos é mostrada, e cada protocolo apresenta vantagens para diferentes experimentos. Também é mostrado um exemplo de perfil de resfriamento do estágio à medida que se aproxima de sua temperatura final e algumas dicas úteis no uso da imobilização de resfriamento.
A microscopia óptica de alta resolução fornece uma ferramenta indispensável para o estudo de estruturas biológicas in vivo em nível subcelular. Muitos estudos biológicos requerem imagens com resolução submicrônica para resolver detalhes anatômicos sutis, incluindo morfologia do neurônio1,2, estrutura da membrana3,4 e localização de proteínas 5,6. Uma imagem de alta resolução requer um tempo de exposição de vários milissegundos a segundos, dependendo da modalidade de imagem e da sonda 7,8. Para alcançar os melhores resultados, é essencial planejar e conduzir cuidadosamente experimentos baseados em microscopia. Crucial para esse esforço é um método eficiente de preparo de animais que facilite imagens de alta resolução.
O nematoide C. elegans é um organismo modelo amplamente utilizado para o estudo de diversos processos biológicos9. Este pequeno animal é tipicamente cultivado em placas de ágar meio de crescimento de nematoides (NGM) e eles se reproduzem rapidamente por autofecundação, tornando-os adequados para estudos em larga escala. Sua transparência e uma ampla gama de técnicas de marcação permitem a visualização direta de sua anatomia interna10,11. As estruturas finas em C. elegans são ideais para estudar processos biológicos em nível subcelular, como regeneração de neurônios 12, degeneração de neurônios13 e divisão celular14. Tais estudos necessitam de imagens com resolução submicrônica e imobilização animal forte o suficiente para evitar o desfoque da imagem. A imobilização forte é especialmente crucial para técnicas que envolvem múltiplas imagens no espaço ou no tempo, como pilhas de imagens 3D (ou seja, pilhas z) e imagens de lapso de tempo. Qualquer movimento de animal entre as exposições pode obscurecer o resultado. Para C. elegans, a imobilização forte tipicamente envolve manipulação manual de animais individuais e montagem em lâminas com anestésico15,16. Esses procedimentos demorados e trabalhosos tornam os experimentos em grande escala muito difíceis. Uma estratégia de imobilização em que os animais são direta e reversivelmente imobilizados em suas placas de cultivo originais poderia permitir imagens de alta produtividade e alta resolução.
A imobilização por resfriamento de C. elegans tem sido demonstrada em alguns estudos, mas não é amplamente utilizada. Geralmente é combinada com um dispositivo microfluídico para conter ainda mais os animais17,18,19. No entanto, os dispositivos microfluídicos são complexos, requerem treinamento operacional significativo e não podem ser facilmente integrados aos fluxos de trabalho típicos de cultivo sólido dos experimentos de C. elegans. Assim, a microfluídica não é amplamente utilizada para a imobilização de C. elegans. Apresentamos aqui, em conjunto com a recente publicação20 do Laboratório Chung, a introdução de uma nova abordagem de imobilização de resfriamento usando um estágio de resfriamento termoelétrico (Figura 1) para resolver essas deficiências. Com o estágio de resfriamento, uma placa de cultivo de poliestireno típica de 60 mm pode ser resfriada até qualquer temperatura alvo (conjunto T) entre -8 °C e temperatura ambiente. Essa abordagem do estágio de resfriamento pode imobilizar pronta e reversivelmente toda uma população animal com o mínimo esforço do usuário, eliminando 98% do tempo de processamento animal20.
Abaixo, são descritos os procedimentos para a construção de um estágio de resfriamento do zero. Com exceção da usinagem de peças e impressão 3D, todo o procedimento deve levar 4 h sem a necessidade de ferramentas especiais ou experiência. Em seguida, três diferentes estratégias de resfriamento com taxas de resfriamento variáveis e esforços do usuário para imobilizar C. elegans em um microscópio vertical típico são descritas mais adiante. A estratégia preferida pode depender do aplicativo do usuário. Os protocolos para essas três estratégias de imobilização por resfriamento são descritos em detalhes.
A fabricação, montagem e uso do estágio de resfriamento é mostrado neste manuscrito. A maioria dos componentes são itens de prateleira que podem ser comprados on-line. Alguns componentes, como a placa de cobre e a janela de safira, precisam de um pedido personalizado e podem levar até 1 mês para serem fabricados. Outros componentes que podem ser impressos em 3D são facilmente fabricados na maioria das instituições de pesquisa (Tabela Suplementar 1). O processo de montagem precisa de apenas algumas ferramentas e pode ser feito rapidamente por um não especialista em poucas horas. Assim, a maioria dos laboratórios biológicos deve ser capaz de implementar facilmente este dispositivo.
O estágio de resfriamento e a abordagem de imobilização por resfriamento possuem várias melhorias significativas em relação aos métodos de imobilização existentes, cuidadosamente detalhados na publicação original20. Em resumo, o estágio de resfriamento permite a forte imobilização de grandes populações de C. elegans de todas as idades, incluindo embriões e dauers, em suas placas de cultura típicas sob fluxos de trabalho de microscopia padrão. Ele elimina a necessidade de configurações de hardware complexas, como microfluídica, proporcionando um efeito de imobilização mais forte. Além disso, minimiza a possível exposição química tóxica a animais e pesquisadores, uma vez que não são usados produtos químicos, proporcionando um efeito de imobilização semelhante. Essas capacidades técnicas permitem a ampla aplicação deste dispositivo e a abordagem a muitos experimentos que requerem microscopia in vivo de alta resolução em um grande número de animais.
Existem algumas etapas críticas durante a construção do dispositivo, incluindo toda a aplicação de pasta térmica e a fita larga para fixar a janela de safira na placa de cobre. A pasta térmica garante uma forte condutividade térmica, substituindo as lacunas por um material de baixa resistência térmica. Para alcançar o desempenho de resfriamento desejado, a pasta precisa ser introduzida corretamente entre todas as superfícies de apoio/contato, incluindo a superfície fria Peltier para a placa de cobre, a superfície quente Peltier para o bloco de resfriamento de cobre e a placa de cobre para a janela de safira. A fita larga aplicada ao estágio isola a placa de cobre para evitar o aquecimento do ar e a condensação, o que leva à ferrugem. Também reforça a conexão entre a janela de safira e a placa de cobre. Assim, tanto a aplicação da pasta térmica quanto da fita larga exigem cuidados extras.
Em um experimento real de imobilização de resfriamento, os parâmetros fornecidos neste manuscrito, como tensões e tempos, dependem das propriedades específicas das placas e do estágio de cultivo, como a quantidade de ágar nas placas, a eficiência do estágio e a temperatura e umidade ambiente. Em modificações futuras, um controlador de realimentação poderia ser instalado, como um proporcional-integral-derivado (PID), para ajustar ativamente a entrada de tensão para o estágio de resfriamento para atingir a temperatura desejada e estabilizá-lo.
Existem várias limitações da imobilização dessa etapa de resfriamento, cuidadosamente detalhadas na publicação original20. Em resumo, animais criados em diferentes temperaturas são imobilizados em diferentes graus, o que pode precisar de ajustes finos extras. Além disso, este estágio de resfriamento atual não é projetado para um microscópio invertido. Além disso, imagens ou triagem em uma placa de cultivo diretamente podem introduzir contaminação na placa.
Estamos projetando novas versões do estágio de resfriamento adequadas para diferentes plataformas de imagem, incluindo microscópios verticais compostos e microscópios invertidos. Esses novos projetos permitirão a imobilização direta do resfriamento animal em placas de cultura durante a obtenção de imagens nessas plataformas. As imagens nesses estágios de resfriamento usarão objetivas de imersão de ar de longa distância de trabalho, semelhantes à configuração vertical. Atualmente, as objetivas de imersão no ar podem ter uma abertura numérica de até 0,9, o que fornece cerca de 300 nm de resolução para imagens de proteínas de fluorescência verde. Assim, a combinação de um novo estágio de resfriamento com um microscópio poderia permitir imagens de fluorescência com resolução submicrônica rotineiramente.
Também fornecemos algumas dicas úteis para usar o estágio de resfriamento de acordo com nossa experiência. Por exemplo, os indivíduos devem verificar se há bolhas de ar dentro do conjunto de resfriamento de água. As bolhas de ar degradam o resfriamento para a superfície quente Peltier e, assim, degradam a eficácia de resfriamento do estágio de resfriamento. Se houver bolhas de ar, a fonte de alimentação de 12 V deve ser ligada para fazer a água fluir e todos os componentes do fluxo de água devem ser agitados. As bolhas de ar podem ser liberadas de áreas presas e ventiladas pelo tanque da bomba. Os pesquisadores devem garantir que a tubulação de fluxo de água não seja dobrada ou cruzada ao montar o conjunto de resfriamento de água. A flexão ou cruzamento do tubo pode impedir o fluxo adequado de água e reduzir a eficácia do resfriamento. As conexões de tubo devem ser adequadamente ajustadas e apertadas. Se necessário, um tubo macio com um diâmetro diferente pode ser usado em vez disso para garantir a estanqueidade. A pasta não deve ser aplicada, mesmo que a conexão não seja apertada o suficiente, pois a pasta pode introduzir entupimentos durante o uso futuro. A umidade ambiente afeta o desempenho do resfriamento e introduz condensação e gelo no estágio de resfriamento. Antes de colocar uma placa de cultivo no estágio de resfriamento, recomenda-se usar um lenço de papel para remover a condensação ou usar um dissipador de calor para remover rapidamente o gelo que se formou na janela de safira. O tanque da bomba e os ventiladores do radiador podem causar pequenas vibrações no microscópio se trabalharem na mesma mesa. A vibração do microscópio borra a imagem adquirida e, portanto, deve ser evitada. Uma almofada pode ser usada para isolar mecanicamente o tanque e o radiador, ou eles podem ser colocados em uma mesa separada próxima. O estágio de resfriamento pode se tornar um estágio de aquecimento invertendo a conexão elétrica com o Peltier.
The authors have nothing to disclose.
Agradecemos a Noah Joseph (Departamento de Bioengenharia do Nordeste) pela usinagem de chapas de cobre.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |