Questo documento descrive i protocolli per la costruzione e il funzionamento di una fase di raffreddamento per immobilizzare in massa C. elegans sulle loro piastre di coltivazione originali.
Gli approcci di microscopia in vivo ad alta risoluzione possono rivelare informazioni sottili e dettagli fini all’interno dell’animale modello Caenorhabditis elegans (C. elegans), ma richiedono una forte immobilizzazione animale per prevenire la sfocatura del movimento nelle immagini. Sfortunatamente, la maggior parte delle attuali tecniche di immobilizzazione richiede un notevole sforzo manuale, rendendo l’imaging ad alta risoluzione a bassa produttività. L’immobilizzazione di C. elegans è notevolmente semplificata utilizzando un approccio di raffreddamento che può facilmente immobilizzare intere popolazioni direttamente sui loro piatti di coltivazione. La fase di raffreddamento può stabilire e mantenere un ampio intervallo di temperature con una distribuzione uniforme sulla piastra di coltivazione. In questo articolo, l’intero processo di costruzione della fase di raffreddamento è documentato. L’obiettivo è che un tipico ricercatore possa costruire una fase di raffreddamento operativa nel proprio laboratorio seguendo questo protocollo senza difficoltà. Viene mostrato l’utilizzo della fase di raffreddamento seguendo tre protocolli e ogni protocollo presenta vantaggi per diversi esperimenti. Viene inoltre mostrato un esempio di profilo di raffreddamento dello stadio mentre si avvicina alla sua temperatura finale e alcuni suggerimenti utili nell’utilizzo dell’immobilizzazione del raffreddamento.
La microscopia ottica ad alta risoluzione fornisce uno strumento indispensabile per lo studio delle strutture biologiche in vivo a livello subcellulare. Molti studi biologici richiedono l’imaging con risoluzione submicronica per risolvere dettagli anatomici sottili, tra cui la morfologia neuronale 1,2, la struttura della membrana3,4 e la localizzazione proteica 5,6. Un’immagine ad alta risoluzione richiede un tempo di esposizione da diversi millisecondi a secondi, a seconda della modalità di imaging e della sonda 7,8. Per ottenere risultati ottimali, è essenziale pianificare attentamente e condurre esperimenti basati sulla microscopia. Fondamentale per questo sforzo è un metodo di preparazione animale efficiente che faciliti l’imaging ad alta risoluzione.
Il nematode C. elegans è un organismo modello ampiamente utilizzato per lo studio di molti processi biologici9. Questo piccolo animale è tipicamente coltivato su piastre di agar con terreno di crescita nematode (NGM) e si riproduce rapidamente per autofecondazione, rendendoli adatti per studi su larga scala. La loro trasparenza e una vasta gamma di tecniche di etichettatura consentono la visualizzazione diretta della loro anatomia interna10,11. Le strutture fini di C. elegans sono ideali per studiare i processi biologici a livello subcellulare, come la rigenerazione neuronale12, la degenerazione neuronale13 e la divisione cellulare14. Tali studi richiedono l’imaging con risoluzione submicronica e l’immobilizzazione animale abbastanza forte da prevenire la sfocatura dell’immagine. L’immobilizzazione forte è particolarmente cruciale per le tecniche che coinvolgono più immagini nello spazio o nel tempo, come gli stack di immagini 3D (cioè z-stack) e l’imaging time-lapse. Qualsiasi movimento animale tra le esposizioni può oscurare il risultato. Per C. elegans, l’immobilizzazione forte comporta tipicamente la manipolazione manuale di singoli animali e il loro montaggio su vetrini con un anestetico15,16. Queste procedure ad alta intensità di tempo e lavoro rendono molto difficili gli esperimenti su larga scala. Una strategia di immobilizzazione in cui gli animali sono immobilizzati direttamente e reversibilmente sulle loro piastre di coltivazione originali potrebbe consentire immagini ad alta risoluzione ad alto rendimento.
L’immobilizzazione da raffreddamento di C. elegans è stata dimostrata in alcuni studi, ma non è ampiamente utilizzata. Di solito è combinato con un dispositivo microfluidico per trattenere ulteriormente gli animali17,18,19. Tuttavia, i dispositivi microfluidici sono complessi, richiedono una formazione operativa significativa e non possono essere facilmente integrati con i tipici flussi di lavoro di coltivazione solida degli esperimenti di C. elegans. Pertanto, la microfluidica non è ampiamente utilizzata per l’immobilizzazione di C. elegans. Presentato qui, in concomitanza con la recente pubblicazione20 del Chung Laboratory, è l’introduzione di un nuovo approccio di immobilizzazione del raffreddamento utilizzando uno stadio di raffreddamento termoelettrico (Figura 1) per affrontare queste carenze. Con la fase di raffreddamento, una tipica piastra di coltivazione in polistirene da 60 mm può essere raffreddata a qualsiasi temperatura target(set T) compresa tra -8 °C e temperatura ambiente. Questo approccio alla fase di raffreddamento può immobilizzare prontamente e reversibilmente un’intera popolazione animale con il minimo sforzo da parte dell’utente, eliminando il 98% del tempo di lavorazione degli animali20.
Di seguito, vengono descritte le procedure per costruire una fase di raffreddamento da zero. Ad eccezione della lavorazione di parti e della stampa 3D, l’intera procedura dovrebbe richiedere 4 ore senza la necessità di strumenti speciali o competenze. Quindi, vengono ulteriormente descritte tre diverse strategie di raffreddamento con diverse velocità di raffreddamento e sforzi dell’utente per immobilizzare C. elegans su un tipico microscopio verticale. La strategia preferita può dipendere dall’applicazione utente. I protocolli per queste tre strategie di immobilizzazione del raffreddamento sono descritti in dettaglio.
La fase di raffreddamento, l’assemblaggio e l’utilizzo sono mostrati in questo manoscritto. La maggior parte dei componenti sono articoli pronti all’uso che possono essere acquistati online. Alcuni componenti, come la lastra di rame e la finestra in zaffiro, necessitano di un ordine personalizzato e potrebbero richiedere fino a 1 mese per la fabbricazione. Altri componenti che possono essere stampati in 3D sono facilmente fabbricati nella maggior parte degli istituti di ricerca (Tabella supplementare 1). Il processo di assemblaggio richiede solo pochi strumenti e può essere eseguito rapidamente da un non esperto in poche ore. Pertanto, la maggior parte dei laboratori biologici dovrebbe essere in grado di implementare facilmente questo dispositivo.
La fase di raffreddamento e l’approccio di immobilizzazione del raffreddamento possiedono diversi miglioramenti significativi rispetto ai metodi di immobilizzazione esistenti, accuratamente dettagliati nella pubblicazione originale20. In breve, la fase di raffreddamento consente la forte immobilizzazione di grandi popolazioni di C. elegans di tutte le età, compresi embrioni e dauers, sulle loro tipiche piastre di coltura sotto flussi di lavoro di microscopia standard. Elimina la necessità di configurazioni hardware complesse, come la microfluidica, fornendo al contempo un effetto di immobilizzazione più forte. Inoltre, riduce al minimo la possibile esposizione chimica tossica agli animali e ai ricercatori poiché non vengono utilizzate sostanze chimiche, fornendo al contempo un effetto di immobilizzazione simile. Queste capacità tecniche consentono l’ampia applicazione di questo dispositivo e l’approccio a molti esperimenti che richiedono microscopia in vivo ad alta risoluzione su un gran numero di animali.
Ci sono alcuni passaggi critici durante la costruzione del dispositivo, tra cui tutte le applicazioni di pasta termica e l’ampio nastro per fissare la finestra di zaffiro alla piastra di bottaio. La pasta termica garantisce una forte conduttività termica sostituendo gli spazi vuoti con un materiale a bassa resistenza termica. Per ottenere le prestazioni di raffreddamento desiderate, la pasta deve essere introdotta correttamente tra tutte le superfici adiacenti / di contatto, compresa la superficie fredda Peltier sulla piastra di rame, la superficie calda Peltier sul blocco di raffreddamento in rame e la piastra di rame sulla finestra di zaffiro. L’ampio nastro applicato al palco isola la piastra di rame per evitare il riscaldamento dall’aria e dalla condensa, che porta alla ruggine. Rafforza anche la connessione tra la finestra in zaffiro e la lastra di rame. Pertanto, sia l’applicazione della pasta termica che il nastro largo richiedono particolare attenzione.
In un vero esperimento di immobilizzazione del raffreddamento, i parametri forniti in questo manoscritto, come le tensioni e i tempi, dipendono dalle proprietà specifiche delle piastre e dello stadio di coltivazione, come la quantità di agar nelle piastre, l’efficienza dello stadio e la temperatura e l’umidità ambiente. Nelle modifiche future, potrebbe essere installato un controller di retroazione, come una derivata integrale proporzionale (PID), per regolare attivamente l’ingresso della tensione allo stadio di raffreddamento per raggiungere la temperatura desiderata e stabilizzarla.
Ci sono diverse limitazioni di questa immobilizzazione dello stadio di raffreddamento, accuratamente dettagliate nella pubblicazione originale20. In breve, gli animali allevati a temperature diverse sono immobilizzati a diversi livelli, il che potrebbe richiedere una messa a punto extra. Inoltre, questo stadio di raffreddamento della corrente non è progettato per un microscopio invertito. Inoltre, l’imaging o lo screening su una piastra di coltivazione direttamente possono introdurre contaminazione nella piastra.
Stiamo progettando nuove versioni dello stadio di raffreddamento adatte a diverse piattaforme di imaging, tra cui microscopi verticali composti e microscopi invertiti. Questi nuovi design consentiranno l’immobilizzazione diretta del raffreddamento degli animali sulle piastre di coltura durante l’imaging su queste piattaforme. L’imaging su questi stadi di raffreddamento utilizzerà obiettivi di immersione in aria a lunga distanza di lavoro, simili alla configurazione verticale. Al giorno d’oggi, gli obiettivi di immersione in aria possono avere un’apertura numerica fino a 0,9, che fornisce una risoluzione di circa 300 nm per l’imaging delle proteine a fluorescenza verde. Pertanto, la combinazione di un nuovo stadio di raffreddamento con un microscopio potrebbe consentire l’imaging a fluorescenza con risoluzione submicronica di routine.
Forniamo anche alcuni consigli utili per l’utilizzo della fase di raffreddamento in base alla nostra esperienza. Ad esempio, le persone dovrebbero verificare se ci sono bolle d’aria all’interno del gruppo di raffreddamento ad acqua. Le bolle d’aria degradano il raffreddamento sulla superficie calda di Peltier e quindi degradano l’efficacia di raffreddamento dello stadio di raffreddamento. Se sono presenti bolle d’aria, l’alimentatore a 12 V deve essere acceso per far fluire l’acqua e tutti i componenti del flusso d’acqua devono essere scossi. Le bolle d’aria possono essere espulse dalle aree intrappolate e scaricate dal serbatoio della pompa. I ricercatori dovrebbero assicurarsi che il tubo del flusso d’acqua non sia piegato o incrociato durante l’assemblaggio del gruppo di raffreddamento ad acqua. La flessione o l’attraversamento del tubo possono impedire l’adeguato flusso d’acqua e ridurre l’efficacia del raffreddamento. Le connessioni dei tubi devono essere adeguatamente adattate e strette. Se necessario, è possibile utilizzare invece un tubo morbido con un diametro diverso per garantire la tenuta. La pasta non deve essere applicata, anche se la connessione non è abbastanza stretta, poiché la pasta potrebbe introdurre intasamenti durante l’uso futuro. L’umidità della stanza influisce sulle prestazioni di raffreddamento e introduce condensa e ghiaccio sullo stadio di raffreddamento. Prima di posizionare una piastra di coltivazione sulla fase di raffreddamento, si consiglia di utilizzare un fazzoletto di carta per rimuovere la condensa o utilizzare un dissipatore di calore per rimuovere rapidamente il ghiaccio che si è formato sulla finestra di zaffiro. Il serbatoio della pompa e le ventole del radiatore possono causare piccole vibrazioni nel microscopio se lavorano sullo stesso tavolo. La vibrazione del microscopio offusca l’immagine acquisita e quindi dovrebbe essere evitata. Un cuscino può essere utilizzato per isolare meccanicamente il serbatoio e il radiatore, oppure possono essere posizionati su un tavolo vicino separato. Lo stadio di raffreddamento può diventare uno stadio di riscaldamento invertendo il collegamento elettrico al Peltier.
The authors have nothing to disclose.
Riconosciamo Noah Joseph (Northeastern Bioengineering Department) per la lavorazione delle lastre di rame.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |