Dit artikel beschrijft protocollen voor het bouwen en bedienen van een koeltrap om C. elegans massaal op hun oorspronkelijke teeltplaten te immobiliseren.
Hoge resolutie in vivo microscopiebenaderingen kunnen subtiele informatie en fijne details in het modeldier Caenorhabditis elegans (C. elegans) onthullen, maar vereisen een sterke immobilisatie van dieren om bewegingsonscherpte in de beelden te voorkomen. Helaas vereisen de meeste huidige immobilisatietechnieken aanzienlijke handmatige inspanningen, waardoor beeldvorming met hoge resolutie een lage doorvoer heeft. Immobilisatie van C. elegans wordt sterk vereenvoudigd door een koelbenadering te gebruiken die gemakkelijk hele populaties direct op hun teeltplaten kan immobiliseren. De koelfase kan een breed temperatuurbereik vaststellen en handhaven met een uniforme verdeling op de teeltplaat. In dit artikel wordt het hele proces van het bouwen van de koelfase gedocumenteerd. Het is de bedoeling dat een doorsnee onderzoeker volgens dit protocol zonder problemen een operationele koeltrap in zijn laboratorium kan bouwen. Het gebruik van de koelfase volgens drie protocollen wordt getoond en elk protocol heeft voordelen voor verschillende experimenten. Ook wordt een voorbeeld van een koelprofiel van het podium getoond terwijl het zijn eindtemperatuur nadert en enkele nuttige tips voor het gebruik van koelimmobilisatie.
Hoge resolutie optische microscopie biedt een onmisbaar hulpmiddel voor het bestuderen van in vivo biologische structuren op subcellulair niveau. Veel biologische studies vereisen beeldvorming met submicronresolutie om subtiele anatomische details op te lossen, waaronder neuronmorfologie 1,2, membraanstructuur3,4 en eiwitlokalisatie 5,6. Een afbeelding met een hoge resolutie vereist een belichtingstijd van enkele milliseconden tot seconden, afhankelijk van de beeldmodaliteit en sonde 7,8. Om optimale resultaten te bereiken, is het essentieel om op microscopie gebaseerde experimenten zorgvuldig te plannen en uit te voeren. Cruciaal voor deze inspanning is een efficiënte dierbereidingsmethode die beeldvorming met hoge resolutie mogelijk maakt.
De nematode C. elegans is een veel gebruikt modelorganisme voor het bestuderen van vele biologische processen9. Dit kleine dier wordt meestal gekweekt op nematode groeimedium (NGM) agarplaten en ze planten zich snel voort door zelfbevruchting, waardoor ze zeer geschikt zijn voor grootschalige studies. Hun transparantie en een breed scala aan etiketteringstechnieken maken de eenvoudige visualisatie van hun interne anatomiemogelijk 10,11. De fijne structuren in C. elegans zijn ideaal voor het bestuderen van biologische processen op subcellulair niveau, zoals neuronregeneratie 12, neurondegeneratie13 en celdeling14. Dergelijke studies vereisen beeldvorming met submicronresolutie en immobilisatie van dieren die sterk genoeg is om beeldonscherpte te voorkomen. Sterke immobilisatie is vooral cruciaal voor technieken waarbij meerdere afbeeldingen in ruimte of tijd betrokken zijn, zoals 3D-beeldstapels (d.w.z. z-stacks) en time-lapse-beeldvorming. Elke beweging van dieren tussen de blootstellingen kan het resultaat verdoezelen. Voor C. elegans omvat sterke immobilisatie meestal handmatige manipulatie van individuele dieren en het monteren ervan op dia’s met een verdovingsmiddel15,16. Deze tijd- en arbeidsintensieve procedures maken grootschalige experimenten erg moeilijk. Een immobilisatiestrategie waarbij dieren direct en omkeerbaar worden geïmmobiliseerd op hun oorspronkelijke teeltplaten, zou beeldvorming met hoge doorvoer en hoge resolutie mogelijk kunnen maken.
Koelimmobilisatie van C. elegans is aangetoond in een paar studies, maar wordt niet op grote schaal gebruikt. Het wordt meestal gecombineerd met een microfluïdisch apparaat om dieren verder te beperken17,18,19. Microfluïdische apparaten zijn echter complex, vereisen een aanzienlijke operationele training en kunnen niet gemakkelijk worden geïntegreerd met typische vaste teeltworkflows van C. elegans-experimenten. Microfluïdica worden dus niet op grote schaal gebruikt voor immobilisatie van C. elegans. Hier gepresenteerd, in combinatie met de recente publicatie20 van het Chung Laboratory, is de introductie van een nieuwe koelimmobilisatiebenadering met behulp van een thermo-elektrische koeltrap (figuur 1) om deze tekortkomingen aan te pakken. Met de koelfase kan een typische 60 mm polystyreen teeltplaat worden afgekoeld tot elke doeltemperatuur (T-set) tussen -8 °C tot kamertemperatuur. Deze koelfasebenadering kan gemakkelijk en omkeerbaar een hele dierpopulatie immobiliseren met minimale gebruikersinspanning, waardoor 98% van de verwerkingstijd van dieren wordt geëlimineerd20.
Hieronder worden de procedures beschreven voor het helemaal opnieuw bouwen van een koelfase. Met uitzondering van het bewerken van onderdelen en 3D-printen, zal de hele procedure naar verwachting 4 uur duren zonder de vereiste van speciaal gereedschap of expertise. Vervolgens worden drie verschillende koelstrategieën met verschillende koelsnelheden en gebruikersinspanningen om C. elegans te immobiliseren op een typische rechtopstaande microscoop verder beschreven. De voorkeursstrategie kan afhankelijk zijn van de gebruikerstoepassing. De protocollen voor deze drie koelimmobilisatiestrategieën worden in detail beschreven.
De productie, assemblage en het gebruik van de koelfase worden in dit manuscript getoond. De meeste componenten zijn kant-en-klare items die online kunnen worden gekocht. Sommige componenten, zoals de koperen plaat en het saffiervenster, hebben een aangepaste bestelling nodig en kunnen tot 1 maand duren om te fabriceren. Andere componenten die 3D-geprint kunnen worden, zijn in de meeste onderzoeksinstellingen eenvoudig te fabriceren (aanvullende tabel 1). Het assemblageproces heeft slechts een paar gereedschappen nodig en kan snel worden gedaan door een niet-expert in een paar uur. De meeste biologische laboratoria zouden dit apparaat dus gemakkelijk moeten kunnen implementeren.
De koelfase en de koelimmobilisatiebenadering hebben verschillende belangrijke verbeteringen ten opzichte van bestaande immobilisatiemethoden, zorgvuldig beschreven in de oorspronkelijke publicatie20. Kortom, de koelfase maakt de sterke immobilisatie mogelijk van grote populaties C. elegans van alle leeftijden, inclusief embryo’s en dauers, op hun typische kweekplaten onder standaard microscopieworkflows. Het elimineert de noodzaak van complexe hardware-opstellingen, zoals microfluïdica, terwijl het een sterker immobilisatie-effect biedt. Bovendien minimaliseert het de mogelijke toxische chemische blootstelling aan dieren en onderzoekers, omdat er geen chemicaliën worden gebruikt, terwijl het een vergelijkbaar immobilisatie-effect biedt. Deze technische mogelijkheden maken de brede toepassing van dit apparaat en de aanpak van vele experimenten mogelijk die een hoge resolutie in vivo microscopie op grote aantallen dieren vereisen.
Er zijn enkele kritieke stappen tijdens het bouwen van het apparaat, waaronder alle toepassing van koelpasta en de brede tape om het saffiervenster aan de cooperplaat te bevestigen. De koelpasta zorgt voor een sterke thermische geleidbaarheid door openingen te vervangen door een materiaal met een lage thermische weerstand. Om de gewenste koelprestaties te bereiken, moet de pasta op de juiste manier worden ingebracht tussen alle abiterende / contactoppervlakken, inclusief het koude oppervlak van Peltier naar de koperplaat, het Peltier-hete oppervlak naar het koperen koelblok en de koperplaat naar het saffiervenster. De brede tape die op het podium is aangebracht, isoleert de koperen plaat om verwarming door lucht en condensatie te voorkomen, wat tot roest leidt. Het versterkt ook de verbinding tussen het saffiervenster en de koperplaat. Zowel het aanbrengen van koelpasta als de brede tape vereisen dus extra zorg.
In een echt koelimmobilisatie-experiment zijn de parameters in dit manuscript, zoals spanningen en tijden, afhankelijk van de specifieke eigenschappen van de teeltplaten en het stadium, zoals de hoeveelheid agar in de platen, de efficiëntie van het stadium en de omgevingstemperatuur en vochtigheid. In toekomstige wijzigingen kan een feedbackcontroller worden geïnstalleerd, zoals een proportioneel-integraal-derivaat (PID), om de spanningsingang actief aan te passen aan de koelfase om de gewenste temperatuur te bereiken en deze te stabiliseren.
Er zijn verschillende beperkingen van deze immobilisatie van de koelfase, zorgvuldig beschreven in de oorspronkelijke publicatie20. Kortom, dieren die bij verschillende temperaturen worden grootgebracht, worden in verschillende mate geïmmobiliseerd, wat mogelijk extra fine-tuning nodig heeft. Ook is deze huidige koeltrap niet ontworpen voor een omgekeerde microscoop. Verder kan beeldvorming of screening op een teeltplaat direct verontreiniging van de plaat veroorzaken.
We ontwerpen nieuwe versies van de koeltrap die geschikt zijn voor verschillende beeldvormingsplatforms, waaronder samengestelde rechtopstaande microscopen en omgekeerde microscopen. Deze nieuwe ontwerpen zullen directe immobilisatie van dierlijke koeling op kweekplaten mogelijk maken tijdens beeldvorming op deze platforms. De beeldvorming op deze koelfasen maakt gebruik van luchtonderdompelingsdoelstellingen op lange werkafstand, vergelijkbaar met de rechtopstaande configuratie. Tegenwoordig kunnen luchtonderdompelingsobjectieven een numeriek diafragma van maximaal 0,9 hebben, wat ongeveer een resolutie van 300 nm biedt voor beeldvorming van groene fluorescentie-eiwitten. De combinatie van een nieuwe koeltrap met een microscoop zou dus routinematig fluorescentiebeeldvorming met submicronresolutie mogelijk kunnen maken.
We geven ook enkele nuttige tips voor het gebruik van de koelfase volgens onze ervaring. Individuen moeten bijvoorbeeld controleren of er luchtbellen in de waterkoelingsassemblage zitten. Luchtbellen degraderen de koeling naar het hete oppervlak van Peltier en degraderen zo de koeleffectiviteit van de koelfase. Als er luchtbellen aanwezig zijn, moet de 12 V-voeding worden ingeschakeld om het water te laten stromen en moeten alle componenten van de waterstroom worden geschud. Luchtbellen kunnen uit ingesloten gebieden worden gespoeld en door de pomptank worden geventileerd. Onderzoekers moeten ervoor zorgen dat de waterstroombuizen niet worden gebogen of gekruist bij het monteren van de waterkoelingsassemblage. Het buigen of kruisen van buizen kan de adequate waterstroom voorkomen en de koelefficiëntie verminderen. Buisverbindingen moeten goed passen en strak zitten. Indien nodig kan in plaats daarvan een zachte buis met een andere diameter worden gebruikt om dichtheid te garanderen. Pasta mag niet worden aangebracht, zelfs als de verbinding niet strak genoeg is, omdat pasta bij toekomstig gebruik verstoppingen kan veroorzaken. De luchtvochtigheid in de ruimte beïnvloedt de koelprestaties en introduceert condensatie en ijs op de koelfase. Voordat u een kweekplaat op de koelfase plaatst, wordt aanbevolen om een papieren zakdoekje te gebruiken om condensatie te verwijderen of een koellichaam te gebruiken om snel ijs te verwijderen dat zich op het saffiervenster heeft gevormd. De pomptank en radiatorventilatoren kunnen kleine trillingen in de microscoop veroorzaken als ze op dezelfde tafel werken. Microscooptrillingen vertroebelen het verkregen beeld en moeten dus worden vermeden. Een kussen kan worden gebruikt om de tank en radiator mechanisch te isoleren, of ze kunnen op een aparte tafel in de buurt worden geplaatst. De koeltrap kan een verwarmingstrap worden door de elektrische aansluiting op de Peltier om te keren.
The authors have nothing to disclose.
We erkennen Noah Joseph (Northeastern Bioengineering Department) voor de bewerking van koperplaten.
12-V power supply | ANYTITI | ledpower00 | output DC 12V +/-0.5V, 5A power 60W |
8-32 screw | arbitrary | for bracket fixation | |
bracket | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
breadboard | DEYUE | 7545924028 | 400 pin solderless board kit for DIY electric connection |
copper cooling block | Kalolary | Kalolary-Heatsink001 | 40*40mm internal fin thickness 0.5mm |
copper plate | arbitrary | N/A | Machined from a 170x120x3 mm 99.9% pure copper sheet. See supplementary for 2D drawing for manufacturing. |
digital thermocouple thermometer | Proster | 4333090752 | dual channel thermometer with two K-type thermocouple probes measuring range -50-300°C accuracy ±1.5% resolution 0.1°C /°F < 1000° |
isolation base | N/A | N/A | 3D printed using 1.75mm PLA filament. See supplementary for 3D model. |
jumper wires | arbitrary | for electronic connection | |
multistage peltier | DigiKey | TEC1-12706 | thermoelectric cooling device size 40*40*7.05 mm Umax 16.1 V Imax 8.5 A ΔTmax @ Th 85°C @ 27°C Qmax @ Th 51.6W @ 27°C resistance 1.65 Ω |
Nalgene 50 Platinum-Cured Silicone Tubing | ThermoScientific | 14-176-332E | ultrasoft tube durometer hardness Shore A, 50 inner diameter 1/4 in outer diameter 9.5 mm |
packaging tape | arbitrary | 4 inch wide to cover the copper plate | |
pump tank | Yosoo | SC-300T | input power DC 12V flow rate 300L/h max |
radiator | DIYhzWater | 10463 | 12 pipe aluminum heat exchanger cooling water drain row with two 120mm fans |
sapphire window | Altos Photonics, Inc. | N/A | Contact Altos for custom order size Ø 80mm, 3mm thick surface quality 60-40s/d uncoated |
thermal paste | Corsair | XTM50 | reduce thermal impedance between surfaces thermal conductivity 5.0W/mK |
tunable power supply | Kungber | DY-SPS3010B | voltage range 0 – 30V current range 0 – 10A linear Power Supply with 4-Digits coarse and fine adjustments with alligator leads |