Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

Bas  B. Oude Munnink; David  F. Nieuwenhuijse; Reina  S. Sikkema; Marion Koopmans

doi:10.3791/60906

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Validación de la secuenciación de nanoporos del genoma completo, utilizando el virus Usutu como ejemplo

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Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

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Validación de la secuenciación de nanoporos del genoma completo, utilizando el virus Usutu como ejemplo

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05:45 min

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March 11, 2020

DOI:

10.3791/60906-v

DOI:

10.3791/60906-v

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05:45 min

March 11, 2020

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Bas B. Oude Munnink¹, David F. Nieuwenhuijse¹, Reina S. Sikkema¹, Marion Koopmans¹

¹ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Summary

Anteriormente validamos un protocolo para la secuenciación del virus Usutu (USUV) del genoma completo basado en amplificación en una plataforma de secuenciación de nanoporos. Aquí, describimos los métodos utilizados con más detalle y determinamos la tasa de error de la celda de flujo rincrónico R10.

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