Summary

Transmisyon elektron mikroskobu için retinal organoid örneklerinin hazırlanması

Published: June 07, 2024
doi:

Summary

Bu protokol, transmisyon elektron mikroskobu için retinal organoid numuneler için optimize edilmiş ve ayrıntılı bir hazırlık prosedürü sağlar. Olgun retinal organoidlerde sinapsların analizini içeren uygulamalar için uygundur.

Abstract

Retinal organoidler (RO’lar), belirli koşullar altında indüklenmiş pluripotent kök hücrelerden (iPSC’ler) farklılaşan insan retina özelliklerini taklit eden üç boyutlu bir kültür sistemidir. RO’larda sinaps gelişimi ve olgunlaşması immünositokimyasal ve fonksiyonel olarak incelenmiştir. Bununla birlikte, sinaptik temas üst yapısının doğrudan kanıtı, hem özel şerit sinapsları hem de geleneksel kimyasal sinapsları içeren sınırlıdır. Transmisyon elektron mikroskobu (TEM), insanlarda ve çeşitli türlerde retina gelişimini ve sinaps olgunlaşmasını aydınlatan yüksek çözünürlük ve saygın bir geçmiş ile karakterizedir. RO’lardaki sinaptik yapıyı keşfetmek için güçlü bir araçtır ve RO’ların araştırma alanında yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu nedenle, RO sinaptik kontaklarının yapısını nano ölçekte daha iyi keşfetmek ve yüksek kaliteli mikroskobik kanıtlar elde etmek için, basit ve tekrarlanabilir bir RO TEM numune hazırlama yöntemi geliştirdik. Bu belge, protokolü, kullanılan reaktifleri ve RO fiksasyon hazırlığı, fiksasyon sonrası, gömme ve görselleştirme dahil olmak üzere ayrıntılı adımları açıklamaktadır.

Introduction

İnsanlarda ve memelilerde hayati bir görsel duyu organı olan retina, nöron somalarını barındıran üç nükleer katman ve geleneksel sinapslarve özel şerit sinaps2,3 dahil olmak üzere sinaptik bağlantılar 1 tarafından oluşturulan iki pleksiform katman ile karakterize edilen belirgin bir lamine yapı sergiler. Şerit sinaps, vezikül uyarılarının kademeli bir şekilde iletilmesinde çok önemli bir rol oynar 2,3. Görme süreci, çeşitli nöron ve sinaps seviyeleri boyunca elektro-optik sinyal iletimini içerir ve sonuçta görsel kortekse 4,5 ulaşır.

Retinal organoidler (RO’lar), retina dokusunun fizyolojik durumlarını in vitro 1,6,7 taklit eden, indüklenmiş pluripotent kök hücrelerden (iPSC’ler) türetilen üç boyutlu (3D) bir kültür sistemini temsil eder. Bu yaklaşım, retina hastalıkları8, ilaç taraması9 ve retinitis pigmentosa10 ve glokom11 gibi geri dönüşümsüz retinal dejeneratif durumlar için potansiyel bir tedavi olarak hizmet etmek için umut vaat etmektedir. Güçlü bir in vitro optik iletim sistemi olarak, RO’lar içindeki sinaps, etkili sinyal dönüşümünü ve transferini kolaylaştıran çok önemli bir yapıdır5.

RO gelişimi, morfolojik özelliklerine ve moleküler ekspresyon profillerine göre kabaca üç aşamaya ayrılabilir 6,12. Evre 1’deki RO’lar (D21-D60 civarında), retinanın nöral progenitör hücrelerini, birçok retinal ganglion hücresini (RGC’ler) ve insan fetal gelişiminin ilk dönemine karşılık gelen birkaç yıldız patlaması amakrin hücresini (SAC’ler) içerir. Evre 2’de (D50-D150 civarında), RO’lar bazı fotoreseptör öncülerini, internöronları ve sinaptogenezle ilgili genleri eksprese eder, bu da bir geçiş aşamasını temsil eder. Fotoreseptörler, insan fetal gelişimininüçüncü aşamasına karşılık gelen evre 3 RO’larda (yaklaşık D100-D150’den sonra) olgunluk geliştirir 6,12,13. Özellikle, aşama 1 ve aşama 2’deki RO’larla karşılaştırıldığında, aşama 3’teki RO’lar, şerit sinapslarının14 varlığı da dahil olmak üzere, sinapslarıolgunlaşmış 12 belirgin bir lamel yapıya sahiptir. Ayrıca, yakın zamanda yapılan bir çalışma, olgun sinapsların ışık sinyallerinin iletimi için var olduğunu doğruladı ve bu da işlevsel olduklarını gösteriyor13. Bu nedenle, evre 3’teki RO’lar genellikle sinaptik yapıyı araştırmak için seçilir.

İmmünohistokimya, çeşitli moleküler proteinlerin ekspresyonunun incelenmesine yaygın olarak uygulanır. Bununla birlikte, optik mikroskobun sınırlaması, bir seferde yalnızca sınırlı sayıda spesifik hücre ve molekülü gözlemleme yeteneğinde yatmaktadır, bu da hücreler ve çevreleri arasındaki ilişkilerin kapsamlı bir analizinin olmamasına neden olmaktadır. Transmisyon Elektron Mikroskobu (TEM), ışık mikroskobunu ~ 10-20 kat15 aşan, 0.1-0.2 nm’lik sınırlı bir çözünürlüğe sahip yüksek çözünürlük ile karakterize edilir. Optik mikroskopinin kusurlarını telafi eder ve insanlarda 16,17 ve çeşitli türlerde 18,19,20,21 retina gelişimini ve sinaps olgunlaşmasını aydınlatmak için kullanılır. TEM, presinaptik ve postsinaptik bileşenlerin18,20 doğrudan ayırt edilmesini sağlar ve hatta şeritler 2,3, veziküller22 ve mitokondri 23 gibi hücre altı yapıların kapsamlı bir şekilde gözlemlenmesine izin verir. Bu nedenle TEM, sinaps türlerini tanımlamak ve RO’lardaki sinaptik kontakların üst yapısını nano ölçekte keşfetmek için önemli bir araçtır.

Yüksek kaliteli elektron mikrografları elde etmek için numune hazırlamanın büyük önem taşıdığına dikkat etmek çok önemlidir. Bazı çalışmalar RO12,13,24 üzerinde EM gerçekleştirmiş olsa da, ayrıntılı prosedürler belirsizdir. Elektron mikroskobu görüntüsünün kalitesi büyük ölçüde RO fiksasyonunun ve reaktif geçirgenliğinin etkisine bağlı olduğundan, hazırlık sırasında çeşitli önemli faktörlerin dikkate alınması gerekir. Sonuç olarak, RO’lardaki sinaptik temasları daha iyi araştırmak için, RO fiksasyonu, gömme ve gözlem bölgelerinin tanımlanmasının çalışma noktalarını gösteren iyi tekrarlanabilirliğe sahip bir yöntem sunuyoruz.

Protocol

1. iPSC’lerden RO elde etme25 NOT: RO’lar, daha önce bildirilen prosedür değiştirilerek iPSC’lerden türetilmiştir. Bakteriyel bir proteaz kullanarak iPSC’leri ~ birleşimde ayırın (bkz. Malzeme Tablosu). Kolonileri parçalara ayırın ve bir hücre kaldırıcı ile kazıyın. Toplandıktan sonra, hücre kümelerini 0.25 mL buz gibi soğuk Matrigel içinde …

Representative Results

iPSC farklılaşması yoluyla 3D RO’ların oluşturulması, retina hastalığı mekanizmalarını ve kök hücre replasman tedavisini incelemek için güçlü bir araç sağlar. Diğerleri RO’lardaki sinaptik bağlantıları fonksiyonel ve immünositokimyasal olarak göstermiş olsa da, konvansiyonel ve şerit sinapsların doğrudan kanıtları çok sınırlıdır. Burada, RO’larda TEM ile iki tip sinapsın üst yapısını araştırmak için bir yöntem sunuyoruz. 180 günlük kültürd…

Discussion

Bu yazıda, TEM ile RO’larda konvansiyonel ve şerit sinaptik üst yapının gözlemlenmesi için ayrıntılı bir protokol sunduk. Bu protokol, bazı modifikasyonlarla daha önce tarif edilen retina hazırlama yöntemlerine dayanmaktadır20. Numune işlemenin başarı oranını ve TEM mikrograflarının kalitesini artırmak için aşağıdaki önemli noktaları göz önünde bulundurun. İlk olarak, RO’ların iPSC’lerden geliştiğini ve vaskülatür<sup class="x…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Bu çalışma kısmen Çin Ulusal Anahtar Araştırma ve Geliştirme Programı (2022YFA1105503), Devlet Sinirbilim Anahtar Laboratuvarı (SKLN-202103) ve Çin Zhejiang Doğa Bilimleri Vakfı (Y21H120019), Çin Doğa Bilimleri Vakfı (82070981) tarafından sağlanan hibelerle desteklenmiştir.

Materials

100 mm Petri dish Corning 430167
Acetone Electron Microscopy Science 10000
B27 supplement Gibco A3582801
Cell lifter Santa Cruz sc-395251
Copper grids Beijing Zhongjingkeyi Technology Co., Ltd. AZH400HH
DigitalMicrograph Software Gatan, Inc. Software
Dispase StemCell Technologies #07913 Bacterial protease
DMEM/F12 medium Gibco #11320033
Embedding mold Beijing Zhongjingkeyi Technology Co., Ltd. GZ10592
Epon-812 resin Electron Microscopy Science #14900
Fetal Bovine Serum (FBS) Biological Industries #04-0021A
Glutaraldehyde Electron Microscopy Science 16020
hiPSC Shownin Biotechnology Co. Ltd. RC01001-A
Lead citrate Beijing Zhongjingkeyi Technology Co., Ltd. GZ02618
L-GlutaMax Life Technologies #35050061 L-glutamine substitute
Matrigel Corning 356234
Microscope slide CITOTEST 80312-3161
N2 supplement Gibco 17502048
Na2HPO4· 12H2O Sigma 71650 A component of PB/PBS
NaH2PO4· H2O Sigma 71507 A component of PB/PBS
Non-essential amino acids Sigma #M7145
Optical microscope Lab Binocular Biological Microscope Xsz-107bnii
OsO4 TED PELLA 4008-160501
Oven Bluepard BPG9040A
Paraformaldehyde Electron Microscopy Science 157-8
Penicillin-Streptomycin Gibco #15140-122
Semi/ultrathin microtome Reichert-Jung 396649
Taurine Sigma #T0625
Toluidine blue Sangon Biotech E670105-0100
Transmission Electron Microscopes HITACHI H-7500
Uranyl acetate TED PELLA CA96049
β-mercaptoethanol Sigma 444203

References

  1. Andreazzoli, M., Barravecchia, I., De Cesari, C., Angeloni, D., Demontis, G. C. Inducible pluripotent stem cells to model and treat inherited degenerative diseases of the outer retina: 3d-organoids limitations and bioengineering solutions. Cells. 10 (9), 2489 (2021).
  2. Moser, T., Grabner, C. P., Schmitz, F. Sensory processing at ribbon synapses in the retina and the cochlea. Physiol Rev. 100 (1), 103-144 (2020).
  3. Tom Dieck, S., Brandstätter, J. H. Ribbon synapses of the retina. Cell Tissue Res. 326 (2), 339-346 (2006).
  4. Kolb, H., Fernandez, E., Nelson, R. . Webvision: The organization of the retina and visual. , (1995).
  5. Soto, F., Zhao, L., Kerschensteiner, D. Synapse maintenance and restoration in the retina by ngl2. Elife. 7, e30388 (2018).
  6. Kruczek, K., Swaroop, A. Pluripotent stem cell-derived retinal organoids for disease modeling and development of therapies. Stem Cells. 38 (10), 1206-1215 (2020).
  7. O’Hara-Wright, M., Gonzalez-Cordero, A. Retinal organoids: A window into human retinal development. Development. 147 (24), (2020).
  8. Norrie, J. L., et al. Retinoblastoma from human stem cell-derived retinal organoids. Nat Commun. 12 (1), 4535 (2021).
  9. Luni, C., Serena, E., Elvassore, N. Human-on-chip for therapy development and fundamental science. Curr Opin Biotechnol. 25, 45-50 (2014).
  10. Chahine Karam, F., et al. Human ipsc-derived retinal organoids and retinal pigment epithelium for novel intronic rpgr variant assessment for therapy suitability. J Pers Med. 12 (3), 502 (2022).
  11. Lo, J., et al. Therapeutic strategies for glaucoma and optic neuropathies. Mol Aspects Med. 94, 101219 (2023).
  12. Capowski, E. E., et al. Reproducibility and staging of 3d human retinal organoids across multiple pluripotent stem cell lines. Development. 146 (1), 171686 (2019).
  13. Cowan, C. S., et al. Cell types of the human retina and its organoids at single-cell resolution. Cell. 182 (6), 1623-1640 (2020).
  14. Cora, V., et al. A cleared view on retinal organoids. Cells. 8 (5), 391 (2019).
  15. Żak, A. M. Light-induced in situ transmission electron microscopy─development, challenges, and perspectives. Nano Lett. 22 (23), 9219-9226 (2022).
  16. Tschulakow, A. V., Oltrup, T., Bende, T., Schmelzle, S., Schraermeyer, U. The anatomy of the foveola reinvestigated. PeerJ. 6, e4482 (2018).
  17. Syrbe, S., et al. Müller glial cells of the primate foveola: An electron microscopical study. Exp Eye Res. 167, 110-117 (2018).
  18. Xiao, J., et al. Rod bipolar cells receive cone photoreceptor inputs through both invaginating synapses and flat contacts in the mouse and guinea pig retinas. J Comp Neurol. 531 (11), 1184-1197 (2023).
  19. Liu, X., et al. Retinal degeneration in rpgra mutant zebrafish. Front Cell Dev Biol. 11, 1169941 (2023).
  20. Yang, Q., et al. Expression of α-synuclein in the mouse retina is confined to inhibitory presynaptic elements. J Comp Neurol. 531 (10), 1057-1079 (2023).
  21. Zhang, J., et al. Early degeneration of photoreceptor synapse in ccl2/cx3cr1-deficient mice on crb1(rd8) background. Synapse. 67 (8), 515-531 (2013).
  22. De Robertis, E., Franchi, C. M. Electron microscope observations on synaptic vesicles in synapses of the retinal rods and cones. J Biophys Biochem Cytol. 2 (3), 307-318 (1956).
  23. Frey, T. G., Mannella, C. A. The internal structure of mitochondria. Trends Biochem Sci. 25 (7), 319-324 (2000).
  24. Gonzalez-Cordero, A., et al. Recapitulation of human retinal development from human pluripotent stem cells generates transplantable populations of cone photoreceptors. Stem Cell Reports. 9 (3), 820-837 (2017).
  25. Gao, M. L., et al. Patient-specific retinal organoids recapitulate disease features of late-onset retinitis pigmentosa. Front Cell Dev Biol. 8, 128 (2020).
  26. Afanasyeva, T. a. V., et al. A look into retinal organoids: Methods, analytical techniques, and applications. Cell Mol Life Sci. 78 (19-20), 6505-6532 (2021).

Play Video

Cite This Article
Liu, X., Rao, B., Lin, Q., Gao, M., Zhang, J. Preparing Retinal Organoid Samples for Transmission Electron Microscopy. J. Vis. Exp. (208), e66590, doi:10.3791/66590 (2024).

View Video