Descriviamo un mezzo di protocollo per hPSCs, utilizzando definito di differenziazione 3D semplificato e ridotto di fattori di crescita, in grado di generare aggregati cellulari con prime neuroepithelial strutture e positive per marcatori cerebellare-collegata, come pure un optional Modifica 2D per differenziazione delle cellule come un monostrato per generare neuroni funzionali.
Ridurre la complessità e il costo dei protocolli di differenziazione è importante per i ricercatori. Questo interesse si adatta con le preoccupazioni circa possibili effetti non intenzionali che fattori estrinseci patterning potrebbero introdurre in cellule staminali pluripotenti umane (hPSC) modelli di sviluppo del cervello o di patofisiologia, come mascheramento fenotipo della malattia. Qui, presentiamo due protocolli di differenziazione cerebellare per hPSCs, progettato con metodo di avvio più semplice, meno fattori di patterning e meno richieste di materiale rispetto ai protocolli precedenti. Recentemente, abbiamo sviluppato procedure di cultura, che generano digalleggiante 3-dimensionale (3D) prodotti coerenti con altri protocolli di “organoid” del cervello, tra cui morfologie rilevanti per lo sviluppo del cervello come sub/ventricolare zona – di modellazione e rombiche labbro-come le strutture. La seconda utilizzata una routine monostrato aderente, 2D alla completa differenziazione, che si è dimostrata in grado di generare neuroni cerebellari funzionali, come prodotti sono positivi per gli indicatori cerebellare-collegata ed esibiscono gli afflussi del neurone-come calcio. Insieme, questi protocolli offrono gli scienziati una scelta di opzioni adatte a scopi di ricerca differenti, come pure un modello base per testare altri tipi di differenziazioni neurale semplificate.
Protocolli in vitro per la differenziazione hPSCs verso cerebellare lignaggi inizialmente operato sul principio di che imita in vivo sviluppo cerebellare1,2,3,4. Come tali, hanno richiesto una serie di fattori a qualcuno di presentarti a orari specifici per guidare la maturazione e pro-cerebellare patterning. Primo fra questi erano WNT, bone morphogenetic proteins (BMPs) e fattori di crescita del fibroblasto (FGFs) con ruoli noti Mid-hindbrain sviluppo e formazione di isthmic organizzatore5,6,7. Naturalmente, ogni ulteriore passaggio e fattore significa un aumento in manipolazioni alta intensità di lavoro e una maggiore spesa per il ricercatore, e così lo sviluppo di protocolli più semplici in grado di raggiungere risultati uguali è di interesse. Questo problema pratico ben combacia con la domanda ipotetica, se le cellule richiedono tale controllo stretto, esterno sul loro sviluppo in vitro.
Per differenziazione cerebellare, un protocollo pubblicato nel 2015 ha affrontato la necessità di utilizzare un vasto numero di fattori di crescita utilizzando solo FGF2, FGF19 e fattore di cellula-derivato stromal 1 (SDF1) per patterning fini8. Questo studio inoltre hanno differito da precedenti protocolli cerebellare, utilizzando un sistema di coltura 3D digalleggiante. Oltre a produrre cellule positive per marcatori cerebellare, il cervello “organoids” generato dalla loro tecnica sono stati indicati per esibire morfologia pertinente, non disponibile in colture monostrato 2D tradizionale, quali rombiche labbro-come le strutture. Anche se meno complesso e costoso riguardo ai fattori di crescita, altre caratteristiche quali la formazione di corpi embryoid uniformi (EBs) e cultura in piastre da 96 pozzetti (96WPs), rendeva proceduralmente complessa durante i primi passi. Un altro protocollo 3D pubblicato lo stesso anno, segnalato successo differenziazione neurale lignaggi utilizzando cella comune e poco costoso cultura tecniche9. Anche se questo gruppo stava indagando corticale piuttosto che di differenziazione cerebellare, applicazione del loro concetto di differenziazione cerebellare potrebbe non essere scontato.
Recentemente abbiamo segnalato un protocollo di differenziazione cerebellare 3D utilizzando un ridotto numero di fattori di campitura (vale a dire, FGF2, 4 e 8), così come una configurazione semplificata mantenendo le cellule in piastre da 6 pozzetti (6WPs) tutto il tempo per ridurre al minimo i requisiti medi10. Per facilitare la produzione di cellule del granello, levigato agonista (SAG) è stato utilizzato durante la fase di maturazione finale. L’abbassamento è un’alternativa meno costosa di chimica di sonic hedgehog (SHH), che era stato usato in precedenza cerebellare protocolli, dovuto il relativo ruolo nel promuovere la crescita dei granuli delle cellule precursori (GCPs) in vivo1,2, 11,12,13. Prodotti di differenziazione erano costanti con quelli di altri protocolli 3D, compresa la presenza di marcatori cerebellare-collegata in strutture morfologicamente competenti8,9. Tali risultati rafforzano il messaggio precedente che dettagliate mimetismo di nella vivo ambiente potrebbe non essere necessario per i protocolli complessi 3D in vitro di differenziazione.
Oltre al protocollo 3D, questo rapporto descrive un protocollo 2D, progettato con la stessa configurazione rapida, materiali di base e ridotto numero di fattori di crescita. È in grado di produrre cellule staminali embrionali umane (hESC) o indotta da cellule staminali pluripotenti (hiPSCs), positivo per gli indicatori associati all’inizio neurale, cerebellare e identità delle cellule del granello. Inoltre, la formazione immagine del calcio indica la presenza di neuroni umani funzionali. La possibilità di scegliere tra protocolli, aggiunge un livello di flessibilità per i ricercatori, per coloro che sono interessati in entrambi: (1) generazione cellulari specifici tipi, lo sviluppo del cervello umano (2) modellazione e strutture, (3) analisi ottimizzato nello strato monomolecolare associate le impostazioni (ad es., registrazioni di patch-clamp), o (4) interazioni cellula-cellula in colture miste neurale. Loro natura semplice e a basso costo li rende accessibili per i ricercatori che sono nuovi al campo hPSC, o hanno bisogno di procedure di hPSC base da cui partire per esplorare ulteriormente le opzioni di differenziazione.
Complessità e i costi sono fattori rilevanti per ricercatori sulle cellule staminali quando scegliendo o lo sviluppo di protocolli di differenziazione. Ciò è particolarmente vero in quanto è una questione aperta di quanto controllo esterno è necessaria per generare tipi di cella desiderata, o — porre in modo diverso — come hPSCs competenti sono a produrre il proprio ambiente di sviluppo, se lasciati a se stessi con sufficiente sostanze nutrienti. Introduzione di fattori estrinseci in vitro può produrre molto bene i prodotti cella desiderata, ma potrebbe anche interferire con la capacità inerente allo sviluppo intrinseco avrebbero esibito cellule in vivo. Tali considerazioni sono importanti, soprattutto se l’obiettivo è uso di iPSCs derivate dal paziente per la modellazione di malattia. Ampio uso di campitura e/o fattori di crescita potrebbe mascherare fenotipi di malattia. I protocolli dettagliati in questo rapporto seguono l’andamento degli studi precedenti per ridurre la complessità, costo e/o utilizzo di fattori estrinseci patterning8,9.
Basato su risultati riportati da Muguruma et al., nostro recente studio, sembra che è possibile raggiungere la differenziazione verso destini cerebellare senza sforzi concertati per riprodurre condizioni in vivo , come hanno fatto gli studi più iniziali 1 , 2 , 3 , 4 , 8 , 10. la parte intrigante è che i due studi usato diversi insiemi di fattori di crescita, suggerendo che né insieme era necessarie, anche se entrambi utilizzati FGF2. Abbiamo fatto gli esami aggiuntivi, dove sono stati selettivamente escluso dal protocollo FGFs e ha mostrato che le cellule erano in grado di generare gli stessi prodotti senza estrinseca FGFs10. Differenze tra i nostri studi sono state qualificate dal fatto che abbiamo usato hPSC diverse linee e i metodi di coltura, ha indotto la differenziazione neurale con RA e incluso componenti per supportare la sopravvivenza delle cellule del granello e maturazione (BDNF, GDNF, SAG e KCL)11 –14. Inoltre, è stato impiegato un metodo di avvio meno complesso, rispetto al Muguruma et al.. Il protocollo ha cominciato generando EBs uniforme di 96WPs, che li isolati fisicamente e chimicamente da altro. Il protocollo qui aveva tutti i PSC relativamente affollati insieme in 6WPs durante la formazione di EB, che ha permesso loro di interagire liberamente. Come questo può differenzialmente influenzato l’ambiente fisico e chimico di EBs e successive organoids (compresa la produzione intrinseca di composti di segnalazione) è sconosciuto e potrebbe essere esplorato. Inoltre, mentre ci mostrano l’espressione di geni associati con — e così suggestivo di — origine cerebellare, situato all’interno di strutture morfologicamente simili a quelli riportati da Muguruma et al., non possiamo escludere la generazione di un neurone-come strutture che sono di identità non-cerebellare. Gli studi futuri, utilizzando un grande pannello di anticorpi simili a quelli riportati da Muguruma et al. (cioè, ATOH1, CALB, ecc.) renderebbe tali assegnazioni e confronto tra prodotti di entrambi i protocolli, più conclusivi.
All’interno del protocollo 3D, è importante per cominciare e mantenere un numero sufficiente di cellule in coltura per assicurare un numero sufficiente di prodotti finiti per l’analisi. Data la significativa diminuzione presto nel protocollo, si consiglia di iniziare con più di 500 EBs/pozzetto durante i primi 3 giorni nella cultura (Figura 1). Questo non dovrebbe essere difficile da realizzare dato Colonia dimensioni per hPSCs nella cultura senza alimentatore, ma potrebbe non essere così facile per chi utilizza ancora metodi di alimentatore-dipendente. Dato il gran numero di celle, è importante da guardare per cambiamento di colore nel mezzo (che indica le variazioni del pH) e accumulo di cellule morte. Entrambi devono essere corretti per prevenire il collasso della cultura. Ci possono essere anche agglutinamento delle cellule e degli aggregati in strutture massicce. Anche se si potrebbero ancora aggregati che possono essere analizzati, quantità di prodotto sarà notevolmente ridotto, così li rompere in piccoli aggregati con delicata triturazione può essere utile. Tuttavia, evitare di inquietanti aggregati normali, che a loro volta possono crescere fino a grandi dimensioni (Figura 4). Se gli aggregati diventano troppo radi, si consiglia di combinare pozzi, in modo che gli aggregati non sono completamente isolati. Variabilità del prodotto (in numero, dimensioni e morfologia) è un problema ben noto nella coltura cellulare 3D, tra cui per tali protocolli a partire con passaggi formazione EB isolati, uniforme, suggerendo che una procedura di avvio meno complessa (ad esempio il protocollo descritto qui ) potrebbe essere più pratico8,15. Mentre questa eterogeneità è qualcosa che i ricercatori devono tenere a mente, in particolare durante l’analisi, il protocollo ha segnalato generato prodotti coerenti con quelli trovati in altri protocolli 3D8,9,15. Base alle dimensioni e morfologia, cadono all’interno della gamma di Rosetta neurale a organoid cerebrale, come descritto in una recente revisione di Kelava e Lancaster15, con la maggior parte la classificazione della sferoide di montaggio. Particolarmente degno di nota, sono indicativi di rosette neurale con lume, zone ventricolare (sub) e rombico-labbro come caratteristiche la presenza di strutture 3D (Figura 5 e Figura 6) come identificato da altri gruppi di8 , 15 , 16 , 17. dal momento che ogni esperimento produsse almeno una aggregazione con presunti VZ/SVZs e cerebellare-collegata marcatori (ZIC1, KIRREL2), quelli sono utili criteri per determinare il successo di una differenziazione 3D utilizzando il nostro protocollo, con RL-come funzionalità che fornisce ulteriore supporto. Estendere la lunghezza della cultura ultimi 35 giorni non è stato testato, ma potrebbe essere perseguito per determinare il limite massimo di crescita, complessità e maturità consentito da questa tecnica.
Il protocollo 2D utilizza la stessa formazione di EB non aderente e il processo di induzione neurale come il protocollo 3D e così le osservazioni di cui sopra si applicano anche. Una volta placcato, dovrebbe essere considerato un diverso insieme di considerazioni. L’EBs dovrebbe aderire in fretta per cellule di proliferare verso l’esterno sulla piastra. Se ci sono problemi con aderenza, aggiunta di RI (se non già utilizzato), ridotto volume di terreno, o possono essere applicate modifiche sperimentali nella concentrazione di PLO/LAM. È importante mantenere le cellule dalla crescita troppo denso o troppo radi (preferibilmente coltivati tra 20-80% confluency) nei pozzetti; monitoraggio quotidiano e tempestivo passaggio è importante, per evitare over-confluenza o galleggiante celle. A differenza del protocollo 3D, non dovrebbero esserci diminuzione significativa durante la coltura, anche se ci possono essere zone di scarsa crescita, o un rallentamento del tasso di proliferazione. Passaggio influisce sullo stato di maturazione delle cellule (ad esempio, rimuovere i processi delle cellule e reti sviluppate fra le cellule) e dovrebbe essere tenuto presente quando si avvicina punti dove le cellule verranno raccolti o analizzate in qualche modo. Ad esempio, per calcio imaging è molto importante per le cellule di passaggio tra 2-6 giorni prima dell’analisi. Passaggio troppo vicino alla analisi potrebbero significare le cellule non hanno avuto tempo per la connessione e/o matura e troppo lontano può provocare cellule sovraffollamento, rendendo difficile la formazione immagine. Sebbene esista variabilità fra gli esperimenti, i risultati sono coerenti con quelli segnalati in iniziale 2D protocolli cerebellare1,2. Analisi di espressione di macchiatura e gene ICC confermano la presenza di cellule positive per indicatore delle cellule del granello ZIC1, identificando anche gli indicatori connessi con altre identità neurale e cerebellare (Figura 7 e Figura 8). La formazione immagine del calcio, che coinvolge la stimolazione elettrica delle cellule incubate con tintura di fluor5, indicata attività neuronale funzionale (Figura 9, supplementare nella figura 1e supplementare nella figura 2), anche se non è confermato se questi erano cellule del granello. Si può sostenere che dando le cellule più tempo per maturare, estendendo la lunghezza della cultura ultimi 35 giorni, dovrebbe aumentare la quantità di attività neuronale funzionale. Questo potenziale potrebbe essere esplorato in futuro.
Oltre le linee di ricerca suggerito sopra, sarebbe di interesse determinare differenze di identità di prodotto (quantità e qualità) tra i protocolli di 2D e 3D. L’importanza di FGFs estrinseca non è stato testato nel protocollo 2D, e sarebbe utile sapere se la mancanza di struttura 3D dopo il placcaggio, e così le vie di segnalazione associate, renderebbe la 2D culture più o meno dipendente da quelli presto patterning composti. Ulteriori protocolli Stripped-Down (ad es., no RA, BDNF, SAG) sono ugualmente plausibile linee per ulteriori indagini. Infine, gli studi futuri possono beneficiare di nuovi strumenti di ricerca per meglio caratterizzare (e valutare l’efficienza di generazione) umani specifici sottotipi neuronali cerebellare.
Con i dato avvertimenti in mente, entrambi segnalati protocolli possono essere utilizzati per differenziazioni cerebellare, con prodotti adatti a scopi diversi. Possono servire come punti di partenza pratici per ricercatori che intraprendono studi pilota, test di vitalità delle linee cellulari per tali differenziazioni, o come un modello di base per altri tipi di differenziazione neurale mirato.
The authors have nothing to disclose.
Siamo grati a Gerbren Jacobs e Jurjen Broeke per loro assistenza di tecnico esperti, di Prisca Leferink per contribuire alla generazione e alla caratterizzazione delle due linee di controllo iPSC e Lisa Gasparotto per dimostrare le nostre procedure.
DMEM/F12+Glutamax | Gibco | 31331-028 | glutamine fortified DMEM/F12 |
Neurobasal medium | Gibco | 21103-049 | neural basic medium |
N2 supplement | Gibco | 17502-048 | |
B27 supplement | Gibco | 17504001 | |
Insulin | Imgen | PT468-B | |
L-glutamine | Gibco | 25030-024 | |
Non-essential Amino Acids (NEAA) | Gibco | 11140-035 | |
beta-mercaptoethanol | Gibco | 21985-023 | |
Poly-L-Ornithine | Sigma | P3655 | |
Poly (2-hydroxyethyl methacrylate) | Sigma | P3932 | aka Poly-Hema |
Laminin | Sigma | L2020 | |
E8 medium and supplement | Gibco | A1517001 | hPSC medium and supplement |
Penicillin/Streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
Sodium Chloride | Sigma | S-5886 | |
y-27632 (ROCK inhibitor) | SelleckChem | S1049-10mg | |
DMSO | Sigma | D-2650 | |
Geltrex | Gibco | A1413302 | hPSC-appropriate adherent coating (PAAC) |
0,5M EDTA | Gibco | 15575-020 | |
0.2 um filter | VWR | 28145-77 | |
1.5 mL Eppendorf tube | VWR | 525-0130 | |
DMEM/F12 | Gibco | 21331-020 | |
Ethanol | VWR | 83804360 | |
Parafilm | Sigma | PM996 | wrap for culture plates |
cryotubes | ThermoFisher | 368632 | |
TrypLE | Gibco | 12563-029 | trypsin-based dissociation agent |
Defined Trypsin Inhibitor (DTI) | Gibco | R-007-100 | |
FGF-2 | Peprotech | 100-18B | |
FGF-4 | R&D Systems | 100-31 | |
FGF-8B | Peprotech | 100-25 | |
Retinoic Acid | Sigma | R2625 | |
Brain Derived Neurotrophic Factor | Peprotech | 450-02 | |
Glial Derived Neurotrophic Factor | Peprotech | 450-10 | |
Potassium Chloride | Sigma | P5405 | |
Neurotrophic Factor 3 | Peprotech | 450-03 | |
Smoothened Agonist (SAG) | Cayman | 11914 | CAS 912545-86-9 |
Axiovert 40C microscope | Zeiss | Brightfield imaging microscope | |
Axiocam | Zeiss | Brightfield imaging – image aquisition | |
Eppendorf Centrifuge 5810 | Eppendorf | 521-0996 | centrifuge for cell culture |
PBS (gebufferde natrium oplossing) | Braun Medical | 3623140 | |
5 ml Serological pipets | VWR | 612-4950 | |
10 ml Serological pipets | VWR | 612-4951 | |
6-wells culture plates | VWR | 734-2323 | |
12-wells culture plates | VWR | 734-2324 | |
hESCs | WiCELL | line H01 |