وتقدم مجموعة من التقنيات المختلفة لتعظيم جمع البيانات من الأنسجة الماوس.
تجاوز وظيفة جينة واحدة لقطع أعمق في شبكات الجينات التنظيمية يتطلب تحولات متعددة مجتمعة في حيوان واحد. مثل هذا التحليل من اثنين أو أكثر من الجينات تحتاج إلى أن تستكمل مع التهجين في الموضع الطبيعي للجينات أخرى ، أو من البروتينات المناعية الخاصة بهم ، سواء في أجهزة محمولة كلها النامية أو أقسام لتحليل مفصل للتعديلات التعبير الخلوية والأنسجة. الجمع بين عدة جينات التعديلات يتطلب استخدام لجنة المساواة العرقية أو لحذف flipase مشروط الجينات وتجنب الفتك الجنينية. المخططات المطلوبة تربية تعزز على نحو مثير الجهد والتكاليف بما يتناسب مع عدد من الجينات المتحولة ، مع نتائج قليلة جدا من الحيوانات مع ذخيرة كاملة من التعديلات الوراثية المطلوبة. إطفاء الكم الهائل من الجهد والوقت للحصول على هذه العينات القليلة الثمينة التي تحمل طفرات متعددة يتطلب التحسين الأنسجة. وعلاوة على ذلك ، والتحقيق في حيوان واحد مع تقنيات متعددة يجعل من السهل ربط عيوب الجينات الحذف مع التشكيلات التعبير. قمنا بتطوير تقنية للحصول على مزيد من التحليل الدقيق لحيوان معين ، مع القدرة على تحليل العديد من مختلف هياكل معترف بها تشريحيا وكذلك الجينات والبروتينات التعبير عن نفسه من العينة في كل من الأجهزة كلها صحيحة والمقاطع. على الرغم من أن الفئران قد استخدمت للتدليل على فعالية هذه التقنية يمكن تطبيقها على مجموعة واسعة من الحيوانات. للقيام بذلك جمعنا محبة للدهون صبغ تتبع جبل بأكمله في الموقع التهجين ، المناعية ، والأنسجة لاستخراج أقصى كمية ممكنة من البيانات.
في هذا الفيديو ، ونحن يبرهن على وجود طريقة لدمج أربع تقنيات من أجل تحقيق أقصى قدر من التماسك وجمع البيانات عن طريق الربط بين البيانات داخل حيوان معين (الشكل 3). هذا النهج سوف تقلل من كمية تربية ، وبالتالي الوقت اللازم للحصول على بيانات للنشر وتحسين المعلومات حول توطين المشترك والآثار المترابطة من المسوخ. وعلى الرغم من واستخدمت الفئران الجنينية في هذه الفأرة والفيديو الكبار وكذلك الحيوانات الأخرى مثل الدجاج ، والضفدع ، والزرد يتم تحليلها باستخدام هذه التقنيات كذلك. عند استخدام أنواع أخرى قد بروتيناز ك الهضم تحتاج إلى تغييرها. هنا نستخدم الأصباغ المختلفة NeuroVue الاستشعاع لتسمية تحديدا ما يصل إلى ثلاثة من السكان العصبية الفائدة. الاستفادة من هذه الأصباغ هي التي يمكن استخدامها في فئرانا معدلة وراثيا ، والتي قد تكون مشكلة عند الاعتماد فقط على المناعية التي قد تكون أو لا تكون المتضررة من الطفرات التي سيتم تحليلها ، وأنها تسمية الخلايا العصبية وretrogradely anterogradely 5. وزاد أيضا دراسة حديثة أن عدد السكان الخلايا العصبية التي يمكن أن توصف في وقت واحد الى ستة 2. بعد ذلك ، ثم صباغة النسيج محبة للدهون تتبع نفس الفائدة يتم تحليلها باستخدام التهجين في الموقع ، لتحليل الجينات والاستنساخ ويمكن تحليلها في وقت لاحق باستخدام المناعية للتوزيع البروتين. ويمكن استكمال التحليل الأخير الأنسجة التفصيلية التي يمكن أن تضاف إلى توصيف النمط الظاهري 6. هذا التحليل متعدد العوامل لديه القدرة على اكتساب رؤى جديدة من خلال تحليل المتلازم ضمن نفس الحيوان التي يمكن أن يكون الأمر خلاف ذلك واردا ، أو على الأقل في حاجة إلى مزيد من البروتوكولات واسعة وخصبة الماوس.
The authors have nothing to disclose.
تم الحصول على الصور مبائر في جامعة ولاية ايوا كارفر مركز التصوير. وقدمت وقدمت التمويل عن طريق منح SBIR (MH079805) لدعم BF إضافية لتربية الفئران لهذا المشروع من قبل NIDCD (5R01DC00559007) لBF
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
in situ Hybridization: | ||||
PC DIG wash + block buffer set | Roche | 1585762 | ||
Premix 20x SSC Buffer | Roche | 1666681 | ||
Proteinase K 20mg/ml | Ambion | AM2546 | ||
Diethyl Pyrocorbonate (DEPC) | RPI | D43060 | ||
Formamide | Sigma | F9037 | ||
Dextran Sulfate | RPI | D20020 | ||
BM Purple | Roche | 11442074001 | ||
Anti-Dig-AP Fab fragments | Roche | 11093274910 | ||
RNase A enzyme 10mg/ml | Fermentas | EN0531 | ||
RNase Away | RPI | 7003 | ||
Salmon Sperm DNA 10mg/ml | Invitrogen | 15632-011 | ||
Stericup Filter Unit 0.22μm; 500ml | Millipore | SCGVU05RE | ||
Filter Discs 0.2μm; 25mm | Whatman | 6780-2502 | ||
Phosphate buffered saline PH 7.4 packets | Sigma | P-5368 | ||
Immunohistochemistry: | ||||
Goat Serum | Sigma | G9023 | ||
Triton X-100 | Sigma | T8532 | ||
Hoechst Dye | Polysciences Inc. | 9460 | ||
Histology: | ||||
Poly/Bed 812 Embedding Media/DMP-30 Kit | Polysciences Inc. | 08792-1 | ||
Propylene oxide | Sigma | 110205 | ||
Gluteraldehyde Solution 50% | Fisher | G151 | ||
DPX Mountant | Fluka | 44581 | ||
Rocker | MidSci | 55D1114 | ||
Heat Block | Fisher | 11-715-125D | ||
Rotator | Thermo | 400110Q | ||
Incubator set to 60° | Fisher | 11-690-625D | ||
Dye tracing: | ||||
Microscissors | Geuder | G-19775 | ||
Fine Forceps | E.M.S | 72680-F | ||
NeuroVue dye: Maroon, Red, Jade | MTTI | FS-100(1,2,6) | ||
1X phosphate buffered saline (PBS) | Sigma | P-5368 | ||
Dissecting scope | Leica | M205 FA | ||
Incubator set to 36° | Fisher | 11-690-506DQ | ||
Confocal Microscope | Leica | LSM 510 | ||
Slides | Surgipath | 00240 | ||
Coverslips | Surgipath | 00106 | ||
RPI | Glycerol | G22025-0.5 | ||
Paraformaldehyde (4% and 0.4%) | Fisher | T353-500 |