この原稿では、最適化されたヘパリンベースのアフィニティークロマトグラフィー法を使用して、アデノ随伴ウイルスベクターを生成および精製するための詳細なプロトコルについて説明します。シンプルでスケーラブル、かつ費用対効果の高いアプローチを提供し、超遠心分離の必要性を排除します。得られたベクターは、高い純度と生物学的活性を示し、前臨床試験でその価値を証明しています。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、 in vivo 遺伝子送達のベクターとしてますます価値が高まっており、現在、ヒトでの臨床試験が行われています。ただし、AAVを精製するために一般的に使用される方法は、塩化セシウムまたはヨージキサノール密度勾配超遠心分離を利用します。これらの分析法は、その利点にもかかわらず、時間がかかり、拡張性に限界があり、多くの場合、純度の低いベクターになります。これらの制約を克服するために、研究者はクロマトグラフィー技術に注意を向けています。ここでは、AAVの精製のための普遍的な捕捉ステップとして機能する最適化されたヘパリンベースのアフィニティークロマトグラフィープロトコルを紹介します。
この方法は、ヘパラン硫酸プロテオグリカンに対するAAV血清型2(AAV2)の固有の親和性に依存しています。具体的には、プロトコルは、所望のAAVキャプシドタンパク質をコードするプラスミドとAAV2のものとの同時トランスフェクションを伴い、両方の親血清型の特性を兼ね備えたモザイクAAVベクターを生じる。簡単に言うと、生産者細胞の溶解後、AAV粒子を含む混合物を、標準的な高速タンパク質液体クロマトグラフィー(FPLC)システムを使用して最適化されたシングルステップヘパリンアフィニティークロマトグラフィープロトコルに従って直接精製します。精製されたAAV粒子は、その後濃縮され、純度と生物活性の観点から包括的な特性評価を受けます。このプロトコルは、超遠心分離やグラジエントを必要とせずに実行できるシンプルでスケーラブルなアプローチを提供し、クリーンで高いウイルス力価をもたらします。
アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターは、現在の遺伝子治療研究で最も有望な送達システムの1つとして、その道を征服しつつあります。1965年に最初に同定されたAAVは、直径約25 nmの正二十面体タンパク質キャプシドを持ち、一本鎖DNAゲノムを持つ小さな非エンベロープウイルスです。AAVは、溶解サイクルを完了するために、単純ヘルペスウイルスや、より頻繁にはアデノウイルスなどのヘルパーウイルスとの同時感染に特有に依存するため、パルボウイルス科および依存パルボウイルス属に属します2,3。
AAVの4.7キロベースのゲノムは、特徴的なT字型のヘアピンエンドを形成する2つの逆終端反復(ITR)に隣接する2つのオープンリーディングフレーム(ORF)で構成されています4。ITRは、AAVのパッケージング、複製、および統合に不可欠な唯一のシス作用要素であるため、組換えAAV(rAAV)ベクターに保持される唯一のAAV配列です。このシステムでは、ベクター産生に必要な遺伝子がトランスで別々に供給され、目的の遺伝子をウイルスキャプシド5,6内にパッケージ化することができます。
各ウイルス遺伝子は、選択的スプライシングと開始コドンによって異なるタンパク質を体系化します。Rep ORF内では、4つの非構造タンパク質(Rep40、Rep52、Rep68、およびRep78)がコードされており、ウイルスDNAの複製、部位特異的な統合、およびカプセル化に重要な役割を果たしています7,8。Cap ORFは、N末端で互いに異なる3つの構造タンパク質(VP1、VP2、およびVP3)を発現するためのテンプレートとして機能し、それらが集合して1:1:10 4,9の比率で60量体ウイルスカプシドを形成します。さらに、非従来型のCUG開始コドンを持つCap遺伝子にネストされた代替ORFは、アセンブリ活性化タンパク質(AAP)をコードしています。この核タンパク質は、新しく合成されたカプシドタンパク質VP1-3と相互作用し、カプシドの集合を促進することが示されています10,11。
カプシドのアミノ酸配列の違いは、ヒトおよび非ヒト霊長類組織から単離された11の天然に存在するAAV血清型および100を超える変異体を説明する7,12,13。構造的に変化する領域のコンフォメーションの変化は、異なる株由来のカプシドの明確な抗原特性と受容体結合特異性を支配します。これにより、異なる哺乳類の器官間で異なる組織指向性と形質導入効率がもたらされます14。
rAAVの初期の製造方法は、ヘルパー目的でアデノウイルス感染に依存していました15,16,17,18,19。効率的で、通常は大規模に生産しやすいにもかかわらず、この感染からいくつかの問題が発生します。精製および不活化のための熱変性ステップの後でも、アデノウイルス粒子はAAV調製物中にまだ存在する可能性があり、望ましくない安全性の問題を構成する20。さらに、変性したアデノウイルスタンパク質の存在は臨床使用には受け入れられません。他の生産戦略は、Rep/Capおよび導入遺伝子を標的細胞21またはバキュロウイルス−昆虫細胞系22に持ち込むように操作された組換え単純ヘルペスウイルス株を利用する。これらのシステムは、スケーラビリティとGMP互換性の点で利点がありますが、それでも同様の問題に直面しています。
これらの問題を容易に克服するために、rAAV産生のためのトリプルトランスフェクション法が一般的に採用されています。簡単に言うと、rAAVアセンブリは、以下をコードする3つのプラスミドを持つ細胞の一過性トランスフェクションに依存しています:1)野生型AAV2ゲノム(pITR)のITR間に充填された導入遺伝子発現カセット。2)複製およびビリオンアセンブリ(pAAV-RC)に必要なRep/Cap配列。3)ヘルパー効果に必要なアデノウイルス関連RNA(pHelper)6,20,23。プラスミドトランスフェクション法は、前臨床試験におけるrAAV産生に簡便性と柔軟性を提供しますが、これらの手順を大規模生産に適用する場合、スケーラビリティと再現性の点で限界があります。別のアプローチとして、AAV Rep/Cap遺伝子またはRep/Capのいずれかをベクターコンストラクトと組み合わせて安定的に発現するAAV産生細胞株(接着増殖と浮遊増殖の両方)を使用することで、rAAV産生を達成できます。これらのシステムでは、アデノウイルスヘルパー遺伝子はプラスミドトランスフェクションによって導入されます。この戦略は細胞培養プロセスのスケーラビリティを向上させますが、技術的には複雑で時間がかかります21,24,25。
いずれの場合も、生産者細胞を溶解し、1つまたは複数の精製ステップに供します。現在、rAAVを精製するための主要な方法には、塩化セシウム(CsCl)またはヨージキサノールの超高速密度勾配遠心分離の使用が含まれ、クロマトグラフィー技術がそれに続くかどうか26。ウイルス沈殿の元の精製スキームでは、硫酸アンモニウムを使用し、その後、CsCl勾配による2〜3ラウンドの超遠心分離を行いました。このプロセスの主な利点には、すべての血清型を精製できることと、異なる密度に基づいて空のカプシドから完全な粒子を物理的に分離できることが含まれます。ただし、この方法は精巧で時間がかかり、スケーラビリティが限られているため、多くの場合、収量が悪くなり、サンプル品質が低下します27,28,29,30。さらに、CsClが哺乳類に及ぼす可能性のある毒性作用のために、in vivo研究の前に生理学的緩衝液に対する透析が必要になることがよくあります。
ヨウ素酸は、rAAVベクターを精製するための代替等浸透圧グラジエント培地としても使用されており、安全性とベクター力価の両方の観点からCsClよりも優れています。しかし、CsClと同様に、ヨージキサノール法は、細胞培養ライセートの負荷容量(したがってrAAV精製のスケーラビリティ)に関連するいくつかの欠点を提示し、時間と費用のかかる方法のままである30,31。
これらの制約を克服するために、研究者はクロマトグラフィー技術に注意を向けました。この点に関して、親和性クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー法、またはイオン交換クロマトグラフィー法のいずれかを組み込んだいくつかの精製アプローチが開発されました。これらの方法は、天然の受容体を含む特定の血清型の生化学的特性、またはウイルス粒子の電荷特性に依存する32。例えば、AAV2、AAV3、AAV6、AAV13がヘパラン硫酸プロテオグリカン(HSPG)に好ましく結合するという発見により、アフィニティークロマトグラフィー精製に近縁なヘパリンを使用する可能性が開かれました。しかし、HSPGへの結合部位は血清型によって異なり、AAVの付着と標的細胞の感染を異なる方法で媒介する2,33,34,35,36。一方、AAV1、AAV5、AAV6はN結合型シアル酸(SA)に結合するのに対し、AAV4はO結合型SAを使用します2,14,34。同じ理論的根拠に従って、SA37 に高度に濃縮された哺乳類タンパク質であるムチンの使用に基づいて、rAAV5 の精製のためのシングルステップアフィニティークロマトグラフィープロトコルも開発されました。ヘパリンベースの技術と同様に、この精製も生成される特定の血清型に依存します。ヘパリンとムチンとは別に、A20モノクローナル抗体やラクダ科の単一ドメイン抗体(AVBセファロースとPOROS CaptureSelect)など、他のリガンドがアフィニティークロマトグラフィーで検討されています22,23,38,39,40,41。既存の精製方法を改善するための他の革新的な戦略には、特定の結合エピトープを提示するためにrAAVキャプシドに小さな修飾を導入することが含まれます。例えば、ヘキサヒスチジンタグ付きまたはビオチン化rAAVは、それらのエピトープを標的とするリガンド(それぞれニッケルニトリロ三酢酸およびアビジン樹脂)を用いて精製することができる42,43,44。
rAAVの望ましい特性を広げるために、研究者はカプシドを混合することによってビリオンを女装させました。これは、生産中に2つの異なるAAV血清型からカプシド遺伝子を等モルまたは異なる比率で供給することによって達成され、異なる血清型34、45、46、47、48、49、50のカプシドサブユニットの混合物からなるカプシド構造を生じさせる.以前の研究では、AAV2とAAV1(1:1の比率)およびAAV2とAAV9(1:1の比率)のカプシドタンパク質を共発現すると、モザイクrAAV1/2およびrAAV2/9ベクターがそれぞれ生成されるという物理的証拠が提供されています45,46,48。モザイクrAAVの生成の主な利点は、異なるAAV血清型からの有利な形質を統合する能力であり、その結果、導入遺伝子発現と親和性の相乗的な改善をもたらし、rAAV産生中に有用な他の特性を維持します。興味深いことに、特定のモザイク変異体は、いずれかの親ウイルスとは異なる新しい特性を示すことさえあります46,47,49。AAV2のヘパリン結合能を利用することにより、AAV2を指向性進化および/または合理的設計によって生成された他の天然または新しいAAVキャプシドと混合することにより、モザイクrAAVベクターを生成および精製できる可能性があります。それにもかかわらず、以前の研究では、モザイクベクターを組み立てようとする際のキャプシドサブユニットの適合性の重要性が強調されています。例えば、Rabinowitzらは、AAV1、AAV2、およびAAV3のトランスカプセル化がモザイクカプシドの効率的な共集合につながったが、これらの血清型とAAV4との異性装が安定なビリオンの生成を妨げたことを実証した34,45,47。さらに、AAV1、AAV2、およびAAV3は、これらのカプシドを異なる比率で混合した場合に得られるウイルス力価が低下したため、AAV5との適合性が低いことを示しました。興味深いことに、モザイクrAAV2/5は、親AAV5と同様にムチン結合能力を維持しながら、ヘパリン結合特性の低下を示しました。しかし、3:1の比率のrAAV3/5は、ヘパリンとムチンへの二重結合を維持した。全体として、形質導入の強化、特異的な親和性、または免疫原性の低い新しいモザイクrAAVの作製は、カプシドの集合体と受容体の相互作用を理解することから大きな恩恵を受ける可能性がありますが、特定の組み合わせには依然として徹底的な調査と最適化が必要です。
本研究では、最適化されたヘパリンアフィニティークロマトグラフィー法を用いたrAAVの製造と精製のための段階的なプロトコルについて説明します。rAAV は一過性トランスフェクションによって産生され、高速タンパク質液体クロマトグラフィー(FPLC)システムを使用して精製されます。選択された精製画分を濃縮した後、得られたウイルスストックは、力価、純度、固有の物理的特性、およびin vitroおよびin vivoの生物学的活性の点で特徴付けられます。概念実証として、モザイクrAAV1/2およびrAAV2/9ベクターの生成に対するこのプロトコルの改善と適用性を実証します。各血清型の選択は、それらの著しく異なる向性に基づいており、モザイクバージョンにも独自の特徴を与えている可能性があります。AAV血清型1は、中枢神経系(CNS)に対して全体的に中程度の親和性を持ち、ニューロンとグリアを(程度は低いが)形質導入する能力を持ち、in vivoで順行性および逆行性の方向に軸索輸送を受けます2,7,8。さらに、AAV血清型9は、新生児および成体マウスの両方において、血液脳関門を通過し、CNSを標的とする自然な能力のために選択された51,52。最後に、AAV血清型2は、ヘパリンに結合する能力を考慮して選択され、アフィニティークロマトグラフィー33が可能になった。精製されたrAAV1/2およびrAAV2/9粒子は、両方の親AAV血清型の特性を兼ね備えており、したがって、CNS45,46,48,49の形質導入に適したベクターを構成する。
急速に拡大しているAAVベクターツールキットは、さまざまな投与経路を通じて、幅広い細胞タイプに対する最も有望な遺伝子導入システムの1つとなっています。この研究では、前臨床試験でその価値を証明できるモザイクrAAVベクターの製造、精製、および特性評価のための改良されたプロトコルの開発を目指しました。そのために、rAAV1/2およびrAAV2/9モザイクベクターの生成についてここで説明しますが、この手順は、標準的なrAAV2ベクター(データ非表示)の精製にも適用できます。
モザイク rAAV は、PEI をトランスフェクション試薬として使用した最適化されたトランスフェクション法に従って作製しました。一過性トランスフェクション法は、柔軟性と速度が高く、初期段階の前臨床試験で大きな利点があるため、選択されました。一旦、特定の導入遺伝子および血清型が検証されると、特定の Rep/Cap 遺伝子のサブセットを発現する安定したトランスフェクション細胞株を確立し、感染プロセスによって提供される追加の遺伝子を有することにより、より良いスケーラビリティおよび費用対効果を達成するように生産システムを微調整することができる24。リン酸カルシウムトランスフェクションと比較して、PEIにはいくつかの利点があります。これは、より広いpH範囲で効果的に作用する、安定した費用対効果の高いトランスフェクション試薬です。さらに、トランスフェクション後に細胞培地を交換する必要性を排除し、その結果、コストと作業負荷の両方を大幅に削減する69。
CsClまたはヨージキサノール勾配によって課せられる制限のいくつかを回避する試みとして、生成されたrAAVをアフィニティークロマトグラフィーによって回収および精製しました。この戦略は、超遠心分離やグラジエントを必要とせずに実行できる、簡素化されたスケーラブルなアプローチを提供し、クリーンで高いウイルス力価を実現します。実際、FPLCシステムを使用したクロマトグラフィー技術は、ベッドの高さが高いカラムにより多くの樹脂量を充填することで自動化およびスケールアップできます。本明細書に記載のプロトコルは、5 mL HiTrap Heparin HPカラム(データは示さず)を組み込むように容易に適合させることができる。さらに、ヘパリンカラムは数回再利用できるため、この分析法の費用対効果に貢献します。
次に、精製されたrAAVは、力価、純度、形態学的特徴、および生物学的活性の観点から特徴付けられました。興味深いことに、クーマシーブルー染色では、3つの典型的なウイルスカプシドタンパク質に加えて、約17 kDaのバンドが画分F8-F16で検出されました。ただし、このバンドは、rAAVの濃縮ステップ後に存在しなくなります。さらに、B1およびA69標識時に、VP3(<62kDa)より低い分子量を有するいくつかのかすかなバンドも検出することができ、これらはVP1、VP2、およびVP3キャプシドタンパク質の断片である可能性があることを示唆している70。別の可能性は、これらは実際には、フェリチンまたはAAVキャプシドタンパク質と同様のタンパク質フィンガープリントを共有し、AAV生物学に関与する可能性のあるポリペプチドと他の細胞タンパク質などの他の共精製タンパク質であるということです26,71,72。
TEMとスタナー分析により、さまざまなプロダクションでさまざまなレベルの空の粒子が存在することも明らかになりました。同様に、他の研究では、トランスフェクションまたは感染法によって調製されたrAAVの可変かつ高レベル(>65%)の空のカプシドの生成が以前に報告されています24,73。rAAV生成の背後にあるメカニズムは、新しく合成されたVPタンパク質からの空のカプシドの急速な形成から始まり、その後、Repタンパク質74,75によって媒介される予め形成されたカプシドへのゲノムパッケージングのゆっくりとした律速ステップが続く。したがって、空のカプシドはrAAV産生物で生成されるが、空のカプシドとフルカプシドの割合は、目的の導入遺伝子のサイズと配列、および細胞培養条件によって変化する可能性がある58,73。空のカプシドは、目的のゲノムを欠くことにより、治療効果を提供できず、自然免疫応答または適応免疫応答を増加させる可能性があるため、いくつかの懸念を引き起こします。しかし、いくつかの報告では、それらの比率を調整することにより、空のAAVカプシドがAAV特異的中和抗体の非常に効果的なおとりとして機能し、したがって形質導入効率を高める可能性があることも示されています60,76,77。空のカプシドの存在が決定的に有害であり、そして完全なベクターと比較して空の粒子の陰イオン性がわずかに少ないことを考えると、潜在的な解決策は、陰イオン交換クロマトグラフィー技術64を用いて第2の研磨精製ステップを行うことを含むことができる。
この研究はまた、生成されたモザイクrAAVが、rAAV1/2の頭蓋内注射時に in vitro ニューロン培養だけでなくCNSにも効率的に形質導入できるという説得力のある証拠を提供します。全体として、これらの結果は、記載されている製造および精製プロトコルが、高純度で生物学的に活性なrAAVを6日間で使用できる状態にし、前臨床試験におけるrAAVの生成のための汎用性と費用対効果の高い方法であることを示唆しています。
The authors have nothing to disclose.
コインブラ臨床生物医学研究所(iCBR)および革新的生物医学バイオテクノロジーセンター(CIBB)のMónica Zuzarte博士がrAAVのTEM分析に関して提供してくれた協力、洞察、技術支援に感謝します。コインブラ大学神経科学・細胞生物学センター(CNC-UC)およびコインブラ大学学際研究所(IIIUC)のドミニク・フェルナンデス博士には、一次神経細胞培養実験に関する貴重な技術支援と洞察をいただき、感謝の意を表します。本研究に不可欠なpRV1、pH21、およびpFdelta6プラスミドは、アバディーン大学生命科学・医学部医科学部のクリスティーナ・マクルーア博士から寛大に提供され、感謝しています。この作業は、Centro 2020地域運用プログラムを通じて、欧州地域開発基金(ERDF)から資金提供を受けました。COMPETE 2020 – 競争力と国際化のための運用プログラム、およびFCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiaを介したポルトガルの国家資金を通じて、プロジェクト:UIDB/04539/2020、UIDP/04539/2020、LA/P/0058/2020、ViraVector (CENTRO-01-0145-FEDER-022095)、Imagene (PTDC/BBB-NAN/0932/2014 |POCI-01-0145-FEDER-016807)、リセット-IDT-COP(CENTRO-01-0247-FEDER-070162)、ファイティングサース-CoV-2(CENTRO-01-01D2-FEDER-000002)、BDforMJD(CENTRO-01-0145-FEDER-181240)、ModelPolyQ2.0(CENTRO-01-0145-FEDER-181258)、MJDEDIT(CENTRO-01-0145-FEDER-181266);米国ポルトガル生物医学研究基金(APBRF)およびリチャード・チン・アンド・リリー・ロック・マチャド・ジョセフ病研究基金、IMI2 JUグラント契約に基づくARDATによる945473 EUおよびEFPIAの支援なし。GeneT-チーミングプロジェクトは101059981欧州連合のホライズンヨーロッパプログラムの支援を受けています。M.M.L.は 2021.05776.BD の支援を受けました。CHは 2021.06939.BD によってサポートされました。A.C.S.は 2020.07721.BD によって支援されました。D.D.L.は 2020.09668.BD によってサポートされ、 図1 は BioRender.com を使用して作成されました。
10% povidone-iodine | Medline | MDS093943 | |
12-well plates | Thermo Scientific | 11889684 | |
24-well plates | VWR | 734-2325 | |
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
96-well Stunner plate | Unchained Labs | 701-2025 | 96-well quantification plate for the consecutive ultraviolet-visible light absorption, static light scattering, and dynamic light scattering analysis of rAAV samples |
AAVpro Titration Kit (for Real-Time PCR) Ver.2 | Takara | 6233 | For determining the titer of AAV using RT-qPCR. This kit contains DNase I, Lysis Buffer, Dilution Buffer, positive control, Taq II mix, primer forward, primer reverse, water |
Acetic acid glacial | Fisher Chemical | A/0360/PB17 | |
ÄKTA pure 25 | Cytiva | 29018224 | FPLC system controlled by UNICORN software, version 6.3 |
Alkaline phosphatase-linked goat anti-mouse | Invitrogen | 31328 | |
Amicon ultra-0.5 centrifugal filter unit | Merck Millipore | UFC5100 | |
Amicon ultra-15 centrifugal filter unit | Merck Millipore | UFC9100 | |
Benzonase Nuclease | Merck Millipore | E1014 | |
Bromophenol blue | Sigma-Aldrich | B0126 | |
CFX96 Real-Time PCR detection system | Biorad | 184-5096 | |
ChemiDoc Touch Imaging System | Bio-Rad Laboratories | 1708370 | |
Chicken polyclonal anti-GFP primary antibody | Abcam | ab13970 | |
Coomassie Blue G250 | Fisher Chemical | C/P541/46 | |
Dithiothreitol (DTT) | Fisher Bioreagents | BP17225 | |
DMEM | Sigma-Aldrich | D5796 | |
ECF Substrate for Western Blotting | Cytiva | RPN5785 | |
FastDigest SmaI | Thermo Scientific | FD0663 | |
FEI-Tecnai G2 Spirit Biotwin | FEI | Biotwin | Transmission electron microscope |
Fetal bovine serum | Biowest | S1810 | |
Fluorescence mounting medium | Dako | S3023 | |
Formvar-carbon coated 200 mesh grid | TAAB Laboratories Equipment | F077/025 | |
Gas evacuation apparatus | RWD | R546W | |
Glycerol | Fisher BioReagents | 10021083 | |
Goat polyclonal anti-chicken antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11039 | |
Hamilton needle 30G, Small Hub RN Needle, 25 mm, PST3 | Hamilton | 7803-07 | |
Hamilton syringe (10 µL) | Hamilton | 7653-01 | |
HEK293T | American Type Culture Collection | CRL-11268 | |
HiTrap Heparin HP 1 x 5 mL | Cytiva | 17040701 | Pre-packed heparin column |
HiTrap Heparin HP 5 x 1 mL | Cytiva | 17040601 | Pre-packed heparin column |
Immobilon-P PVDF Membrane | Merck Millipore | IPVH00010 | |
Isoflurane | Braun | 469860 | |
Ketamine | Dechra Pharmaceuticals | N/A | Nimatek |
Low-retention microcentrifuge tubes (2 mL) | Fisher Scientific | 11906965 | |
Lunatic & Stunner Client software | Unchained Labs | N/A | Client analysis software version 8.0.1.235. Software for the consecutive ultraviolet-visible light absorption, static light scattering, and dynamic light scattering analysis of rAAV samples |
Methanol | Fisher Chemical | M/4000/FP21 | |
Mouse monoclonal anti-AAV, VP1, VP2 antibody (A69) | American Research Products | 03-61057 | |
Mouse monoclonal anti-AAV, VP1, VP2, VP3 antibody (B1) | American Research Products | 03-61058 | |
Neuro2a | American Type Culture Collection | CCL-131 | |
Normal goat serum | Gibco | 16210064 | |
NucleoBond Xtra Maxi EF | Macherey-Nagel | 12738422 | |
NZYColour Protein Marker II | NZYtech | MB09002 | |
pAAV-CMV-scGFP | Addgene | 32396 | Addgene plasmid # 32396; http://n2t.net/addgene:32396; RRID:Addgene_32396 |
pAAV-CMV-ssGFP | Addgene | 105530 | Addgene plasmid # 105530; http://n2t.net/addgene:105530; RRID:Addgene_105530 |
pAAV2/9n | Addgene | 112865 | Addgene plasmid # 112865; http://n2t.net/addgene:112865; RRID:Addgene_112865 |
Paraformaldehyde | Acros Organics | 10342243 | |
PBS | Fisher BioReagents | BP2438 | |
Penicillin-streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
Pluronic F-68 Non-ionic Surfactant (100x) | Gibco | 24040032 | |
Polyethylenimine MAX, MW 40,000 | Polysciences Europe | 24765 | |
R500 Series Compact Small Animal Anesthesia Machine – Isoflurane | RWD | N/A | |
Sample Inlet Valve V9-IS | Cytiva | 29027746 | |
Sample pump P9-S | Cytiva | 29027745 | |
Sodium azide | Sigma-Aldrich | S2002 | |
Sodium chloride | Fisher Scientific | 10428420 | |
Sodium deoxycholate | Sigma-Aldrich | D6750 | |
Sodium dodecyl sulfate (SDS) | Fisher Bioreagents | BP166 | |
Sterile PVDF syringe filter | Fisher Scientific | 15191499 | |
Stunner Platform | Unchained Labs | 700-2002 | Equipment for the consecutive ultraviolet-visible light absorption, static light scattering, and dynamic light scattering analysis of rAAV samples |
Superloop 150 mL | Cytiva | 18-1023-85 | |
Superloop 50 mL | Cytiva | 18-1113-82 | |
SURE 2 supercompetent cells | Stratagene, Agilent Technologies | HPA200152 | |
Treated culture dishes | Corning | 734-1711 | |
Tris base | Fisher BioReagents | BP152 | |
Tris hydrochloride | Fisher BioReagents | BP153 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-072 | |
Wheat Germ Agglutinin (WGA) conjugated with Alexa Fluor 633 | Invitrogen | W21404 | |
Xylazine | Dechra Pharmaceuticals | N/A | Sedaxylan |
Zeiss Axio Observer Z1 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | N/A | Inverted fluorescence microscope equiped with an EC Plan-Neofluar 10x/0.30 objective and a Plan-Apochromat 40x/0.95 objective |
Zeiss Axio Scan.Z1 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | N/A | Slide scanner fluorescence microscope equipped with a Plan-Apochromat 20x/0.8 objective |
Zeiss LSM 710 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | N/A | Inverted confocal microscope equipped with a Plan-Apochromat 40x/1.4 Oil DIC objective |
µ-Slide 8 well Ibidi | Ibidi | 80826 | 8-well chamber slide |