Questo protocollo descrive un percorso semi-automatizzato per migliorare l’efficienza e la capacità di elaborazione e crioconservazione dello sperma proveniente da specie di coralli minacciate, con l’obiettivo di garantire la diversità genetica e sostenere gli sforzi di ripristino della barriera corallina.
Le barriere coralline stanno affrontando una crisi a causa dell’aumento della frequenza degli eventi di sbiancamento causati dal riscaldamento degli oceani, con conseguente morte dei coralli sulle barriere coralline di tutto il mondo. La conseguente perdita di diversità genetica e biodiversità può diminuire la capacità dei coralli di adattarsi ai cambiamenti climatici, quindi gli sforzi per preservare la diversità esistente sono essenziali per massimizzare le risorse disponibili per il ripristino della barriera corallina ora e in futuro. L’approccio più efficace per garantire la genetica a lungo termine è la crioconservazione e la biobanca, che consente la conservazione congelata di campioni viventi a temperature criogeniche in azoto liquido a tempo indeterminato. La crioconservazione degli spermatozoi di corallo è possibile dal 2012, ma la natura stagionale della riproduzione dei coralli significa che le attività di biobanca sono limitate a poche notti all’anno in cui si verifica la deposizione delle uova. Migliorare l’efficienza dei flussi di lavoro di processazione e crioconservazione dello sperma di corallo è quindi essenziale per massimizzare queste limitate opportunità di biobanca. A tal fine, abbiamo deciso di ottimizzare i percorsi di elaborazione della crioconservazione per lo sperma di corallo basandosi sulle tecnologie esistenti e creando un approccio semi-automatizzato per semplificare la valutazione, la gestione e la crioconservazione dello sperma di corallo. Il processo, che combina l’analisi dello sperma assistita da computer, crioviali con codice a barre e una serie di schede tecniche automatiche collegate per la modifica simultanea da parte di più utenti, migliora l’efficienza sia dell’elaborazione dei campioni che della gestione dei metadati sul campo. Attraverso l’integrazione con programmi di ricerca trasversali come il Reef Restoration and Adaptation Program in Australia, la crioconservazione può svolgere un ruolo cruciale nei programmi di ripristino della barriera corallina su larga scala, facilitando la gestione genetica delle popolazioni di acquacoltura, sostenendo la ricerca per migliorare la tolleranza termica e prevenendo l’estinzione delle specie di coralli. Le procedure descritte saranno utilizzate per i professionisti della crioconservazione dei coralli e delle biobanche sulle barriere coralline di tutto il mondo e forniranno un modello per la transizione delle tecnologie di crioconservazione dai laboratori di ricerca alle applicazioni su larga scala.
Le barriere coralline di tutto il mondo stanno subendo una perdita di specie, popolazioni e diversità genetica di coralli a causa del riscaldamento degli oceani e dell’acidificazione causata dai cambiamenti climatici, diminuendo la vitalità di questi habitat critici e influenzando le specie che supportano 1,2. L’approccio più efficace per garantire la genetica a lungo termine è la crioconservazione e la biobanca, che consente la conservazione congelata di campioni viventi a temperature criogeniche in azoto liquido a tempo indeterminato3. Lo sviluppo nel 2012 di metodi per la crioconservazione dello sperma di corallo4 ha permesso per la prima volta il biobanking della genetica di queste specie e ha portato allo sviluppo del primo biorepository per la genetica dei coralli nel 20125. Da allora, questo protocollo di crioconservazione è stato ulteriormente perfezionato6 e utilizzato per garantire la genetica di oltre 50 specie di coralli a livello globale, di cui 30 provenienti dalla Grande Barriera Corallina in Australia7. Gli spermatozoi di corallo crioconservati possono generare coralli sani che si sviluppano normalmente e sono stati utilizzati per facilitare esperimenti di flusso genico assistito in Australia8 e nei Caraibi9. Mentre le tecnologie sono attualmente in fase di sviluppo per consentire la crioconservazione di tipi di tessuti complessi come le larve10 e i tessuti di corallo adulto 11,12, la crioconservazione dello sperma di corallo è attualmente lo strumento più consolidato disponibile per la biobanca di routine della genetica dei coralli.
Con l’aumento dell’impatto sulle popolazioni di coralli, diversi paesi hanno avviato programmi su larga scala per sostenere il ripristino e l’adattamento della barriera corallina (ad esempio, il Reef Restoration and Adaptation Program [RRAP] in Australia13) o per garantire le popolazioni di coralli in pericolo rimanenti (ad esempio, Florida Coral Rescue negli Stati Uniti14). Nel contesto di questi programmi, la crioconservazione può essere considerata una tecnologia abilitante, che supporta la ricerca e la produzione di coralli su larga scala, oltre a garantire la diversità genetica esistente e prevenire le estinzioni. La crioconservazione dello sperma può consentire un maggiore controllo sulla riproduzione tra popolazioni fisicamente o temporalmente separate e può consentire la gestione genetica dei riproduttori per selezionare i tratti desiderabili come la tolleranza termica o la resistenza alle malattie8. Ad oggi, la biobanca degli spermatozoi di corallo è stata intrapresa su scala relativamente piccola a sostegno della gestione della biodiversità7, quindi sarà necessario un certo livello di upscaling se tale biobanca vuole raggiungere il suo potenziale all’interno di questi più ampi programmi di ripristino della barriera corallina. Come per tutti gli sforzi di ripristino della barriera corallina basati sulla riproduzione dei coralli, il principale ostacolo all’aumento degli sforzi di biobanca è il periodo limitato durante il quale i gameti di corallo sono disponibili, poiché la deposizione delle uova nella maggior parte delle specie che costruiscono la barriera corallina coincide con la luna piena in tarda primavera e all’inizio dell’estate15, il che significa che i gameti sono disponibili per la crioconservazione e il biobanking solo in poche notti all’anno. Inoltre, nelle regioni in cui si verifica la deposizione delle uova di massa, ad esempio la Grande Barriera Corallina, ci sono in genere più specie che depongono le uova contemporaneamente o entro poche ore l’una dall’altra nella stessa notte15. Sono quindi necessari miglioramenti al percorso di crioconservazione degli spermatozoi per aumentare la scala e l’efficienza del trattamento per massimizzare la capacità di biobanca durante queste brevi finestre annuali di riproduzione, garantendo al contempo l’integrità dei campioni e dei metadati associati.
La crioconservazione e la biobanca degli spermatozoi di corallo prevedono diverse fasi chiave, dalla raccolta dei gameti durante la deposizione delle uova all’inserimento dei campioni nel biorepository e nel database (Figura 1). Il processo inizia con la separazione degli spermatozoi dagli ovuli (nelle specie ermafrodite) o la raccolta degli spermatozoi dalla colonna d’acqua (nelle specie gonocoriche), seguita dalla valutazione della motilità e della concentrazione degli spermatozoi. Gli spermatozoi vengono quindi combinati con un crioprotettore (concentrazione finale del 10% v/v, dimetilsolfossido, DMSO) in acqua di mare filtrata (FSW) e raffreddati a -20 °C/min in un dispositivo di raffreddamento progettato su misura4. Le prime iterazioni di questo processo si basavano sulla valutazione visiva della motilità e della concentrazione degli spermatozoi tramite microscopia a contrasto di fase e conta dell’emocitometro, stampa e marcatura delle provette mentre i campioni venivano elaborati per la crioconservazione, il pipettaggio manuale dei campioni di sperma in crioviali e il raffreddamento su un rack galleggiante appositamente progettato16. L’applicazione dell’analisi dello sperma assistita da computer (CASA)17 e lo sviluppo di un dispositivo di raffreddamento stampato in 3D6 hanno migliorato l’efficienza e l’affidabilità della crioconservazione degli spermatozoi di corallo, ma il percorso di elaborazione dei campioni di sperma è rimasto in gran parte lo stesso sin dal suo inizio. Sebbene questo approccio sia adatto per l’elaborazione di campioni provenienti da un numero moderato di colonie e specie in una notte di riproduzione, per grandi volumi e numeri di colonie (ad esempio, singoli campioni da >10 colonie alla volta), ci sono colli di bottiglia nel percorso di crioconservazione che impediscono l’elaborazione dei campioni in modo tempestivo (cioè entro 2 ore dal rilascio dello sperma) senza degradazione del potenziale di fertilità del campione. Sebbene siano disponibili sistemi di movimentazione dei fluidi su larga scala per crioviali (ad esempio, Thomas et al.18), sono tipicamente progettati per l’elaborazione di grandi lotti (ad esempio, più rack di crioviali) e non sono adatti per il trasporto e l’uso sul campo, quindi non sono convenienti per questa applicazione. Pertanto, il presente studio mirava a migliorare l’efficienza della crioconservazione dello sperma di corallo introducendo apparecchiature e metodi di automazione portatili ed economici nelle fasi chiave del percorso di elaborazione per massimizzare il numero di campioni che potrebbero essere efficacemente crioconservati in una notte di deposizione delle uova.
Il percorso di elaborazione semi-automatizzato descritto in questo protocollo consente l’elaborazione efficiente e la crioconservazione dello sperma di corallo per proteggere la genetica dalle specie minacciate e sostenere gli sforzi di ripristino e adattamento della barriera corallina. La motivazione per lo sviluppo di questo protocollo è stata la mancanza di sistemi esistenti adatti ai requisiti di produttività della crioconservazione degli spermatozoi di corallo e l’uso di crioviali, poiché i sistemi di elaborazione ad alto rendimento per la crioconservazione degli spermatozoi si basano tipicamente sul confezionamento di campioni in paillettes francesi da 0,25 mL o 0,5 mL21,22. In confronto, i crioviali sono generalmente utilizzati su piccola scala per l’elaborazione a basso rendimento (ad esempio, la crioconservazione di campioni di laboratorio per la ricerca23,24), o in sistemi di elaborazione ad alto rendimento per campioni di massa che utilizzano apparecchiature costose e non portatili (ad esempio, l’elaborazione di colture cellulari per l’industria18,25). Abbiamo anche studiato il potenziale per l’utilizzo di un sistema di auto-decapping per semplificare la rimozione e la sostituzione dei cappucci criovali, ma i sistemi erano disponibili solo per singoli crioviali o per interi rack crioviali, quindi non fornivano una soluzione conveniente. Attualmente, ci sono diversi gruppi a livello globale che stanno utilizzando il protocollo di crioconservazione ideato da Hagedorn et al.4 per garantire la diversità genetica dei coralli, ed è importante che questo lavoro continui ad espandersi a più barriere coralline in tutto il mondo. Pertanto, una considerazione importante nello sviluppo dell’attuale protocollo è stata la necessità di utilizzare tecnologie convenienti e accessibili che potessero essere prontamente implementate da questi altri gruppi e che non fossero proibitive per i nuovi gruppi che volevano iniziare la crioconservazione degli spermatozoi di corallo.
Un componente chiave del protocollo descritto è la migliore gestione dei metadati di esempio tramite fogli di calcolo collegati in Microsoft Excel. L’inserimento dei dati è generalmente semplice, ma va notato che la modifica delle informazioni nei fogli dati automatici deve essere eseguita solo eliminando e reinserendo le informazioni, poiché le funzioni rapide (ad esempio, Ctrl + C, Ctrl + V) per modificare i dati influenzeranno potenzialmente gli input simultanei da parte di altri utenti e possono causare problemi con il collegamento dei dati tra i fogli di calcolo. Un importante componente dei metadati è un identificatore univoco (vale a dire, l’ID della colonia) che è collegato alla colonia donatrice e che è collegato al campione in tutte le fasi del percorso di elaborazione. È essenziale che le provette del campione siano chiaramente etichettate con l’ID della colonia al momento della raccolta del fascio e che queste informazioni siano accuratamente trascritte su tutte le nuove provette in cui il campione viene trasferito durante la preparazione (ad esempio, durante il filtraggio per separare ovuli e spermatozoi o per l’aggiunta di criodiluente). Sebbene il protocollo consenta il trasferimento automatico delle informazioni sulla qualità del campione dall’operatore CASA alla workstation di crioconservazione, è possibile che si verifichino problemi quando la copertura Internet o Wi-Fi è scarsa. Se si verificano ritardi nel trasferimento dei dati, si consiglia di utilizzare le due workstation offline e di mantenere fogli dati automatici separati che possono essere riconciliati in seguito. Le informazioni chiave richieste dall’operatore di crioconservazione sono l’ID della colonia e la concentrazione del campione, quindi si raccomanda che l’operatore CASA scriva la concentrazione del campione sulla provetta del campione come backup per garantire che queste informazioni siano a portata di mano per la preparazione della crioconservazione in caso di ritardo nel caricamento o nel download dei metadati tra computer.
La scelta dello scanner di codici a barre e dei crioviali con codice a barre utilizzati per questo protocollo può essere variata in base al budget e alla disponibilità del prodotto; Tuttavia, ci sono alcuni elementi chiave che dovrebbero essere considerati nella loro selezione. Lo scanner di codici a barre dovrebbe avere la capacità di personalizzare le impostazioni, in particolare la capacità di modificare le specifiche di input dei dati e la direzione di inserimento dei dati. Le schede tecniche automatiche utilizzate per questo protocollo utilizzano l’inserimento orizzontale, ma in alcune occasioni (ad esempio, l’accesso alla biobanca o per altri usi di laboratorio) potrebbe essere richiesto l’inserimento verticale, quindi è importante che questa funzione sia personalizzabile. Sebbene il protocollo possa essere utilizzato sia con codici a barre 1D che 2D, si raccomanda che i crioviali selezionati abbiano un componente leggibile dall’uomo (ad esempio, i codici a barre 1D in genere includono un numero univoco) per consentire il controllo incrociato dell’ingresso del campione durante la crioconservazione. Oltre all’inserimento dei campioni, lo scanner di codici a barre può essere utilizzato per automatizzare l’inserimento di alcuni campi di metadati creando e stampando codici QR per informazioni che vengono ripetute tra i campioni (ad esempio, nomi di specie, date e posizioni della barriera corallina) prima della deposizione delle uova. Queste informazioni possono quindi essere inserite rapidamente e facilmente nelle schede tecniche automatiche scansionando con lo scanner di codici a barre. Inoltre, allegando codici a barre con numero di serie a ciascun rack criogenico e sonda a termocoppia, è anche possibile collegare ogni ciclo di crioconservazione con un set specifico di apparecchiature all’interno del database, utile per il controllo qualità e per identificare i componenti che richiedono riparazione o sostituzione.
I fattori limitanti nella lavorazione sono spesso il tempo trascorso in attesa che i fasci si rompano e il tempo necessario per filtrare e separare lo sperma dagli ovuli prima della CASA e della crioconservazione. Ove possibile, si consiglia di trattare i campioni nell’ordine in cui i fasci si rompono; Tuttavia, è possibile ottenere ulteriori guadagni in termini di efficienza attraverso la gestione strategica degli ordini di elaborazione dei campioni. Ad esempio, se ci sono 5 o meno crioviali per colonia a causa di bassi volumi di campione (cioè meno di 3 mL di spermatozoi per colonia) o di una bassa concentrazione di spermatozoi che richiede una diluizione 2:1 con criodiluente (cioè meno di 2 × 109/mL), allora è meglio aggiungere criodiluente a due campioni di colonia contemporaneamente in modo che possano essere eseguiti insieme sullo stesso rack criogenico (totale # slot disponibili = 11), piuttosto che eseguirli separatamente con manichini che riempiono gli spazi vuoti. Inoltre, è possibile eseguire più rack criogenici contemporaneamente (per campioni >6 mL di volume), a condizione che si presti attenzione a garantire che tutti i processi possano essere completati entro il tempo di equilibratura criodiluente di 10 minuti, il che può aumentare ulteriormente la produttività del campione. Tuttavia, quando si eseguono più rack criogenici o si combinano più colonie su un singolo rack criogenico, è necessario prestare attenzione per garantire che i metadati di crioconservazione siano assegnati al campione corretto nella scheda tecnica automatica, soprattutto se i campioni vengono crioconservati in un ordine diverso dalla loro valutazione CASA.
Oltre allo sviluppo del flusso di lavoro semi-automatizzato, la presente descrizione del protocollo fornisce anche due confronti metodologici relativi alla concentrazione di spermatozoi che mirano a migliorare i risultati dell’analisi dello sperma e della crioconservazione. In generale, la raccolta di 5 ml di fasci di gameti su 5 ml di acqua di mare (volume totale 10 ml) si tradurrà in una concentrazione di spermatozoi pari o superiore a 2 × 109 cellule/mL, ma ci sono occasioni in cui la concentrazione di spermatozoi può essere inferiore a causa di differenze di specie o di fasci che si rompono durante la raccolta. L’uso di un criodiluente DMSO a concentrazione più elevata (30% v/v) riduce la quantità di diluizione degli spermatozoi per ridurre al minimo la variazione da lotto a lotto nella concentrazione di spermatozoi nel crioviale. È importante sottolineare che l’uso del 30% di DMSO per raggiungere la concentrazione finale di DMSO non influisce sulla concentrazione post-scongelamento o sui parametri di motilità, come mostrato dai dati rappresentativi nella Figura 3. Il secondo confronto metodologico fornisce un’alternativa ai vetrini monouso a camera fissa a vetrino coprioggetti tipicamente utilizzati per CASA. La sfida principale con l’utilizzo di vetrini disponibili in commercio per l’analisi degli spermatozoi di corallo è che possono influire sull’accuratezza della valutazione della motilità a causa dell’adesione degli spermatozoi al rivestimento del vetrino. L’uso della soluzione di attivazione risolve questo problema in molti, ma non in tutti, i campioni, pertanto si consiglia comunque di eseguire un’analisi CASA separata per la motilità utilizzando un vetrino semplice per garantire affidabilità e coerenza. L’uso di una camera di conteggio Makler supera la necessità di analizzare separatamente la concentrazione e la motilità e potenzialmente migliora l’accuratezza delle misure di concentrazione (Figura 2), quindi se ne consiglia l’uso con il protocollo attuale. Data questa discrepanza nelle misurazioni della concentrazione, un risultato che è stato riportato in precedenza20, è importante registrare sempre i dettagli del vetrino nel database insieme ai dati sulla qualità dello sperma e, ove possibile, essere coerenti nel tipo di vetrino da camera utilizzato per ridurre al minimo la variazione da lotto a lotto e contribuire a garantire calcoli affidabili dei rapporti spermatozoi/ovuli per le fecondazioni.
Il processo semi-automatizzato qui descritto fornisce un percorso standardizzato ed efficiente per la crioconservazione e la bioconservazione dello sperma di specie di coralli minacciate, mantenendo al contempo la biosicurezza e la qualità del campione. Il protocollo descritto è facilmente trasferibile e relativamente poco costoso da implementare in programmi in tutto il mondo che stanno lavorando per garantire la diversità dei coralli esistenti utilizzando la crioconservazione, che sarà essenziale per prevenire le estinzioni e massimizzare le risorse disponibili per gli sforzi di ripristino della barriera corallina ora e in futuro.
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo i proprietari tradizionali di Konomie, il popolo Woppaburra, per il permesso di testare il sistema descritto in questo documento durante la deposizione delle uova nel paese nel novembre 2022, e il Centro di Educazione Ambientale di Konomie per l’uso delle loro strutture. Vorremmo anche ringraziare il supporto del personale dell’Australian Institute of Marine Science e degli scienziati che hanno facilitato la raccolta e la deposizione delle uova delle colonie all’interno del National Sea Simulator. Questo lavoro è stato intrapreso come attività del sottoprogramma di crioconservazione (RRAP-CP-01) per il Reef Restoration and Adaptation Program, una partnership tra il Reef Trust del governo australiano e la Great Barrier Reef Foundation, con il supporto aggiuntivo della Taronga Conservation Society Australia, della Taronga Conservation Science Initiative e di altri filantropi che sostengono la Taronga Foundation.
Ovation ALI-Q 2 VS Pipette Controller – Aliquotting pipette | Vistalab | 2100-1005 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
5 mL serological pipettes (bulk) | Thermo Scientific | Nunc 170355 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
10 mL serological pipettes (bulk) | Thermo Scientific | Nunc 170356 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
P2 0.2–2 µL pipettor | Gilson | F144054M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P10 1–10 µL pipettor | Gilson | F144055M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P20 2–20 µL pipettor | Gilson | F144056M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P200 20–200 µL pipettor | Gilson | F144058M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P1000 100–1000 µL pipettor | Gilson | F144059M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
Vacuum pump | Millipore | WP6122050 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
Reusable bottle-top filtration system | Thermo Scientific | DS0320-5045 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
0.22-µm filter discs, mixed cellulose esters | Merck Millipore | GSWP04700 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
Filtered sea water | N/A | – | Base medium for sperm activation and cryoprotectant solutions |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D4540 | Cryoprotectant chemical used at a final concentration of 10% v/v in filtered seawater for sperm cryopreservation |
Caffeine | Sigma-Aldrich | C0750 | Used to activate sperm motility |
BSA heat shock fraction | Sigma-Aldrich | A9647 | Used to minimise sperm adherance to CASA well slides |
15-mL tubes – racked | Thermo Scientific | 339651 | Preparation of sperm activation solution |
50-mL tubes racked | Thermo Scientific | 339653 | For collection of gamete bundles and filtered sperm samples |
Transfer pipettes | Thermo Scientific | Samco 202PK | To aid collection of gamete bundles from the water surface |
100-µm filter baskets | Fisher Scientific | 22363549 | To exclude eggs during separation of the sperm sample |
Eppendorf racks | Interpath | 511029 | Dilution and activation of sperm for concentration and motiliy assessment |
Eppendorf 1.5-mL tube | Eppendorf | 30120086 | Dilution and activation of sperm for concentration and motiliy assessment |
Glass coverslips 18×18 mm | Brand | 4700 45 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
Plain glass slides, precleaned, 75×25 mm | Corning | 2947 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
Haemocytometer | Hausser Scientific | 1492 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
CASA slides (Leja 20-µm 4 chamber, SC-20-01-04-B) | IMV Technologies | 025107 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
Makler sperm counting chamber (CASA) | IVFStore | SM-373 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
accu-bead® counting beads | Hamilton-Thorne | 710111 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
CASA system + laptop | Hamilton Thorne | Ceros II | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
Safety Glasses | Generic | – | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Lab coat | Long sleeve, full length | – | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Cryogloves (pair) | Tempshield | Mid-Arm | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Medium forceps | Generic | – | For removing cryopreserved samples from the cryo racks and manipulating samples in liquid nitrogen |
Barcode scanner (2D compatible) | Zebra | DS2278 | For reading 1D and 2D barcodes on cryovials for sample management |
2.0-mL CryoStorage Vial, external thread, pre-capped, 2D SafeCode (DataMatrix/ECC200), linear and human readable | Eppendorf | 30079434 | Barcoded cryovials for cryopreservation of sperm samples |
Cryovial rack | Simport | T315 | Rack to hold cryovials, with locking base to allow for one hand de-capping and capping |
Freezing racks | Custom | – | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Freezing rack lid | Custom | – | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Freezing Thermos – 1.5 Litre 18/8 Stainless Steel Double-Wall Vacuum Food Container | Isosteel | VA-9683 | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Lab timers | Generic | – | For timing of cryoprotectant equilibration prior to cryopreservation |
Nitrogen bath 9L | BelArt | M16807-9104 | For quenching samples during cryopreservaton and holding samples during sorting and handling |
Thermocouple data logger- multichannel | Omega | HH520 | Temperature monitoring during cryopreservation to determine freezing rate and end point |
Thermocouple probe – Type K | Omega | 5SC-TT-K-30-36 | Temperature monitoring during cryopreservation to determine freezing rate and end point |
Cryo pens/coloured permanent pen | Staedtler Lumocolor | 318 | Optional for marking cryovial lids to assist with sample management |
Dry Shipper – charged | Taylor Wharton | CXR100, or CX500 | For transfer of cryopreserved samples from field/collection sites to the biorepository for storage |