Dit protocol beschrijft een semi-geautomatiseerde route om de efficiëntie en capaciteit van de verwerking en cryopreservatie van sperma van bedreigde koraalsoorten te verbeteren, met als doel de genetische diversiteit veilig te stellen en de inspanningen voor rifherstel te ondersteunen.
Koraalriffen worden geconfronteerd met een crisis nu de frequentie van verbleking als gevolg van de opwarming van de oceaan toeneemt, wat resulteert in de dood van koralen op riffen over de hele wereld. Het daaropvolgende verlies van genetische diversiteit en biodiversiteit kan het vermogen van koraal om zich aan te passen aan het veranderende klimaat verminderen, dus inspanningen om de bestaande diversiteit te behouden zijn essentieel om de beschikbare middelen voor rifherstel nu en in de toekomst te maximaliseren. De meest effectieve aanpak om genetica op lange termijn veilig te stellen, is cryopreservatie en biobanking, waardoor levende monsters voor onbepaalde tijd bevroren kunnen worden opgeslagen bij cryogene temperaturen in vloeibare stikstof. Cryopreservatie van koraalsperma is sinds 2012 mogelijk, maar het seizoensgebonden karakter van de reproductie van koraal betekent dat biobankactiviteiten beperkt zijn tot slechts een paar nachten per jaar wanneer het paaien plaatsvindt. Het verbeteren van de efficiëntie van workflows voor de verwerking van koraalsperma en cryopreservatie is daarom essentieel om deze beperkte biobankmogelijkheden te maximaliseren. Daartoe wilden we de verwerkingsroutes voor cryopreservatie voor koraalsperma optimaliseren door voort te bouwen op bestaande technologieën en een semi-geautomatiseerde aanpak te creëren om de beoordeling, behandeling en cryopreservatie van koraalsperma te stroomlijnen. Het proces, dat computerondersteunde sperma-analyse, cryovials met streepjescode en een reeks gekoppelde automatische datasheets combineert voor gelijktijdige bewerking door meerdere gebruikers, verbetert de efficiëntie van zowel de monsterverwerking als het metadatabeheer in het veld. Door integratie met transversale onderzoeksprogramma’s zoals het Reef Restoration and Adaptation Program in Australië, kan cryopreservatie een cruciale rol spelen in grootschalige rifherstelprogramma’s door het genetisch beheer van aquacultuurpopulaties te vergemakkelijken, onderzoek te ondersteunen om de thermische tolerantie te verbeteren en het uitsterven van koraalsoorten te voorkomen. De beschreven procedures zullen worden gebruikt voor beoefenaars van cryopreservatie van koraal en biobanking op riffen over de hele wereld en zullen een model bieden voor de overgang van cryopreservatietechnologieën van onderzoekslaboratoria naar grootschalige toepassingen.
Koraalriffen ervaren wereldwijd een verlies van koraalsoorten, populaties en genetische diversiteit als gevolg van de opwarming en verzuring van de oceaan als gevolg van klimaatverandering, waardoor de levensvatbaarheid van deze kritieke habitats afneemt en de soorten die ze ondersteunenworden beïnvloed 1,2. De meest effectieve aanpak om genetica op lange termijn veilig te stellen, is cryopreservatie en biobanking, waardoor levende monsters voor onbepaalde tijd bevroren kunnen worden opgeslagen bij cryogene temperaturen in vloeibare stikstof3. De ontwikkeling in 2012 van methoden voor de cryopreservatie van koraalsperma4 maakte voor het eerst de biobanking van genetica van deze soorten mogelijk en leidde in 2012 tot de ontwikkeling van de eerste biorepository voor koraalgenetica5. Sindsdien is dit cryopreservatieprotocol verder verfijnd6 en gebruikt om de genetica van meer dan 50 soorten koraal wereldwijd veilig te stellen, waarvan 30 soorten afkomstig zijn van het Great Barrier Reef in Australië7. Gecryopreserveerd koraalsperma kan gezonde koralen genereren die zich normaal ontwikkelen en zijn gebruikt om experimenten met geassisteerde genenstroom in Australië8 en het Caribisch gebied9 te vergemakkelijken. Hoewel er momenteel technologieën in ontwikkeling zijn om de cryopreservatie van complexe weefseltypes zoals larven10 en volwassen koraalweefsels 11,12 mogelijk te maken, is cryopreservatie van koraalsperma momenteel het meest gevestigde hulpmiddel dat beschikbaar is voor routinematig biobankieren van koraalgenetica.
Naarmate de impact op koraalpopulaties is toegenomen, hebben verschillende landen grootschalige programma’s opgestart om het herstel en de aanpassing van riffen te ondersteunen (bijv. het Reef Restoration and Adaptation Program [RRAP] in Australië13) of om de resterende bedreigde koraalpopulaties veilig te stellen (bijv. Florida Coral Rescue in de VS14). In de context van deze programma’s kan cryopreservatie worden gezien als een faciliterende technologie, die onderzoek en grootschalige koraalproductie ondersteunt, naast het veiligstellen van de bestaande genetische diversiteit en het voorkomen van uitsterven. Cryopreservatie van sperma kan een grotere controle over de voortplanting mogelijk maken tussen populaties die fysiek of tijdelijk gescheiden zijn en kan genetisch beheer van de broedvoorraad mogelijk maken om te selecteren op gewenste eigenschappen zoals thermische tolerantie of ziekteresistentie8. Tot op heden is biobanking van koraalsperma op relatief kleine schaal uitgevoerd ter ondersteuning van het beheer van de biodiversiteit7, dus er zal een zekere mate van opschaling nodig zijn als een dergelijke biobanking zijn potentieel binnen deze grotere rifherstelprogramma’s wil benutten. Zoals bij alle inspanningen voor rifherstel op basis van de voortplanting van koraal, is de belangrijkste belemmering voor het verhogen van de inspanningen op het gebied van biobankieren de beperkte periode waarin koraalgameten beschikbaar zijn, aangezien het paaien in de meeste rifbouwende soorten samenvalt met de volle maan in het late voorjaar en de vroege zomer15, wat betekent dat gameten slechts een paar nachten per jaar beschikbaar zijn voor cryopreservatie en biobankieren. Bovendien zijn er in regio’s waar massaal paaien, bijvoorbeeld het Great Barrier Reef, meestal meerdere soorten tegelijkertijd of binnen een paar uur na elkaar op dezelfde nacht paaien15. Verbeteringen aan de cryopreservatieroute van sperma zijn daarom nodig om de schaal en efficiëntie van de verwerking te vergroten om de biobankcapaciteit tijdens deze korte jaarlijkse paaivensters te maximaliseren en tegelijkertijd de integriteit van monsters en bijbehorende metadata te waarborgen.
Cryopreservatie en biobanking van koraalsperma omvatten verschillende belangrijke stappen, van het verzamelen van gameten tijdens het paaien tot de opname van monsters in de biorepository en database (Figuur 1). Het proces begint met het scheiden van sperma uit eieren (bij hermafrodiete soorten) of het verzamelen van sperma uit de waterkolom (bij gonochorische soorten), gevolgd door de beoordeling van de beweeglijkheid en concentratie van het sperma. Sperma wordt vervolgens gecombineerd met cryoprotectant (10% v/v eindconcentratie, dimethylsulfoxide, DMSO) in gefilterd zeewater (FSW) en gekoeld bij -20 °C/min in een op maat ontworpen koelapparaat4. Vroege iteraties van dit proces waren gebaseerd op visuele beoordeling van de beweeglijkheid en concentratie van het sperma via fasecontrastmicroscopie en hemocytometertellingen, het afdrukken en labelen van buizen terwijl monsters werden verwerkt voor cryopreservatie, het met de hand pipetteren van spermamonsters in cryovials en koeling op een speciaal ontworpen drijvend rek16. De toepassing van computerondersteunde spermaanalyse (CASA)17 en de ontwikkeling van een 3D-geprint koelapparaat6 hebben de efficiëntie en betrouwbaarheid van cryopreservatie van koraalsperma verbeterd, maar de verwerkingsroute voor spermamonsters is sinds het begin grotendeels hetzelfde gebleven. Hoewel deze aanpak geschikt is voor het verwerken van monsters van een matig aantal kolonies en soorten tijdens een paainacht, zijn er voor grote hoeveelheden en aantallen kolonies (bijv. individuele monsters van >10 kolonies tegelijk) knelpunten in de cryopreservatieroute die de verwerking van de monsters op een tijdige manier belemmeren (d.w.z. binnen 2 uur na het vrijkomen van het sperma) zonder verslechtering van het vruchtbaarheidspotentieel van het monster. Hoewel er grootschalige vloeistofbehandelingssystemen voor cryovials beschikbaar zijn (bijv. Thomas et al.18), zijn ze doorgaans ontworpen voor verwerking van grote batches (d.w.z. meerdere rekken met cryovials) en zijn ze niet geschikt voor transport en gebruik in het veld, dus ze zijn niet kosteneffectief voor deze toepassing. Daarom was de huidige studie gericht op het verbeteren van de efficiëntie van cryopreservatie van koraalsperma door draagbare, goedkope automatiseringsapparatuur en -methoden te introduceren bij belangrijke stappen in het verwerkingstraject om het aantal monsters dat effectief kan worden gecryopreserveerd tijdens een paainacht te maximaliseren.
De semi-geautomatiseerde verwerkingsroute die in dit protocol wordt beschreven, maakt de efficiënte verwerking en cryopreservatie van koraalsperma mogelijk om genetica van bedreigde soorten veilig te stellen en rifherstel en aanpassingsinspanningen te ondersteunen. De motivatie voor de ontwikkeling van dit protocol was het ontbreken van bestaande systemen die geschikt waren voor de doorvoervereisten van cryopreservatie van koraalsperma en het gebruik van cryovials, aangezien verwerkingssystemen met hoge doorvoer voor cryopreservatie van sperma doorgaans gebaseerd zijn op monsterverpakkingen in Franse rietjes van 0,25 ml of 0,5 ml21,22. Ter vergelijking: cryovials worden over het algemeen op kleine schaal gebruikt voor verwerking met een lage doorvoer (bijv. cryopreservatie van laboratoriummonsters voor onderzoek23,24), of in verwerkingssystemen met een hoge doorvoer voor bulkmonsters met behulp van dure, niet-draagbare apparatuur (bijv. celcultuurverwerking voor de industrie 18,25). We hebben ook het potentieel onderzocht voor het gebruik van een automatisch dekappingsysteem om het verwijderen en vervangen van cryoviale doppen te stroomlijnen, maar systemen waren alleen beschikbaar voor individuele cryovials of voor hele cryoviale rekken, dus ze boden geen kosteneffectieve oplossing. Momenteel zijn er wereldwijd verschillende groepen die het cryopreservatieprotocol van Hagedorn et al.4 gebruiken om de genetische diversiteit van koralen veilig te stellen, en het is belangrijk dat dit werk zich blijft uitbreiden naar meer riffen over de hele wereld. Daarom was een belangrijke overweging bij de ontwikkeling van het huidige protocol de noodzaak om kosteneffectieve en toegankelijke technologieën te gebruiken die gemakkelijk door deze andere groepen konden worden geïmplementeerd en die niet onbetaalbaar zouden zijn voor nieuwe groepen die wilden beginnen met cryopreservatie van koraalsperma.
Een belangrijk onderdeel van het beschreven protocol is de verbeterde verwerking van voorbeeldmetadata via gekoppelde spreadsheets in Microsoft Excel. Gegevensinvoer is over het algemeen eenvoudig, maar er moet worden opgemerkt dat het bewerken van informatie in de automatische gegevensbladen alleen mag worden gedaan door informatie te verwijderen en opnieuw in te voeren, aangezien snelle functies (bijv. Ctrl + C, Ctrl + V) om gegevens te bewerken mogelijk van invloed zijn op gelijktijdige invoer door andere gebruikers en problemen kunnen veroorzaken met het koppelen van gegevens tussen spreadsheets. Een belangrijke metadatacomponent is een unieke identificatiecode (namelijk kolonie-ID) die is gekoppeld aan de donorkolonie en die in alle stadia van het verwerkingstraject aan het monster wordt gekoppeld. Het is van essentieel belang dat de monsterbuisjes duidelijk worden geëtiketteerd met de kolonie-ID op het moment van bundelverzameling, en dat deze informatie nauwkeurig wordt getranscribeerd op alle nieuwe buisjes waarin het monster tijdens de bereiding wordt overgebracht (bijv. tijdens het filteren om eieren en sperma te scheiden, of voor toevoeging aan cryodiluentie). Hoewel het protocol de automatische overdracht van informatie over de monsterkwaliteit van de CASA-operator naar het cryopreservatiewerkstation mogelijk maakt, kunnen er problemen optreden wanneer de internet- of wifi-dekking slecht is. Als er vertragingen optreden bij de gegevensoverdracht, wordt aanbevolen dat de twee werkstations offline werken en afzonderlijke automatische gegevensbladen bijhouden die achteraf kunnen worden afgestemd. De belangrijkste informatie die de cryopreservatie-operator nodig heeft, is de kolonie-ID en de monsterconcentratie, dus het wordt aanbevolen dat de CASA-operator de monsterconcentratie op de monsterbuis schrijft als back-up om ervoor te zorgen dat deze informatie bij de hand is voor cryopreservatievoorbereiding als er een vertraging is bij het uploaden of downloaden van metadata tussen computers.
De keuze van de barcodescanner en cryovials met barcode die voor dit protocol worden gebruikt, kan worden gevarieerd om te voldoen aan het budget en de productbeschikbaarheid; Er zijn echter enkele belangrijke elementen waarmee rekening moet worden gehouden bij hun selectie. De barcodescanner moet de capaciteit hebben voor aangepaste instellingen, met name de mogelijkheid om de specificaties voor gegevensinvoer en de richting van gegevensinvoer te wijzigen. De automatische gegevensbladen die voor dit protocol worden gebruikt, maken gebruik van horizontale invoer, maar in sommige gevallen (bijv. toegang tot de biobank of voor ander laboratoriumgebruik) kan verticale invoer vereist zijn, dus het is belangrijk dat deze functie aanpasbaar is. Hoewel het protocol kan worden gebruikt met zowel 1D- als 2D-barcodes, wordt aanbevolen dat de geselecteerde cryovials een voor mensen leesbare component hebben (bijv. 1D-barcodes bevatten meestal een uniek nummer) om kruiscontrole van de monsterinvoer tijdens cryopreservatie mogelijk te maken. Naast het invoeren van monsters, kan de barcodescanner worden gebruikt om de invoer van sommige metadatavelden te automatiseren door QR-codes te maken en af te drukken voor informatie die wordt herhaald in monsters (bijv. soortnamen, datums en riflocaties) voorafgaand aan het paaien. Deze informatie kan vervolgens snel en eenvoudig in de auto-datasheets worden ingevoerd door te scannen met de barcodescanner. Door barcodes met serienummers aan elk cryo-rek en thermokoppelsonde toe te voegen, is het bovendien ook mogelijk om elke cryopreservatierun te koppelen aan een specifieke set apparatuur in de database, wat handig is voor kwaliteitscontrole en om componenten te identificeren die moeten worden gerepareerd of vervangen.
De beperkende factoren bij de verwerking zijn vaak de tijd die wordt besteed aan het wachten tot bundels uiteenvallen en de tijd die nodig is om het sperma van de eieren te filteren en te scheiden voorafgaand aan CASA en cryopreservatie. Waar mogelijk wordt aanbevolen om monsters te verwerken in de volgorde waarin bundels uiteenvallen; Verdere efficiëntiewinsten kunnen echter worden behaald door het strategisch beheer van monsterverwerkingsorders. Als er bijvoorbeeld 5 of minder cryovialen per kolonie zijn vanwege lage monstervolumes (d.w.z. minder dan 3 ml sperma per kolonie) of een lage spermaconcentratie die een verdunning van 2:1 met cryodiluent vereist (d.w.z. minder dan 2 × 109/ml), dan is het beter om cryodiluens tegelijkertijd aan twee koloniemonsters toe te voegen, zodat ze samen op hetzelfde cryorek kunnen worden uitgevoerd (totaal # beschikbare slots = 11), in plaats van ze apart uit te voeren met dummy’s die de lege ruimtes opvullen. Bovendien is het mogelijk om meerdere cryo-rekken tegelijk te laten draaien (voor monsters >6 ml volume), op voorwaarde dat ervoor wordt gezorgd dat alle processen binnen de 10 minuten cryodiluentietijd kunnen worden voltooid, wat de doorvoer van het monster verder kan verhogen. Wanneer u echter meerdere cryo-rekken gebruikt of meerdere kolonies op een enkel cryo-rek combineert, moet ervoor worden gezorgd dat cryopreservatie-metadata worden toegewezen aan het juiste monster in het automatische gegevensblad, vooral als monsters worden gecryopreserveerd in een andere volgorde dan hun CASA-beoordeling.
Naast de ontwikkeling van de semi-geautomatiseerde workflow, biedt de huidige protocolbeschrijving ook twee methodologische vergelijkingen met betrekking tot spermaconcentratie die tot doel hebben de resultaten van spermaanalyse en cryopreservatie te verbeteren. Over het algemeen zal het verzamelen van 5 ml gametenbundels over 5 ml zeewater (totaal volume 10 ml) resulteren in een spermaconcentratie van 2 × 109 cellen/ml of meer, maar er zijn gevallen waarin de spermaconcentratie lager kan zijn als gevolg van soortverschillen of bundels die tijdens het verzamelen uiteenvallen. Het gebruik van een DMSO-cryodiluent met een hogere concentratie (30% v/v) vermindert de hoeveelheid waarmee het sperma wordt verdund om de variatie van batch tot batch in de spermaconcentratie in de cryovial te minimaliseren. Belangrijk is dat het gebruik van 30% DMSO om de uiteindelijke DMSO-concentratie te bereiken geen invloed heeft op de concentratie- of motiliteitsparameters na dooi, zoals blijkt uit de representatieve gegevens in figuur 3. De tweede methodologische vergelijking biedt een alternatief voor de objectglaasjes met vaste dekglaasjes voor eenmalig gebruik die doorgaans voor CASA worden gebruikt. De grootste uitdaging bij het gebruik van in de handel verkrijgbare objectglaasjes voor de analyse van koraalsperma is dat ze de nauwkeurigheid van de motiliteitsbeoordeling kunnen beïnvloeden doordat sperma aan de coating van het objectglaasje blijft kleven. Het gebruik van de activeringsoplossing lost dit probleem op in veel, maar niet alle monsters, dus het wordt nog steeds aanbevolen om een afzonderlijke CASA-analyse uit te voeren op beweeglijkheid met behulp van een gewoon objectglaasje om betrouwbaarheid en consistentie te garanderen. Het gebruik van een Makler-telkamer overwint de noodzaak om concentratie en beweeglijkheid afzonderlijk te analyseren, en verbetert mogelijk de nauwkeurigheid van concentratiemetingen (Figuur 2), dus het wordt aanbevolen voor gebruik met het huidige protocol. Gezien deze discrepantie in concentratiemetingen, een bevinding die eerder is gerapporteerd20, is het belangrijk om altijd de details van de objectglaasjes in de database op te nemen naast de gegevens over de spermakwaliteit en, waar mogelijk, consistent te zijn in het type kamerglaasje dat wordt gebruikt om variatie van batch tot batch te minimaliseren en te helpen zorgen voor betrouwbare berekeningen van sperma: ei-verhoudingen voor bevruchtingen.
Het semi-geautomatiseerde proces dat hierin wordt beschreven, biedt een gestandaardiseerde en efficiënte route voor cryopreservatie en biobanking van sperma van bedreigde koraalsoorten, met behoud van de bioveiligheid en kwaliteit van het monster. Het beschreven protocol is gemakkelijk overdraagbaar en relatief goedkoop te implementeren in programma’s over de hele wereld die werken aan het veiligstellen van de bestaande koraaldiversiteit met behulp van cryopreservatie, wat essentieel zal zijn om uitsterven te voorkomen en de beschikbare middelen voor rifherstelinspanningen nu en in de toekomst te maximaliseren.
The authors have nothing to disclose.
We danken de traditionele eigenaren van Konomie, het Woppaburra-volk, voor de toestemming om het in dit document beschreven systeem uit te proberen tijdens het paaien op het land in november 2022, en het Konomie Environmental Education Centre voor het gebruik van hun faciliteiten. We willen ook de steun erkennen van het personeel en de wetenschappers van het Australian Institute of Marine Science die het verzamelen en paaien van kolonies binnen de National Sea Simulator hebben gefaciliteerd. Dit werk werd uitgevoerd als een activiteit van het subprogramma Cryopreservatie (RRAP-CP-01) voor het Reef Restoration and Adaptation Program, een partnerschap tussen de Australian Government’s Reef Trust en de Great Barrier Reef Foundation, met aanvullende steun van Taronga Conservation Society Australia, het Taronga Conservation Science Initiative en andere filantropen die de Taronga Foundation ondersteunen.
Ovation ALI-Q 2 VS Pipette Controller – Aliquotting pipette | Vistalab | 2100-1005 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
5 mL serological pipettes (bulk) | Thermo Scientific | Nunc 170355 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
10 mL serological pipettes (bulk) | Thermo Scientific | Nunc 170356 | Fluid handling – measuring sperm volume, addition of cryoprotectant solution, aliquoting samples into cryovials |
P2 0.2–2 µL pipettor | Gilson | F144054M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P10 1–10 µL pipettor | Gilson | F144055M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P20 2–20 µL pipettor | Gilson | F144056M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P200 20–200 µL pipettor | Gilson | F144058M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
P1000 100–1000 µL pipettor | Gilson | F144059M | Preparation of sperm activation solutions and sperm sample handling for concentration and motiliy assessment |
Vacuum pump | Millipore | WP6122050 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
Reusable bottle-top filtration system | Thermo Scientific | DS0320-5045 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
0.22-µm filter discs, mixed cellulose esters | Merck Millipore | GSWP04700 | Preparation of filtered sea water for solution preparation |
Filtered sea water | N/A | – | Base medium for sperm activation and cryoprotectant solutions |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D4540 | Cryoprotectant chemical used at a final concentration of 10% v/v in filtered seawater for sperm cryopreservation |
Caffeine | Sigma-Aldrich | C0750 | Used to activate sperm motility |
BSA heat shock fraction | Sigma-Aldrich | A9647 | Used to minimise sperm adherance to CASA well slides |
15-mL tubes – racked | Thermo Scientific | 339651 | Preparation of sperm activation solution |
50-mL tubes racked | Thermo Scientific | 339653 | For collection of gamete bundles and filtered sperm samples |
Transfer pipettes | Thermo Scientific | Samco 202PK | To aid collection of gamete bundles from the water surface |
100-µm filter baskets | Fisher Scientific | 22363549 | To exclude eggs during separation of the sperm sample |
Eppendorf racks | Interpath | 511029 | Dilution and activation of sperm for concentration and motiliy assessment |
Eppendorf 1.5-mL tube | Eppendorf | 30120086 | Dilution and activation of sperm for concentration and motiliy assessment |
Glass coverslips 18×18 mm | Brand | 4700 45 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
Plain glass slides, precleaned, 75×25 mm | Corning | 2947 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
Haemocytometer | Hausser Scientific | 1492 | Assessment of sperm concentration and motility using phase microscopy |
CASA slides (Leja 20-µm 4 chamber, SC-20-01-04-B) | IMV Technologies | 025107 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
Makler sperm counting chamber (CASA) | IVFStore | SM-373 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
accu-bead® counting beads | Hamilton-Thorne | 710111 | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
CASA system + laptop | Hamilton Thorne | Ceros II | Assessment of sperm concentration and motility using Computer Assisted Sperm Analysis (CASA) |
Safety Glasses | Generic | – | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Lab coat | Long sleeve, full length | – | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Cryogloves (pair) | Tempshield | Mid-Arm | Personal protective equi[pment for use when handling DMSO and liquid nitrogen |
Medium forceps | Generic | – | For removing cryopreserved samples from the cryo racks and manipulating samples in liquid nitrogen |
Barcode scanner (2D compatible) | Zebra | DS2278 | For reading 1D and 2D barcodes on cryovials for sample management |
2.0-mL CryoStorage Vial, external thread, pre-capped, 2D SafeCode (DataMatrix/ECC200), linear and human readable | Eppendorf | 30079434 | Barcoded cryovials for cryopreservation of sperm samples |
Cryovial rack | Simport | T315 | Rack to hold cryovials, with locking base to allow for one hand de-capping and capping |
Freezing racks | Custom | – | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Freezing rack lid | Custom | – | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Freezing Thermos – 1.5 Litre 18/8 Stainless Steel Double-Wall Vacuum Food Container | Isosteel | VA-9683 | Cryopreservation system custom designed for coral sperm, utilising 3D-printed and readily available components. Parts list and assembly instructions are available in Zuchwicz et al., 2021 (doi:10.1016/j.cryobiol.2021.04.005) |
Lab timers | Generic | – | For timing of cryoprotectant equilibration prior to cryopreservation |
Nitrogen bath 9L | BelArt | M16807-9104 | For quenching samples during cryopreservaton and holding samples during sorting and handling |
Thermocouple data logger- multichannel | Omega | HH520 | Temperature monitoring during cryopreservation to determine freezing rate and end point |
Thermocouple probe – Type K | Omega | 5SC-TT-K-30-36 | Temperature monitoring during cryopreservation to determine freezing rate and end point |
Cryo pens/coloured permanent pen | Staedtler Lumocolor | 318 | Optional for marking cryovial lids to assist with sample management |
Dry Shipper – charged | Taylor Wharton | CXR100, or CX500 | For transfer of cryopreserved samples from field/collection sites to the biorepository for storage |