פרוטוקול זה מדגים את השימוש בפלטפורמה רובוטית למיקרו-זיקיה לתאי גזע עצביים בודדים ונוירונים בפרוסות מוח. טכניקה זו היא רב-תכליתית ומציעה שיטה למעקב אחר תאים ברקמה ברזולוציה מרחבית גבוהה.
שאלה מרכזית בנוירוביולוגיה התפתחותית היא כיצד תאי גזע עצביים ותאי האבות יוצרים את המוח. כדי לענות על שאלה זו, יש לתייג, לתמרן, ולעקוב אחר תאים בודדים ברקמת המוח ברזולוציה גבוהה לאורך זמן. משימה זו היא מאתגרת מאוד בשל המורכבות של רקמות במוח. פיתחנו לאחרונה רובוט, המדריך מחט microinjection לתוך רקמת המוח על ניצול תמונות שנרכשו ממיקרוסקופ כדי לספק נפחי femtoliter של פתרון לתאים בודדים. הפעולה הרובוטית מגדילה את התשואה הכוללת שהיא בסדר גודל גדול יותר ממיקרו-צורך ידני ומאפשרת תיוג מדויק ומניפולציה גמישה של תאים בודדים ברקמה חיה. עם זה, אפשר למיקרו-מיקרוסקופים מאות תאים בתוך פרוסה אורגנוטיפית אחת. מאמר זה מדגים את השימוש ברובוט microinjection עבור microinjection אוטומטי של תאים עצביים ותנוירונים בפרוסות רקמת המוח. באופן רחב יותר, זה יכול לשמש על כל רקמת אפיתל שמציעות משטח שניתן להגיע על ידי פיפטה. לאחר ההגדרה, רובוט microinjection יכול לבצע 15 או יותר microinjections לדקה. רובוט microinjection בשל התפוקה שלה ורסטיליות יעשה microinjection טכניקת מניפולציה תא ביצועים גבוהים פשוטה באופן נרחב לשימוש ביו-הנדסה, ביוטכנולוגיה, וביופיזיקה לביצוע ניתוחים של תא יחיד בפרוסות מוח organotypic.
פרוטוקול זה מתאר את השימוש ברובוט כדי למקד ולתמרן תאים בודדים בפרוסות רקמת המוח, התמקדות במיוחד בתאי גזע עצביים יחיד ונוירונים. הרובוט פותח כדי לטפל בשאלה מרכזית בנוירוביולוגיה התפתחותית, כך תאי גזע עצביים וצבי ותאי האבות תורמים למורפוגנזה במוח1,2,3,4,5. כדי לענות על שאלה זו, אחד צריך לתייג ולעקוב אחר תאי גזע עצביים יחיד ולעקוב אחר התקדמות תיור הזמן שלהם לאורך זמן כדי לתאם התנהגות תא יחיד עם מורפוגנזה רקמה. זה יכול להיות מושגת בדרכים שונות, למשל, על ידי אלקטרואידות רקמת המוח ברחם או על ידי תיוג תא יחיד באמצעות מת lipophilic. למרות עוצמה, שיטות אלה חסרות רזולוציה מדויקת של תא יחיד (אלקטרואדות) ו/או את האפשרות לתמרן את החלל התוך תאי (צבע ליפופילי). Microinjection לתאים בודדים פותחה כדי להתגבר על אתגר זה6,7,8. במהלך microinjection, פיפטה מוכנסת לזמן קצר לתוך תא אחד בתוך רקמה שלמה תחת לחץ microinject נפחי femtoliter של reagents9. תיארנו בעבר הליך ידני עבור microinjecting תאי גזע עצביים יחיד ברקמה organotypic (איור 1A)10,11. Microinjection לתוך תאי גזע עצביים מסתמך על השימוש של micropipette כי הוא מוכנס לתוך תאי גזע עצביים יחיד להזריק פתרון המכיל צבע פלורסנט, יחד עם מולקולות אחרות של עניין. פילוח סלקטיבי של תאי גזע עצביים מושגת על ידי התקרבות telencephalon המתפתח דרך פני השטח בחדר (או החדר, לראות קריקטורה איור 1A),שנוצר על ידי קרום פלזמה apical של אבותיים apical (קריקטורה איור 1A). תהליך זה חייב לחזור על עצמו עבור כל תא שהנסוי רוצה להזריק. יתר על כן, ההצלחה של microinjection תלויה בשליטה מדויקת של העומק ומשך של הזרקת micropipette ברקמה. לכן, למרות היתרונות הייחודיים, microinjection ידני הוא מייגע מאוד ודורש תרגול ניכר כדי לבצע בתפוקה סבירה ותשואה, מה שהופך טכניקה זו קשה לשימוש באופן מדרגי. כדי להתגבר על מגבלה זו, פיתחנו לאחרונה רובוט מונחה תמונה, Autoinjector12 (או microinjection רובוט) שיכול לבצע באופן אוטומטי microinjections לתאים בודדים.
הרובוט microinjection עושה שימוש באלגוריתמים מיקרוסקופיים של הדמיה וראייה ממוחשבת כדי למקד במדויק מיקומים ספציפיים בחלל תלת-ממדי בתוך רקמה למיקרו-זיקה (איור 1B). ניתן לבנות את הרובוט microinjection על ידי ביצוע שינויים פשוטים יחסית להגדרת microinjection קיים. השרטוט הכולל של הרובוט microinjection מוצג איור 1C. פיפטה מותקנת במחזיק פיפטה המחובר למניפולטור בעל שלושה צירים. מצלמת מיקרוסקופ משמשת לרכישת תמונות של הרקמה ומחט microinjection. מערכת רגולציה לחץ מותאם אישית משמש כדי לשלוט בלחץ בתוך פיפטה ומיקרו-מאניפולטור הניתן לתכנות משמש כדי לשלוט במיקום של פיפטה microinjector. תמונות המצלמה של הרקמה ופיפטה microinjection משמשים כדי לקבוע את המיקום המרחבי של קצה פיפטה microinjection ואת המיקומים שבהם microinjections צריך להתבצע. לאחר מכן התוכנה מחשבת מסלולים הדרושים כדי להעביר את הפיפטה בתוך הרקמה. כל החומרה נשלטת על ידי התוכנה שפיתחנו בעבר. כל התוכנות נכתבות בשפת קידוד (למשל, פיתון ו-Arduino) ותוכל להוריד https://github.com/bsbrl/Autoinjector הוראות. ממשק המשתמש הגרפי (GUI) מאפשר למשתמש למצוא תמונה של הרקמה והמיקרו-פיפט, ולהתאים אישית את המסלול של מיקרו-ג’ציה. המערכת שלנו יכולה להתבסס באמצעות שינויים פשוטים יחסית למיקרוסקופ הפוך המצויד במסנני ברייטפילד ואפיפלורסנס.
ראשית, אנו מספקים הוראות להכנת פרוסות רקמה אורגנוטיפית במוח עבור microinjection. לאחר מכן הפרוטוקול ממחיש את הפעלת רובוט microinjection ואחריו שלבי הכנה, כגון כיול תנועה פיפטה, כי צריך להיעשות לפני microinjection. לאחר מכן הגדרת הפרמטרים של ההזרקה. לאחר מכן, המשתמש יכול להגדיר את המסלול המשמש את הרובוט microinjection ולהתחיל את הליך ההזרקה. רקמה microinjected (במקרה זה פרוסות רקמה organotypic המוח) ניתן לשמור בתרבות לפרקי זמןשונים בהתאם לעיצוב ניסיוני 10,11. הרקמה יכולה להיות מעובדת כדי לעקוב וללמוד את הזהות והגורל של התאים המוזרקים וצידלהם. לחלופין, ניתן לעקוב אחר התאים microinjected באמצעות הדמיה חיה. במסגרת פרוטוקול זה, אנו מדגימים את השימוש ברובוט כדי microinjection אוטומטי תאים עצביים בפרוסות organotypic של עכבר E14.5 telencephalon גב. הרובוט מסוגל עוד יותר microinjection לתוך נוירונים יילודים בעכבר telencephalon, כמו גם טלנספלון העוברהאנושי 12.
לסיכום, אנו מתארים פלטפורמה רובוטית שניתן להשתמש בה כדי לעקוב אחר תאים בודדים ולתמרן ברקמות. הפלטפורמה עושה שימוש בלחץ וזה, לכן, מאוד תכליתי כמו האופי הכימי של המתחם להזריק. בנוסף, ניתן להתאים אותו לתאי יעד אחרים מאשר תאי גזע. אנו מצפים שהמערכת שלנו תותאם בקלות גם למערכות מודל אחרות.
Microinjection לתוך תאי גזע עצביים יחיד ברקמה מספק רזולוציה מעולה של תא יחידוסיבהזו הוא שימש לנתח את הביולוגיה התא של התקדמות תאי גזע עצביים ומעבר גורל(איור 2;ראהגם 10,11,12). הליך microinjection אוטומטי יכול להתבצע על סוגים אחרים של תאים בעכברים עובריים ורקמות מוח אנושיות. תוצאות מייצגות של microinjection של נוירונים שזה עתה נולדו על ידי מיקוד פני השטח הבסאלי של telencephalon מוצגים איור 3.
העיקרון שנקבע כאן יכול להיות מיושם כדי למקד מספר סוגי תאים שונים במוח העכבר העוברי ומוח אנושי. הראינו בעבר כי הרובוט microinjection יכול לשמש גם כדי למקד תאים חד-אדם האבות האחוריים בעכבר וtelencephalon ונוירונים שזה עתה נולד בעכבר ואדם פיתוח neocortex12. כדי להשיג את התוצאות הטובות ביותר של הליך ההזרקה, אחד צריך למטב את כל השלבים לפני תחילת ההזרקה. חשוב לשקול בזהירות ולייעל את הכנת פרוסות רקמת אורגנוטיפיק בת קיימא ושמורה היטב מרקמות המוח(איור 1). זה חיוני להיות מהיר בהליך החיתוך וחיתוך מאויר באיור 1. עבור הזרקה apical מיקוד APs, אחד צריך לבחור את הפרוסות המציגות את הכיוון האידיאלי של פני השטח apical. עבור הזרקת APs, הכיוון האידיאלי הוא פני השטח apical ניצב לתחתית צלחת פטרי. כל אוריינטציה אחרת תהיה מתירנית גם כן, עם זאת, פני השטח האפתי ניצב לצלחת פטרי מספק שטח פנים רחב יותר להזרקה, ובכך להגדיל את ההצלחה של הזרקה. עבור הזרקה לתוך נוירונים, הכיוון של הפרוסה משחק מעט עד לא השפעה.
לאחר הבחירה של הפרוסות להזרקה, הליך ההזרקה לכל פרוסה אורך כ-5 דקות. בהתחשב בכך אחד עובד עם רקמה חיה, מומלץ מאוד כדי להאיץ את הליך ההזרקה. לכן אנו ממליצים להגדיר את כל הפרמטרים להזרקה באמצעות GUI(איור 1D)לפני הרקמה מוכנה, כדי להפחית את כל זמן המתנה מיותר. לפתרון בעיות נא עיין בקובץ המשלים.
במקרה של תרבות פרוסה לטווח ארוך, צעדים לאחר הליך microinjection אוטומטי יכול להשפיע על הבריאות של התאים ובכך הניסוי. לכן, מומלץ מאוד להריץ בדיקת בקרת איכות ולמטב את תנאי תרבות הפרוסה. כדי להעריך את הכדאיות של תאים לאחר הליך החיתוך וההזרקה, ביצענו תיוג EdU במהלך התרבות, כימתנו את מספר הגרעין הפיפנוטי (פרוקסי לתאים אפופטוטיים) בתרבויות והזריקנורקמה 12. כימות אלה לא חשפו כל השפעה משמעותית של microinjection על הכדאיות רקמות (איור 2C). אנו ממליצים להפעיל בקרות איכות דומות תוך הקמת חיתוך רקמות אורגנוטיפיקצינור microinjection במעבדה.
בהשוואה למיקרו-ציה ידנית, הרובוט microinjection מספק מספר יתרונות. ראשית, עקומת הלמידה עבור המשתמש היא פחות תלולה בהשוואה להזרקה ידנית: משתמש חדש יגיע למיומנות גבוהה לאחר מספר מוגבל של הפעלות, בדרך כלל 1 או 2. שנית, במקרה של מיקרו-ניסיון ידני, מיומנות דומה דורשת חודשים של אימונים. הליך ההזרקה מהיר ויעיל יותר(איור 2B). כימות פרמטרים אלה ומצאנו כי רובוט microinjection התעלה על משתמש ידני מיומן ביחס להצלחה ההזרקה (% של הזרקה מוצלחת / מספר כולל של זריקות) ובמספר הכולל של זריקות ליחידהזמן 12. התוצאה היא עלייה כוללת של 300% ביעילות ההזרקה (% של הזרקה מוצלחת / דקות) עבור רובוט microinjection בהשוואה למשתמש מיומן. העלייה ביעילות הייתה בולטת עוד יותר כאשר משווים את הרובוט microinjection עם משתמש מתחיל והגיע 700%. אחרון חביב, רובוט microinjection יכול להיות מתוכנת בקלות לחקור באופן שיטתי את כל הפרמטרים המרחביים. זה יתרון במיוחד בעת התאמת רובוט microinjection למקד תאים חדשים או רקמות, או בעת שימוש ברובוט microinjection למטרות הדורשות רזולוציה מרחבית שונה.
בניית רובוט microinjection דורש שינויים מינימליים מיקרוסקופ אפינפרוסנט קיים12. בעבר סיפקנו הוראות לעיבוד זה https://github.com/bsbrl/Autoinjector. לאחר הגדרת החומרה, פרוטוקול זה מספק פרטים מתודולוגיים מרכזיים לביצוע בהצלחה של מיקרו-עיטוריות אוטומטיות. בסך הכל, רובוט microinjection יש קצב הזרקה מוצלח של 15.52 + 2.48 זריקות /min, שהוא 15x גדול יותר מאשר משתמש חסר ניסיון (1.09 ± 0.67 זריקות / דקה), ו 3x גדול יותר מאשר משתמש מומחה (4.95 ± 1.05 זריקות / דקה)12. שיפור זה בקצב הזרקה מוצלח מעצים הן משתמשים מתחילים מומחים להזריק תאים נוספים בפרק זמן קצר יותר אשר חיוני כדי לשמר את הכדאיות רקמות. בנוסף, הרובוט microinjection הוא להתאמה אישית ואת המסלול, עומק הזריקה, מספר זריקות, מרווח בין זריקות ניתן לכוונן כל באמצעות GUI. תכונות אלה מאפשרות לרובוט microinjection לשמש ככלי למיטוב ניסויים מייגעים בעבר, ולחקור ניסויים חדשים מיסודו הדורשים תשואה גבוהה יותר מאשר בעבר אפשרי.
המגבלות העיקריות של הליך microinjection שתיארנו כאן קשורות להכנת פרוסות רקמה, צעד מכריע שזקוק אופטימיזציה נרחבת. בנוסף, microinjection מסתמך על הנוכחות של משטח שניתן לגשת על ידי פיפטה זכוכית. תכונה זו מגבילה את סוג הרקמות ומיקומות רקמות שניתן למקד באמצעות microinjection באמצעות ההתקנה הנוכחית.
הרובוט microinjection משתמש כיום בהדמיית brightfield ונעשה בו שימוש בהכנות לחתיכה מוחית במבחנה. בעתיד, רובוט microinjection יכול להיות משולב עם הדמיה 2-פוטן כדי להגדיל את הספציפיות של תא יחיד מיקוד vivo עבור תיוג מולקולרי או צבע. מאמצים כאלה כבר נעשו עבור אלקטרופיזיולוגיה תא יחיד15,16. ההתקן הנוכחי דורש תצפית ידנית על הליך המיקרו-ציה. גרסאות עתידיות יכולות לכלול אסטרטגיות לניקויפיפטות מיקרו-צורך סתום 17 או שילוב של רובוטיםלטיפול בנוזלים 18 עבור מיקרו-חוזים אוטונומיים מלאים. מכשירים אלה יכולים להגדיל את היקף המיקרו-ציה על ידי הזמנות בסדר גודל. התאמת אלגוריתמים לשליטה מקבילה בפיפטותמיקרו-הריון מרובות 19 יכולה לאפשר משלוח מרובה של עשרות צבעים ותריגנטים מולקולריים לאותם תאים באותם ניסויים. יש לזה פוטנציאל לפתוח דרכים חדשות לסינון מולקולרי ברקמה.
רובוט microinjection יכול לשמש כדי לתייג תאים מזוהים מבחינה פונקציונלית באמצעות ברקודים DNA או RNA. זה יכול להיות משולב בתורו עם טכניקות אחרות ניתוח תא יחיד, כגון רצף RNA תא יחיד (scRNAseq) ומיקרוסקופאלקטרונים. התוצאות הראשוניות שלנו מראות כי תאים microinjected וצולהם ניתן לשחזר ולבודד באמצעות ניתוח רקמות ואחריו מיון FACS (טברנה, תוצאות שלא פורסם). לאחר מכן ניתן להשתמש בתאים המיוין של FACS עבור scRNAseq. יתר על כן, תוצאות ראשוניות מראות כי יכולות רזולוציית תא יחיד של רובוט microinjection יכול לשמש בשילוב עם ניתוח מיקרוסקופי אלקטרונים לחקור את הביולוגיה התא על תאי גזע עצביים ברקמה ברזולוציה מרחבית גבוהה (טברנה וילש-Bräuninger, תוצאות שלא פורסם). נתונים אלה מראים כי רובוט microinjection יכול לשמש ככלי למיקרוסקופ אור ואלקטרונים מתאם ברקמה ובמובן רחב יותר, לניתוח רב מודאלי של זהות התא והתנהגות ברקמה.
Microinjection מסתמך על השימוש בלחץ, אחד יכול להרשות לעצמו הזרקת פתרונות עם מורכבות מולקולרית גבוהה (למשל, תעתיק שלם). תכונה זו של microinjection נוצלה בעבר לבידוד ו שיבוט קולטנים מגודריםליגנד 20. לאורך קו זה, הרובוט microinjection עשוי לשמש מידול וללמוד תכונות רב גנית ברמה התאית. בשילוב עם אסטרטגיית תת-מאגר, הרובוט microinjection עשוי לשמש גם כפלטפורמה לזיהוי קבוצה מינימלית של גנים המניעים תכונה מסוימת / התנהגות תאית. עד כה, רובוט microinjection שימש כדי לתמרן את הביוכימיה של התא באמצעות משלוח של mRNA, DNA או חלבונים רקומביננטי10,21,22. אנו צופים יישום של רובוט microinjection לחקר הביופיזיקה של החלל התוך תאי, למשל, על ידי אספקת ננו-חומרים או ננו-מינכינים המאפשרים חישה ו/או מניפולציה של המאפיינים הביופיזיים של החלל התוך תאי.
The authors have nothing to disclose.
המחברים רוצים להכיר בקרן נמיס (ET). SBK מכיר כספים מהמחלקה להנדסת מכונות, המכללה למדעים והנדסה, MnDRIVE RSAM יוזמה של אוניברסיטת מינסוטה, מינסוטה המחלקה להשכלה גבוהה, המכונים הלאומיים לבריאות (NIH) 1R21NS103098-01, 1R01NS111028, 1R34NS11111654, 1R21NS112886 ו 1R01NS11196. GS נתמכה על ידי מלגת המחקר לבוגרים של הקרן הלאומית למדע ומענק הכשרה IGERT NSF.
Chemicals | |||
Agarose, Low Melt | Carl Roth | Cat# 6351.2 | |
Agarose, Wild Range | Sigma-Aldrich | Cat# A2790 | |
Best-CA 221 Glue | Best Klebstoffe GmbH & Co.KG | Cat# CA221-10ml | |
B-27 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17504044 | |
Cellmatrix Type-IA (Collagen, Type !) | FUJIFILM Wako Chemicals | Cat# 637-00653 | |
Distilled Water | |||
DMEM-F12, CO2 independent (w/o Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D2906 | |
DMEM-F12, CO2 independent (with Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D8900 | |
HEPES-NAOH, pH 7.2, 1M (HEPES buffer) | Carl Roth | Cat# 9105.3 | |
L-Glutamine, 200 mM | Thermo Fisher Sientific | Cat# 25030024 | |
Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | Cat# 81381 | |
N-2 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17502048 | |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | Cat# 21103049 | |
Nuclease-free water | Thermo Fisher Scientific | Cat# AM9937 | |
O2 (40%), CO2 (5%), N2 (55%) Mix, 50 liters | |||
Paraformaldehyde | Merck | Cat# 818715 | |
PBS | |||
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | Cat# 15140122 | |
Rat serum | Charles River Laboratories | ||
Japan | |||
Sodium bicarbonate (NaHCO3) | Merck | Cat# 106323 | |
Sodium hydroxide (NaOH) | Merck | Cat# 106482 | |
Tyrode’s salt | Sigma | Cat# T2145-10x1L) | |
Equipment | |||
Borosilicate glass capillaries, 1.2 mm outer diameter x 0.94 mm inner diameter | Sutter Instruments | Cat# BF-120-94-10 | |
Bottle-top filter system, 500 mL | Corning | Cat# 430769 | |
Computer PC | |||
Custom pressure rig | Custom pressure rig | ||
Electronic pressure regulator | Parker Hannifin | Cat# 990-005101-002 | |
Falcon tubes, 15 mL | Corning | Cat# 430791 | |
Falcon tubes, 50 mL | Corning | Cat# 430829 | |
Fine-tip paintbrush | |||
Flaming/ Brown micropipette puller | Sutter Instruments | Cat# P-97 | |
Forceps, Dumont no. 3 | Fine Science Tools | Cat# 11231-30 | |
Forceps, Dumont no. 5 | Fine Science Tools | Cat# 11255-20 | |
Forceps, Dumont no. 55 | Fine Science Tools | Cat# 11252-20 | |
Heating block | Labtech International | Cat # Dri block Digi2 | |
Inverted fluorescence microscope | Zeiss | Cat# Axiovert 200 | |
Light source | Olympus | Cat# Highlight 3100 | |
Manual pressure regulator | McMaster Carr | Cat# 0-60 PSI 41795K3 | |
Microloader Tips | Eppendorf | Cat# 5242956.003 | |
Microcontroller | Arduino | Cat# Arduino Due | |
Microscope camera Hamamatsu Orca Flash 4.0 V3 | |||
Motorized stage XY for microscope | |||
Multiwell plate, 24 wells | Nunc | Cat# 142475 | |
Pasteur pipettes, plastic | |||
Petri dish, 60 x 15 mm | Greiner | Cat# 628102 | |
Petri dish, 35 x 10 mm | Nunc | Cat# 153066 | |
Petri dish, 34 x 14 mm, including Microwell no. 1.5 cover glass | MatTek | Cat# P35G-1.5-14-C | |
Pipette holder | Warner Instruments | Cat# 64-2354 MP-s12u | |
Pipette and tips | |||
Puller filament, 3.0-mm square box filament | Sutter Instrument | Cat# FB330B | |
Slice culture incubation box | MPI-CBG | Cat# custom made | |
Solenoid valve | Cat# LHDA053321H-A | ||
Stereomicroscope | Olympus | Cat# SZX12 | |
Tabletop centrifuge | Heraeus | Cat# 5431622 | |
Thermometer | |||
Three-axis Manipulator | Sensapex Inc | Cat# tree-axis uMP | |
Vibratome | Leica | Cat# VT1000s | |
Whole-embryo-culture-system incubator | Ikemoto Company | Cat# RKI-10-0310 | |
Waterbath | |||
Software and Algorithms | |||
Arduino | Arduino | ||
Fiji | RRID: SCR_002285 | ||
Python | Python Software foundation | Python 2.7.12 | |
ZEN | RRID: SCR_013672 |