このプロトコルは、脳スライス中の単一の神経幹細胞およびニューロンへのマイクロインジェクションのためのロボットプラットフォームの使用を実証する。この技術は多目的であり、高い空間分解能を持つ組織の細胞を追跡する方法を提供する。
発生神経生物学の中心的な問題は、神経幹細胞と前駆細胞がどのように脳を形成するかである。この質問に答えるためには、時間の経過とともに高解像度の脳組織の単一の細胞にラベルを付け、操作し、従う必要があります。このタスクは、脳内の組織の複雑さのために非常に困難です。最近では、顕微鏡から取得した画像を利用して、マイクロインジェクションニードルを脳組織に導き、フェムトリットルの溶液を単一細胞に送達するロボットを開発しました。ロボット操作は、手動マイクロインジェクションよりも桁違いに大きい全体的な収量を増加させ、生体組織における単一細胞の正確なラベリングと柔軟な操作を可能にします。これにより、1つのorganotypicスライス内に何百もの細胞をマイクロ注入することができます。この記事では、脳組織スライスにおける神経前駆細胞およびニューロンの自動マイクロインジェクションにマイクロインジェクションロボットを使用する方法を示します。より広い意味では、ピペットで到達可能な表面を特徴とする任意の上皮組織に使用することができる。一度設定すると、マイクロインジェクションロボットは毎分15回以上のマイクロインジェクションを実行できます。マイクロインジェクションロボットは、そのスループットとバーサリティのために、生物学的な脳スライスで単細胞分析を行うためのバイオエンジニアリング、バイオテクノロジー、および生物物理学で使用される広く簡単な高性能細胞操作技術をマイクロインジェクションにします。
このプロトコルは、特に単一の神経幹細胞およびニューロンに焦点を当てた脳組織スライス内の単一細胞を標的と操作するためのロボットの使用を記述する。このロボットは、神経生物学の中心的な問題に対処するために開発されました, それは神経幹と前駆細胞が脳形態形成に貢献する方法であります1,2,3,4,5.この質問に答えるためには、単一の神経幹細胞にラベルを付けて追跡し、時間の経過とともに系統の進行に従って、単一細胞の挙動と組織形態形成を相関させる必要があります。これは、子宮内の脳組織を電気ポレートするか、親油性ダイスを使用して単一細胞を標識することによって、異なる方法で達成することができる。強力ですが、これらの方法は、正確な単一細胞分解能(エレクトロポレーション)および/または細胞内空間(親油性色素)を操作する可能性を欠いている。この課題を克服するために単一細胞へのマイクロインジェクション6,7,8.マイクロインジェクションの間に、ピペットは、試薬9のフェムトリットル量をマイクロインジェクトする圧力下で、無傷の組織内の単一の細胞に短時間挿入される。我々は、前もって、単一神経幹細胞を単一神経幹細胞に対して単一の組織にマイクロインジェクトする手作業を説明した(図1A)10,11。神経幹細胞へのマイクロインジェクションは、単一の神経幹細胞に挿入されるマイクロピペットを使用して、目的の他の分子と共に蛍光色素を含む溶液を注入することに依存しています。神経幹細胞の選択的標的化は、心室表面を介して発達中のテレンセバロン(または心室、図1Aの漫画を参照)に近づくことで達成される。それは、アプリカル前駆細胞の頭膜形質膜によって形成される(図1Aの漫画)。このプロセスは、実験者が注入することを望む各細胞に対して繰り返されなければならない。さらに、マイクロインジェクションの成功は、組織におけるマイクロピペット注入の深さと持続時間の正確な制御に依存する。したがって、独自の利点にもかかわらず、手動マイクロインジェクションは非常に退屈であり、合理的なスループットと収率で実行するためにかなりの練習が必要であり、この技術はスケーラブルな方法で使用することが困難になります。この制限を克服するために、我々は最近、単一細胞へのマイクロインジェクションを自動的に行うことができる画像誘導ロボット、オートインジェクタ12(またはマイクロインジェクションロボット)を開発しました。
マイクロインジェクションロボットは、顕微鏡イメージングとコンピュータビジョンアルゴリズムを利用して、組織内の3次元空間内の特定の位置を精密に標的化してマイクロインジェクションを行います(図1B)。マイクロインジェクションロボットは、既存のマイクロインジェクション設定に比較的簡単な修正を加えることで構築できます。マイクロインジェクションロボットの全体概略を 図1Cに示します。ピペットは3軸マニピュレータに取り付けられたピペットホルダーに取り付けられます。顕微鏡カメラは、組織とマイクロ注射針の画像を取得するために使用されます。カスタム圧力制御システムは、ピペット内部の圧力を制御するために使用され、プログラム可能なマイクロマニピュレータは、マイクロインジェクターピペットの位置を制御するために使用されます。組織とマイクロインジェクションピペットのカメラ画像は、マイクロインジェクションピペット先端の空間位置とマイクロインジェクションを行う必要がある場所を決定するために使用されます。ソフトウェアは、その後、組織内のピペットを移動するために必要な軌道を計算します。すべてのハードウェアは、以前に開発したソフトウェアによって制御されます。すべてのソフトウェアは、コーディング言語(例えば、PythonとArduino)で書かられており、指示https://github.com/bsbrl/Autoinjectorからダウンロードすることができます。グラフィカルユーザーインターフェース(GUI)は、ユーザーが組織とマイクロピペットを画像化し、マイクロインジェクションの軌跡をカスタマイズすることができます。当社のシステムは、明視野フィルターとエピ蛍光フィルターを搭載した反転顕微鏡に比較的簡単な変更を使用して確立することができます。
まず、マイクロインジェクション用の脳の組織性組織スライスの準備について説明します。次に、このプロトコルは、マイクロインジェクションロボットの開始と、マイクロインジェクションの前に行う必要があるピペットモーションキャリブレーションなどの準備ステップを開始することを示しています。その後、射出パラメータを定義します。この後、ユーザはマイクロインジェクションロボットが使用する軌道を定義し、射出手順を開始することができます。マイクロ注入された組織(この場合は脳のorganotypic組織スライス)は、実験計画10、11に応じて異なる期間培養中に保つことができる。組織は、注入された細胞とその子孫の同一性と運命に従い、研究するために処理することができる。あるいは、マイクロ注入された細胞は、ライブイメージングを用いて追跡することができる。このプロトコルの範囲内で、我々は自動的にマウスE14.5後回りのテレンスファロンの組織ノチピックスライス中の神経前駆細胞をマイクロインジェクションするロボットの使用を実証する。ロボットは、マウスのテレンスファロンの新生児ニューロンにマイクロインジェクションを加えることができるだけでなく、ヒト胎児のテレンスファロン12でも可能である。
要約すると、我々は、組織の単一細胞を従い、操作するために使用することができるロボットプラットフォームを記述する。プラットフォームは圧力を利用し、したがって、注入する化合物の化学的性質に関して非常に汎用性がある。また、幹細胞以外の標的細胞に適合させることができる。当社のシステムは、他のモデルシステムにも容易に適応できると期待しています。
組織における単一の神経幹細胞へのマイクロインジェクションは、優れた単一細胞分解能を提供し、そのために神経幹細胞の進行と運命遷移の細胞生物学を解剖するために使用されてきた(図2;10,11,12も参照)。自動マイクロインジェクション手順は、胚性マウスおよびヒト脳組織の両方の他のタイプの細胞に対して行うことができる。テレンスファロンの基底面を標的とした新生児ニューロンのマイクロインジェクションの代表的な結果を図3に示す。
ここで確立された原理は、胚性マウス脳およびヒト脳におけるいくつかの異なる細胞型を標的に適用することができる。我々は以前、マイクロインジェクションロボットがマウス後脳およびテレンセバロンおよびヒト新皮質12の新生児ニューロンの単一の前駆細胞を標的にすることもできることを示した。注射手順の最良の結果を得るためには、注射を開始する前にすべての手順を最適化する必要があります。脳組織から生存可能でよく保存された組織組織スライスの調製を慎重に検討し、最適化することが重要です(図1)。図 1に示す解剖とスライスの手順を迅速に行うことは非常に重要です。AP をターゲットとするアピカル インジェクションの場合、アピカル サーフェスの理想的な方向を示すスライスを選択する必要があります。AP の注入の場合、理想的な方向はペトリ皿の底に垂直な尖形表面である。他の向きも同様に寛容になりますが、ペトリ皿に垂直な尖方面は射出のためのより広い表面積を提供し、注射の成功を高めます。ニューロンへの注入の場合、スライスの向きはほとんど効果がありません。
注入するスライスが選択されると、スライスごとの注入手順は約5分かかります。1つは、生体組織で動作することを考慮, それは注射手順をスピードアップすることが強くお勧めします.この目的のために、不必要な待ち時間を減らすために、GUI(図1D)を介して注入するためのすべてのパラメータを設定することをお勧めします。トラブルシューティングについては、補足ファイルを参照してください。
長期スライス培養の場合、自動マイクロインジェクション手順の後のステップは、細胞の健康に影響を及ぼし、それによって実験を行う。そのため、品質管理テストを実行し、スライスのカルチャ条件を最適化することを強くお勧めします。スライスおよび注入手順の後の細胞生存率を評価するために、培養中にEdU標識を行い、培養および注入組織12におけるピノスティック核(アポトーシス細胞のプロキシ)の数を定量した。これらの定量は、組織の生存率に対するマイクロインジェクションの有意な影響を明らかにしなかった(図2C)。ラボで、組織語の組織スライスとマイクロインジェクションパイプラインを確立しながら、同様の品質管理を実行することをお勧めします。
手動マイクロインジェクションと比較して、マイクロインジェクションロボットはいくつかの利点を提供します。まず、ユーザーの学習曲線は手動注入と比較して急ではありません:新しいユーザーは、限られたセッション数(通常は1または2)の後に高い能力に達します。第二に、手動マイクロインジェクションの場合、同等の熟練度は数ヶ月の訓練を必要とする。射出手順は、より速く、より効率的です(図2B)。我々は、これらのパラメータを定量化し、マイクロインジェクションロボットが注入の成功(成功した注射/注射の総数の割合)と単位時間あたりの注入の総数に関して熟練した手動ユーザーを上回ることを発見した。これにより、マイクロインジェクションロボットの注入効率が、熟練したユーザーと比較して全体で300%増加します(成功した注入/分の割合)。マイクロインジェクションロボットを初心者ユーザーと比較すると効率の向上がさらに顕著になり、700%に達しました。最後に、マイクロインジェクションロボットは、すべての空間パラメータを体系的に探索するように簡単にプログラムすることができます。これは、マイクロインジェクションロボットを新しい細胞や組織を標的にしたり、異なる空間分解能を必要とする目的でマイクロインジェクションロボットを使用したりする場合に特に有利です。
マイクロインジェクションロボットを構築するには、既存のエピ蛍光顕微鏡12への変更を最小限に抑える必要がある。私たちは以前、この適応のための指示をhttps://github.com/bsbrl/Autoinjectorで提供しました。ハードウェアがセットアップされると、このプロトコルは、自動マイクロインジェクションを正常に実行するための主要な方法論的詳細を提供します。全体として、マイクロインジェクションロボットの注射速度は15.52 + 2.48で、経験の浅いユーザー(1.09±0.67注射/分)より15倍大きく、エキスパートユーザー(4.95±1.05注射/分)12よりも3倍大きい。成功した注入率のこの改善は、組織の生存率を維持するために不可欠である短い時間でより多くの細胞を注入する初心者と専門家のユーザーの両方を力に.さらに、マイクロインジェクションロボットはカスタマイズ可能であり、軌道、射出の深さ、注入の数、注入の間隔はすべてGUIを使用して調整することができる。これらの機能により、マイクロインジェクションロボットをツールとして使用して、以前の作業性の高い実験を最適化し、以前よりも高い収量を必要とする根本的に新しい実験を探求することができます。
ここで説明したマイクロインジェクション手順の主な制限は、組織スライスの調製に関連しており、大規模な最適化が必要な重要なステップです。さらに、マイクロインジェクションは、ガラスピペットによって接近することができる表面の存在に依存する。この機能は、現在のセットアップを使用してマイクロインジェクションを介して標的とすることができる組織および組織の位置のタイプを制限する。
マイクロインジェクションロボットは現在、明視野イメージングを使用し、インビトロ脳スライス製剤に使用されています。将来的には、マイクロインジェクションロボットを2光子イメージングと組み合わせて、分子タグ付けや色素タグ付けのための生体内での単一細胞ターゲティングの特異性を高めることができる。このような努力は、単一細胞の電気生理学15、16のために既になされている。現在の装置はマイクロ注入プロシージャの手動観察を要求する。将来のバージョンには、詰まったマイクロインジェクションピペット17を洗浄するための戦略や、多重化された完全自律マイクロインジェクションのための流体ハンドリングロボット18の統合が含まれる可能性があります。これらのデバイスは、マイクロインジェクションの規模を桁違いに増加させる可能性があります。複数のマイクロインジェクションピペット19の並列制御のためのアルゴリズムを適応させることは、同じ実験の中で同じ細胞に数十種の色素および分子試薬の多重化された送達を可能にする可能性がある。これは、組織の分子スクリーニングのための新しい道を開く可能性を秘めています。
マイクロインジェクションロボットは、DNAまたはRNAバーコードを使用して機能的に同定された細胞にタグを付けるために使用することができます。これは、単一細胞RNAシーケンシング(scRNAeq)および電子顕微鏡法などの他の単一細胞分析技術と組み合わせることができます。我々の予備的な結果は、微小注入された細胞とその子孫を回復し、組織解離を使用して単離し、続いてFACS分類(タベルナ、未発表の結果)を示している。FACS ソートされたセルは、scRNAeq に使用できます。さらに、マイクロインジェクションロボットの単一細胞分解能を電子顕微鏡解析と組み合わせて使用して、高い空間分解能(タベルナおよびウィルシュ・ブロイニンガー、未発表の結果)で組織中の神経幹細胞の細胞生物学を探索できることが予備的な結果で明記されています。これらのデータは、微小インジェクションロボットが、組織における相関光および電子顕微鏡のツールとして、より広い意味で、組織における細胞同一性および挙動のマルチモーダル分析に使用できることを示唆している。
マイクロインジェクションは圧力の使用に依存しており、分子複雑度の高い溶液(例えば、トランスクリプトーム全体)を注入する余裕があります。マイクロインジェクションのこの特徴は、リガンドゲート受容体20を単離しクローニングするために過去に利用されてきた。このラインに沿って、マイクロインジェクションロボットは、細胞レベルで多元的な形質をモデル化し、研究するために使用される可能性があります。サブプール戦略と組み合わせることで、マイクロインジェクションロボットは、特定の形質/細胞挙動を駆動する遺伝子の最小セットを識別するためのプラットフォームとしても使用される可能性があります。これまで、マイクロインジェクションロボットは、mRNA、DNAまたは組換えタンパク質10、21、22の送達を介して細胞の生化学を操作するために使用されてきた。マイクロインジェクションロボットは、細胞内空間の生物物理学を調査する際、例えば、細胞内空間の生体物理特性のセンシングや操作を可能にするナノ材料やナノマシンを提供する場合に、その応用を予見する。
The authors have nothing to disclose.
著者たちはノミス財団(ET)を認めたいと考えています。SBKは、ミネソタ大学のMnDRIVE RSAMイニシアチブ、ミネソタ大学高等教育科、国立衛生研究所(NIH)1R21NS103098-01、1R01NS1111028、1R34NS1116888、1R21NS112886666および1R211111Rの機械工学部門からの資金を認めています。GSは、国立科学財団大学院研究フェローシップとNSF IGERTトレーニング助成金によって支援されました。
Chemicals | |||
Agarose, Low Melt | Carl Roth | Cat# 6351.2 | |
Agarose, Wild Range | Sigma-Aldrich | Cat# A2790 | |
Best-CA 221 Glue | Best Klebstoffe GmbH & Co.KG | Cat# CA221-10ml | |
B-27 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17504044 | |
Cellmatrix Type-IA (Collagen, Type !) | FUJIFILM Wako Chemicals | Cat# 637-00653 | |
Distilled Water | |||
DMEM-F12, CO2 independent (w/o Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D2906 | |
DMEM-F12, CO2 independent (with Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D8900 | |
HEPES-NAOH, pH 7.2, 1M (HEPES buffer) | Carl Roth | Cat# 9105.3 | |
L-Glutamine, 200 mM | Thermo Fisher Sientific | Cat# 25030024 | |
Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | Cat# 81381 | |
N-2 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17502048 | |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | Cat# 21103049 | |
Nuclease-free water | Thermo Fisher Scientific | Cat# AM9937 | |
O2 (40%), CO2 (5%), N2 (55%) Mix, 50 liters | |||
Paraformaldehyde | Merck | Cat# 818715 | |
PBS | |||
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | Cat# 15140122 | |
Rat serum | Charles River Laboratories | ||
Japan | |||
Sodium bicarbonate (NaHCO3) | Merck | Cat# 106323 | |
Sodium hydroxide (NaOH) | Merck | Cat# 106482 | |
Tyrode’s salt | Sigma | Cat# T2145-10x1L) | |
Equipment | |||
Borosilicate glass capillaries, 1.2 mm outer diameter x 0.94 mm inner diameter | Sutter Instruments | Cat# BF-120-94-10 | |
Bottle-top filter system, 500 mL | Corning | Cat# 430769 | |
Computer PC | |||
Custom pressure rig | Custom pressure rig | ||
Electronic pressure regulator | Parker Hannifin | Cat# 990-005101-002 | |
Falcon tubes, 15 mL | Corning | Cat# 430791 | |
Falcon tubes, 50 mL | Corning | Cat# 430829 | |
Fine-tip paintbrush | |||
Flaming/ Brown micropipette puller | Sutter Instruments | Cat# P-97 | |
Forceps, Dumont no. 3 | Fine Science Tools | Cat# 11231-30 | |
Forceps, Dumont no. 5 | Fine Science Tools | Cat# 11255-20 | |
Forceps, Dumont no. 55 | Fine Science Tools | Cat# 11252-20 | |
Heating block | Labtech International | Cat # Dri block Digi2 | |
Inverted fluorescence microscope | Zeiss | Cat# Axiovert 200 | |
Light source | Olympus | Cat# Highlight 3100 | |
Manual pressure regulator | McMaster Carr | Cat# 0-60 PSI 41795K3 | |
Microloader Tips | Eppendorf | Cat# 5242956.003 | |
Microcontroller | Arduino | Cat# Arduino Due | |
Microscope camera Hamamatsu Orca Flash 4.0 V3 | |||
Motorized stage XY for microscope | |||
Multiwell plate, 24 wells | Nunc | Cat# 142475 | |
Pasteur pipettes, plastic | |||
Petri dish, 60 x 15 mm | Greiner | Cat# 628102 | |
Petri dish, 35 x 10 mm | Nunc | Cat# 153066 | |
Petri dish, 34 x 14 mm, including Microwell no. 1.5 cover glass | MatTek | Cat# P35G-1.5-14-C | |
Pipette holder | Warner Instruments | Cat# 64-2354 MP-s12u | |
Pipette and tips | |||
Puller filament, 3.0-mm square box filament | Sutter Instrument | Cat# FB330B | |
Slice culture incubation box | MPI-CBG | Cat# custom made | |
Solenoid valve | Cat# LHDA053321H-A | ||
Stereomicroscope | Olympus | Cat# SZX12 | |
Tabletop centrifuge | Heraeus | Cat# 5431622 | |
Thermometer | |||
Three-axis Manipulator | Sensapex Inc | Cat# tree-axis uMP | |
Vibratome | Leica | Cat# VT1000s | |
Whole-embryo-culture-system incubator | Ikemoto Company | Cat# RKI-10-0310 | |
Waterbath | |||
Software and Algorithms | |||
Arduino | Arduino | ||
Fiji | RRID: SCR_002285 | ||
Python | Python Software foundation | Python 2.7.12 | |
ZEN | RRID: SCR_013672 |