Este protocolo demonstra o uso de uma plataforma robótica para microinjeção em células-tronco neurais únicas e neurônios em fatias cerebrais. Esta técnica é versátil e oferece um método de rastreamento de células em tecido com alta resolução espacial.
Uma questão central na neurobiologia do desenvolvimento é como as células neurais de tronco e progenitor formam o cérebro. Para responder a essa pergunta, é preciso rotular, manipular e seguir células únicas no tecido cerebral com alta resolução ao longo do tempo. Esta tarefa é extremamente desafiadora devido à complexidade dos tecidos no cérebro. Recentemente desenvolvemos um robô que guia uma agulha de microinjeção no tecido cerebral ao utilizar imagens adquiridas a partir de um microscópio para fornecer volumes femtoliter de solução em células únicas. A operação robótica aumenta resultando em um rendimento global que é uma ordem de magnitude maior do que a microinjeção manual e permite rotulagem precisa e manipulação flexível de células únicas em tecido vivo. Com isso, pode-se microinjetar centenas de células dentro de uma única fatia organotípica. Este artigo demonstra o uso do robô de microinjeção para microinjeção automatizada de células progenitoras neurais e neurônios nas fatias de tecido cerebral. De forma mais ampla, pode ser usado em qualquer tecido epitelial com uma superfície que pode ser alcançada pela pipeta. Uma vez configurado, o robô de microinjeção pode executar 15 ou mais microinjeções por minuto. O robô de microinjeção devido à sua produtividade e versatilidade fará da microinjeção uma técnica de manipulação celular de alto desempenho amplamente simples para ser usada em bioengenharia, biotecnologia e biofísica para a realização de análises unicelulares em fatias cerebrais organotípicas.
Este protocolo descreve o uso de um robô para atingir e manipular células únicas em fatias de tecido cerebral, focando em particular em células-tronco neurais e neurônios únicos. O robô foi desenvolvido para abordar uma questão central na neurobiologia do desenvolvimento, que é como as células neurais e progenitoras contribuem para a morfogênese cerebral1,2,3,4,5. Para responder a essa pergunta, é preciso rotular e rastrear células-tronco neurais únicas e seguir sua progressão de linhagem ao longo do tempo para correlacionar o comportamento de célula única com morfogênese tecidual. Isso pode ser alcançado de diferentes maneiras, por exemplo, eletroporando tecido cerebral no útero ou rotulando célula única usando mortes lipofílicas. Embora poderosos, esses métodos carecem de resolução celular única precisa (eletroporação) e/ou a possibilidade de manipular o espaço intracelular (corante lipofílico). A microinjeção em células únicas foi desenvolvida para superar este desafio6,7,8. Durante a microinjeção, uma pipeta é brevemente inserida em uma única célula dentro de tecido intacto sob pressão para microinjetar volumes femtoliter de reagentes9. Descrevemos anteriormente um procedimento manual para microinjeção de células-tronco neurais únicas em tecido organotípico(Figura 1A)10,11. A microinjeção em células-tronco neurais depende do uso de uma micropipette que é inserida em células-tronco neurais únicas para injetar uma solução contendo um corante fluorescente, juntamente com outras moléculas de interesse. O direcionamento seletivo das células-tronco neurais é alcançado aproximando-se do telencephalon em desenvolvimento através da superfície ventricular (ou ventrículo, ver desenho animado na Figura 1A), que é formado pela membrana plasmática apical de progenitores a apical (desenho animado na Figura 1A). Esse processo deve ser repetido para cada célula que o experimentador deseja injetar. Além disso, o sucesso da microinjeção depende do controle preciso da profundidade e duração da injeção de micropipette no tecido. Assim, apesar das vantagens únicas, a microinjeção manual é extremamente tediosa e requer uma prática considerável para realizar a rendimento e rendimento razoável, dificultando o uso dessa técnica de forma escalável. Para superar essa limitação, desenvolvemos recentemente um robô guiado por imagem, o Autoinjetor12 (ou robô de microinjeção) que pode realizar automaticamente microinjeções em células únicas.
O robô de microinjeção faz uso de algoritmos microscópicos de imagem e visão computacional para atingir precisamente locais específicos em espaço 3D dentro do tecido para microinjeção(Figura 1B). O robô de microinjeção pode ser construído fazendo modificações relativamente simples em uma configuração de microinjeção existente. O esquema geral do robô de microinjeção é mostrado na Figura 1C. Uma pipeta é montada em um suporte de pipeta ligado a um manipulador de três eixos. Uma câmera de microscópio é usada para adquirir imagens do tecido e da agulha de microinjeção. Um sistema de regulação de pressão personalizado é usado para controlar a pressão dentro da pipeta e um micromanipulador programável é usado para controlar a posição da pipeta microinjetor. As imagens da câmera da pipeta tecidual e de microinjeção são usadas para determinar a localização espacial da ponta da pipeta de microinjeção e os locais onde as microinjeções precisam ser realizadas. O software então calcula as trajetórias necessárias para mover a pipeta dentro do tecido. Todo o hardware é controlado pelo software que desenvolvemos anteriormente. Todo o software é escrito em linguagem de codificação (por exemplo, Python e Arduino) e pode ser baixado a partir de https://github.com/bsbrl/Autoinjector com instruções. A interface gráfica do usuário (GUI) permite ao usuário imaginar o tecido e a micropipette, e personalizar a trajetória da microinjeção. Nosso sistema pode ser estabelecido usando modificações relativamente simples em um microscópio invertido equipado com filtros de campo brilhante e epi-fluorescência.
Primeiro, fornecemos instruções sobre o preparo de fatias de tecido organoíspica cerebral para microinjeção. Em seguida, o protocolo ilustra a partida do robô de microinjeção seguido de etapas preparatórias, como a calibração do movimento da pipeta, que precisam ser feitas antes da microinjeção. Isso é seguido pela definição dos parâmetros de injeção. Depois disso, o usuário pode definir a trajetória usada pelo robô de microinjeção e iniciar o procedimento de injeção. O tecido microinjetado (neste caso, as fatias de tecido organoíspico cerebral) pode ser mantido na cultura por diferentes períodos de tempo, dependendo do desenho experimental10,11. O tecido pode ser processado para seguir e estudar a identidade e o destino das células injetadas e sua descendência. Alternativamente, as células microinjetadas podem ser seguidas usando imagens vivas. No âmbito deste protocolo, demonstramos o uso do robô para microinjeção células progenitoras neurais em fatias organotipípicas do rato E14,5 telencephalon dorsal. O robô é ainda capaz de microinjeção em neurônios recém-nascidos no telencephalon do rato, bem como no teleencefalo fetal humano12.
Em resumo, descrevemos uma plataforma robótica que pode ser usada para seguir e manipular células únicas no tecido. A plataforma faz uso de pressão e é, portanto, extremamente versátil quanto à natureza química do composto a injetar. Além disso, pode ser adaptado para outras células-alvo além de células-tronco. Esperamos que nosso sistema seja facilmente adaptado a outros sistemas de modelos também.
A microinjeção em células-tronco neurais únicas no tecido proporciona excelente resolução celular única e, por essa razão, tem sido usada para dissecar a biologia celular da progressão de células-tronco neurais e transição do destino(Figura 2; ver também10,11,12). O procedimento automatizado de microinjeção pode ser realizado em outros tipos de células em camundongos embrionários e tecido cerebral humano. Resultados representativos da microinjeção de neurônios recém-nascidos mirando a superfície basal do telencephalon são mostrados na Figura 3.
O princípio aqui estabelecido pode ser aplicado para atingir vários tipos de células diferentes em cérebros de camundongos embrionários e cérebros humanos. Já mostramos anteriormente que o robô de microinjeção também pode ser usado para atingir células progenitoras únicas no cérebro traseiro do rato e telencephalon e neurônios recém-nascidos no camundongo e no desenvolvimento humano do neocórtex12. Para obter os melhores resultados do procedimento de injeção, deve-se otimizar todas as etapas antes de iniciar a injeção. É importante considerar e otimizar cuidadosamente a preparação de fatias de tecido organotípica viável e bem preservada do tecido cerebral(Figura 1). É crucial ser rápido no procedimento de dissecção e corte ilustrado na Figura 1. Para a injeção apical direcionada aos APs, deve-se escolher as fatias mostrando a orientação ideal da superfície apical. Para a injeção de APs, a orientação ideal é a superfície apical perpendicular ao fundo da placa de Petri. Qualquer outra orientação também será permissiva, no entanto, a superfície apical perpendicular à placa de Petri fornece uma área de superfície mais ampla para injeção, aumentando assim o sucesso da injeção. Para injeção em neurônios, a orientação da fatia joga pouco ou nenhum efeito.
Uma vez selecionadas as fatias a serem injetas, o procedimento de injeção por fatia leva aproximadamente 5 minutos. Considerando que se trabalha com tecido vivo, é altamente recomendável acelerar o procedimento de injeção. Para isso, recomendamos definir todos os parâmetros para injeção através da GUI (Figura 1D) antes que o tecido esteja pronto, para reduzir qualquer tempo de espera desnecessário. Para solucionar problemas, consulte o arquivo Suplementar.
No caso da cultura de fatias de longo prazo, passos após o procedimento automatizado de microinjeção podem afetar a saúde das células e, assim, o experimento. Por isso, é altamente recomendável executar um teste de controle de qualidade e otimizar as condições de cultura de fatias. Para avaliar a viabilidade celular após o procedimento de corte e injeção, realizamos a rotulagem edu durante a cultura e quantificamos o número de núcleos pitnóticos (um proxy para células apoptóticas) nas culturas e tecido injetado12. Essas quantificações não revelaram nenhum impacto significativo da microinjeção na viabilidade tecidual(Figura 2C). Recomendamos executar controles de qualidade semelhantes ao estabelecer o corte de tecido organotipado e o oleoduto de microinjeção no laboratório.
Comparado com a microinjeção manual, o robô de microinjeção oferece várias vantagens. Primeiro, a curva de aprendizado para o usuário é menos íngreme em comparação com a injeção manual: um novo usuário atingirá uma alta proficiência após um número limitado de sessões, tipicamente 1 ou 2. Em segundo lugar, no caso da microinjeção manual, uma proficiência comparável requer meses de treinamento. O procedimento de injeção é mais rápido e eficiente(Figura 2B). Quantificamos esses parâmetros e descobrimos que o robô de microinjeção superou um usuário manual qualificado em relação ao sucesso da injeção (% de injeção bem sucedida/número total de injeções) e no número total de injeções por unidade de tempo12. Isso resulta em um aumento global de 300% da eficiência da injeção (% de injeção/min bem sucedida) para o robô de microinjeção em comparação com um usuário qualificado. O aumento da eficiência foi ainda mais acentuado quando se comparava ao robô de microinjeção com um usuário iniciante e chegou a 700%. Por último, mas não menos importante, o robô de microinjeção pode ser facilmente programado para explorar sistematicamente todos os parâmetros espaciais. Isso é particularmente vantajoso ao adaptar o robô de microinjeção para atingir novas células ou tecidos, ou ao usar o robô de microinjeção para fins que requerem resolução espacial diferente.
A construção do robô de microinjeção requer alterações mínimas em um microscópio de epi-fluorescência existente12. Já fornecemos instruções para esta adaptação em https://github.com/bsbrl/Autoinjector. Uma vez que o hardware é configurado, este protocolo fornece detalhes metodológicos importantes para realizar com sucesso microinjeções automatizadas. No geral, o robô de microinjeção tem uma taxa de injeção bem sucedida de 15,52 + 2,48 injeções/min, o que é 15x maior que um usuário inexperiente (1,09 ± 0,67 injeções/min), e 3x maior que um usuário especialista (4,95 ± 1,05 injeções/min)12. Essa melhoria na taxa de injeção bem-sucedida capacita tanto os usuários iniciantes quanto os especialistas a injetar mais células em um período menor de tempo, o que é essencial para preservar a viabilidade do tecido. Além disso, o robô de microinjeção é personalizável e a trajetória, profundidade da injeção, número de injeções, espaçamento entre injeções podem ser todos sintonizados usando a GUI. Esses recursos permitem que o robô de microinjeção seja usado como uma ferramenta para otimizar experimentos anteriormente trabalhosos, e para explorar fundamentalmente novos experimentos que requerem maior rendimento do que o possível anteriormente.
As principais limitações do procedimento de microinjeção que descrevemos aqui estão relacionadas à preparação de fatias teciduais, um passo crucial que precisa de ampla otimização. Além disso, a microinjeção conta com a presença de uma superfície que pode ser abordada pela pipeta de vidro. Esse recurso limita o tipo de tecidos e locais de tecido que podem ser direcionados através de microinjeção usando a configuração atual.
O robô de microinjeção atualmente usa imagens de campo brilhante e tem sido usado em preparações in vitro de fatias cerebrais. No futuro, o robô de microinjeção poderia ser combinado com imagens de 2 fótons para aumentar a especificidade do alvo de célula única in vivo para marcação molecular ou de corante. Tais esforços já foram feitos para a eletrofisiologia celular única15,16. O dispositivo atual requer observação manual do procedimento de microinjeção. As versões futuras podem incluir estratégias para limpar pipetas de microinjeção entupidas17 ou integração de robôs de manuseio de fluidos18 para microinjeções multiplexadas e totalmente autônomas. Esses dispositivos poderiam aumentar a escala de microinjeção por ordens de magnitude. A adaptação de algoritmos para controle paralelo de várias pipetas de microinjeção19 poderia permitir a entrega multiplexada de dezenas de corantes e reagentes moleculares nas mesmas células dentro dos mesmos experimentos. Isso tem o potencial de abrir novos caminhos para a triagem molecular no tecido.
O robô de microinjeção poderia ser usado para marcar células identificadas funcionalmente usando códigos de barras de DNA ou RNA. Isso poderia, por sua vez, ser combinado com outras técnicas de análise de células únicas, como sequenciamento de RNA de células únicas (scRNAseq) e microscopia eletrônica. Nossos resultados preliminares mostram que as células microinjetadas e sua prole podem ser recuperadas e isoladas usando dissociação tecidual seguida de classificação FACS (Taverna, resultados inéditos). As células classificadas FACS podem então ser usadas para scRNAseq. Além disso, resultados preliminares mostram que as capacidades de resolução celular única do robô de microinjeção podem ser usadas em combinação com análise microscópica eletrônica para explorar a biologia celular em células-tronco neurais em tecido em alta resolução espacial (Taverna e Wilsch-Bräuninger, resultados inéditos). Esses dados sugerem que o robô de microinjeção pode ser usado como uma ferramenta para microscopia de luz correlativa e elétrons no tecido e em sentido mais amplo, para a análise multimodal da identidade celular e comportamento no tecido.
A microinjeção depende do uso da pressão e pode-se permitir soluções de injeção com alta complexidade molecular (por exemplo, um transcriptome inteiro). Essa característica da microinjeção foi explorada no passado para isolar e clonar receptores com ligantes20. Ao longo desta linha, o robô de microinjeção pode ser usado para modelar e estudar traços multigênicos no nível celular. Combinado com uma estratégia de subcoamento, o robô de microinjeção também pode ser usado como uma plataforma para identificar o conjunto mínimo de genes que conduzem um certo traço/comportamento celular. Até agora, o robô de microinjeção tem sido usado para manipular a bioquímica da célula através da entrega de proteínas mRNA, DNA ou recombinante10,21,22. Prevemos uma aplicação do robô de microinjeção na sondagem da biofísica do espaço intracelular, por exemplo, fornecendo nanomateriais ou nanomáquinas que permitem a detecção e/ou manipulação das propriedades biofísicas do espaço intracelular.
The authors have nothing to disclose.
Os autores gostariam de reconhecer a Fundação Nomis (ET). A SBK reconhece os fundos do departamento de Engenharia Mecânica, Faculdade de Ciência e Engenharia, Iniciativa MnDRIVE RSAM da Universidade de Minnesota, Minnesota departamento de ensino superior, Institutos Nacionais de Saúde (NIH) 1R21NS103098-01, 1R01NS111028, 1R34NS111654, 1R21NS112886 e 1R21 NS111196. A GS foi apoiada pela National Science Foundation Graduate Research Fellowship e pela NSF IGERT training grant.
Chemicals | |||
Agarose, Low Melt | Carl Roth | Cat# 6351.2 | |
Agarose, Wild Range | Sigma-Aldrich | Cat# A2790 | |
Best-CA 221 Glue | Best Klebstoffe GmbH & Co.KG | Cat# CA221-10ml | |
B-27 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17504044 | |
Cellmatrix Type-IA (Collagen, Type !) | FUJIFILM Wako Chemicals | Cat# 637-00653 | |
Distilled Water | |||
DMEM-F12, CO2 independent (w/o Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D2906 | |
DMEM-F12, CO2 independent (with Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D8900 | |
HEPES-NAOH, pH 7.2, 1M (HEPES buffer) | Carl Roth | Cat# 9105.3 | |
L-Glutamine, 200 mM | Thermo Fisher Sientific | Cat# 25030024 | |
Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | Cat# 81381 | |
N-2 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17502048 | |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | Cat# 21103049 | |
Nuclease-free water | Thermo Fisher Scientific | Cat# AM9937 | |
O2 (40%), CO2 (5%), N2 (55%) Mix, 50 liters | |||
Paraformaldehyde | Merck | Cat# 818715 | |
PBS | |||
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | Cat# 15140122 | |
Rat serum | Charles River Laboratories | ||
Japan | |||
Sodium bicarbonate (NaHCO3) | Merck | Cat# 106323 | |
Sodium hydroxide (NaOH) | Merck | Cat# 106482 | |
Tyrode’s salt | Sigma | Cat# T2145-10x1L) | |
Equipment | |||
Borosilicate glass capillaries, 1.2 mm outer diameter x 0.94 mm inner diameter | Sutter Instruments | Cat# BF-120-94-10 | |
Bottle-top filter system, 500 mL | Corning | Cat# 430769 | |
Computer PC | |||
Custom pressure rig | Custom pressure rig | ||
Electronic pressure regulator | Parker Hannifin | Cat# 990-005101-002 | |
Falcon tubes, 15 mL | Corning | Cat# 430791 | |
Falcon tubes, 50 mL | Corning | Cat# 430829 | |
Fine-tip paintbrush | |||
Flaming/ Brown micropipette puller | Sutter Instruments | Cat# P-97 | |
Forceps, Dumont no. 3 | Fine Science Tools | Cat# 11231-30 | |
Forceps, Dumont no. 5 | Fine Science Tools | Cat# 11255-20 | |
Forceps, Dumont no. 55 | Fine Science Tools | Cat# 11252-20 | |
Heating block | Labtech International | Cat # Dri block Digi2 | |
Inverted fluorescence microscope | Zeiss | Cat# Axiovert 200 | |
Light source | Olympus | Cat# Highlight 3100 | |
Manual pressure regulator | McMaster Carr | Cat# 0-60 PSI 41795K3 | |
Microloader Tips | Eppendorf | Cat# 5242956.003 | |
Microcontroller | Arduino | Cat# Arduino Due | |
Microscope camera Hamamatsu Orca Flash 4.0 V3 | |||
Motorized stage XY for microscope | |||
Multiwell plate, 24 wells | Nunc | Cat# 142475 | |
Pasteur pipettes, plastic | |||
Petri dish, 60 x 15 mm | Greiner | Cat# 628102 | |
Petri dish, 35 x 10 mm | Nunc | Cat# 153066 | |
Petri dish, 34 x 14 mm, including Microwell no. 1.5 cover glass | MatTek | Cat# P35G-1.5-14-C | |
Pipette holder | Warner Instruments | Cat# 64-2354 MP-s12u | |
Pipette and tips | |||
Puller filament, 3.0-mm square box filament | Sutter Instrument | Cat# FB330B | |
Slice culture incubation box | MPI-CBG | Cat# custom made | |
Solenoid valve | Cat# LHDA053321H-A | ||
Stereomicroscope | Olympus | Cat# SZX12 | |
Tabletop centrifuge | Heraeus | Cat# 5431622 | |
Thermometer | |||
Three-axis Manipulator | Sensapex Inc | Cat# tree-axis uMP | |
Vibratome | Leica | Cat# VT1000s | |
Whole-embryo-culture-system incubator | Ikemoto Company | Cat# RKI-10-0310 | |
Waterbath | |||
Software and Algorithms | |||
Arduino | Arduino | ||
Fiji | RRID: SCR_002285 | ||
Python | Python Software foundation | Python 2.7.12 | |
ZEN | RRID: SCR_013672 |