Dit protocol toont het gebruik van een robotplatform voor micro-injectie in enkele neurale stamcellen en neuronen in hersenschijfjes. Deze techniek is veelzijdig en biedt een methode om cellen te volgen in weefsel met een hoge ruimtelijke resolutie.
Een centrale vraag in ontwikkelingsneurobiologie is hoe neurale stam- en voorlopercellen de hersenen vormen. Om deze vraag te beantwoorden, moet men labelen, manipuleren, en volgen enkele cellen in het hersenweefsel met een hoge resolutie na verloop van tijd. Deze taak is zeer uitdagend vanwege de complexiteit van weefsels in de hersenen. We hebben onlangs een robot ontwikkeld, die een micro-injectienaald in hersenweefsel leidt bij het gebruik van beelden die uit een microscoop zijn verkregen om femtolitervolumes van oplossing in enkele cellen te leveren. De robotoperatie verhoogt een totale opbrengst die groter is dan handmatige microinjectie en zorgt voor nauwkeurige etikettering en flexibele manipulatie van enkele cellen in levend weefsel. Hiermee kan men honderden cellen microinjecteren in een enkel organotypisch plakje. Dit artikel toont het gebruik van de micro-injectie robot voor geautomatiseerde micro-injectie van neurale voorloper cellen en neuronen in de hersenen weefsel plakjes. Meer in het algemeen, het kan worden gebruikt op elk epitheelweefsel met een oppervlak dat kan worden bereikt door de pipet. Eenmaal ingesteld, kan de micro-injectierobot 15 of meer microinjecties per minuut uitvoeren. De micro-injectie robot vanwege de doorvoer en versaliteit zal micro-injectie een breed eenvoudige high-performance cel manipulatie techniek worden gebruikt in bio-engineering, biotechnologie, en biofysica voor het uitvoeren van eencellige analyses in organotypic hersenen plakjes.
Dit protocol beschrijft het gebruik van een robot om enkele cellen in plakjes hersenweefsel te targeten en te manipuleren, met name gericht op enkele neurale stamcellen en neuronen. De robot werd ontwikkeld om een centrale vraag in ontwikkelingsneurobiologie aan te pakken, dat is hoe neurale stam- en voorlopercellen bijdragen aan de hersenmorfogenese1,2,3,4,5. Om deze vraag te beantwoorden, moet men enkele neurale stamcellen labelen en volgen en hun afstammingprogressie na verloop van tijd volgen om enkelcellig gedrag te correleren met weefselmorfogenese. Dit kan op verschillende manieren worden bereikt, bijvoorbeeld door hersenweefsel in de baarmoeder te elektroporeren of door eencellige te labelen met lipofiele matrijzen. Hoewel krachtig, deze methoden missen nauwkeurige eencellige resolutie (elektroporatie) en / of de mogelijkheid om de intracellulaire ruimte (lipofiele kleurstof) te manipuleren. Microinjectie in enkele cellen werd ontwikkeld om deze uitdaging te overwinnen6,7,8. Tijdens microinjectie wordt een pipet kort in een enkele cel in intact weefsel ingebracht onder druk om femtolitervolumes van reagentia te microinjecteren9. We hebben eerder een handmatige procedure beschreven voor het microinjecteren van enkele neurale stamcellen in organotypisch weefsel(figuur 1A)10,11. Microinjectie in neurale stamcellen is afhankelijk van het gebruik van een micropipet die wordt ingebracht in enkele neurale stamcellen om een oplossing te injecteren die een fluorescerende kleurstof bevat, samen met andere moleculen van belang. De selectieve targeting van neurale stamcellen wordt bereikt door het benaderen van de zich ontwikkelende telencephalon via het ventriculaire oppervlak (of ventrikel, zie cartoon in figuur 1A), dat wordt gevormd door het apicale plasmamembraan van apicale voorlopers (cartoon in figuur 1A). Dit proces moet worden herhaald voor elke cel die de onderzoeker wil injecteren. Verder is het succes van microinjectie afhankelijk van de nauwkeurige controle van de diepte en duur van micropipet injectie in het weefsel. Dus, ondanks de unieke voordelen, handmatige microinjectie is uiterst vervelend en vereist aanzienlijke oefening uit te voeren op redelijke doorvoer en opbrengst, waardoor deze techniek moeilijk te gebruiken in een schaalbare manier. Om deze beperking te overwinnen, hebben we onlangs een beeldgeleide robot ontwikkeld, de Autoinjector12 (of microinjection robot) die automatisch micro-injecties in enkele cellen kan uitvoeren.
De micro-injectierobot maakt gebruik van microscopische beeldvormings- en computervisiealgoritmen om specifieke locaties in 3D-ruimte in weefsel nauwkeurig te targeten voor microinjectie(figuur 1B). De microinjectierobot kan worden gebouwd door relatief eenvoudige wijzigingen aan te brengen in een bestaande microinjectie-setup. Het algemene schema van de microinjectierobot wordt weergegeven in figuur 1C. Een pipet is gemonteerd in een pipethouder bevestigd aan een drieassige manipulator. Een microscoopcamera wordt gebruikt om beelden van het weefsel en de microinjectienaald te verkrijgen. Een aangepaste drukregulatie systeem wordt gebruikt om de druk in de pipet te controleren en een programmeerbare micromanipulator wordt gebruikt om de positie van de microinjector pipet te controleren. De camerabeelden van het weefsel en de microinjectiepipet worden gebruikt om de ruimtelijke locatie van de microinjectiepipetpunt te bepalen en de locaties waar microinjecties moeten worden uitgevoerd. De software berekent vervolgens trajecten die nodig zijn om de pipet in het weefsel te verplaatsen. Alle hardware wordt gecontroleerd door de software die we eerder hebben ontwikkeld. Alle software is geschreven in codeertaal (bijvoorbeeld Python en Arduino) en kan worden gedownload van https://github.com/bsbrl/Autoinjector met instructies. De grafische gebruikersinterface (GUI) stelt de gebruiker in staat om het weefsel en micropipet in beeld te brengen en het traject van microinjectie aan te passen. Ons systeem kan worden vastgesteld met behulp van relatief eenvoudige wijzigingen aan een omgekeerde microscoop uitgerust met brightfield en epi-fluorescentie filters.
Ten eerste geven we instructies over het voorbereiden van hersenorganotypische weefselplakken voor microinjectie. Vervolgens illustreert het protocol het starten van de microinjectierobot gevolgd door voorbereidende stappen, zoals pipetbewegingkalibratie, die moeten worden gedaan voordat de microinjectie wordt geïnjecteerd. Dit wordt gevolgd door het definiëren van de injectieparameters. Hierna kan de gebruiker het traject definiëren dat door de microinjectierobot wordt gebruikt en de injectieprocedure starten. Het microinjected weefsel (in dit geval hersenorganotypische weefselschijfjes) kan gedurende verschillende perioden in de kweek worden bewaard, afhankelijk van het experimentele ontwerp10,11. Het weefsel kan worden verwerkt om de identiteit en het lot van de geïnjecteerde cellen en hun nakomelingen te volgen en te bestuderen. Als alternatief kunnen de microinjected cellen worden gevolgd met behulp van live beeldvorming. Binnen het toepassingsgebied van dit protocol, tonen we het gebruik van de robot om automatisch micro-injectie neurale voorloper cellen in organotypic plakjes van de muis E14.5 dorsale telencephalon. De robot is verder in staat microinjectie in pasgeborenen neuronen in de muis telencephalon, evenals in de menselijke foetale telencephalon12.
Samengevat beschrijven we een robotplatform dat kan worden gebruikt om enkele cellen in weefsel te volgen en te manipuleren. Het platform maakt gebruik van druk en is daarom zeer veelzijdig wat betreft de chemische aard van de verbinding om te injecteren. Bovendien kan het worden aangepast aan andere doelcellen dan stamcellen. We verwachten dat ons systeem ook eenvoudig kan worden aangepast aan andere modelsystemen.
Microinjectie in enkele neurale stamcellen in weefsel biedt een uitstekende eencellige resolutie en om die reden is het gebruikt om de celbiologie van neurale stamcelprogressie en de overgang van het lot te ontleden(figuur 2; zie ook10,11,12). De geautomatiseerde micro-injectie procedure kan worden uitgevoerd op andere soorten cellen in zowel embryonale muizen en menselijk hersenweefsel. Representatieve resultaten van micro-injectie van pasgeboren neuronen door zich te richten op het basale oppervlak van de telencephalon worden weergegeven in figuur 3.
Het principe dat hier is vastgesteld, kan worden toegepast om verschillende celtypen in embryonale muizenhersenen en menselijke hersenen te targeten. We hebben eerder aangetoond dat de micro-injectierobot ook kan worden gebruikt om enkele voorlopercellen in de achterhersenen van de muis en de telencephalon en pasgeboren neuronen in de muis en de mens die neocortex12ontwikkelt, te targeten. Om de beste resultaten van de injectieprocedure te verkrijgen, moet men alle stappen optimaliseren voordat u met de injectie begint. Het is belangrijk om de voorbereiding van levensvatbare en goed bewaarde organotypische weefselschijfjes uit hersenweefsel zorgvuldig te overwegen en te optimaliseren(figuur 1). Het is van cruciaal belang om snel te zijn in de in figuur 1geïllustreerde ontledings- en snijprocedure . Voor apicale injectie gericht op de AP’s, moet men kiezen voor de segmenten met de ideale oriëntatie van het apicale oppervlak. Voor AP’s injectie, de ideale oriëntatie is de apicale oppervlak loodrecht op de bodem van de petrischaal. Elke andere oriëntatie zal ook tolerant zijn, maar het apicale oppervlak loodrecht op de Petri schotel biedt een breder oppervlak voor injectie, waardoor het succes van de injectie. Voor injectie in neuronen speelt de oriëntatie van het segment weinig tot geen effect.
Zodra de te injecteren plakjes zijn geselecteerd, duurt de injectieprocedure per schijf ongeveer 5 minuten. Gezien het feit dat men werkt met levend weefsel, is het sterk aanbevolen om de injectieprocedure te versnellen. Hiertoe raden we aan om alle parameters voor injectie via de GUI(figuur 1D)in te stellen voordat het weefsel klaar is, om onnodige wachttijden te verkorten. Voor het oplossen van problemen verwijzen wij u naar het aanvullende bestand.
In het geval van de lange termijn slice cultuur, stappen na de geautomatiseerde micro-injectie procedure kan invloed hebben op de gezondheid van de cellen en daarmee het experiment. Daarom is het ten zeerste aan te raden om een kwaliteitscontroletest uit te voeren en de segmentcultuuromstandigheden te optimaliseren. Om de levensvatbaarheid van cellen na de snij- en injectieprocedure te evalueren, voerden we EdU-etikettering uit tijdens de cultuur en kwantificeerden we het aantal pyknotische kernen (een proxy voor apoptotische cellen) in de culturen en geïnjecteerd weefsel12. Deze kwantificeringen hebben geen significante invloed van micro-injectie op de levensvatbaarheid van weefsels aan het licht gebracht (figuur 2C). We raden aan om vergelijkbare kwaliteitscontroles uit te voeren terwijl de organotypische weefsels en micro-injectiepijpleiding in het lab worden ingesteld.
In vergelijking met handmatige microinjectie biedt de microinjectierobot verschillende voordelen. Ten eerste is de leercurve voor de gebruiker minder steil in vergelijking met handmatige injectie: een nieuwe gebruiker bereikt een hoge vaardigheid na een beperkt aantal sessies, meestal 1 of 2. Ten tweede, in het geval van handmatige microinjectie, een vergelijkbare vaardigheid vereist maanden van opleiding. De injectieprocedure is sneller en efficiënter(figuur 2B). We kwantificeerden deze parameters en vonden dat de micro-injectierobot beter presteerde dan een ervaren handmatige gebruiker met betrekking tot het injectiesucces (% van succesvolle injectie/totaal aantal injecties) en in het totale aantal injecties per eenheidstijd12. Dit resulteert in een totale 300% verhoging van de injectie-efficiëntie (% van succesvolle injectie / min) voor de micro-injectie robot in vergelijking met een ervaren gebruiker. De toename van de efficiëntie was nog duidelijker bij het vergelijken van de micro-injectie robot met een beginnende gebruiker en bereikte 700%. Last but not least kan de microinjectierobot eenvoudig worden geprogrammeerd om systematisch alle ruimtelijke parameters te verkennen. Dit is vooral voordelig bij het aanpassen van de micro-injectierobot om nieuwe cellen of weefsels te targeten, of bij het gebruik van de microinjectierobot voor doeleinden die verschillende ruimtelijke resolutie vereisen.
Het bouwen van de micro-injectierobot vereist minimale veranderingen in een bestaande epifluorescentiemicroscoop12. We hebben eerder instructies gegeven voor deze aanpassing op https://github.com/bsbrl/Autoinjector. Zodra de hardware is ingesteld, biedt dit protocol belangrijke methodologische details voor het succesvol uitvoeren van geautomatiseerde microinjecties. Over het algemeen heeft de microinjectierobot een succesvolle injectiesnelheid van 15,52 + 2,48 injecties/min, wat 15x groter is dan een onervaren gebruiker (1,09 ± 0,67 injecties/min), en 3x groter dan een deskundige gebruiker (4,95 ± 1,05 injecties/min)12. Deze verbetering in succesvolle injectie tarief machtigt zowel beginnende als deskundige gebruikers om meer cellen te injecteren in een kortere tijd die essentieel is om weefsel levensvatbaarheid te behouden. Bovendien is de microinjectierobot aanpasbaar en kan de baan, diepte van de injectie, het aantal injecties, de afstand tussen de injecties allemaal worden afgestemd met behulp van de GUI. Deze functies maken het mogelijk de microinjectierobot te gebruiken als een hulpmiddel om eerder moeizame experimenten te optimaliseren en fundamenteel nieuwe experimenten te verkennen die een hogere opbrengst vereisen dan voorheen mogelijk was.
De belangrijkste beperkingen van de micro-injectieprocedure die we hier beschreven zijn gerelateerd aan de voorbereiding van weefselschijfjes, een cruciale stap die uitgebreide optimalisatie nodig heeft. Bovendien is microinjectie afhankelijk van de aanwezigheid van een oppervlak dat door de glazen pipet kan worden benaderd. Deze functie beperkt het type weefsel en weefsel locaties die kunnen worden gericht via micro-injectie met behulp van de huidige setup.
De micro-injectie robot maakt momenteel gebruik van brightfield imaging en is gebruikt in in vitro brain slice preparaten. In de toekomst kan de micro-injectierobot worden gecombineerd met 2-fotonbeeldvorming om de specificiteit van eencellige targeting in vivo voor moleculaire of kleurstoftagging te vergroten. Dergelijke inspanningen zijn reeds gedaan voor eencellige elektrofysiologie15,16. Het huidige apparaat vereist handmatige observatie van de micro-injectieprocedure. Toekomstige versies kunnen strategieën omvatten voor het reinigen van verstopte micro-injectiepipettes17 of integratie van vloeistofbehandelingsrobots18 voor multiplexed, volledig autonome micro-injecties. Deze apparaten kunnen de schaal van micro-injectie verhogen door ordes van grootte. Het aanpassen van algoritmen voor parallelle controle van meerdere micro-injectiepipetten19 zou de levering van tientallen kleurstoffen en moleculaire reagentia in dezelfde cellen binnen dezelfde experimenten mogelijk kunnen maken. Dit heeft het potentieel om nieuwe wegen te openen voor moleculaire screening in weefsel.
De microinjectierobot kan worden gebruikt om functioneel geïdentificeerde cellen te taggen met behulp van DNA- of RNA-barcodes. Dit kan op zijn beurt worden gecombineerd met andere eencellige analysetechnieken, zoals eencellige RNA-sequencing (scRNAseq) en elektronenmicroscopie. Onze voorlopige resultaten tonen aan dat microinjected cellen en hun nakomelingen kunnen worden hersteld en geïsoleerd met behulp van weefseldissociatie, gevolgd door FACS sortering (Taverna, ongepubliceerde resultaten). De FACS gesorteerde cellen kunnen vervolgens worden gebruikt voor scRNAseq. Bovendien tonen voorlopige resultaten aan dat de single cell resolutie mogelijkheden van de micro-injectie robot kan worden gebruikt in combinatie met elektronenmicroscopische analyse om de celbiologie op neurale stamcellen in weefsel bij hoge ruimtelijke resolutie te verkennen (Taverna en Wilsch-Bräuninger, ongepubliceerde resultaten). Deze gegevens suggereren dat de micro-injectierobot kan worden gebruikt als een hulpmiddel voor correlatief licht en elektronenmicroscopie in weefsel en in bredere zin, voor de multimodale analyse van celidentiteit en -gedrag in weefsel.
Microinjectie is afhankelijk van het gebruik van druk en men kan zich injectieoplossingen veroorloven met een hoge moleculaire complexiteit (bijvoorbeeld een hele transcriptie). Dit kenmerk van microinjectie is in het verleden misbruikt voor het isoleren en klonen van ligand-gated receptoren20. Langs deze lijn, de micro-injectie robot kan worden gebruikt voor het modelleren en bestuderen van multi-geniale eigenschappen op cellulair niveau. In combinatie met een subpoolingstrategie kan de microinjectierobot ook worden gebruikt als platform om de minimale set genen te identificeren die een bepaald eigenschap/cellulair gedrag aansturen. Tot nu toe is de micro-injectierobot gebruikt om de biochemie van de cel te manipuleren via de levering van mRNA, DNA of recombinant eiwitten10,21,22. We voorzien een toepassing van de microinjectierobot in het onderzoeken van de biofysica van de intracellulaire ruimte, bijvoorbeeld door het leveren van nanomaterialen of nanomachines die het mogelijk maken de biofysische eigenschappen van de intracellulaire ruimte te beslokken en/of te manipuleren.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs willen de Nomis Foundation (ET) erkennen. SBK erkent fondsen van de afdeling Werktuigbouwkunde, College of Science and Engineering, MnDRIVE RSAM initiatief van de Universiteit van Minnesota, Minnesota afdeling van het hoger onderwijs, National Institutes of Health (NIH) 1R21NS103098-01, 1R01NS111028, 1R34NS11654, 1R21NS112886 en 1R21 NS111196. GS werd ondersteund door National Science Foundation Graduate Research Fellowship en NSF IGERT opleidingsbeurs.
Chemicals | |||
Agarose, Low Melt | Carl Roth | Cat# 6351.2 | |
Agarose, Wild Range | Sigma-Aldrich | Cat# A2790 | |
Best-CA 221 Glue | Best Klebstoffe GmbH & Co.KG | Cat# CA221-10ml | |
B-27 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17504044 | |
Cellmatrix Type-IA (Collagen, Type !) | FUJIFILM Wako Chemicals | Cat# 637-00653 | |
Distilled Water | |||
DMEM-F12, CO2 independent (w/o Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D2906 | |
DMEM-F12, CO2 independent (with Phenol red) | Sigma-Aldrich | Cat# D8900 | |
HEPES-NAOH, pH 7.2, 1M (HEPES buffer) | Carl Roth | Cat# 9105.3 | |
L-Glutamine, 200 mM | Thermo Fisher Sientific | Cat# 25030024 | |
Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | Cat# 81381 | |
N-2 Supplement | Thermo Fisher Scientific | Cat# 17502048 | |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | Cat# 21103049 | |
Nuclease-free water | Thermo Fisher Scientific | Cat# AM9937 | |
O2 (40%), CO2 (5%), N2 (55%) Mix, 50 liters | |||
Paraformaldehyde | Merck | Cat# 818715 | |
PBS | |||
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | Cat# 15140122 | |
Rat serum | Charles River Laboratories | ||
Japan | |||
Sodium bicarbonate (NaHCO3) | Merck | Cat# 106323 | |
Sodium hydroxide (NaOH) | Merck | Cat# 106482 | |
Tyrode’s salt | Sigma | Cat# T2145-10x1L) | |
Equipment | |||
Borosilicate glass capillaries, 1.2 mm outer diameter x 0.94 mm inner diameter | Sutter Instruments | Cat# BF-120-94-10 | |
Bottle-top filter system, 500 mL | Corning | Cat# 430769 | |
Computer PC | |||
Custom pressure rig | Custom pressure rig | ||
Electronic pressure regulator | Parker Hannifin | Cat# 990-005101-002 | |
Falcon tubes, 15 mL | Corning | Cat# 430791 | |
Falcon tubes, 50 mL | Corning | Cat# 430829 | |
Fine-tip paintbrush | |||
Flaming/ Brown micropipette puller | Sutter Instruments | Cat# P-97 | |
Forceps, Dumont no. 3 | Fine Science Tools | Cat# 11231-30 | |
Forceps, Dumont no. 5 | Fine Science Tools | Cat# 11255-20 | |
Forceps, Dumont no. 55 | Fine Science Tools | Cat# 11252-20 | |
Heating block | Labtech International | Cat # Dri block Digi2 | |
Inverted fluorescence microscope | Zeiss | Cat# Axiovert 200 | |
Light source | Olympus | Cat# Highlight 3100 | |
Manual pressure regulator | McMaster Carr | Cat# 0-60 PSI 41795K3 | |
Microloader Tips | Eppendorf | Cat# 5242956.003 | |
Microcontroller | Arduino | Cat# Arduino Due | |
Microscope camera Hamamatsu Orca Flash 4.0 V3 | |||
Motorized stage XY for microscope | |||
Multiwell plate, 24 wells | Nunc | Cat# 142475 | |
Pasteur pipettes, plastic | |||
Petri dish, 60 x 15 mm | Greiner | Cat# 628102 | |
Petri dish, 35 x 10 mm | Nunc | Cat# 153066 | |
Petri dish, 34 x 14 mm, including Microwell no. 1.5 cover glass | MatTek | Cat# P35G-1.5-14-C | |
Pipette holder | Warner Instruments | Cat# 64-2354 MP-s12u | |
Pipette and tips | |||
Puller filament, 3.0-mm square box filament | Sutter Instrument | Cat# FB330B | |
Slice culture incubation box | MPI-CBG | Cat# custom made | |
Solenoid valve | Cat# LHDA053321H-A | ||
Stereomicroscope | Olympus | Cat# SZX12 | |
Tabletop centrifuge | Heraeus | Cat# 5431622 | |
Thermometer | |||
Three-axis Manipulator | Sensapex Inc | Cat# tree-axis uMP | |
Vibratome | Leica | Cat# VT1000s | |
Whole-embryo-culture-system incubator | Ikemoto Company | Cat# RKI-10-0310 | |
Waterbath | |||
Software and Algorithms | |||
Arduino | Arduino | ||
Fiji | RRID: SCR_002285 | ||
Python | Python Software foundation | Python 2.7.12 | |
ZEN | RRID: SCR_013672 |