Summary

Einführung eines Gene Knockout direkt in die Amastigote-Phase von Trypanosoma cruzi mit dem CRISPR/Cas9-System

Published: July 31, 2019
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Summary

Hier beschreiben wir ein Protokoll zur Einführung eines Genknockouts in den extrazellulären Amastigot von Trypanosoma cruzi, mit dem CRISPR/Cas9-System. Dem Wachstumsphänotyp kann entweder durch Zellzählung der axtischen Amastigotenkultur oder durch Proliferation intrazellulärer Amastigoten nach der Invasion der Wirtszelle gefolgt werden.

Abstract

Trypanosoma cruzi ist ein pathogener Protozoenparasit, der die Chagas-Krankheit hauptsächlich in Lateinamerika verursacht. Um ein neuartiges Wirkstoffziel gegen T. cruzizu identifizieren, ist es wichtig, die Wesentlichkeit des Zielgens im Säugetierstadium des Parasiten, des Amastigots, zu validieren. Amastigotes von T. cruzi replizieren sich in der Wirtszelle; daher ist es schwierig, ein Knockout-Experiment durchzuführen, ohne andere Entwicklungsstadien zu durchlaufen. Kürzlich berichtete unsere Gruppe von einem Wachstumszustand, in dem sich der Amastigot für bis zu 10 Tage axenisch replizieren kann, ohne seine amastigotähnlichen Eigenschaften zu verlieren. Durch die Verwendung dieser zeitlichen axikonischen Amastigotenkultur führten wir erfolgreich gRNAs direkt in die Cas9-extierende Amastigote ein, um Genknockouts zu verursachen, und analysierten ihre Phänotypen ausschließlich im Amastigot-Stadium. In diesem Bericht beschreiben wir ein detailliertes Protokoll zur Herstellung von in vitro abgeleiteten extrazellulären Amastigoten und zur Nutzung der axtischen Kultur in einem CRISPR/Cas9-vermittelten Knockout-Experiment. Der Wachstumsphänotyp von Knockout-Amastigoten kann entweder anhand der Zellzahl der Axtkultur oder durch Replikation des intrazellulären Amastigots nach der Invasion der Wirtszelle bewertet werden. Diese Methode umgeht die Parasitenstadiumdifferenzierung, die normalerweise bei der Herstellung eines transgenen oder knockout amastigote beteiligt ist. Die Nutzung der zeitlichen aatonischen Amastigotenkultur hat das Potenzial, die experimentelle Freiheit bühnenspezifischer Studien in T. cruzi zu erweitern.

Introduction

Trypanosoma cruzi ist der Erreger der Chagas-Krankheit, die vor allem in Lateinamerika vorherrscht1. T. cruzi hat auf der Reise zwischen einem Insektenvektor und einem Säugetierwirt2unterschiedliche Lebenszyklusstadien. T. cruzi repliziert als Epimastigot im Mittelgut eines blutsaugenden Triatomin-Bugs und differenziert sich in seinem Hintergut zu einem infektiösen metazyklischen Trypomastigot, bevor er auf einem menschlichen oder tierischen Wirt abgelagert wird. Sobald der Trypomastigot durch die Bissstelle oder durch eine Schleimhaut in den Wirtskörper gelangt, dringt der Parasit in eine Wirtszelle ein und verwandelt sich in eine flagellalose runde Form, die als Amastigot bezeichnet wird. Der Amastigot repliziert sich innerhalb der Wirtszelle und differenziert sich schließlich in Trypomastigote, das aus der Wirtszelle platzt und in den Blutkreislauf eintritt, um eine andere Wirtszelle zu infizieren.

Da derzeit verfügbare Chemotherapeutika, Benznidazol und Nifurtimox Nebenwirkungen verursachen und in der chronischen Phase der Krankheit3unwirksam sind, ist es von großem Interesse, neuartige Wirkstoffziele gegen T. cruzi zu identifizieren. In den letzten Jahren hat sich das CRISPR/Cas9-System zu einem leistungsfähigen Werkzeug entwickelt, um Gen Knockout in T. cruzieffektiv durchzuführen, entweder durch Transfektion von separaten oder einzelnen Plasmiden, die gRNA und Cas94enthalten, durch stabile Expression von Cas9 und Einführung von gRNA5,6,7 oder Transkriptionsschablon von gRNA8, oder durch Elektroporation des vorgeformten gRNA/Cas9 RNP-Komplexes7,9. Dieser technologische Fortschritt wird mit Spannung erwartet, um die Drogenzielforschung bei der Chagas-Krankheit zu beschleunigen.

Um mit der Arzneimittelentwicklung fortzufahren, ist es entscheidend, die Wesentlichkeit des Zielgens oder die Wirksamkeit von Wirkstoff-Kandidatenverbindungen im Amastigot von T. cruzizu validieren, da es sich um die Replikationsstufe des Parasiten im Säugetierwirt handelt. Dies ist jedoch eine schwierige Aufgabe, da Amastigoten aufgrund des Vorhandenseins einer obstruktiven Wirtszelle nicht direkt manipuliert werden können. In Leishmaniawurde ein eng verwandter protozoischer Parasit zu T. cruzientwickelt, eine axenische Amastigote-Kultivierungsmethode entwickelt und in den Arzneimittelscreening-Assays10,11,12 , 13. Obwohl es einige Unterschiede in der Anfälligkeit für Verbindungen zwischen axtischen Amastigoten und intrazellulären Amastigoten14gibt, bietet die Fähigkeit, die axenische Kultur aufrechtzuerhalten, dennoch wertvolle experimentelle Werkzeuge, um die Grundbiologie des klinisch relevanten Stadiums von Leishmania15,16. Im Fall von T. cruzistammen Literaturen über das Vorhandensein natürlich vorkommender extrazellulärer Amastigoten (EA)17 und die In-vitro-Produktion von EA17,18,19 Jahrzehnten. Darüber hinaus ist EA bekannt, eine infektiöse Fähigkeit20haben , wenn auch weniger als die von Trypomastigote, und der Mechanismus der amastigote Host Invasion wurde in den letzten Jahren aufgeklärt (rezensiert von Bonfim-Melo et al.21). Im Gegensatz zu Leishmaniawar EA jedoch nicht als Versuchswerkzeug in T. cruziverwendet worden, vor allem weil EA als obligate intrazellulärer Parasit angesehen worden war und daher in einer praktischen Form nicht als “replikative Form” betrachtet worden war. sinn.

Kürzlich schlug unsere Gruppe vor, EA von T. cruzi als zeitliche axenische Kultur zu nutzen22. Amastigotes des T. cruzi Tulahuen Stammes können sich bis zu 10 Tage lang frei von Wirtszellen in LIT-Medium bei 37 °C replizieren, ohne dass eine größere Verschlechterung oder Verlust amastigotähnlicher Eigenschaften entsteht. Während der wirtfreien Wachstumsphase wurde EA erfolgreich für die exogene Genexpression durch konventionelle Elektroporation, Arzneimitteltitrationstest mit trypanocidalen Verbindungen und CRISPR/Cas9-vermittelten Knockout gefolgt von einer Wachstumsphänotypüberwachung eingesetzt. In diesem Bericht beschreiben wir das detaillierte Protokoll zur Herstellung von in vitro abgeleiteten EA und zur Nutzung des axtischen Amastigots in Knockout-Experimenten.

Protocol

HINWEIS: Eine Übersicht über den gesamten experimentellen Fluss ist in Abbildung 1dargestellt. Abbildung 1: Übersicht über das Knockout-Experiment mit EA. Gewebekultur-abgeleitete Trypomastigoten werden geerntet und in EA differenziert. gRNA wird durch Elektroporation in Cas9-exektierende Amastigoten transfizie…

Representative Results

Isolierung von Trypomastigoten durch das Ausschwimmverfahren Um frische Trypomastigoten aus der Kontamination alter EAs durch Swim-out-Verfahren zu ernten, müssen Zellpellets mindestens für 1 h inkubiert werden. Abbildung 2B). In diesem speziellen Experiment betrug der Prozentsatz der Trypomastigoten in der ursprünglichen Mischung 38 %, und der Prozentsatz nach dem Ausschwimmen lag zu einem bestimmten Zeitpunkt über 98 %. Aus zwei T-75-Flasche…

Discussion

Wir haben gezeigt, dass die axtische Kultur von T. cruzi amastigotes in CRISPR/Cas9-vermitteltem Gen Knockout genutzt werden kann, indem gRNA direkt in Cas9-exemittiert wird. Auf diese Weise kann die Wesentlichkeit des Zielgens speziell im Amastigot-Stadium bewertet werden, ohne andere Entwicklungsstadien durchlaufen zu müssen.

Ein weiterer vorteilhafter Aspekt der Amastigot-Transfektion ist die Bequemlichkeit bei der Prüfung auf eine große Anzahl von Zielgenen. Sobald die Kokultur…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Diese Arbeit wurde teilweise von JSPS KAKENHI Grant Number 18K15141 an Y.T. unterstützt.

Materials

20% formalin solution FUJIFILM Wako Pure Chemical 068-03863 fixing cells
25 cm2 double seal cap culture flask AGC Techno Glass 3100-025
75 cm2 double seal cap culture flask AGC Techno Glass 3110-075
All-in One Fluorescence Microscope Keyence BZ-X710
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for Control) IDT custom made target sequence = GGACGGCACCTTCATCTACAAGG
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcCGM1) IDT custom made target sequence = TAGCCGCGATGGAGAGTTTATGG
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcPAR1) IDT custom made target sequence = CGTGGAGAACGCCATTGCCACGG
Alt-R CRISPR-Cas9 tracrRNA IDT 1072532 to anneal with crRNA
Amaxa Nucleofector device LONZA AAN-1001 electroporation
Basic Parasite Nucleofector Kit 2 LONZA VMI-1021 electroporation
BSA Sigma-Aldrich A3294 component of the medium for in-vitro amastigogenesis
Burker-Turk disposable hemocytometer Watson 177-212C cell counting
Coster 12-well Clear TC-Treated Multiple Well Plates Corning 3513
DMEM FUJIFILM Wako Pure Chemical 044-29765 culture medium
Fetal bovine serum, Defined Hyclone SH30070.03 heat-inactivate before use
G-418 Sulfate Solution FUJIFILM Wako Pure Chemical 077-06433 selection of transformant
Hemin chloride Sigma-Aldrich H-5533 component of LIT medium
Hoechst 33342 Thermo Fisher Scientific H3570 staining of nuclei
Liver infusion broth, Difco Becton Dickinson 226920 component of LIT medium
MES FUJIFILM Wako Pure Chemical 349-01623 component of the medium for in-vitro amastigogenesis
PBS (–) FUJIFILM Wako Pure Chemical 166-23555
Propidium Iodide Sigma-Aldrich P4864-10ML staining of dead cells
RPMI 1646 Sigma-Aldrich R8758 medium for metacyclogenesis

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Akutsu, Y., Doi, M., Furukawa, K., Takagi, Y. Introducing a Gene Knockout Directly Into the Amastigote Stage of Trypanosoma cruzi Using the CRISPR/Cas9 System. J. Vis. Exp. (149), e59962, doi:10.3791/59962 (2019).

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