Aqui, nós descrevemos um protocolo para introduzir um nocaute do gene no amastigotas extracelular de Trypanosoma cruzi, usando o sistema de crispr/Cas9. O phenotype do crescimento pode ser seguido acima pela contagem da pilha da cultura axênicos do amastigotas ou pela proliferação de amastigotas intracelular após a invasão da pilha de anfitrião.
O Trypanosoma cruzi é um parasita protozoário patogénico que causa a doença de Chagas principalmente na América Latina. A fim de identificar um novo alvo de drogas contra o T. cruzi, é importante validar a essencialidade do gene alvo na fase de mamíferos do parasita, o amastigote. Amastigotas de T. cruzi replicam dentro da célula hospedeira; assim, é difícil realizar uma experiência de nocaute sem passar por outros estágios de desenvolvimento. Recentemente, nosso grupo relatou uma condição do crescimento em que o amastigotas pode replicar axenically por até 10 dias sem perder suas propriedades amastigotas-like. Usando esta cultura axênica temporal do amastigotas, nós introduzimos com sucesso grnas diretamente no Cas9-expressando o amastigotas para causar nocautes do gene e analisou seus fenótipos exclusivamente no estágio do amastigotas. Neste relatório, nós descrevemos um protocolo detalhado para produzir in vitro os amastigotes extracelular derivados, e para utilizar a cultura axênicos em um experimento nocaute crispr/Cas9-negociado. O phenotype do crescimento de amastigotas do Knockout pode ser avaliado pela contagem da pilha da cultura axênicos, ou pela réplica do amastigotas intracelular após a invasão da pilha de anfitrião. Este método ignora a diferenciação do estágio do parasita envolvida normalmente em produzir um transgênicas ou um amastigote do knockout. A utilização da cultura do amastigotas axênico temporal tem o potencial de ampliar a liberdade experimental de estudos específicos do estágio em T. cruzi.
O Trypanosoma cruzi é o agente causador da doença de Chagas, predominante principalmente na América Latina1. T. cruzi tem estágios distintos do ciclo de vida enquanto viaja entre um vetor do inseto e um anfitrião mamífero2. T. cruzi Replica como um atividade no intestino médio de um bug triatomíneo sugador de sangue e diferencia-se em um tripomastigota metacíclicos infeccioso em seu intestino posterior antes de ser depositado em um anfitrião humano ou animal. Uma vez que o tripomastigota entra no corpo hospedeiro através do local da mordida ou através de uma membrana mucosa, o parasita invade uma célula hospedeira e se transforma em uma forma redonda flagella-less chamada um amastigote. O amastigotas Replica dentro da célula hospedeira e, eventualmente, diferencia-se em trypomastigote, que explode fora da célula hospedeira e entra na corrente sanguínea para infectar outra célula hospedeira.
Como os agentes quimioterapêuticos atualmente disponíveis, o Benznidazol e o Nifurtimox, causam efeitos colaterais adversos e são ineficazes na fase crônica da doença3, é de grande interesse identificar novos alvos de drogas contra o T. cruzi. Nos últimos anos, o sistema CRISPR/Cas9 tornou-se uma poderosa ferramenta para efetivamente realizar nocaute genético em T. cruzi, seja por transfecção de plasmídeo (s) separado ou único contendo Grna e CAS94, por expressão estável de Cas9 e subsequente introdução de grna5,6,7 ou modelo de transcrição de grna8, ou por eletroporação do complexo pré-formado de grna/Cas9 RNP7,9. Este avanço tecnológico é altamente antecipado para acelerar a pesquisa-alvo de drogas na doença de Chagas.
Para prosseguir com o desenvolvimento da droga, é crucial validar a essencialidade do gene alvo ou a eficácia dos compostos candidatos à droga na amastigotas de T. cruzi, pois é a fase de replicação do parasita no hospedeiro de mamíferos. No entanto, esta é uma tarefa desafiadora, porque amastigotas não podem ser manipuladas diretamente devido à presença de uma célula hospedeira obstrutiva. Em Leishmania, um parasita de protozoário intimamente relacionado ao T. cruzi, um método de cultivo de amastigotas axênico foi desenvolvido e tem sido utilizado em ensaios de triagem de fármacos10,11,12, 13. embora existam algumas discrepâncias na suscetibilidade a compostos entre amastigotas axênicas e amastigotas intracelulares14, a capacidade de manter a cultura axênica, no entanto, fornece valiosas ferramentas experimentais para estudar a biologia básica do estágio clinicamente relevante de Leishmania15,16. No caso do T. cruzi, literaturas quanto à presença de amastigotas extracelulares (ea)17 e produção in vitro de ea17,18,19 datam de décadas atrás. Além disso, a EA é conhecida por ter uma capacidade infecciosa20, embora menos do que a do trypomastigote, e o mecanismo de invasão do hospedeiro amastigota tem sido elucidado nos últimos anos (revisado por Bonfim-Melo et al.21). No entanto, diferentemente da Leishmania, a ea não tinha sido utilizada como ferramenta experimental no T. cruzi, principalmente porque a ea tinha sido considerada como um parasita intracelular obrigatório e, portanto, não tinha sido considerada como “forma replicativa” em uma prática Sentido.
Recentemente, nosso grupo propôs utilizar a EA de T. cruzi como uma cultura axênica temporal22. Amastigotas de T. cruzi tulahuen estirpe pode replicar livre de células hospedeiras em meio iluminado a 37 ° c por até 10 dias sem grande deterioração ou perda de propriedades semelhantes a amastigotas. Durante o período de crescimento livre de hospedeiro, a EA foi utilizada com sucesso para expressão gênica exógena por eletroporação convencional, ensaio de titulação de fármacos com compostos tripanociais e nocaute de CRISPR/Cas9, seguido de monitoramento do fenótipo de crescimento. Neste relatório, nós descrevemos o protocolo detalhado para produzir in vitro o ea derivado e para utilizar o amastigotas axênicos em experimentos do nocaute.
Nós demonstramos que a cultura axênicos de amastigotas do T. cruzi pode ser utilizada no nocaute crispr/Cas9-negociado do gene, electroporating o grna diretamente em Cas9-expressando o ea. Desta forma, a essencialidade do gene alvo especificamente no estágio amastigotas pode ser avaliada sem passar por outros estágios de desenvolvimento.
Um outro aspecto benéfico do transfection do amastigotas é a conveniência no teste para um grande número genes do alvo. Uma vez que a cocultu…
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi apoiado em parte por JSPS KAKENHI Grant Number 18K15141 para Y.T.
20% formalin solution | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 068-03863 | fixing cells |
25 cm2 double seal cap culture flask | AGC Techno Glass | 3100-025 | |
75 cm2 double seal cap culture flask | AGC Techno Glass | 3110-075 | |
All-in One Fluorescence Microscope | Keyence | BZ-X710 | |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for Control) | IDT | custom made | target sequence = GGACGGCACCTTCATCTACAAGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcCGM1) | IDT | custom made | target sequence = TAGCCGCGATGGAGAGTTTATGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcPAR1) | IDT | custom made | target sequence = CGTGGAGAACGCCATTGCCACGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 tracrRNA | IDT | 1072532 | to anneal with crRNA |
Amaxa Nucleofector device | LONZA | AAN-1001 | electroporation |
Basic Parasite Nucleofector Kit 2 | LONZA | VMI-1021 | electroporation |
BSA | Sigma-Aldrich | A3294 | component of the medium for in-vitro amastigogenesis |
Burker-Turk disposable hemocytometer | Watson | 177-212C | cell counting |
Coster 12-well Clear TC-Treated Multiple Well Plates | Corning | 3513 | |
DMEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 044-29765 | culture medium |
Fetal bovine serum, Defined | Hyclone | SH30070.03 | heat-inactivate before use |
G-418 Sulfate Solution | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 077-06433 | selection of transformant |
Hemin chloride | Sigma-Aldrich | H-5533 | component of LIT medium |
Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3570 | staining of nuclei |
Liver infusion broth, Difco | Becton Dickinson | 226920 | component of LIT medium |
MES | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 349-01623 | component of the medium for in-vitro amastigogenesis |
PBS (–) | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 166-23555 | |
Propidium Iodide | Sigma-Aldrich | P4864-10ML | staining of dead cells |
RPMI 1646 | Sigma-Aldrich | R8758 | medium for metacyclogenesis |