Здесь мы описываем протокол о введении генного нокаута во внеклеточном аматиготе трипаносома крузи, с использованием системы CRISPR/Cas9. За фенотипом роста может последовать либо подсчет клеток агостической культуры аматигота, либо распространение внутриклеточного амастигота после вторжения клеток-хозяев.
Трипаносома крузи является патогенным протозоанским паразитом, который вызывает болезнь Шагаса в основном в Латинской Америке. Для того, чтобы определить новый целевой препарат против T. cruzi, важно проверить существенность гена-митариона в стадии млекопитающих паразита, амастигот. Аматиготы T. cruzi реплицируются внутри клетки-хозяина; таким образом, трудно провести нокаут эксперимент, не проходя через другие этапы развития. Недавно наша группа сообщила о состоянии роста, в котором амастигот может реплицировать аксенически до 10 дней, не теряя своих амастигот-подобных свойств. Используя эту временную апорную культуру амасигота, мы успешно внедрили GРНС непосредственно в Cas9-expressing amastigote, чтобы вызвать генные нокауты и проанализировали их фенотипы исключительно в стадии амасигота. В этом отчете мы описываем подробный протокол для производства in vitro, полученных внеклеточными амазиготами, и для использования опорной культуры в эксперименте по нокауту, опосредованным CRISPR/Cas9. Фенотип роста нокаут амастиготов может быть оценен либо по клеточным подсчетам аксеников, либо путем репликации внутриклеточного аматигота после вторжения клеток-хозяев. Этот метод обходит дифференциацию стадии паразита, обычно участвующую в производстве трансгенного или нокаутирующего аматигота. Использование временной апорической культуры амастигот имеет потенциал для расширения экспериментальной свободы сценических исследований в T. cruzi.
Трипаносома крузи является возбудимым возбудите болезнь Шагаса, которая распространена в основном в Латинской Америке1. T. cruzi имеет отличительные этапы жизненного цикла, как он путешествует между насекомым вектор и млекопитающих хозяин2. T. cruzi реплицирует сярлица в качестве эпиматигота в середине г. кровососущего триатомина и дифференцируется в инфекционный метациклический трипомэтигот в его заднухе перед тем, как оставить на человека или животного хозяина. Как только trypomastigote попадает в организм хозяина через место укуса или через слизистую оболочку, паразит вторгается в клетку-хозяина и превращается в флагелла менее круглая форма называется амасигот. Амасигот реплицируется внутри клетки-хозяина и в конечном итоге дифференцируется в трипоматигот, который вырывается из клетки-хозяина и входит в кровоток, чтобы заразить другую клетку-хозяина.
Поскольку в настоящее время доступны химиотерапевтические агенты, бензнидазол и нифуртимокс, вызывают неблагоприятные побочные эффекты и неэффективны в хронической фазе заболевания3, это представляет большой интерес для выявления новых целей наркотиков против T. cruzi. В последние годы, система CRISPR/Cas9 стала мощным инструментом для эффективного выполнения генного нокаута в T. cruzi, либо путем трансфекции отдельных или одной плазмиды (ы), содержащей gRNA и Cas94, путем стабильного выражения Cas9 и последующего введение gRNA5,6,7 или транскрипции шаблона gRNA8, или путем электропорации предварительно сформированного комплекса gRNA/Cas9 RNP7,9. Этот технологический прогресс, как ожидается, ускорить целевое исследование наркотиков в области болезни Шагаса.
Чтобы продолжить разработку препарата, очень важно проверить существенность гена-мишени или эффективность соединений кандидата препарата в amastigote T. cruzi, так как это этап репликации паразита в млекопитающих хозяина. Однако, это трудная задача, потому что amastigotes не может быть непосредственно манипулировать из-за присутствия обструктивной ячейки хозяина. В Лейшмании, тесно связанных простейшие паразита T. cruzi, апорный метод культивирования amastigote был разработан и был использован в анализе скрининга наркотиков10,11,12, 13. Хотя Есть некоторые расхождения в восприимчивости к соединениям между апорическими амастиготами и внутриклеточными амастиготами14, способность поддерживать топорную культуру, тем не менее, предоставляет ценные экспериментальные инструменты для изучения базовая биология клинически релевантной стадии Лейшмания15,16. В случае T. cruzi, литературы о наличии естественных внеклеточных амастиготов (EA)17 и в пробирке производства EA17,18,19 датируются десятилетия назад. Кроме того, Е.А., как известно, инфекционные возможности20, хотя и меньше, чем у trypomastigote, и механизм вторжения амасигота принимающей была выяснена в последние годы (обзор Bonfim-Мело и др.21). Однако, в отличие от Leishmania,EA не был использован в качестве экспериментального инструмента в T. cruzi, в первую очередь потому, что EA считался обязанным внутриклеточным паразитом, и, таким образом, не рассматривался как “репликативная форма” в практической Смысле.
Недавно наша группа предложила использовать EA T. cruzi в качестве временной апорической культуры22. Amastigotes штамма T. cruzi Tulahuen может размножаться без клеток-хозяев в среде LIT при 37 градусах По Цельсия в течение 10 дней без серьезного ухудшения или потери амасиготных свойств. В период роста без хозяина, EA был успешно использован для экспрессии экзогенного гена обычным электропорированием, проверкой титрации препарата с трипаноцидальными соединениями и нокаутом CRISPR/Cas9 с последующим мониторингом фенотипа роста. В этом отчете мы описываем подробный протокол для производства in vitro, полученного EA, и использования аксена в экспериментах нокаута.
Мы продемонстрировали, что топорная культура T. cruzi amastigotes может быть использована в CRISPR/Cas9-опосредованного гена нокаутом, путем электропорабивания gRNA непосредственно в Cas9-выражения EA. Таким образом, существенность гена-мишени конкретно в стадии amastigote может быть оценена, не проходя…
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была частично поддержана JSPS KAKENHI Грант номер 18K15141 к Y.T.
20% formalin solution | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 068-03863 | fixing cells |
25 cm2 double seal cap culture flask | AGC Techno Glass | 3100-025 | |
75 cm2 double seal cap culture flask | AGC Techno Glass | 3110-075 | |
All-in One Fluorescence Microscope | Keyence | BZ-X710 | |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for Control) | IDT | custom made | target sequence = GGACGGCACCTTCATCTACAAGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcCGM1) | IDT | custom made | target sequence = TAGCCGCGATGGAGAGTTTATGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA (for TcPAR1) | IDT | custom made | target sequence = CGTGGAGAACGCCATTGCCACGG |
Alt-R CRISPR-Cas9 tracrRNA | IDT | 1072532 | to anneal with crRNA |
Amaxa Nucleofector device | LONZA | AAN-1001 | electroporation |
Basic Parasite Nucleofector Kit 2 | LONZA | VMI-1021 | electroporation |
BSA | Sigma-Aldrich | A3294 | component of the medium for in-vitro amastigogenesis |
Burker-Turk disposable hemocytometer | Watson | 177-212C | cell counting |
Coster 12-well Clear TC-Treated Multiple Well Plates | Corning | 3513 | |
DMEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 044-29765 | culture medium |
Fetal bovine serum, Defined | Hyclone | SH30070.03 | heat-inactivate before use |
G-418 Sulfate Solution | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 077-06433 | selection of transformant |
Hemin chloride | Sigma-Aldrich | H-5533 | component of LIT medium |
Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3570 | staining of nuclei |
Liver infusion broth, Difco | Becton Dickinson | 226920 | component of LIT medium |
MES | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 349-01623 | component of the medium for in-vitro amastigogenesis |
PBS (–) | FUJIFILM Wako Pure Chemical | 166-23555 | |
Propidium Iodide | Sigma-Aldrich | P4864-10ML | staining of dead cells |
RPMI 1646 | Sigma-Aldrich | R8758 | medium for metacyclogenesis |