שורות תאים דרוזופילה הם ריאגנטים חשוב למחקר בסיסי והן ביו. מאמר זה מספק פרוטוקולים מפשיר, subculturing של הקפאה קריוגנית של שורות תאים דרוזופילה נפוץ כדי לסייע לחוקרים שילוב השימוש האלה ריאגנטים במחקר שלהם.
כיום יש מעל 160 ברורים דרוזופילה שורות תאים מופץ על ידי מרכז משאבים גנומיקה דרוזופילה (DGRC). עם הגנום הנדסה, מספר שורות תאים הרומן צפוי לגדול. DGRC שואפת להכיר חוקרים באמצעות שורות תאים דרוזופילה ככלי ניסיוני משלימים ולנסוע שלהם למחקר ופיתוח. נהלי עבודה עם מגוון רחב של שורות תאים דרוזופילה בעלי מאפיינים ברורים הינם מסופקים, לרבות פרוטוקולים עבור מפשיר culturing, cryopreserving שורות תאים. חשוב לציין, פרסום זה מדגים את שיטות עבודה מומלצות שבהן נדרש לעבוד עם דרוזופילה שורות תאים כדי למזער את הסיכון של מציג מיקרואורגניזמים adventitious או שורות תאים אחרים. החוקרים להכיר נהלים אלה יוכלו להתעמק היישומים רבים להשתמש בתאים דרוזופילה תרבותי כולל ביוכימיה, ביולוגיה של התא, גנומיקה תפקודית.
השימוש דרוזופילה תרבותי תאים משלים ויוו לטוס ניתוח גנטי, משמש ככלי חקירה ראשית למיעון רבות השאלות הביולוגיות הבסיסיות1,2,3. שורות תאים דרוזופילה מציעים ייחודי הומוגנית אוכלוסיות של תאי ממקורות שונים רקמה עם רקע גנטי מובהק. שורות תאים מתאימים עבור יישומים רבים כולל ביטוי גנים הטרנסגניים, גנומיקה, transcriptomics, פרוטאומיקס, גליקומיקס, תפוקה גבוהה RNA הפרעה (RNAi) המסכים, ביולוגיה של התא, מיקרוסקופ. חשוב, השימוש של תרבית תאים דרוזופילה מקלה על אפיון התגובות זמני מיידי לגירויים ידוע. יתר על כן, תרבית תאים דרוזופילה הוא נוטה הגנום CRISPR-Cas9 עריכה, ולכן קל יחסית ליצור שורות תאים חדשים עם הגנום ספציפי שינויים4,5,6, 7.
מרכז משאבים גנומיקה דרוזופילה (DGRC) משמש מרכז מאגר והפצה עבור שורות תאים דרוזופילה . אחת המטרות של DGRC היא לסייע חברי קהילת המחקר באמצעות משאבי התרבות התא דרוזופילה . מאמר זה מציג פקודות בסיסיות לטיפול של שורות תאים דרוזופילה . תתנחם מהמשאבים הקיימים כדי לסייע לחוקרים להיות נוח עם טיפול תרביות תאים דרוזופילה ולהשיג רמת העצמאות שלהם ניסויים1,2,8,9 ,10.
הקווים תא דרוזופילה הנפוצות ביותר הם: שניידר קווים מספר11, Kc16712, דיסק דמותי מיצובישי/מיאקי ואת מערכת העצבים המרכזית (CNS) קווים13,14, מילנר מעבדה דיסק דמותי קווים 15,16,תא השחלות למבוגרים קווים17, ו Ras קווים18 (טבלה 1). השורות שניידר ו- Kc167 הם שורות תאים לכל מטרה כללית לשימוש בביוכימיה, ביטוי גנים הטרנסגניים רקומביננטי, ומסכי גנטי הפוכה. הקווים מעבדה (ML) מיצובישי/מיאקי נגזר דיסקים דמותי זחל או במערכת העצבים המרכזית (CNS), הם היו שימושיים עבור מחקרים בנושא neurosecretion, תקנה שעתוק RNA עיבוד. הקווים דיסק מילנר (CME) היה חשוב ללמוד מעבר אותות. הקווים תא המדרשה/OSS נגזר מוטציה השחלות למבוגרים נותרו ריאגנטים חשוב לחקור את ההשפעה ללא קידוד של הביולוגיה RNA קטנים תא הנבט תחזוקה ובידול17,19. לבסוף, הקווים ראס הם ייחודיים, כי אלה שורות תאים שמקורם עוברי ectopically לבטא את אונקוגן Ras. הם כוללים את החתימה תעתיק של תאי שריר קודמן, מבטא שמריהו פעיל מכונות20. סקירת מאמרים ופרקים לכסות את היישומים שורות אלה תא פופולרי עם יותר פרטים2,3,9.
כל שורות תאים אלה יכולים להיות subcultured, קפוא. יש דרישות שונות קלה, אבל חשוב על איך כל שורה תא ומשופרת לקראת הקפאה קריוגנית. לדוגמה, שורות תאים נפרדים לדרוש מדיה שונים ותוספי מזון (טבלה 1). הקווים משתנים גם במאפייני השטח הדבקות, מורפולוגיות (איור 1 ו- 2 איור), גנוטיפ, זמן ההכפלה (טבלה 2). אנו מציגים פרוטוקולים בסיסיים, להדגיש את ההבדלים ייחודי לטיפול הקווים השונים דרוזופילה בשימוש נרחב תא.
תרביות תאים דרוזופילה הם ראשי ריאגנטים עבור מסכי מבוססת תא תפוקה גבוהה. השימוש שלהם גם משלים ויוו מחקר גנטי על ידי מתן אוכלוסיה הומוגנית של תאים מתאים ביוכימיה, מהירה בדיקה של בונה הטרנסגניים לפני הזרקת לתוך זבובים, ביולוגיה של התא, מיקרוסקופיה ולאחרונה תאים סומטיים גנטי מניפולציות על ידי הגנום עריכה1,2,3,8,9,10.
הכדאיות ושחזור של תאים דרוזופילה הקפוא רגיש לתנודות קיצוני אפילו בטמפרטורות נמוכות. DGRC מאחסן שורות תאים קפואה בשלב הנוזלי של N2 (-196 מעלות צלזיוס), מסיע אותם בתוך קרח יבש (78.5 º C). Ampules קפואים שהעביר בתוך קרח יבש כדאי לא יועבר חזרה לתוך נוזל N2 או מקפיא-80 ° C עבור אחסון. במקום זאת, התאים קפוא צריך להיות הקרת, reseeded-צפיפות גבוהה תא בהקדם האפשרי עם ההגעה (פרוטוקול בסעיף 1) ותרבותית למטרות המיועד שלהם (פרוטוקול בסעיף 3). אם הקווים תאים שאינם מנוצלים באופן מיידי לניסויים, התא קווים צריך להיות cryopreserved (פרוטוקול סעיף 6) עד שיהיו מוכנים לשימוש.
שורות תאים מסוימים, כגון השורות ML-BG2-c2 וראס צריך כמה ימים כדי להתאושש מן ההשפעות של קמה לתחייה מהמדינה cryopreserved. כמות משמעותית של פסולת הסלולר מלווה את שורות תאים אלו הימים הראשונים לאחר מפשיר. נותר ללא הפרעה, התאים לשחזר, להתרבות. הרבה שורות תאים דרוזופילה -DGRC הותאמו לגדול M3 מבוסס מדיה22. עבור שורות תאים כי הם איטיים להתאושש מן ההשפעות של מפשיר, בשימוש במדיה ממוזגים עשויה להיות שימושית. סביר ממוזגים המדיה להכיל גורמי גדילה מופרש על ידי תאי לתוך המדיה אשר עשויים לעודד את השחזור ואת התפשטות התאים לאחר מפשיר.
שורות תאים בדרך כלל לעקוב אחר עקומת גדילה סטריאוטיפי המורכב שלב ההשהיה, שלב מעריכית, מישור שלב, שלב ההתדרדרות. שורות רבות של תאים דרוזופילה להתרבות היומן-בשלב של צמיחה, כאשר הם מתורבתים-צפיפות בין עונה 1 פרק 106 עונה 1 פרק 107 תאים למ”ל על 25 מעלות צלזיוס. זה חיוני כי שורות תאים הם passaged כך הם תמיד שלב הגידול המעריכי.
המפגש של תרבות, המבוטא באחוזים, מתאר את הצמיחה פני השטח מכוסה על ידי התאים. תא זרימה עבור קו תא תלוי תא הצורה והגודל שלה. שורות תאים נפרדים יש מורפולוגיות שונות ומאפייני הדבקות. כתוצאה מכך, ייתכן שורות תאים שונים-כ דומה למפגש צפיפות התאים מאוד ברורים (איור 1). תרבות זרימה לא יכול להיות אינדיקטור אידיאלי עבור passaging תרביות תאים דרוזופילה מכיוון שורות תאים דרוזופילה ממשיכים להתרבות גם על ידי ללגוז האחד על השני מוקדים או ההשעיה אפילו לאחר השטח צמיחה מכוסה (איור 1). עם זאת, משתמשים מנוסים עם שורות תאים מסוים עשוי לעתים קרובות להשתמש הנהרות כמדריך חזותי מהירה עבור כאשר תת-תרבות.
אמנם זה אפשרי לגדול דרוזופילה קווים ב RT הסביבה בין 19−25 ° C, לא מומלץ בגלל תנודות טמפרטורת הסביבה משפיעה על קצב התפשטות. השימוש של חממה ייעודית-25 ° C מומלץ. החממה של תרביות תאים דרוזופילה אינו צריך להקל על חילופי גז CO2 כי דרוזופילה תא תרבות המדיה אל תשתמש CO2 לאכסון. הלחות בתוך החממה עבור culturing שורות תאים הוא גורם חשוב לא להתעלם כאשר culturing בתאים צלחות. בהתאם לסוג על החממה ועל סביבת העבודה, ייתכן צורך למקם גביע במים סטריליים בתוך החממה. כדי למזער את המדיה אידוי, להשתמש T-הבקבוק סגור או לאחסן תרבות צלחות במיכל פלסטיק אטומה בחוזקה ואילו בתוך החממה.
חשוב לפיתוח זמנים עבור subculturing שורות תאים דרוזופילה . כדי להעריך צמיחה קצב וצג בעקביות, זה נוח תת-תרבות יחס אפילו גיאומטריים (פיצול יחס 1:2, 1:4, 1:8). לדוגמה, ניתן לפצל צלחת confluent 10 מ”ל של תאים Kc167-8 x 106 תאים למ”ל ביחס 1:8 כדי להשיג צפיפות זריעה של עונה 1 פרק 106 תאים/mL (מ 1.25 ל השעיה תא מדולל 8.75 מ של מדיה טריים). ב- 72 h, Kc167 תרבויות צפויים להתרבות על צפיפות של תאים6 8 x 10/mL, בהתחשב שלה זמן ההכפלה של 24 שעות. היחס פיצול ולכן נקבע כדי להקל על תת-תרבות נוח שיגרה של עד פעמיים בשבוע, המבטיח כי התאים תמיד מתורבתים בשלב שלהם יומן מעריכית של צמיחה. דבר זה מאפשר זמנים קבוע subculturing את התאים כך הוא זמן זרימה לא קצר מדי ולא יותר מדי זמן. אם הזמן למפגש קצר מדי, התאים הם subcultured-צפיפות התא התחתון (יחס פיצול גבוה יותר). באופן דומה, אם הזמן להגיע למפגש ארוך מדי, התאים הם subcultured-צפיפות תא גבוהה יותר (יחס הפיצול נמוכה יותר). חשוב לציין כי רוב שורות תאים דרוזופילה רגישים מאוד צפיפות התאים נמוך (< עונה 1 פרק 105 תאים למ”ל), אילו תאים בקושי להתרבות ואת עלולה למות בסופו של דבר.
דרוזופילה שורות תאים משתנים מאפייני צמיחה מורפולוגיה. כתוצאה מכך, ייתכן שורות תאים עם מאפיינים ברורים להיות מטופלים באופן שונה. רוב דרוזופילה פתוחים למחצה חסיד. צפיפות התאים נמוך יותר, הם דבקים חזקים השטח צמיחה, התרבות הופך confluent, התאים הופכים פחות חסיד ולנתק בקלות. זה שינוי הדרגתי תא הדבקות מקלה על subculturing קל של שורות תאים דרוזופילה הנפוצה ביותר (שניידר, Kc קווים, דיסק דמותי וקווים CNS) שכן היא מאפשרת את המפעיל פשוט לוותר על מדיה מעל טפט תא לנתק אותם מפני השטח גדילה כאשר התרבות היא צפופה. לקווים שאינם מחסידי משטח כגון נבט הנשי-קו גזע/השחלות נדן סומאטית (המדרשה/OSS) וקווים ראס, זה חיוני כדי דגירה התאים טריפסין למשך זמן קצר לסייע ניתוק התאים מפני השטח צמיחה.
תוספות מדיה עבור רוב שורות תאים דרוזופילה כוללות עגל עוברית סרום (FCS). אינסולין ולחלץ לטוס למבוגרים (את פליקס) נדרשים עבור כמה שורות ספציפיות. את פליקס מכילה רכיבים לא מוגדר חיוני לצמיחה של שורות ספציפיות דיסק דמותי זחל והן לקווי תא השחלות למבוגרים. מכין DGRC, ואת עושה את פליקס למבוגרים זמין נגזר בן שבוע זבובים אורגון-R-modENCODE (RRID: BDSC_25211) ב aliquots 2.5 מ ל ו- 10 מ”ל. DGRC מספק גם הנחיות בקנה מידה קטן את פליקס הכנה באתר האינטרנט שלה . הכנה את פליקס, עם זאת, הוא זמן רב ואינה דורשת כמות גדולה של הזבוב הבוגר.
הקפאה קריוגנית של שורות תאים דרוזופילה שומר ריאגנטים עבור שמירה על שורות תאים וזמן לא נעשה בו שימוש מיידי. הקפאה קריוגנית מושגת על ידי לאט להקפיא את התאים (-1 ° C/דקה)-80 מעלות במדיום המכיל דימתיל סולפוקסיד, סוכן cryoprotective. השלב קירור איטי הוא קריטי עבור הקפאה קריוגנית מוצלחת. במקפיא-80 ° C, האמפולה של תאים מצטנן בקצב של-1 ° C/min כאשר הם ממוקמים בתוך מיכל המקפיא מלא אלכוהול איזופרופיל החל בטמפרטורת החדר 25 ° C, זה יקח עד 2 שעות על הטמפרטורה ב ampules כדי להגיע-80 מעלות צלזיוס. מומלץ להשאיר את ampules כדי להקפיא למשך הלילה.
Ampules קפואים ואז שתתאפשר במהירות לתוך השלב הנוזלי של חנקן עבור אחסון ממושך. בטמפרטורת החדר, cryovial לחמם במהירות כ 10 ° C/דקה, הכדאיות ייחשף ב מעל-50 ° C23. כדי למנוע ההעברה מהירה, לטפל ampules בקבוצות קטנות כדי למזער את החשיפה טמפרטורת הסביבה. לחלופין, במקום את cryovials קפוא על קרח יבש בעת הכנת להעברת שלהם לנוזל N2- אם חנקן נוזלי אינה זמינה, התאים ניתן לאחסן במקפיא-80 ° C, אך עם סיכון של הידרדרות משמעותית לאורך זמן.
תא צפיפות הוא קריטי עבור הקפאה קריוגנית מוצלחת ואת התחייה עוקבות של שורות תאים. באופן כללי, התא החדש קווים אמורים לקפוא ליצירת הראשונית להקפיא (1−3 ampules), ברגע עודף של תאים הופכת לזמינה. ברגע שורת התאים יש כבר תרבותי נוסף stably, מלאי קפוא של 10−20 ampules צריך להיווצר. מלאי זה הוא להפשיר ואז לבדוק את תא ההקפאה שלאחר השחזור ואת הכדאיות, לאחר מכן זה הופץ עבור experimentations או כדי להחליף את המניה כאשר המספר של ampules מניות קפוא יורד מתחת חמש. לבסוף, חשוב לאמת כי התאים המופשרים לשמר את המאפיינים של המניות הורים כמו שורות תאים ידועים להתפתח3,24.
לסיכום, מאמר זה מציג פריימר לעבודה עם תרביות תאים דרוזופילה על-ידי מתן המידע הבסיסי על שונים קווים, שיטות עבודה מומלצות, audiovisual פרוטוקולים לטיפול הבסיסי של שורות תאים דרוזופילה . משאב נגיש זה נועד להקל בצורה חלקה המבוא לעבודה עם תאים בתרבית דרוזופילה וכדי להשלים את המדריכים הקיימים הדרכה בכל מעבדה למחקר.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים מכוני הבריאות הלאומיים (פרס NIH P40OD010949) וקהילת המחקר על ניצול המשאבים השונים של DNA/וקטורים/תא melanogaster ד מספר פעמים ב DGRC.
100 mm tissue culture plates | Corning | 430167 | Subculturing |
25 cm2 T-flask | Corning | 430168 | Subculturing |
35HC Liquid Nitrogen Storage Tank | Taylor-Wharton | 35HCB-11M | Cryopreservation |
Automated Cell counter | BIO-RAD | TC20 | Counting |
Bactopeptone | BD BioSciences | 211677 | Medium additions |
Counting Slides | BIO-RAD | 145-0011 | Counting |
Cryovial 1 mL | Greiner | 123263 | Cryopreservation |
DMSO | Sigma Aldrich | D5879 | Cryopreservation |
Freezing Box | Nalgene | 5029-0909 | Cryopreservation |
Freezing Container | Fisher Scientific | 15-350-50 | Cryopreservation |
Hematocytometer | Fisher Scientific | #0267110 | Counting |
Human Insulin | Millipore Sigma | I9278 | Medium additions |
Hyclone CCM3 media | GE Healthcare Life Sciences | SH30061.03 | Medium |
Hyclone Fetal Bovine Serum | GE Healthcare Life Sciences | SH30070.03 | Medium additions |
L-Glutamic acid potassium salt monohydrate | Millipore Sigma | G1149 | Medium additions |
L-Glutathione reduced | Millipore Sigma | G6013 | Medium additions |
Potassium Bicarbonate | Millipore Sigma | 237205 | Medium additions |
Select Yeast Extract | Millipore Sigma | Y1000 | Medium additions |
Shields and Sang's M3 Insect medium | Millipore Sigma | S8398 | Medium |
Trpsin-EDTA (0.05 %), phenol red | ThermoFisher Scientific | 25300054 | Subculturing |
Trypan Blue (0.4%) | BIO-RAD | 145-0013 | Counting |