Lignées de cellules de drosophile sont importants réactifs pour la recherche fondamentale et recherche biomédicale. Cet article fournit des protocoles pour la décongélation, repiquage et la cryoconservation des lignées de cellules Drosophila couramment utilisées pour aider les chercheurs à intégrer l’emploi de ces réactifs dans leurs recherches.
On compte actuellement plus de 160 lignées cellulaires Drosophila distinctes, distribuées par le centre de ressources pour le génomique Drosophila (DGRC). Avec le génie du génome, le nombre de nouvelles lignées cellulaires devrait passer. La DGRC a pour but de familiariser les chercheurs avec l’aide de lignées cellulaires de drosophile comme un outil expérimental pour compléter et orientent le calendrier de leur recherche. Procédures permettant de travailler avec une variété de lignées cellulaires drosophile ayant des caractéristiques distinctes sont prévues, y compris des protocoles pour la décongélation, cultivant et cryoconservation des lignées cellulaires. Ce qui est important, cette publication montre les méthodes conseillées pour travailler avec des lignées de cellules de drosophile pour minimiser les risques de contaminations de microorganismes adventices ou d’autres lignées cellulaires. Les chercheurs qui sont familiariser avec ces procédures seront en mesure de se plonger dans les nombreuses applications qui utilisent des cellules de drosophile cultivés dont la biochimie, la biologie cellulaire et la génomique fonctionnelle.
L’utilisation de la drosophile cultivé des cellules compléments in vivo voler analyse génétique et constitue un outil d’enquête primaire pour répondre aux nombreuses questions biologiques fondamentales1,2,3. Lignées cellulaires Drosophila offrent unique population homogène de cellules dérivées des sources de tissus différents avec des antécédents génétiques distinctes. Lignées cellulaires ne conviennent pas pour de nombreuses applications, y compris l’expression des gènes transgéniques, génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, écrans de haut débit RNA interférence (Arni), biologie cellulaire et la microscopie. Ce qui est important, l’utilisation de culture de cellules de drosophile facilite la caractérisation des réponses temporelles immédiates à un stimulus connu. En outre, culture de cellules de drosophile se prête au génome CRISPR-Cas9 édition, ce qui en fait relativement facile de créer de nouvelles lignées de cellules avec génome spécifique modifications4,5,6, 7.
La drosophile génomique Resource Center (DGRC) sert de centre référentiel et de la distribution pour les lignées cellulaires de drosophile . L’un des objectifs de la DGRC est d’aider les membres de la communauté de recherche en utilisant les ressources de la culture de cellule Drosophila . Cet article présente les protocoles de base pour la manipulation des lignées de cellules de drosophile . Il complète les ressources existantes pour aider les chercheurs à devenir à l’aise avec la manipulation des cultures de cellules de drosophile et atteindre un niveau d’autonomie dans leurs expériences1,2,8,9 ,,10.
Les lignées de cellules de drosophile plus couramment utilisées sont : Schneider les lignes11, Kc16712, Mitsubishi/Miyake disque imaginal et système nerveux central (SNC) lignes13,14, lignes de disques imaginaux de laboratoire Milner 15, les cellules ovariennes adultes lignes16,17et le Ras lignes18 (tableau 1). Les lignes de Schneider et Kc167 sont des lignées tout usage générales pour une utilisation en biochimie, l’expression des gènes transgéniques recombinant et des écrans de génétiques inverses. Les lignes de laboratoire (ML) de Mitsubishi/Miyake proviennent des disques imaginaux larvaires ou du système nerveux central (SNC) et ils ont été utiles pour les études liées à neurosécrétions, régulation de la transcription et ARN. Les lignes de disque Milner (CME) ont été importants pour l’étude de la transduction du signal. Les lignées de cellules fGS/OSS dérivées de mutants ovaires adultes restent réactifs importants d’étudier l’impact de non-codage petite biologie des ARN dans des cellules germinales entretien et différenciation17,19. Enfin, les lignes de Ras sont uniques car ce sont des lignées de cellules provenant d’embryons de façon ectopique exprimant l’oncogène Ras. Ils ont la signature de transcriptional des cellules précurseurs musculaires et exprime piRNA active machines20. Récent examen articles et chapitres de livres couvrent les applications de ces lignées de cellules populaire avec plus de détails2,3,9.
Toutes ces lignées cellulaires peuvent être repiquées et congelées. Il y a des exigences différentes légères mais importants pour chaque lignée cellulaire est maintenue et préparée pour la cryoconservation. Par exemple, des lignées distinctes nécessitent différents médias et suppléments (tableau 1). Les lignes varient également dans les propriétés de la surface d’adhérence, morphologies (Figure 1 et Figure 2), le génotype et le temps de doublement (tableau 2). Nous présentons des protocoles de base et mettre en évidence les différences uniques pour gérer les diverses lignées de cellules de Drosophila largement utilisées.
Les cultures de cellules de drosophile sont des réactifs primaires pour les écrans de haut débit basés sur les cellules. Leur utilisation complète également la recherche en génétique in vivo en fournissant une population homogène de cellules appropriés pour la biochimie, rapid testing de constructions transgéniques avant l’injection dans les mouches, biologie cellulaire, microscopie et, plus récemment, génétique des cellules somatiques manipulations du génome modifiant1,2,3,8,9,10.
La viabilité et la récupération de cellules congelées de drosophile est sensible aux fluctuations radicales même à basse température. La DGRC stocke des lignées de cellules congelées dans la phase liquide de N2 (-196 ° C) et les transporte dans la glace sèche (-78,50 ° C). Ampoules congelées qui ont été transportés dans la glace sèche ne devraient pas être transférées en liquide N2 ou un congélateur-80 ° C pour le stockage. Au lieu de cela, les cellules congelées devraient être décongelés, redéfinies à une densité cellulaire élevée dès que possible à l’arrivée (protocole 1 de l’article) et cultivées pour leur destination (protocole, article 3). Si les lignées cellulaires ne sont pas immédiatement utilisées pour des expériences, la cellule lignes devraient être cryoconservés (article 6 du protocole) jusqu’à ce qu’ils sont prêts à l’emploi.
Certaines lignées de cellules, telles que les lignes ML-BG2-c2 et Ras ont besoin de plusieurs jours pour surmonter les effets d’être relancé par l’état cryopréservé. Une quantité importante de débris cellulaires accompagne ces lignées cellulaires, les premiers jours après décongélation. Laissé intact, les cellules vont récupérer et prolifèrent. Plusieurs lignées de cellules de drosophile à la DGRC ont été adaptées en M3 selon médias22. Pour les lignées de cellules qui sont lentes à se remettre des effets de la fonte, l’utilisation de milieux conditionnés peut être utile. Milieux conditionnés susceptible de contenir des facteurs de croissance sécrétés par les cellules dans les médias susceptibles d’encourager la récupération et la prolifération des cellules après décongélation.
Lignées cellulaires suivent généralement une courbe de croissance stéréotypées consistant en une phase de latence, la phase exponentielle de croissance, phase de plateau et une phase de détérioration. Plusieurs lignées de cellules de drosophile prolifèrent dans la phase logarithmique de croissance quand ils sont cultivés à une densité de 1 x 106 à 1 x 107 cellules/mL à 25 ° C. Il est essentiel que les lignées cellulaires sont repiquées tels qu’ils sont toujours en phase de croissance exponentielle.
La confluence d’une culture, exprimée en pourcentage, décrit la surface de croissance qui est couvert par les cellules. Confluence des cellules sur une lignée cellulaire dépend de sa forme des cellules et la taille. Lignées cellulaires distincts ont des morphologies différentes et des propriétés d’adhérence. Ainsi, différentes lignées cellulaires à environ semblable confluence peuvent avoir la densité des cellules très distinctes (Figure 1). Confluence de la culture peut ne pas être un indicateur idéal pour le passage des cultures de cellules de drosophile parce que les lignées de cellules de drosophile continuent à proliférer soit par s’empilent sur les uns les autres comme des foyers ou en suspension, même après que la surface de croissance a été couverts (Figure 1). Toutefois, utilisateurs expérimentés avec des lignées cellulaires spécifiques peuvent utilisent souvent confluence comme un guide visuel rapid pour quand à la sous-culture.
Bien qu’il soit possible de faire pousser des lignes de drosophile à ta ambiant entre 19−25 ° C, il n’est pas recommandé car les fluctuations de la température ambiante peuvent affecter le taux de prolifération. L’utilisation d’un incubateur dédié 25 ° C est recommandée. L’incubateur pour les cultures de cellules de drosophile ne doit pas faciliter l’échange de gaz CO2 milieux de culture cellulaire de drosophile n’utilisant pas de CO2 pour la mise en mémoire tampon. L’humidité à l’intérieur de l’incubateur de culture de lignées cellulaires est un facteur important ne pas à négliger lorsque cultivant les cellules en plaques. Selon le type sur l’incubateur et le milieu de travail, il peut être nécessaire de placer un bécher d’eau stérile à l’intérieur de l’incubateur. Pour minimiser l’évaporation de médias, utiliser un T-flacon fermé ou stocker les plaques de culture dans un récipient en plastique hermétique à l’intérieur de l’incubateur.
Il est important d’établir un calendrier pour le repiquage des lignées de cellules de drosophile . Pour évaluer la cohérence de moniteur et le taux de croissance, il est commode de sous-culture à un rapport même géométrique (split ratio 1:2, 1:4, 1:8). Par exemple, une plaque de 10 mL confluentes de cellules Kc167 à 8 x 106 cellules/mL peut être dédoublée au ratio de 1:8 pour atteindre une densité de semis de 1 x 106 cellules/mL (1,25 mL de suspension cellulaire diluée dans 8,75 mL de supports neufs). En 72 h, cultures Kc167 sont censés se multiplient à une densité de 8 x 106 cellules/mL, compte tenu de son temps de doublement de 24h. Par conséquent, le coefficient de fractionnement est déterminé pour faciliter une routine de pratique sous-culture de jusqu’à deux fois par semaine, veiller à ce que les cellules sont toujours cultivées dans leur phase de log exponentielle de croissance. Cela permet un horaire régulier pour le repiquage des cellules, afin que le temps de confluence est ni trop court ni trop long. Si le temps de confluence est trop court, les cellules sont repiquées à une plus faible densité cellulaire (ratio plus élevé de split). De même, si le temps d’atteindre le confluent est trop long, les cellules sont repiquées à une densité plus élevée de la cellule (plus faible ratio de partage). Il est important de noter que la plupart des lignées de cellules Drosophila sont très sensibles à faible densité (< 1 x 105 cellules/mL), dans lesquels les cellules guère prolifèrent et peuvent finissent par mourir.
Lignées cellulaires Drosophila varient dans la morphologie et les caractéristiques de croissance. Ainsi, les lignées de cellules ayant des propriétés distinctes peuvent avoir à être traités différemment. La plupart des lignées de cellules Drosophila sont semi adhérentes. À plus faible densité cellulaire, ils adhèrent plus à la surface de croissance et de la culture devienne confluente, les cellules deviennent moins adhérentes et détachement facilement. Ce changement graduel dans l’adhérence cellulaire facilite le repiquage facile des lignées de cellules plus largement utilisés Drosophila (Schneider, lignes Kc, disque imaginal et CNS) car il permet à l’opérateur de renoncer simplement médias au cours de la monocouche cellulaire à déloger de la surface de croissance lorsque la culture est dense. Pour les lignes qui sont les surfaces adhérentes telles que la lignée germinale femelle tige/ovaire somatique gaine (fGS/OSS) et les lignes de Ras, il est essentiel d’incuber les cellules en trypsine pour une courte durée aider à détacher les cellules de la surface de croissance.
Ajouts de Media pour la plupart des lignées de cellules Drosophila comprennent le sérum de veau foetal (FCS). Insuline et extrait de mouche adulte (FEX) sont nécessaires pour certaines lignes spécifiques. FEX contient indéfinis composants essentiels à la croissance des disques imaginaux larvaire spécifiques et les lignes de cellules ovariennes adultes. La DGRC prépare et fait FEX adulte disponible issues 1 semaine vieux Oregon-R-modENCODE mouches (IDRM : BDSC_25211) en aliquotes de 2,5 mL et 10 mL. La DGRC fournit également des instructions pour à petite échelle préparation FEX sur son site Internet . Préparation de FEX, cependant, prend du temps et nécessite une grande quantité de mouches adultes.
La cryoconservation des lignées de cellules de drosophile économise temps et réactifs pour le maintien des lignées cellulaires pas dans une utilisation immédiate. Cryoconservation est obtenue par congélation lentement les cellules (-1 ° C/min) à-80 ° C dans un milieu contenant un agent cryoprotecteur DMSO. L’étape de refroidissement lent est critique pour la cryoconservation réussie. Dans un congélateur à-80 ° C, l’ampule de cellules est refroidi à raison de-1 ° C/min lorsqu’il est placé dans un récipient de congélation rempli avec de l’isopropanol. À partir de la température ambiante de 25 ° C, il faudra jusqu’à 2 h pour que la température dans les ampoules pour atteindre-80 ° C. Il est recommandé de laisser les ampoules de geler pendant la nuit.
Ampoules congelées doivent alors être rapidement transférés dans la phase liquide de l’azote pour une conservation prolongée. À température ambiante, le cryovial va réchauffer rapidement à environ 10 ° C/min et la viabilité sera compromise à au-dessus de-50 ° C,23. Pour garder le transfert rapide, gérer les ampoules en petits lots pour minimiser l’exposition à la température ambiante. Sinon, placer la cryovials congelés sur la glace sèche tout en préparant leur transfert dans le liquide N2. Si l’azote liquide n’est pas disponible, les cellules peuvent être entreposés dans un congélateur à-80 ° C, bien qu’avec un risque de détérioration significative au fil du temps.
Densité cellulaire est critique pour la cryoconservation réussie et la reprise ultérieure des lignées cellulaires. En général, nouvelle cellule lignes devraient être gelés pour créer le premier gel (1−3 ampoules) dès qu’un excès de cellules est disponible. Une fois que la lignée cellulaire a été cultivée plus stablement, un stock congelé de 10−20 ampoules doit être créé. Ce stock est ensuite décongelé pour vérifier sa récupération après gel cellulaire et viabilité, après quoi il est propagé d’expérimentations ou de remplacer le stock lorsque le nombre d’ampoules stocks congelés est inférieur à cinq. Enfin, il est important de valider que les cellules dégelées conservent les caractéristiques de son cheptel parental comme les lignées cellulaires sont connues d’évoluer3,24.
En conclusion, cet article présente une couche d’apprêt pour travailler avec des cultures de cellules de drosophile en fournissant les renseignements fondamentaux sur les diverses lignes, meilleures pratiques et protocoles audiovisuels pour le maniement de base de lignées cellulaires de drosophile . Cette ressource accessible est destinée à soulager en douceur l’introduction de travailler avec des cellules de drosophile et en complément des guides de formation existant dans tout laboratoire de recherche.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions les National Institutes of Health (NIH de prix P40OD010949) et le milieu de la recherche utilisant les différentes ressources d’ADN/vecteur/cellule de d. melanogaster , à la DGRC.
100 mm tissue culture plates | Corning | 430167 | Subculturing |
25 cm2 T-flask | Corning | 430168 | Subculturing |
35HC Liquid Nitrogen Storage Tank | Taylor-Wharton | 35HCB-11M | Cryopreservation |
Automated Cell counter | BIO-RAD | TC20 | Counting |
Bactopeptone | BD BioSciences | 211677 | Medium additions |
Counting Slides | BIO-RAD | 145-0011 | Counting |
Cryovial 1 mL | Greiner | 123263 | Cryopreservation |
DMSO | Sigma Aldrich | D5879 | Cryopreservation |
Freezing Box | Nalgene | 5029-0909 | Cryopreservation |
Freezing Container | Fisher Scientific | 15-350-50 | Cryopreservation |
Hematocytometer | Fisher Scientific | #0267110 | Counting |
Human Insulin | Millipore Sigma | I9278 | Medium additions |
Hyclone CCM3 media | GE Healthcare Life Sciences | SH30061.03 | Medium |
Hyclone Fetal Bovine Serum | GE Healthcare Life Sciences | SH30070.03 | Medium additions |
L-Glutamic acid potassium salt monohydrate | Millipore Sigma | G1149 | Medium additions |
L-Glutathione reduced | Millipore Sigma | G6013 | Medium additions |
Potassium Bicarbonate | Millipore Sigma | 237205 | Medium additions |
Select Yeast Extract | Millipore Sigma | Y1000 | Medium additions |
Shields and Sang's M3 Insect medium | Millipore Sigma | S8398 | Medium |
Trpsin-EDTA (0.05 %), phenol red | ThermoFisher Scientific | 25300054 | Subculturing |
Trypan Blue (0.4%) | BIO-RAD | 145-0013 | Counting |