Drosophila -Zell-Linien sind wichtige Reagenzien für Grundlagen- und biomedizinische Forschung. Dieser Artikel enthält Protokolle für Auftauen, Inkubationsschale und die Kryokonservierung von häufig verwendeten Drosophila Zelllinien, Forscher bei der Einbeziehung der Verwendung dieser Reagenzien in ihrer Forschung zu unterstützen.
Derzeit gibt es über 160 verschiedene Drosophila -Zelllinien von Drosophila Genomics Resource Center (DGRC) verteilt. Mit Genom Engineering soll die Anzahl der neuartigen Zell-Linien zu erhöhen. Die DGRC soll Forscher damit vertraut, mit Drosophila Zelllinien als ein experimentelles Werkzeug zu ergänzen und ihre Forschungsagenda zu fahren. Verfahren für das Arbeiten mit einer Vielzahl von Drosophila -Zell-Linien mit unterschiedlichen Charakteristiken sind zur Verfügung gestellt, einschließlich der Protokolle für Auftauen, Kultivierung und cryopreserving Zell-Linien. Wichtig ist, zeigt diese Publikation die best Practices, die Arbeit mit Drosophila Zelllinien zur Minimierung des Risikos von Kontaminationen aus hinzutretender Mikroorganismen oder andere Zell-Linien. Forscher, die sich mit diesen Verfahren vertraut gemacht werden können, in vielen Anwendungen zu beschäftigen, die Drosophila kultivierten Zellen einschließlich der Biochemie, Zellbiologie und funktionelle Genomik verwenden.
Die Verwendung von Drosophila kultivierten Zellen Ergänzungen in-vivo fliegen Genanalyse und dient als primäre Anfrage-Tool für den Umgang mit vielen biologischen Grundfragen1,2,3. Drosophila -Zell-Linien bieten einzigartige homogene Populationen von Zellen aus verschiedenen Gewebe Quellen mit unterschiedlichen genetischen Hintergrund. Zell-Linien eignen sich für viele Anwendungen einschließlich transgenen Genexpression, Genomik, Transkriptom, Proteomik, Metabolomik, Hochdurchsatz RNA-Interferenz (RNAi) Bildschirme, Zellbiologie und Mikroskopie. Wichtig ist, erleichtert die Verwendung von Drosophila Zellkultur die Charakterisierung der unmittelbaren zeitlichen Antworten auf bekannte Reize. Darüber hinaus ist Drosophila Zellkultur zugänglicher CRISPR-Cas9 Genom bearbeiten, so dass es relativ einfach, neue Zelllinien mit spezifischen Genom Änderungen4,5,6, 7.
Die Drosophila Genomics Resource Center (DGRC) dient als Repository und Verteilung Zentrum für Drosophila -Zell-Linien. Eines der Ziele der DGRC soll Mitglieder der Forschungsgemeinschaft bei Drosophila Zelle Kultur Mitteln unterstützen. Dieser Artikel stellt grundlegende Protokolle für die Handhabung von Drosophila -Zell-Linien. Es ergänzt die vorhandene Ressourcen, um Forscher vertraut mit der Handhabung von Drosophila -Zellkulturen und ein Maß an Unabhängigkeit bei ihrer Experimente1,2,8,9 ,10.
Die am häufigsten verwendeten Drosophila -Zell-Linien sind: Schneider Linien11, Kc16712, Mitsubishi/Miyake imaginalen Scheibe und zentralen Nervensystems (ZNS) Zeilen13,14, Milner Labor imaginalen Scheibe Linien 15, die Erwachsenen Eierstock Zelle Linien16,17und Ras Linien18 (Tabelle 1). Die Schneider und Kc167 sind allgemeine Allzweck-Zell-Linien für den Einsatz in Biochemie, rekombinante transgenen Genexpression und reverse genetische Bildschirme. Die Mitsubishi/Miyake-Labor (ML)-Linien stammen aus der Larven imaginalen Scheiben oder zentrale Nervensystem (ZNS) und sie wurden nützlich für Studien im Zusammenhang mit Neurosecretion, Transkription und die RNA-Verarbeitung. Milner (CME) Scheibe Linien sind wichtig für das Studium der Signaltransduktion gewesen. Die fGS/OSS-Zelllinien aus mutierten Erwachsenen Eierstöcke bleiben wichtige Reagenzien zur Untersuchung der Auswirkungen von nicht-kodierenden kleine RNA Biology Keimzelle Wartungs- und Differenzierung17,19. Zu guter Letzt sind die Ras-Linien einzigartig da diese Zelllinien aus Embryonen, die mit dem ectopically Ausdruck der Ras-Onkogen. Sie haben die transkriptionelle Signatur von Muskel Vorläuferzellen und aktive PiRNA Maschinen20drückt. Den letzten Review-Artikel und Buchkapitel decken die Anwendungen dieser beliebten Zelllinien mit mehr Details2,3,9.
Diese Zelllinien können subkultiviert und eingefroren. Es gibt leichte, aber wichtige unterschiedliche Anforderungen für jede Zelllinie ist gepflegt und vorbereitet für die Kryokonservierung. Beispielsweise erfordern verschiedene Zelllinien verschiedener Medien und Ergänzungen (Tabelle 1). Die Linien unterscheiden sich auch in Einhaltung der Oberfläche Eigenschaften, Morphologien (Abbildung 1 und Abbildung 2), Genotyp und Verdopplungszeit (Tabelle 2). Wir präsentieren grundlegende Protokolle und die einzigartige Unterschiede für den Umgang mit verschiedenen weit verbreiteten Drosophila -Zell-Linien hervorheben.
Drosophila -Zellkulturen sind primäre Reagenzien für hohen Durchsatz zellbasierte Bildschirme. Ihre Verwendung ergänzt auch in-vivo Genforschung durch eine homogene Population von Zellen geeignet für Biochemie, schnelle transgene Konstrukte vor dem Einspritzen in fliegen, Zellbiologie, Mikroskopie und jüngerer somatischer Zellen genetische Tests Manipulationen durch Genom Bearbeitung1,2,3,8,9,10.
Die Lebensfähigkeit und die Wiederherstellung der gefrorenen Drosophila Zellen reagiert empfindlich auf drastischen Schwankungen auch bei niedrigen Temperaturen. Die DGRC gefrorenen Zelllinien in der flüssigen Phase von N2 (-196 ° C) speichert und transportiert sie in Trockeneis (-78,50 ° C). Gefrorene Ampullen, die in Trockeneis transportiert wurden dürfen nicht wieder in Flüssigkeit N2 oder einem-80 ° C Gefrierschrank zur Aufbewahrung übertragen werden. Stattdessen sollte die gefrorenen Zellen aufgetaut, Platzierungsspiele auf eine hohe Zelldichte so bald wie möglich bei der Ankunft (Protokoll Abschnitt 1) und für den vorgesehenen Zweck (Protokoll Abschnitt 3) kultiviert werden. Wenn die Zelllinien nicht sofort für Experimente verwendet werden, kryokonserviert die Zelle, die Linien sollten (Protokoll siehe Abschnitt 6) bis sie betriebsbereit sind.
Einige Zelllinien, wie z. B. die ML-BG2-c2 und Ras Linien benötigen mehrere Tage, um von den Auswirkungen der aus dem kryokonservierten Zustand wieder erholen. Eine erhebliche Menge an Zelltrümmer begleitet diesen Zelllinien die ersten paar Tage nach dem Auftauen. Links ungestört, werden die Zellen erholen und sich vermehren. Viele Drosophila -Zell-Linien an den DGRC wurden in M3 basierend Medien22wachsen angepasst. Für Zell-Linien, die nur von den Auswirkungen langsam der Auftauen erholen, kann die Verwendung von konditionierten Medien hilfreich sein. Wahrscheinlich bedingte Medien enthalten Wachstumsfaktoren abgesondert von den Zellen in den Medien, die Förderung der Erholung und Proliferation der Zellen nach dem Auftauen können.
Zell-Linien folgen in der Regel eine stereotype Wachstumskurve, bestehend aus einem Lag-Phase, exponentielle Phase, Plateau-Phase und eine Verschlechterung-Phase. Viele Zell-Linien von Drosophila vermehren sich in der Log-Phase des Wachstums, wenn sie bei einer Dichte von 1 x 106 bis 1 x 107 Zellen/mL bei 25 ° c kultiviert werden Es ist wichtig, dass Zelllinien passagiert sind, so dass sie sich immer in der exponentiellen Wachstumsphase befinden.
Zusammenfluss von einer Kultur, ausgedrückt als Prozentsatz, beschreibt die Wachstum Fläche, die durch Zellen bedeckt ist. Zusammenfluss der Zelle für eine Zelllinie hängt von seiner Zelle Form und Größe. Verschiedene Zelllinien haben unterschiedliche Morphologien und Einhaltung der Eigenschaften. Demzufolge möglicherweise verschiedene Zelllinien an ungefähr ähnlichen Mündung stark ausgeprägte Zelldichte (Abbildung 1). Kultur-Zusammenfluss möglicherweise kein idealer Indikator für Drosophila Zellkulturen Passagierung, weil Drosophila -Zell-Linien vermehren sich weiterhin entweder durch Stapeln übereinander als Brennpunkte oder in der Schwebe, auch nach der Wachstumsoberfläche abgedeckt (Abbildung 1). Jedoch können Benutzer mit bestimmten Zelllinien erfahren Zusammenfluss oft als eine schnelle visuelle Anleitung für wenn die Subkultur nutzen.
Es ist, zwar möglich, Drosophila Linien bei ambient RT 19−25 ° C zu wachsen ist es nicht empfohlen, da Schwankungen der Umgebungstemperatur die Proliferationsrate auswirken können. Eine dedizierte 25 ° C Inkubator wird empfohlen. Der Inkubator für Drosophila Zellkulturen muss nicht CO2 Gasaustausch zu erleichtern, weil Drosophila Zellkulturmedien CO2 nicht für die Pufferung verwenden. Die Luftfeuchtigkeit in die Brutmaschine für die Kultivierung von Zell-Linien ist ein wichtiger Faktor, nicht übersehen werden, wenn Zellen in Platten zu züchten. Je nach Art am Inkubator und das Arbeitsumfeld ist die legen Sie eines Bechers mit sterilem Wasser in die Brutmaschine erforderlich. Um Medien Verdunstung zu minimieren, verwenden Sie geschlossene T-Kolben oder speichern Sie Kultur Platten in einem dicht verschlossenen Plastikbehälter während in die Brutmaschine zu.
Es ist wichtig, einen Zeitplan für Subkultivieren Drosophila -Zell-Linien zu entwickeln. Um das Wachstum Rate und Monitor Konsistenz abschätzen zu können, ist es zweckmäßig, Subkultur zu einem noch geometrische Verhältnis (split-Verhältnis 1:2, 1:4, 1:8). Beispielsweise kann eine 10 mL konfluierende Platte von Kc167 Zellen bei 8 x 106 Zellen/mL im Verhältnis 1:8 zu Aussaatdichte von 1 x 106 Zellen/mL (1,25 mL Zellsuspension verdünnt in 8,75 mL frische Medien) aufgeteilt werden. In 72 h sollen Kc167 Kulturen zu einer Dichte von 8 x 106 Zellen/mL, vermehren sich angesichts seiner Verdopplungszeit von 24 h. Das Split-Verhältnis ist deshalb entschlossen, ermöglichen eine bequeme Subkultur Routine bis zu zweimal pro Woche, um sicherzustellen, dass die Zellen immer in ihre exponentielle Log Wachstumsphase kultiviert werden. Dies ermöglicht einen regelmäßigen Zeitplan für Subkultivieren der Zellen, so dass die Zeit zum Zusammenfluss weder zu kurz noch zu lang ist. Wenn die Zeit zum Zusammenfluss zu kurz ist, werden die Zellen bei einer niedrigeren Zelldichte (höhere Split-Verhältnis) subkultiviert. Ebenso, wenn die Zeit zum Zusammenfluss erreichen zu lang ist, sind die Zellen auf eine höhere Zelldichte (untere Split-Verhältnis) subkultiviert. Es ist wichtig zu beachten, dass die meisten Drosophila -Zell-Linien sehr empfindlich auf geringe Zelldichten sind (< 1 x 105 Zellen/mL), in welchen Zellen kaum vermehren und können schließlich sterben.
Drosophila -Zelllinien variieren in Wuchsmerkmalen und Morphologie. Infolgedessen müssen Zelllinien mit unterschiedlichen Eigenschaften unterschiedlich behandelt werden. Die meisten Drosophila -Zell-Linien sind semi-Anhänger. Bei geringer Zelldichte sie stärker an der Wachstumsoberfläche haften und wie die Kultur konfluierende wird, die Zellen werden weniger Anhänger und leicht lösen. Dieser allmähliche Veränderung in der Zelle Haftfähigkeit erleichtert einfach Inkubationsschale am häufigsten verwendete Drosophila -Zell-Linien (Schneider, Kc, Imaginale Scheibe und CNS-Linien), wie es der Bediener einfach Medien über die Zelle Monolage, sie verdrängen verzichten kann von der Wachstumsoberfläche, wenn die Kultur dicht ist. Für Linien, die Oberfläche Anhänger wie unbedingt die weiblichen Keimbahn Stamm/Eierstöcke somatischen Hülle (fGS/OSS) und Ras Linien, Zellen in Trypsin für eine kurze Dauer zu helfen, lösen die Zellen von der Wachstumsoberfläche auszubrüten.
Medien sind für die meisten Drosophila -Zell-Linien fetalen Kälberserum (FCS). Insulin und Erwachsenen fliegen Extrakt (FEX) sind für einige bestimmten Zeilen erforderlich. FEX enthält nicht definierte Komponenten wesentlich für das Wachstum von bestimmten Larven imaginalen Scheibe Linien und die Erwachsenen Eierstock Zelllinien. Die DGRC bereitet, und macht zur Verfügung Erwachsene FEX abgeleitet von 1 Woche alt Oregon-R-ModENCODE fliegen (RRID: BDSC_25211) in 2,5 mL und 10 mL Aliquote. Die DGRC enthält Anweisungen zum kleinen FEX Vorbereitung auch auf seiner Website . FEX Vorbereitung, jedoch ist zeitaufwändig und erfordert eine große Menge von Erwachsenen fliegen.
Die Kryokonservierung von Drosophila Zelllinien spart Zeit und Reagenzien für die Wartung von Zelllinien nicht in unmittelbaren Gebrauch. Die Kryokonservierung wird durch langsam Einfrieren der Zellen (-1 ° C/min) bis-80 ° C in DMSO, ein Cryoprotective-Agent-haltigem Medium erreicht. Die langsame kühle Schritt ist entscheidend für erfolgreiche Kryokonservierung. In einer Gefriertruhe-80 ° C wird die Ampulle von Zellen mit einer Rate von-1 ° C/min beim Platzieren in einem eiskalten Behälter gefüllt mit Isopropanol gekühlt. Ab 25 ° C Umgebungstemperatur, dauert es bis zu 2 h für die Temperatur in den Ampullen bis-80 ° c erreichen. Es wird empfohlen, die Ampullen über Nacht gefrieren lassen.
Gefrorene Ampullen müssen dann rasch in die flüssige Phase von Stickstoff für längere Lagerung transportiert werden. Bei Raumtemperatur die Cryoröhrchen wird bei etwa 10 ° C/min schnell erhitzen und die Lebensfähigkeit bei über 50 ° C23beeinträchtigt wird. Um die Übertragung zu schnellen halten, handhaben Sie Ampullen in kleinen Chargen, die Umgebungstemperatur minimieren. Alternativ legen Sie die gefrorenen Cryovials auf Trockeneis während der Vorbereitung für ihren Transfer in die Flüssigkeit N2. Wenn flüssiger Stickstoff nicht verfügbar ist, können die Zellen in einem-80 ° C Gefrierschrank, obwohl mit einem Risiko für eine signifikante Verschlechterung im Laufe der Zeit gespeichert werden.
Zelldichte ist entscheidend für erfolgreiche Kryokonservierung und die anschließende Wiederbelebung der Zell-Linien. In der Regel neue Zelle, die Linien eingefroren werden sollten, um die anfängliche erstellen Einfrieren (1−3 Ampullen), sobald ein Übermaß an Zellen zur Verfügung steht. Sobald die Zellinie stabil weiter kultiviert wurde, sollte ein gefrorenen bestand von 10−20 Ampullen erstellt werden. Dieser Bestand ist dann zu prüfen, ob seine Post-Freeze Zelle Erholung und Lebensfähigkeit, wonach es für Experimente propagiert wird oder die Aktie zu ersetzen, wenn die Anzahl der gefrorenen Lager Ampullen fünf unterschreitet aufgetaut. Zu guter Letzt ist es wichtig zu überprüfen, ob die aufgetauten Zellen die Eigenschaften seiner Eltern Aktien behalten, wie Zell-Linien bekannt sind,3,24zu entwickeln.
Dieser Artikel stellt abschließend eine Grundierung für die Arbeit mit Drosophila Zellkulturen durch die grundlegende Information über die verschiedenen Linien, best Practices und audiovisuellen Protokolle für die grundlegende Bedienung des Drosophila -Zell-Linien. Diese zugängliche Ressource soll, die Einführung in das Arbeiten mit kultivierten Zellen Drosophila reibungslos zu erleichtern und bestehende Trainingsanleitungen auf jedem Forschungslabor zu ergänzen.
The authors have nothing to disclose.
Wir danken dem National Institutes of Health (NIH-P40OD010949 Award) und der Forschungsgemeinschaft für Resourcen der verschiedenen D. Melanogaster DNA/Vektor/Zelle bei der DGRC kuratiert.
100 mm tissue culture plates | Corning | 430167 | Subculturing |
25 cm2 T-flask | Corning | 430168 | Subculturing |
35HC Liquid Nitrogen Storage Tank | Taylor-Wharton | 35HCB-11M | Cryopreservation |
Automated Cell counter | BIO-RAD | TC20 | Counting |
Bactopeptone | BD BioSciences | 211677 | Medium additions |
Counting Slides | BIO-RAD | 145-0011 | Counting |
Cryovial 1 mL | Greiner | 123263 | Cryopreservation |
DMSO | Sigma Aldrich | D5879 | Cryopreservation |
Freezing Box | Nalgene | 5029-0909 | Cryopreservation |
Freezing Container | Fisher Scientific | 15-350-50 | Cryopreservation |
Hematocytometer | Fisher Scientific | #0267110 | Counting |
Human Insulin | Millipore Sigma | I9278 | Medium additions |
Hyclone CCM3 media | GE Healthcare Life Sciences | SH30061.03 | Medium |
Hyclone Fetal Bovine Serum | GE Healthcare Life Sciences | SH30070.03 | Medium additions |
L-Glutamic acid potassium salt monohydrate | Millipore Sigma | G1149 | Medium additions |
L-Glutathione reduced | Millipore Sigma | G6013 | Medium additions |
Potassium Bicarbonate | Millipore Sigma | 237205 | Medium additions |
Select Yeast Extract | Millipore Sigma | Y1000 | Medium additions |
Shields and Sang's M3 Insect medium | Millipore Sigma | S8398 | Medium |
Trpsin-EDTA (0.05 %), phenol red | ThermoFisher Scientific | 25300054 | Subculturing |
Trypan Blue (0.4%) | BIO-RAD | 145-0013 | Counting |