Summary

Lipid-Index Bestimmung von flüssigen Fluoreszenz Erholung der pilzliche Erreger Ustilago Maydis

Published: April 03, 2018
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Summary

Hier beschreiben wir ein Protokoll, um der Lipid-Tröpfchen (LD Index) erreichen, um die Dynamik der Triacylglyzerole in Zellen im Hochdurchsatz-Experimente zu studieren. Die LD-Index-Assay ist eine einfache und zuverlässige Methode, die BODIPY 493/503 verwendet. Dieser Assay benötigt keine Dispendious Lipid-Extraktion oder Mikroskopie-Analyse.

Abstract

Der Artikel zeigt, wie die LD-Index-Assay, implementieren, die eine sensible Mikrotestplatte Assay zu bestimmen, die Anhäufung von Triacylglyzerole (TAGs) in Lipid-Tröpfchen (LDs) ist. LD-Index wird ohne Lipid-Extraktion gewonnen. Es ermöglicht die Messung des LDs-Inhalts im Hochdurchsatz-Experimente unter verschiedenen Bedingungen wie Wachstum im Reich oder Stickstoff aufgebraucht Medien. Wenn auch die Methode zum ersten Mal den Fettstoffwechsel von Tröpfchen in Saccharomyces Cerevisiae, studieren beschrieben wurde war es erfolgreich auf Basidiomycete Ustilago Maydisangewendet. Interessant ist, und weil LDs Zellorganellen in eukaryotischen Zellen phylogenetisch konserviert sind, kann die Methode auf eine Vielzahl von Zellen, von Hefe für Säugerzellen angewendet werden. Der LD-Index basiert auf der flüssigen Fluoreszenz Erholung Assay (LFR) von BODIPY 493/503 abschrecken Bedingungen durch die Zugabe von Zellen mit Formaldehyd. fixiert Kalium-Jod dient als ein Fluoreszenz-Durstlöscher. Das Verhältnis zwischen der Fluoreszenz und die optische Dichte Hänge ist LD Index benannt. Neigungen werden berechnet von den geraden Linien erreicht, wenn BODIPY Fluoreszenz und Extinktion bei 600 nm (OD600) werden gegen Probe zusätzlich dargestellt. Optimale Datenqualität spiegelt sich durch Korrelationskoeffizienten gleich oder über 0,9 (R ≥ 0,9). Mehrere Proben können gleichzeitig gelesen werden, wie es in einer Mikrotestplatte umgesetzt werden kann. Da BODIPY 493/503 eine lipophile Leuchtstoff färben die Partitionen in der Lipid-Tröpfchen ist, kann es in vielen Arten von Zellen verwendet werden, die Kirche Jesu Christi zu sammeln.

Introduction

Lipid-Tröpfchen (LDs) sind allgegenwärtige intrazellulären Fett Körper, bestehend aus einem Kern von neutralen Lipiden, vor allem TAGs und Sterol Ester (SE). Der Kern ist umgeben von einer Monoschicht von Phospholipiden, die mit Proteinen wie Perilipin und Enzyme beteiligt an der Synthese von neutralen Lipiden, wie Diacylglycerol Acyl-Transferase, Acetyl-CoA Carboxylase und Acyl-CoA-Synthase-1interagiert. Durch sein dynamisches Verhalten enthält die Phospholipid-Monolayer auch Triacylglycerol Lipasen, die TAGs und SE2Hydrolyseneigung. Je nach Zelltyp und Organismus gespeicherten neutralere Lipiden können verwendet werden, um Energie zu erzeugen, oder synthetisieren Phospholipide und Signalmoleküle. In Hefen und anderen Pilzen ändert den Inhalt des LDs in Reaktion auf eine sich ändernde Stickstoff/Kohlenstoff-Verhältnis in Kulturmedien, darauf hinweist, dass verminderte Stickstoffverfügbarkeit möglicherweise der Schlüssel zu neutral Lipid Produktion3,4 zu erhöhen ,5. Die Produktion von hohen Mengen von TAGs in der Hefe hat eine mögliche Verwendung in der Biotechnologie als Quelle von Biokraftstoffen und in der Lebensmittelindustrie. Einige gespeicherte Lipide enthalten hohe Anteile an mehrfach ungesättigten Fettsäuren wie Omega-3 und Omega-6, mit Ernährungs- und diätetische Bedeutung 6,7,8,9,10 , 11. LDs von Säugerzellen, einschließlich der menschlichen Zellen enthalten auch TAGs und Cholesterin-Ester. Die Phospholipid-Monolayer interagiert mit den Säugetieren homologe Proteine, die in der Hefe LDs beschrieben und mit einem zusätzlichen Protein, Perilipin, der abwesend ist in S. Cerevisiae12. Eine vorgeschlagene Rolle für die Phospholipid-Monolage und seiner damit verbundenen Proteine, die LDs-Struktur zu stabilisieren und damit die Interaktion von LDs mit Organellen als endoplasmatische Retikulum, Mitochondrien, Peroxisomen und Vakuolen, vor allem für Lipid Austausch ist 13,14. Interessanterweise scheinen beim Menschen, LDs Krankheiten wie Typ-2-Diabetes, Arteriosklerose, Steatohepatitis und koronare Herzkrankheit, in dem gibt es eine Zunahme der Zahl 15,16,17 beteiligt sein . Einige Arten von Viren nutzen LDs als Plattformen zusammenzubauen Virionen 2,18,19.

Aufgrund der Auswirkungen der lokalen Entwicklungsstrategie in menschliche Pathologien und deren biotechnologische Einsatzmöglichkeit ist die genaue experimentelle Bestimmung der LDs-Bildung eine wichtige Aufgabe. Dieser Artikel beschreibt eine zuverlässige Assays basierend auf die Erholung der Fluoreszenz (LFR) von BODIPY 493/503 (4, 4-Difluoro-1, 3, 5, 7, 8-Pentamethyl-4-Bora-3a, 4a-Diaza-s-Indacene), um einen relativen Wert des Inhalts der neutrale Lipide in den Zellen zu bekommen. Mit diesem Test ist es möglich, die Dynamik der Anhäufung von neutralen Lipiden in Pilzen wie U. Maydis und S. Cerevisiae, und auch in Säugetierzellen, ohne die Notwendigkeit von Lipid-Extraktion 20. folgen Die Methode angewendet wurde, zum ersten Mal in S. Cerevisiae zu identifizieren, die Protein-Phosphatasen und Kinasen beteiligt die Regulierung des Fettstoffwechsels. Dies war möglich ohne Lipid-Extraktion oder Protein Reinigung21,22. LFR wurde auch verwendet, um die Dynamik der LDs-Formation im peritonealen Makrophagen23zu etablieren. Die Verwendung von BODIPY 493/503 hat einige Vorteile gegenüber anderen neutral Lipid-Farbstoffe als Nil rot. BODIPY 493/503 ist hochspezifisch für neutrale Lipide und hat einen schmalen Emissionsspektrum erleichtern die simultane Detektion der Signale von Farbstoffen wie rot fluoreszierende Protein oder Mito-Tracker, wenn die Proben durch konfokale Mikroskopie analysiert werden. Leider BODIPY 493/503 ist empfindlich gegenüber Immunofluoreszenz, aber dieser Prozess kann mithilfe einer antiquenching Reagenz während der Exposition gegenüber Licht24vermieden werden.

Zur Durchführung der LFR Assay in Hefezellen, sie sind unter den gewünschten Ernährungs-Bedingungen kultiviert und Aliquote sind zu unterschiedlichen Zeitpunkten zurückgezogen. Als nächstes werden Zellen mit Formaldehyd, fixiert, die die Integrität des LDs monatelang bewahrt wenn Zellen bei 4 ° c gelagert werden Ndere Fixierung sollte vermieden werden, vor allem diejenigen, die mit Methanol oder kaltem Aceton, da sie zum Abbau der LDs innerhalb der Zellen24führen. Um den LD-Index zu messen, sind Formaldehyd-feste Zellen im Wasser zu einer definierten Konzentration ausgesetzt. Dann werden sie zu einer Lösung mit der Fluorophor BODIPY 493/503 abgeschreckt durch KI hinzugefügt, und wenn der Fluorophor die Zelle betritt und die LDs ordnet, gibt es eine Erholung der seine Fluoreszenz. Begleitende der Fluoreszenz-Messung (485 nm/510 nm), die Konzentration der Zellen wird quantifiziert durch die Messung der optischen Dichte bei 600 nm. Jede Probe wird viermal gelesen, indem nachfolgende 5 µL Aliquots Formaldehyd fixiert Zellsuspension zu gleich gut. Rohlinge von Fluoreszenz und Absorption sind vor der Zugabe von Zellen erworben. Die Qualität der Fluoreszenz und die Extinktion-Daten werden durch die Bestimmung der Linearität der Messungen ausgewertet: Wenn R < 0.9, Daten werden verworfen. Der R-Wert ist wichtig, weil im Grunde die Intensität der Fluoreszenz eine lineare Reaktion auf steigenden Zelle Konzentrationen produzieren sollte. Wenn die Zellkonzentration zu hoch ist, ist die Linearität verloren. Der LFR-Test bietet eine schnelle, einfache und wirtschaftliche Methode, um wählen die gewünschte LD-Phänotyp im Hochdurchsatz-Experimente. Nach der Auswahl der gewünschten Bedingungen, kann der LD-Inhalt der einzelnen Zellen durch konfokale Mikroskopie, Verwendung der gleichen Formaldehyd-feste Zellen befleckt mit BODIPY, bietet ein Bild von der Kirche Jesu Christi in der Zelle untersucht werden. Ihre TAGs und SE Inhalte können jetzt weiter durch Dünnschichtchromatographie analysiert werden.

Protocol

1. Vorbereitung der Puffer und Lösungen Zur Vorbereitung von 1 L Phosphat gepufferte Kochsalzlösung (PBS, pH 7), 8 g NaCl, 0,2 g KCl, 1,44 g Na2HPO4, 0,24 g KH2PO4 in 800 mL distillated Wasser auflösen. Stellen Sie den pH-Wert auf 7,0 mit HCl, und fügen Sie Wasser für ein Endvolumen von 1 L. PBS als ein 10 x-Stammlösung und bei Raumtemperatur gelagert werden kann. Fügen Sie 1 mL 37 % Formaldehyd um 10 mL der Lösung Befestigung vorzubereiten hinzu, 9 …

Representative Results

LFR, mit BODIPY 493/503 als fluoreszierende Sonde ist eine zuverlässige und einfache Methode, der dynamische Ansammlung von LDs in U. Maydis, unabhängig davon die Wachstumsbedingungen zu studieren. Wenn Zellen in YPD-Medium kultiviert wurden, gab es eine Zunahme der LD-Index in der exponentiellen Phase, gefolgt von einem Rückgang in der stationären Phase (Abbildung 2A). Im Gegensatz dazu gab es in den Zellen unter Stickstoff Hunger gewachsen, ein…

Discussion

LFR ist eine neuartige Methode, die angewendet wurde, zum ersten Mal um den Fettstoffwechsel in S. Cerevisiae und später zu studieren, es erfolgreich war, umgesetzt U. Maydis20,21. Obwohl der LD-Index keinen absoluten Wert der Variablen in Zellen angesammelt geben, freuen Sie sich auf einen schnellen Überblick der Lipidgehalt der Zellen und die Interpretation der Daten ist einfach, wenn LD Index von zwei oder mehr experimentellen Bedingungen v…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Diese Arbeit wurde unterstützt durch Zuschüsse des Instituto Politécnico Nacional-Secretaria de Investigación y Posgrado (IPN-SIP-20170864), Programa de Apoyo ein Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT IN222117)-Universidad Nacional Autónoma de México () UNAM) und Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT 254904-JPP und 256520-GGS). Fundação de Amparo eine Pesquisa Rio De Janeiro (FAPERJ-Cientistas Nosso Estado: E 26/103.353/2011). Wir dank QFB. Oscar Iván Luqueño Bocardo für die schematische Übersicht. Wir danken Dr. Miguel Tapia Rodríguez für die wertvolle Hilfe in der konfokalen Mikroskopie von LDs. Wir möchten danken Dr. Bruno Bozaquel Morais für seine Pionierarbeit bei der Entwicklung der Technik in S. Cerevisiae , die wir für U. Maydisangepasst.

Materials

Spectrophotometer Varioskan Lux multimode microplate reade D5879 Filter 493/503 or monochromator detector
Plate costar Corning Inc. 3615 96 well black-wall/clear bottom
Plate costar  Corning Inc 3598 96 well cell culture plate costar
BODIPY 493/503 Invitrogen/ Thermofisher D3922 4,4-difluoro-1,3,5,7,8-pentamethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene
Formaldehyde solution Sigma Aldrich 252549 ACS reagent, 37 wt % in H2O, contains 10-15% methanol to prevent polymerization
Potassium iodide Sigma Aldrich 60399 BioUltra, ≥ 99.5% (AT)
FB2 Ustilago maydis ATCC 201384 Basidiomycete-Yeast
Sodium chloride Sigma Aldrich 746398 ACS reagent, inorganic salt
Potassium phosphate monobasic Sigma Aldrich P0662 ACS reagent
Select Yeast Extract Sigma Aldrich Y100 Mixture of amini acids, peptides, water- soluble, vitamins and carbohydrates for culture media
N-Z case plus Sigma aldrich N4642 Casein enzymatic hydrolyzate from bovine milk
Glucose Sigma Aldrich G-8270 D (+) glucose
Skaker flask Pirex CLS4450250-6EA Borosiicate glass
Shaker SEV México INO650V-7 Orbital shaker
Centrifuge table Eppendorf 5415C Centrifuge
Microtubes Sigma Aldrich Z606340 Eppendorf
Pipet tips Axygen scientific T-200-Y Universal Pipet Tips with Bevelled End, 200 microliter, non sterile
mLine pipette Biohit 725130 8 channels, volume range 5-100 uL

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Romero-Aguilar, L., Montero-Lomeli, M., Pardo, J. P., Guerra- Sánchez, G. Lipid Index Determination by Liquid Fluorescence Recovery in the Fungal Pathogen Ustilago Maydis. J. Vis. Exp. (134), e57279, doi:10.3791/57279 (2018).

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