Este protocolo describe una técnica que se utiliza para modelar la infección del virus Zika del cerebro humano en desarrollo. Wildtype o líneas de células madre diseñadas, los investigadores pueden utilizar esta técnica para descubrir los diferentes mecanismos o tratamientos que puedan afectar principios infección cerebral y microcefalia resultante en embriones infectados por el virus Zika.
La reciente aparición del virus Zika (ZIKV) en poblaciones susceptibles ha llevado a un aumento abrupto de microcefalia y otras afecciones del neurodesarrollo en recién nacidos. Mientras que los mosquitos son la principal vía de transmisión viral, también se ha demostrado a través de contacto sexual y transmisión vertical de madre a feto. En este último caso de transmisión, por el tropismo viral único de ZIKV, el virus se cree que predominantemente objetivo las células progenitoras neurales (PNJ) del cerebro en desarrollo.
Aquí un método para modelar ZIKV infección y la microcefalia resultante, se producen cuando organitas cerebrales humanas están expuestos a vivir ZIKV se describe. Los organoides Mostrar altos niveles de virus dentro de su población de progenitoras neurales y presentan muerte celular severa y microcefalia en el tiempo. Este modelo de organoide cerebral tridimensional permite a los investigadores para llevar a cabo experimentos de especies comparable para observar e intervenir potencialmente con infección por ZIKV del cerebro humano en desarrollo. El modelo proporciona mayor relevancia a través de métodos estándar de dos dimensiones y contiene arquitectura celular específico de humanos y expresión de la proteína que no es posible en modelos animales.
Zika virus (ZIKV) rápidamente se ha extendido en Micronesia, Polinesia y América y recientemente se ha demostrado para cruzar la barrera placentaria1,2 para infectar el cerebro fetal en desarrollo, conduce a enfermedades del neurodesarrollo tales como microcefalia3,4,5,6 . El impacto a largo plazo en la vida de estos pacientes y la falta de tratamiento, ha llevado a los investigadores y los clínicos codificar para una mejor comprensión de los mecanismos detrás de ZIKV infección y replicación. Estudios previos han examinado la infección ZIKV de sistemas in vitro en una variedad de tipos de células fisiológicamente relevante7,8,9, así como en vivo10 con inmunocompetentes e immunocompromised ratones11,12,13 y primates no humanos14,15,16. Además de estas técnicas más convencionales, varios grupos han implementado organitas cerebral derivados de células madre para entender más sobre infección por ZIKV del cerebro humano en desarrollo. Estos grupos han utilizado humanos organitas cerebral para confirmar la microcefalia fenotipo17,18, receptores relacionados a virus entrada19de investigar, examinar respuestas fisiológicas a la infección20 , 21y potencialmente pantalla para candidatos de drogas22. Aquí se describe una técnica para producir rápidamente e infectando organitas cerebral derivado de células madre, como se mostró anteriormente19, para mejorar la comprensión de la infección por ZIKV del cerebro humano en desarrollo.
Puesto que los organoides se forman de culturas (PSC) de la célula de vástago de pluripotent estándar, esta técnica permite para una variedad de cuestiones científicas para ser contestadas con respecto a la infección viral del cerebro en desarrollo. Por ejemplo, ingeniería CRISPR puede usarse para modificar estas líneas PSC antes de organoide infección en un ritmo más rápido que la mayoría en vivo genética estudios19. Además, a diferencia de en dos culturas de diferenciación (2D) dimensional estándar, organitas exhiben la compleja arquitectura celular que es crítica para corticogenesis, y estudios recientes han demostrado que esta arquitectura puede interrumpirse con infección 21. Por último, el relativamente bajo costo de generar organitas permite mayor rendimiento experimentación y proyección en comparación con modelos en vivo . Por otra parte, hay algunas desventajas para la utilización de organoides estudiar ZIKV. Organoides son más biológicamente relevantes que culturas 2D, hay retos adicionales en la evaluación de los organoides debido a su naturaleza (3D) tridimensional. La proyección de imagen y disociación de los organoides tiende a involucrar a más equipos y una mayor inversión de recursos que en las culturas 2D estándar. Además, carecen de organoides la vasculatura y los componentes inmunológicos que están presentes en los modelos en vivo , así que los investigadores interesados en los aspectos de la infección viral se recomienda buscar un protocolo alternativo.
Hay una serie de técnicas para la formación de humanos organoides y neuroesferas en cultivo, y por lo general caen dentro de las categorías estampado o liso . Métodos de modelado implementan factores para regular la Wnt, BMP, TGFβ y otras vías de señalización para impulsar la diferenciación hacia linajes específicos23. Anula los métodos, como el descrito aquí, se aprovechan de la propensión de las células madre pluripotentes inducidas (iPSCs) y células de madre embrionarias humanas (hESCs) para diferenciar hacia un linaje neuroectodérmico por defecto24. Después de aproximadamente tres semanas de la diferenciación, los organoides que consisten en grandes, estructuras neuroepiteliales de biomiméticos que contienen varios tipos de células que se observan en el cerebro en desarrollo temprano.
La técnica para producir organoides de culturas PSC estándar, alimentador-libre y que infecta estos organoides con ZIKV se presenta en su totalidad. Para orientación sobre los métodos de cultivo necesario para alimentador-libre PSCs, consulte métodos anteriores publicaciones de25,26. Además, para aplicar cantidades constantes de virus para experimentos múltiples, es importante calcular el MOI antes de tiempo. Esto se hace mediante la realización de una infección de las células Vero, seguido por tratamiento con medio de recubrimiento, incubación y el immunostaining. Las descripciones y los métodos de esta técnica han sido previamente descritos19,27.
Una vez que la cultura PSC alcanza la confluencia de objetivo de 50-70%, las células son entonces disociadas y agregación en placas de 96 pocillos de fijación ultra baja. Las células son mantenidas durante 3 días en medios de mantenimiento de celulares gratis xeno (SCMM) y luego se convierte en un medio de inducción neural para el resto de la cultura. Una vez que se han diferenciado las organitas durante 3 semanas, la infección puede llevarse a cabo. Por rutina tomar imágenes durante la semana después de la infección, los investigadores observarán muerte celular progresiva y alteración de los organoides. Los investigadores también pueden disociar las organitas en este momento para llevar a cabo transcripcional o perfiles proteómicos. Métodos Cryosectioning y lightsheet se recomiendan para la proyección de imagen, y los investigadores pueden esperar altos niveles de infección y replicación viral particularmente dentro de las poblaciones progenitoras neurales (NPC) de la célula de los organoides. En definitiva, esta técnica permite a los investigadores examinar rápidamente los mecanismos de la infección viral del cerebro humano con equipo de bajo costo y limitada.
Hay varias advertencias a tener en cuenta cuando utilizando organoides cerebral humana para investigar infección por ZIKV. Una consideración importante es que la formación organoide y estructura es altamente dependiente en la línea de células madre de la cual se forman. Tenga cuidado al comparar entre las líneas celulares, incluyendo líneas isogénicas de ingeniería; es mejor sacar conclusiones utilizando varios subclones e idealmente múltiples líneas de células madre. Además debido a esta diferencia en las líneas celulares, se recomienda experiencias piloto para asegurar que la diferenciación apropiada está ocurriendo en el organitas. Mientras que las estructuras neuroepiteliales son visibles por microscopía brightfield, también se sugiere llevar a cabo experimentos de qRT-PCR o cryosectioning a buscar marcadores de diferenciación neural como PAX6 o fosfo-vimentin.
Uno debe anticipar también una variabilidad considerable entre los organoides en la misma línea celular. Debido a lo liso del Protocolo, el número y tamaño de estructuras neuroepiteliales pueden variar entre los organoides. Por lo general, uno puede esperar al menos dos grandes (> 200 μm de diámetro por D24) neuronales rosetas por organoide. Por esta razón, estudios longitudinales, tales como la observación de cambio de tamaño de organoide sobre infección, son particularmente iluminadoras. Variabilidad entre lotes puede también ocurrir, con la causa más probable para esto ser inexacta célula contando o siembra. Se recomienda llevar a cabo múltiples cuentas y para asegurarse de que la suspensión de células se mezcla bien antes de sembrar en las placas de fondo ULA U 96 pocillos.
Cuando cultivo organitas en placas de fondo ULA U 96 pocillos, plan en ver efectos de evaporación considerable alrededor de los bordes de las placas. Es ideal para rellenar estos pozos con PBS y trabajar solamente con los 60 pozos centro. Debido a la evaporación, organitas en pozos exteriores estarán expuestos a diferentes condiciones que en el centro, lo que probablemente afectará a su crecimiento y diferenciación. Por favor considere esto al planear el número de organoides que se necesitarán para los experimentos. Además, organitas comenzará a cubran el formato de 96 pozos después de aproximadamente 30 días, que será visibles por la decoloración del medio de cultivo. Si planea tomar el organitas más allá de los 30 días, se recomienda transferir el organitas a una placa de 24 pocillos ULA. Realizar a la transferencia, utilice tijeras para cortar una punta de P1000 para que la apertura es mucho mayor que los organoides propios, y transferir los organoides por pipeteo.
Organoides cerebrales humanos tienen gran potencial en el avance de la comprensión del campo de desarrollo neurológico y las enfermedades. Los investigadores se anima a modificar el protocolo según sea necesario. Por ejemplo, uno podría aplicar factores de diseño para mejorar la eficiencia de la diferenciación hacia tipos específicos de la célula, lo que les permite explorar el impacto viral en ciertas regiones anatómicas. Los efectos del desarrollo neurológico de ZIKV son todavía poco conocidos, pero este nuevo enfoque le dará a los investigadores una manera accesible, rápida y de alto rendimiento de investigar los mecanismos de infección.
The authors have nothing to disclose.
Los autores agradecen ayuda con propagación inicial y cuantificación de ZIKV Priscilla L. Yang y Dominique J. Burri de medicina de Harvard. También nos gustaría agradecer a Nathaniel D. Kirkpatrick de apoyo. K.E. fue apoyado por el centro de Stanley de investigación psiquiátrica y el Instituto Harvard de células madre.
Xeno-Free Stem Cell Maintenance Media (SCMM), TeSR-E8 | StemCell Technologies | 5940 | Use for stem cell maintenance and early stages of organoid formaiton. Store at 4 ᵒC for up to two weeks after prepared from individual components |
Enzyme-Free Detachment Reagent, ReLeSR | StemCell Technologies | 5873 | |
Enzymatic Detachment Reagent, Accutase | Gibco | A11105-01 | Store aliquoted at -20 ᵒC, do not keep thawed for longer than necessary |
Y-27632 | Selleck Chem | S1049 | Reconstitute to 50mM in DMSO, and keep at -20 ᵒC in 50µL aliquots. |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
Glutamate-supplemented DMEM/F12 (1X) | Gibco | 10565-018 | (+)2.438 g/L sodium bicarbonate, (+)sodium pyruvate |
N-2 Supplement (100X) | Gibco | 17502-048 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (MEM-NEAA) | Gibco | 11140-050 | |
Heparin | Sigma-Adrich | H4784-1G | Reconstitute to 2 mg/mL in sterile DI water and store at -20 ᵒC in 250µL aliquots |
Earle's Balanced Salt Solution (EBSS) | GE Healthcare Life Sciences | SH30029.02 | |
Stericup Filter (500mL) | Millipore | 220009-140 | |
Costar Ultra-Low Attachment Plate, 96-Well, Round Bottom | Corning | 7007 | |
Low Residual Volume Reagent Reservoir (25mL) | Integra | 4312 | |
Pipet-Lite Multi Pipette L12-200XLS+ | Rainin | 17013810 | |
Large Centrifuge, Culture Plate-Compatible | Thermo Scientific | 75007210 | |
Culture Plate Centrifuge Rotor | Thermo Scientific | 75005706 | |
Vero Cells | ATCC | CCL-81 | For virus expansion, if necessary |
Zika Virus (Uganda Strain) | ATCC | VR-1838 | Other strains may be used |
Zika Virus (Puerto Rico Strain) | ATCC | VR-1843 | Other strains may be used |
phospho-vimentin | MBL | D076-3 | mouse polyclonal, 1:250 dilution |
TBR2 | Abcam | ab23345 | rabbit polyclonal, 1:300 dilution |
MAP2 | Novus | NB300-213 | chicken polyclonal, 1:1500 dilution |
GFAP | Cell Signaling Technologies | CST12389S | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
D1-4G2 flavivirus envelope protein | EMD Millipore | MAB10216 | mouse monoclonal, 1:500 dilution |
cleaved caspase-3 | Cell Signaling Technologies | 9661 | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
488 anti-mouse IgG | Thermo Fisher | A-11001 | goat polyclonal, 1:1000 |
594 anti-rabbit IgG | Thermo Fisher | A-11037 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
647 anti-chicken IgY | Thermo Fisher | A-21449 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |