Dit protocol beschrijft een techniek gebruikt om te modelleren Zika virusinfectie van de ontwikkeling van de menselijke hersenen. Wildtype of gemanipuleerde stamcellijnen kunnen, onderzoekers gebruiken deze techniek te ontdekken van de verschillende mechanismen of behandelingen die vroege infectie van de hersenen en de resulterende microcefalie in Zika virus-geïnfecteerde embryo’s kunnen beïnvloeden.
De recente opkomst van Zika-virus (ZIKV) in gevoelig populaties heeft geleid tot een plotselinge toename microcefalie en andere neurologische aandoeningen bij pasgeboren zuigelingen. Terwijl muggen de hoofdroute van virale transmissie zijn, is het ook aangetoond te verspreiden via seksueel contact en verticale overdracht van moeder naar foetus. In dit laatste geval van overdracht, als gevolg van de unieke virale tropisme van ZIKV, wordt het virus verondersteld om overwegend doel de neurale voorlopercellen (NPC) van de ontwikkelende hersenen.
Hier een methode voor het modelleren van ZIKV infectie, en de resulterende microcefalie, die optreden wanneer menselijke cerebrale organoids worden blootgesteld om te leven van de ZIKV wordt beschreven. De organoids hoge niveaus van virus binnen hun bevolking neurale voorlopercellen weergeven, en ernstige celdood en microcefalie vertonen na verloop van tijd. Dit drie-dimensionale cerebrale organoid model kunnen onderzoekers uit te voeren soorten-matched experimenten om te observeren en potentieel grijpen met ZIKV infectie van de ontwikkeling van de menselijke hersenen. Het model biedt betere relevantie ten opzichte van twee-dimensionale standaardmethoden, en bevat mens-specifieke cellulaire architectuur en eiwit expressie die niet mogelijk in diermodellen.
Zika virus (ZIKV) heeft snel verspreid in Micronesia, Frans-Polynesië, en Amerika, en heeft onlangs aangetoond dat de placenta1,2 te infecteren de ontwikkelende foetale hersenen, leiden tot neurologische aandoeningen, die cross Als microcefalie3,4,5,6 . Het langetermijneffect op deze patiënten leven, en het huidige gebrek aan behandeling, heeft geleid onderzoekers en clinici om een beter inzicht te verschaffen in de mechanismen achter ZIKV infectie en replicatie onleesbaar te maken. Eerdere studies hebben onderzocht ZIKV infectie van in vitro -systemen in een verscheidenheid van fysiologisch relevante cel typen,7,,8,9, evenals in vivo10 met immunocompetent en immuungecompromitteerde muizen11,12,13 en15,16van de14,van de niet-menselijke primaten. Naast deze meer conventionele technieken, hebben verscheidene groepen uitgevoerd stamcel afkomstige cerebrale organoids om te begrijpen meer over ZIKV infectie van de ontwikkeling van de menselijke hersenen. Deze groepen hebben menselijke cerebrale organoids te bevestigen de microcefalie fenotype17,18, onderzoeken van receptoren gekoppeld aan virus post19, onderzoeken van fysiologische reacties op infectie20 gebruikt , 21, en potentieel scherm voor drug kandidaten22. Hier is een techniek voor het snel produceren en infecteren-cel van de stam afgeleid cerebrale organoids beschreven, zoals eerder19, ter verbetering van het inzicht van ZIKV infectie van de ontwikkeling van de menselijke hersenen.
Aangezien de organoids zijn gevormd uit standaard pluripotente stamcel (PSC) culturen, deze techniek maakt het mogelijk voor een aantal wetenschappelijke vragen worden beantwoord met betrekking tot virale infectie van de ontwikkelende hersenen. CRISPR engineering kan bijvoorbeeld worden gebruikt om te wijzigen deze PVC lijnen vóór organoid infectie in een sneller tempo dan de meeste in vivo genetische studies19. Bovendien, in tegenstelling tot in standaard twee dimensionale (2D) differentiatie culturen, organoids vertonen de complexe cellulaire architectuur die essentieel zijn voor corticogenesis, en recente studies hebben aangetoond dat deze architectuur kan worden verstoord na infectie 21. Ten slotte, de relatief lage kosten van het genereren van organoids staat voor hogere doorvoer experimenten en screening in vergelijking met in vivo modellen. Aan de andere kant, zijn er enkele nadelen aan het gebruik van organoids te bestuderen van de ZIKV. Terwijl organoids veel meer biologisch relevant dan 2D culturen zijn, zijn er extra uitdagingen in de beoordeling van organoids vanwege hun driedimensionale (3D) aard. Beeldvorming en dissociatie van organoids heeft de neiging om meer apparatuur en een grotere investering van middelen dan in standaard 2D culturen te betrekken. Bovendien ontbreekt organoids aan de therapieën en immunologische onderdelen die aanwezig in in-vivo modellen, zijn zodat onderzoekers geïnteresseerd in die aspecten van virale infectie worden geadviseerd om een alternatieve protocol.
Er zijn een aantal technieken voor de vorming van menselijk organoids en neurospheres in cultuur, en ze meestal vallen binnen de categorie met patroon of unpatterned . Gedessineerde methoden implementeren factoren voor het regelen van de Wnt, BMP, TGFβ en andere signaalroutes differentiatie naar specifieke lineages23duwen. Unpatterned methoden, zoals hier beschreven, die profiteren van de neiging tot geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSCs) en menselijke embryonale stamcellen (hESCs) om te differentiëren naar een neuroectodermal afstamming door standaard24. Na ongeveer drie weken van differentiatie bestaat de resulterende organoids uit grote, biomimetische neuroepithelial structuren die verschillende celtypes die worden waargenomen in de vroege ontwikkelende hersenen bevatten.
De techniek voor het produceren van organoids uit standaard, feeder-free PVC culturen, en infecteren van deze organoids met ZIKV wordt volledig gepresenteerd. Raadpleeg voor meer informatie over het kweken methoden die nodig zijn voor de feeder-vrije PSC’s, vorige methoden publicaties25,26. Bovendien, om toe te passen consistent hoeveelheid virus voor meerdere experimenten, is het belangrijk om te berekenen van de MOI tevoren. Dit wordt gedaan door het uitvoeren van een infectie van Vero-cellen, gevolgd door behandeling met overlay medium, incubatie en immunokleuring. Beschrijvingen en methoden van deze techniek al eerder beschreven19,27.
Zodra de PSC cultuur bereikt de samenvloeiing van de doelstelling van 50% – 70%, zijn de cellen vervolgens losgekoppeld en samengevoegd in ultra-lage bijlage 96-wells-platen. De cellen worden gehandhaafd voor 3 dagen in de cel van de stam van de xeno-gratis onderhoud media (PCMZ), en vervolgens geconverteerd naar een neurale inductie media voor de rest van de cultuur. Zodra de organoids hebben gedifferentieerd voor 3 weken, kan de infectie worden uitgevoerd. Door regelmatig opnamen tijdens de week na infectie, ziet de onderzoekers progressieve celdood en verstoring van de organoid. Onderzoekers kunnen ook distantiëren van de organoids bij deze tijd om te voeren transcriptionele of proteomic profilering. Cryosectioning en lightsheet methoden worden aanbevolen voor beeldvorming, en onderzoekers kunnen verwachten om te zien van hoge niveaus van infecties en virale replicatie met name binnen de neurale progenitor cel (NPC) populaties in de organoids. Uiteindelijk, deze techniek kan onderzoekers te snel onderzoeken de mechanismen van virale infectie van de hersenen met lage kosten en beperkte apparatuur.
Er zijn verschillende valkuilen om te overwegen wanneer met behulp van menselijke cerebrale organoids te onderzoeken ZIKV infectie. Een belangrijke overweging is dat organoid-formatie en structuur is sterk afhankelijk van de lijn van de cel van de stam waaruit ze zijn ontstaan. Wees voorzichtig bij het vergelijken tussen cellijnen, met inbegrip van isogene aangelegde lijnen; het is het beste te maken van de conclusies met behulp van meerdere subklonen, en een ideale meerdere stamcellijnen. Bovendien is als gevolg van dit verschil in cellijnen, proefprojecten om ervoor te zorgen dat de juiste differentiatie in de organoids plaatsvindt aanbevolen. Terwijl de neuroepithelial structuren door helderveld microscopie zichtbaar zijn, is er ook gesuggereerd om uit te voeren van de experimenten van de qRT-PCR of cryosectioning om te zoeken naar Neurale differentiatie markeringen zoals PAX6 of phospho-vimentin.
Men moet ook anticiperen op aanzienlijke variabiliteit tussen organoids binnen dezelfde cellijn. Vanwege de unpatterned aard van het protocol, kunnen het aantal en de grootte van de structuren van de neuroepithelial variëren tussen individuele organoids. Meestal kan men verwachten ten minste twee grote (> 200 µm in diameter door D24) neurale rozetten per organoid. Om deze reden zijn longitudinale studies, zoals de waarneming van de verandering in organoid grootte na infectie, bijzonder verhelderend. Variabiliteit tussen de partijen kan zich ook voordoen, met de meest waarschijnlijke oorzaak hiervoor wordt onjuist cel tellen of zaaien. Het wordt aangeraden om veelvoudige tellingen en om ervoor te zorgen dat de celsuspensie is goed gemengd vóór het zaaien op de ULA U beneden 96-wells-platen.
Wanneer kweken organoids in ULA U beneden 96-wells-platen, plan bij het zien van aanzienlijke verdamping effecten rond de randen van de platen. Het is ideaal om deze putjes vullen met PBS en werken alleen met de center 60 putten. Als gevolg van de verdamping, zal organoids in de buitenste wells worden blootgesteld aan verschillende voorwaarden toe dan die in het midden, die waarschijnlijk gevolgen voor hun groei en differentiatie hebben zal. Kunt u dit te overwegen bij het plannen van het aantal organoids die nodig zullen zijn voor experimenten. Bovendien zal organoids beginnen te overwoekeren de 96-Wells-indeling na ongeveer 30 dagen, die zichtbaar als gevolg van de verkleuring van het kweekmedium worden zal. Als plan nemen de organoids voorbij de 30 dagen, is het aanbevolen om de organoids overbrengen in een ULA 24-well plaat. Voeren van de overdracht, gebruik van schaar te snijden een P1000 tip zodat de opening veel groter dan de organoids zelf is en de organoids door pipetteren overbrengen.
Menselijke cerebrale organoids houdt groot potentieel in het bevorderen van het veld begrip van neurologische en ziekte. Onderzoekers worden aangemoedigd om het protocol zo nodig wijzigen. Bijvoorbeeld, kon één implementeren patronen factoren ter verbetering van de efficiëntie van de differentiatie naar specifieke celtypes, waardoor ze de virale effecten op bepaalde anatomische gebieden verkennen. De neurologische effecten van ZIKV zijn nog slecht begrepen, maar deze nieuwe aanpak zal plaatsmaken onderzoekers een toegankelijk, snelle en hoge-doorvoer van onderzoek naar de mechanismen van de infectie.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs bedanken Priscilla L. Yang en Dominique J. Burri van Harvard Medical School voor hulp bij eerste vermeerdering en kwantificering van ZIKV. Wij ook bedank Nathaniel D. Kirkpatrick voor imaging steun. K.E. werd gesteund door het Stanley centrum voor psychiatrische onderzoek en de Harvard stamcel instituut.
Xeno-Free Stem Cell Maintenance Media (SCMM), TeSR-E8 | StemCell Technologies | 5940 | Use for stem cell maintenance and early stages of organoid formaiton. Store at 4 ᵒC for up to two weeks after prepared from individual components |
Enzyme-Free Detachment Reagent, ReLeSR | StemCell Technologies | 5873 | |
Enzymatic Detachment Reagent, Accutase | Gibco | A11105-01 | Store aliquoted at -20 ᵒC, do not keep thawed for longer than necessary |
Y-27632 | Selleck Chem | S1049 | Reconstitute to 50mM in DMSO, and keep at -20 ᵒC in 50µL aliquots. |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
Glutamate-supplemented DMEM/F12 (1X) | Gibco | 10565-018 | (+)2.438 g/L sodium bicarbonate, (+)sodium pyruvate |
N-2 Supplement (100X) | Gibco | 17502-048 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (MEM-NEAA) | Gibco | 11140-050 | |
Heparin | Sigma-Adrich | H4784-1G | Reconstitute to 2 mg/mL in sterile DI water and store at -20 ᵒC in 250µL aliquots |
Earle's Balanced Salt Solution (EBSS) | GE Healthcare Life Sciences | SH30029.02 | |
Stericup Filter (500mL) | Millipore | 220009-140 | |
Costar Ultra-Low Attachment Plate, 96-Well, Round Bottom | Corning | 7007 | |
Low Residual Volume Reagent Reservoir (25mL) | Integra | 4312 | |
Pipet-Lite Multi Pipette L12-200XLS+ | Rainin | 17013810 | |
Large Centrifuge, Culture Plate-Compatible | Thermo Scientific | 75007210 | |
Culture Plate Centrifuge Rotor | Thermo Scientific | 75005706 | |
Vero Cells | ATCC | CCL-81 | For virus expansion, if necessary |
Zika Virus (Uganda Strain) | ATCC | VR-1838 | Other strains may be used |
Zika Virus (Puerto Rico Strain) | ATCC | VR-1843 | Other strains may be used |
phospho-vimentin | MBL | D076-3 | mouse polyclonal, 1:250 dilution |
TBR2 | Abcam | ab23345 | rabbit polyclonal, 1:300 dilution |
MAP2 | Novus | NB300-213 | chicken polyclonal, 1:1500 dilution |
GFAP | Cell Signaling Technologies | CST12389S | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
D1-4G2 flavivirus envelope protein | EMD Millipore | MAB10216 | mouse monoclonal, 1:500 dilution |
cleaved caspase-3 | Cell Signaling Technologies | 9661 | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
488 anti-mouse IgG | Thermo Fisher | A-11001 | goat polyclonal, 1:1000 |
594 anti-rabbit IgG | Thermo Fisher | A-11037 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
647 anti-chicken IgY | Thermo Fisher | A-21449 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |