Этот протокол описывает метод, используемый для моделирования Зика вирусной инфекции развивающегося человеческого мозга. С помощью wildtype или инженерных стволовых клеточных линий, исследователи могут использовать эту технику для раскрыть различные механизмы или процедуры, которые могут повлиять на ранней инфекции головного мозга и полученный микроцефалия Зика вирусом эмбрионов.
Недавнее появление Зика вируса (ZIKV) в восприимчивых групп населения привело к резкое увеличение микроцефалия и других условий психомоторного развития у новорожденных. Хотя комаров являются основные пути передачи вируса, оно также было показано для распространения через половой контакт и вертикальной передачи матери и плода. В этом последнем случае передачи, благодаря уникальной вирусный тропизм ZIKV вирус считается преимущественно целевой нейронных прогениторных клеток (НПС) развивающегося мозга.
Здесь метод для моделирования ZIKV инфекции и результирующая микроцефалия, которые возникают, когда человеческого мозга organoids подвергаются жить ZIKV описано. Organoids отображения высокий уровень вируса в пределах их нейронных прародитель населения и тяжелой клеточной смерти и микроцефалия с течением времени. Эта модель трехмерной мозгового органоид позволяет исследователям проводить эксперименты, подобранных видов, наблюдать и потенциально вмешаться с ZIKV инфекцией развивающегося человеческого мозга. Модель обеспечивает улучшение релевантности над стандартной двумерной методами и содержит специфичные для человека сотовой архитектуры и выражение протеина, не возможны в животных моделях.
Зика вирус (ZIKV) быстро распространился в Микронезии, Французская Полинезия и Америки и недавно было показано, чтобы пересечь плацентарный барьер1,2 , чтобы заразить развивающегося мозга плода, приводит к заболеваниям нервной такого микроцефалия3,4,5,6 . Долгосрочное воздействие на жизнь этих пациентов и отсутствие лечения, в настоящее время привела исследователей и клиницистов карабкаться для лучшего понимания механизмов за ZIKV инфекции и репликации. Предыдущие исследования изучили ZIKV инфекции в vitro систем в различных физиологически соответствующие ячейки типов,78,9, а также в естественных условиях10 с иммунокомпетентных и ослабленным мышей11,12,13 и нечеловеческих приматов14,,1516. Помимо этих более традиционные методы несколько групп осуществили стволовых клеток мозга organoids понять больше о ZIKV инфекции развивающегося человеческого мозга. Эти группы использовали человеческого мозга organoids для подтверждения микроцефалия фенотип17,18, расследовать рецепторы, связанные с вирусом запись19, изучать физиологические реакции на инфекции20 , 21и, возможно, экран для наркотиков кандидатов22. Здесь описана методика для быстрого производства и заражение мозга organoids стволовых клеток, полученных, как показано ранее19, чтобы улучшить понимание ZIKV инфекции развивающегося человеческого мозга.
Так как organoids формируются из стандартных плюрипотентных стволовых клеток (PSC) культур, эта техника позволяет для различных научных вопросов ответы относительно вирусной инфекции развивающегося мозга. Например ТРИФОСФАТЫ инженерия может использоваться для изменения эти PSC линии до органоид инфекции более быстрыми темпами, чем большинство в vivo генетических исследований19. Кроме того в отличие от стандартных двух размеров (2D) дифференциация культур, organoids экспонат комплекса сотовой архитектуры, которая имеет решающее значение для corticogenesis, и недавние исследования показали, что эта архитектура может быть нарушена при инфекции 21. Наконец относительно низкая стоимость генерации organoids позволяет выше пропускная способность экспериментов и скрининга по сравнению с моделями в естественных условиях . С другой стороны есть некоторые недостатки использования organoids учиться ZIKV. В то время как organoids биологически гораздо более актуальными, чем 2D культур, есть дополнительные проблемы в оценке organoids ввиду их трехмерные (3D). Изображений и диссоциации organoids стремится привлекать больше оборудования и больших инвестиционных ресурсов, чем стандартные 2D культур. Кроме того organoids отсутствие сосудистую и иммунологические компонентов, которые присутствуют в естественных условиях модели, поэтому исследователей, заинтересованных в те аспекты вирусной инфекции рекомендуется искать альтернативный протокол.
Существует ряд методов для формирования человека organoids и neurospheres в культуре, и они обычно подпадают под рисунком или неупорядоченный категории. Узорные методы реализуют факторы регулирования Wnt, BMP, TGFβ и других сигнальных путей, добиваться дифференциации сторону конкретных линий23. Неупорядоченный такие методы, как один описаны здесь, воспользуйтесь склонность к индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (iPSCs) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ЭСК) дифференцировать сторону нейроэктодермальная линии по умолчанию24. После примерно трех недель дифференциации результирующий organoids состоят из больших, biomimetic нейроэпителиальных структур, которые содержат несколько типов клеток, которые наблюдаются в начале развивающегося мозга.
Техника для производства organoids от стандартных, фидер бесплатно PSC культур и заражение этим organoids с ZIKV представлена в полном объеме. Руководство по культивирования методы, необходимые для подачи Бесплатный уик обратитесь к предыдущим методы публикации25,26. Кроме того для того, чтобы применить последовательное количество вируса для нескольких экспериментов, важно рассчитать MOI впереди времени. Это делается путем проведения инфекцию клеток Веро, следуют обращения с среднего оверлея, инкубации и иммуноокрашивания. Описания и методов этой техники были ранее описанных19,27.
PSC культуры при достижении целевого объекта слияния 50-70%, клетки затем отделить и агрегированы в ультра-низким насадку 96-луночных пластины. Клетки для 3 дней в средствах массовой информации содержание xeno бесплатно стволовых клеток (ПКВВ) и затем преобразуется в нейронной индукции СМИ на оставшуюся часть культуры. Как только organoids имеют дифференцированные за 3 недели, инфекция может проводиться. Регулярно принимая изображения в течение недели после инфицирования, исследователи будут соблюдать прогрессивного клеточной смерти и нарушение органоид. Исследователи также может отделить organoids в это время проводить транскрипционный анализ или proteomic профилирования. Методы Cryosectioning и lightsheet рекомендуются для обработки изображений, и исследователи могут ожидать высокий уровень инфекции и вирусной репликации, особенно в пределах нейронных прогениторных клеток (NPC) населения в organoids. В конечном счете эта техника позволяет исследователям быстро изучить механизмы вирусной инфекции мозга человека с низкой стоимостью и ограниченным оборудования.
Есть несколько моментов, нужно учитывать при использовании человеческого мозга organoids расследовать ZIKV инфекции. Одно из важных соображений является что органоид формирование и структура сильно зависит от линии стволовых клеток, из которых они формируются. Соблюдайте осторожность при сравнении между клеточных линий, включая isogenic инженерных линий; Это лучше сделать выводы, используя несколько subclones и в идеале несколько линий стволовых клеток. Кроме того благодаря этой разнице в клеточных линий, рекомендуется экспериментальные опыты для обеспечения надлежащего разграничения происходит в organoids. В то время как нейроэпителиальных структуры видны brightfield микроскопии, предлагается также проводить эксперименты qRT ПЦР или cryosectioning искать нейронных дифференциация маркеры например PAX6 или фосфо виментин.
Следует также ожидать значительной изменчивости среди organoids в пределах одной и той же линии клеток. Из-за неупорядоченный характер протокола количество и размер нейроэпителиальных структур может варьироваться между отдельными organoids. Как правило, можно ожидать по крайней мере две большие (> 200 мкм в диаметре D24) Нейронные розетки за органоид. По этой причине продольного исследования, например, наблюдение изменений в размер органоид после инфекции, особенно поучительный. Изменчивость между партиями возможны также, с наиболее вероятной причиной для этого неточной клеток подсчета или посев. Рекомендуется проводить несколько графов и убедиться, что суспензию клеток хорошо перемешивается перед посевом на ULA U-дно 96-луночных пластин.
При культивировании organoids в ULA U-дно 96-луночных пластины, план увидев последствия значительного испарения по краям пластин. Это идеальное место для заполнения этих скважин с PBS и работать только с 60 скважин центр. Из-за испарения organoids в наружной скважин будет подвергаться воздействию различных условиях, чем те, в центре, который скорее всего будет влиять на их рост и дифференцировку. Пожалуйста, учитывайте это при планировании количество organoids, которые будут необходимы для экспериментов. Кроме того organoids начнет зарастают 96-луночных формат после примерно 30 дней, которые будут видны благодаря окраске питательной среды. Если планируете принимая organoids за последние 30 дней, рекомендуется передать organoids пластины 24-ну Ула. Для осуществления перевода, используйте ножницы, чтобы вырезать кончик P1000, так что открытие гораздо больше, чем organoids сами и передача organoids закупорить.
Человеческого мозга organoids держать большой потенциал в развитии понимания области нейроразвития и болезней. Исследователи, предлагается изменить протокол при необходимости. Например один может реализовать патронирования факторы повышения эффективности дифференциация к типы конкретных клеток, позволяя им исследовать вирусных воздействия на определенных анатомических областей. Эффекты нервной ZIKV все еще плохо поняты, но этот новый подход даст исследователи доступным, быстрый и высок объём способ изучения механизмов инфекции.
The authors have nothing to disclose.
Авторы благодарят за помощь с первоначального распространения и количественной оценки ZIKV Ян л Присцилла и Доминик J. Бурри из Гарвардской медицинской школы. Мы также хотели бы поблагодарить Натаниэль D. Киркпатрик для поддержки визуализации. К.е. поддержали центр Стэнли психиатрических исследований и Гарвардского института стволовых клеток.
Xeno-Free Stem Cell Maintenance Media (SCMM), TeSR-E8 | StemCell Technologies | 5940 | Use for stem cell maintenance and early stages of organoid formaiton. Store at 4 ᵒC for up to two weeks after prepared from individual components |
Enzyme-Free Detachment Reagent, ReLeSR | StemCell Technologies | 5873 | |
Enzymatic Detachment Reagent, Accutase | Gibco | A11105-01 | Store aliquoted at -20 ᵒC, do not keep thawed for longer than necessary |
Y-27632 | Selleck Chem | S1049 | Reconstitute to 50mM in DMSO, and keep at -20 ᵒC in 50µL aliquots. |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
Glutamate-supplemented DMEM/F12 (1X) | Gibco | 10565-018 | (+)2.438 g/L sodium bicarbonate, (+)sodium pyruvate |
N-2 Supplement (100X) | Gibco | 17502-048 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (MEM-NEAA) | Gibco | 11140-050 | |
Heparin | Sigma-Adrich | H4784-1G | Reconstitute to 2 mg/mL in sterile DI water and store at -20 ᵒC in 250µL aliquots |
Earle's Balanced Salt Solution (EBSS) | GE Healthcare Life Sciences | SH30029.02 | |
Stericup Filter (500mL) | Millipore | 220009-140 | |
Costar Ultra-Low Attachment Plate, 96-Well, Round Bottom | Corning | 7007 | |
Low Residual Volume Reagent Reservoir (25mL) | Integra | 4312 | |
Pipet-Lite Multi Pipette L12-200XLS+ | Rainin | 17013810 | |
Large Centrifuge, Culture Plate-Compatible | Thermo Scientific | 75007210 | |
Culture Plate Centrifuge Rotor | Thermo Scientific | 75005706 | |
Vero Cells | ATCC | CCL-81 | For virus expansion, if necessary |
Zika Virus (Uganda Strain) | ATCC | VR-1838 | Other strains may be used |
Zika Virus (Puerto Rico Strain) | ATCC | VR-1843 | Other strains may be used |
phospho-vimentin | MBL | D076-3 | mouse polyclonal, 1:250 dilution |
TBR2 | Abcam | ab23345 | rabbit polyclonal, 1:300 dilution |
MAP2 | Novus | NB300-213 | chicken polyclonal, 1:1500 dilution |
GFAP | Cell Signaling Technologies | CST12389S | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
D1-4G2 flavivirus envelope protein | EMD Millipore | MAB10216 | mouse monoclonal, 1:500 dilution |
cleaved caspase-3 | Cell Signaling Technologies | 9661 | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
488 anti-mouse IgG | Thermo Fisher | A-11001 | goat polyclonal, 1:1000 |
594 anti-rabbit IgG | Thermo Fisher | A-11037 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
647 anti-chicken IgY | Thermo Fisher | A-21449 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |