Dieses Protokoll beschreibt eine Technik verwendet, um Zika-Virus-Infektion für die Entwicklung des menschlichen Gehirns zu modellieren. Mit Wildtyp oder veränderter Zelllinien, können Forscher diese Technik verwenden, um entdecken Sie die verschiedenen Mechanismen oder Behandlungen, die frühe Infektion des Gehirns und resultierende Mikrozephalie bei Zika Virus-infizierten Embryos beeinträchtigen können.
Die jüngste Entstehung der Zika-Virus (ZIKV) in gefährdeten Bevölkerungsgruppen führte zu einem abrupten Anstieg Mikrozephalie und andere Entwicklungsstörungen Bedingungen bei Neugeborenen. Während Mücken die Hauptroute der viralen Übertragung sind, hat sich auch gezeigt, über sexuellen Kontakt und vertikale Mutter-Fötus-Getriebe zu verbreiten. In diesem Fall der Übertragung, durch die einzigartige virale Tropismus von ZIKV wird das Virus überwiegend auf die neurale Vorläuferzellen (NPCs) für das sich entwickelnde Gehirn vermutet.
Hier auftreten eine Methode zur Modellierung von ZIKV Infektion und die daraus resultierende Mikrozephalie, wenn menschliche zerebrale Organellen ausgesetzt sind ZIKV Leben beschrieben wird. Die Organellen zeigen hohe Virus innerhalb ihrer neuronalen Vorläuferzellen Bevölkerung und weisen schwere Zelltod und Mikrozephalie im Laufe der Zeit. Dieses dreidimensionale zerebralen organoide Modell kann Forscher Experimente Arten abgestimmt zu beobachten und potenziell mit ZIKV Infektion der die Entwicklung des menschlichen Gehirns eingreifen. Das Modell bietet verbesserte Relevanz über zweidimensionale Standardmethoden und enthält Mensch-spezifische zelluläre Architektur und Protein-Expression in Tiermodellen nicht möglich sind.
Zika-Virus (ZIKV) schnell in Mikronesien, Französisch-Polynesien und Südamerika ausgebreitet hat, und vor kurzem wurde gezeigt, dass die Plazentaschranke1,2 , um das sich entwickelnde fetale Gehirn, führt zu solchen Neurodevelopmental Krankheiten infizieren überqueren als Mikrozephalie3,4,5,6 . Die langfristige Auswirkungen dieser Patienten leben und derzeit keine Behandlung, hat Forscher und Kliniker zu klettern, für ein besseres Verständnis der Mechanismen hinter ZIKV Infektion und Replikation geführt. Frühere Studien haben ZIKV Infektion von in-vitro- Systeme in einer Vielzahl von physiologisch relevanten Zelle Arten7,8,9, als auch in Vivo10 mit untersucht. immunkompetenten und immungeschwächte Mäuse11,12,13 und nicht-menschlichen Primaten14,15,16. Zusätzlich zu diesen eher konventionellen Techniken haben mehrere Gruppen zerebrale Organellen Stammzellen abgeleitet, um mehr über ZIKV Infektion der die Entwicklung des menschlichen Gehirns verstehen umgesetzt. Diese Gruppen wurden genutzt, menschlichen zerebrale Organellen zu bestätigen die Mikrozephalie Phänotyp17,18, Rezeptoren verbunden mit Virus Eintrag19untersuchen, prüfen, physiologische Reaktionen auf Infektion20 , 21, und potenziell Bildschirm für Medikamenten-Kandidaten-22. Hier ist eine Technik für schnell produzieren und infizieren Stammzellen abgeleitete zerebralen Organellen beschrieben, wie zuvor gezeigt19, zur Verbesserung des Verständnisses der ZIKV Infektion der die Entwicklung des menschlichen Gehirns.
Da die Organellen von standard pluripotenten Stammzellen (PSC) Kulturen ausgebildet sind, erlaubt diese Technik für eine Vielzahl von wissenschaftlichen Fragen bezüglich Virusinfektion das sich entwickelnde Gehirn beantwortet werden. Beispielsweise kann CRISPR-Technik verwendet werden, ändern diese PSC Zeilen vor der organoide Infektion mit einer schnelleren Rate als die meisten in Vivo genetische19Studien. Zusätzlich, im Gegensatz zu zeigen Organellen in standard zwei-dimensionale (2D) Differenzierung-Kulturen, die komplexen zelluläre Architektur, die für Kortikogenese von entscheidender Bedeutung ist, und neuere Studien haben gezeigt, dass diese Architektur auf Infektion gestört werden kann 21. Schließlich ermöglicht die relativ niedrigen Kosten der Erzeugung von Organellen für höheren Durchsatz Experimente und Screening im Vergleich zu in-Vivo -Modelle. Auf der anderen Seite gibt es einige Nachteile der Nutzung der Organellen, ZIKV zu studieren. Während Organellen als 2D Kulturen weit mehr biologisch relevant sind, gibt es zusätzliche Herausforderungen bei der Bewertung der Organellen aufgrund ihrer dreidimensionalen (3D). Bildgebung und Dissoziation der Organellen neigt dazu, mehr Ausrüstung und eine größere Investition von Ressourcen als in standard 2D Kulturen beteiligt. Darüber hinaus fehlen Organellen das Gefäßsystem und immunologischen Komponenten, die in in Vivo Modellen, so dass Forscher interessiert, jene Aspekte der viralen Infektion geraten sind, ein alternatives Protokoll zu suchen.
Es gibt eine Reihe von Techniken für die Bildung der menschlichen Organellen und Neurosphären in der Kultur, und sie fallen in der Regel in den Kategorien gemustert oder ungemustert . Gemusterte Methoden implementieren Faktoren zur Regulierung der Wnt, BMP TGFβ und andere Signalwege zur Differenzierung gegenüber bestimmten Linien23schieben. Ungemustert Methoden, wie Sie hier beschrieben wird, profitieren Sie von der Neigung zu induzierten pluripotenten Stammzellen (iPSCs) und humanen embryonaler Stammzellen (HES) in Richtung einer Neuroectodermal Linie von unterscheiden Standard24. Nach ca. drei Wochen der Differenzierung bestehen die daraus resultierende Organellen aus groß, biomimetische neuroepithelialer Strukturen, die mehrere Zelltypen enthalten, die in der frühen Entwicklung des Gehirns beobachtet werden.
Die Technik für die Herstellung von Organellen von standard, Feeder-freie PSC-Kulturen und infizieren diese Organellen mit ZIKV wird ausführlich vorgestellt. Leitlinien für die Kultivierung Methoden für Feeder-freie PSCs benötigt finden Sie in vorherigen Methoden Publikationen25,26. Darüber hinaus um konsistente Mengen des Virus für mehrere Experimente gelten, ist es wichtig, die MOI vor der Zeit zu berechnen. Dies geschieht durch die Durchführung einer Infektion von Vero-Zellen, gefolgt von der Behandlung mit Overlay-Medium, Inkubation und Immunostaining. Beschreibungen und Methoden dieser Technik wurden zuvor beschriebenen19,27.
Sobald die PSC-Kultur erreicht Ziel Zusammenfluss von 50-70 %, werden die Zellen dann getrennt und in ultra-niedrigen Anlage 96-Well Platten aggregiert. Die Zellen sind für 3 Tage in Stammzellen Xeno-freie Wartung Medien (INVE) gepflegt und dann auf eine neurale Induktion-Medien für den Rest der Kultur umgewandelt. Sobald die Organellen für 3 Wochen differenziert haben, kann die Infektion durchgeführt werden. Regelmäßig nehmen Bilder in der Woche nach Infektion, werden Forscher progressive Zelltod und Störung der organoide beobachten. Forscher können auch die Organellen zu diesem Zeitpunkt transkriptionelle durchzuführen oder Proteomic profiling distanzieren. Kryoschneiden und Lichtscheibe Methoden werden empfohlen für die Bildgebung und Forscher erwarten hohe Infektionen und virale Replikation vor allem innerhalb der neuronalen Vorläuferzellen (NPC) Zellpopulationen in der Organellen. Schließlich erlaubt diese Technik Forscher, die Mechanismen der viralen Infektion des menschlichen Gehirns mit niedrigen Kosten und begrenzten Ausstattung schnell zu untersuchen.
Es gibt mehrere Vorbehalte zu prüfen, bei der Verwendung von menschlichen zerebraler Organellen, ZIKV Infektion zu untersuchen. Ein wichtiger Aspekt ist, dass organoide Bildung und Struktur ist stark abhängig von der Stammzelllinie aus denen sie gebildet werden. Achten Sie beim Vergleich zwischen Zell-Linien, einschließlich isogenen Linien entwickelt; Es empfiehlt sich, mit mehreren Subclones und idealerweise mehrere Stammzelllinien Schlüsse zu machen. Zusätzlich aufgrund dieses Unterschieds in Zelllinien, Pilotprojekte, um sicherzustellen, dass angemessene Differenzierung in den Organellen Auftritt wird empfohlen. Während die Gliazellen Strukturen Brightfield Mikroskopie sichtbar sind, wird auch vorgeschlagen, qRT-PCR oder Kryoschneiden Experimente zu neuronale Differenzierung Marker wie PAX6 oder Phospho-Vimentin suchen.
Man sollte auch erhebliche Variabilität unter Organellen innerhalb der gleichen Zelllinie vorwegnehmen. Ungemustert aufgrund des Protokolls variiert die Anzahl und Größe der Gliazellen Strukturen zwischen einzelnen Organellen. In der Regel kann man mindestens zwei große erwarten (> 200 µm im Durchmesser von D24) neuronale Rosetten pro organoide. Aus diesem Grund sind Längsschnittstudien, wie die Beobachtung von organoide Größenänderung nach Infektion, besonders aufschlussreich. Variabilität zwischen den einzelnen Chargen kann auch mit die wahrscheinlichste Ursache für das Auftreten als ungenau Zellzählung oder säen. Es wird empfohlen, mehrere Zählungen durchzuführen und sicherzustellen, dass die Zellsuspension gut vermischt ist, vor der Aussaat auf die ULA U-Boden-96-Well-Platten.
Planen Sie Organellen in ULA U-Boden-96-Well Platten Kultivierung, auf beträchtliche Verdunstung Effekte an den Rändern der Platten zu sehen. Es ist ideal, um diese Vertiefungen mit PBS auffüllen und arbeiten nur mit dem Zentrum 60 Wells. Aufgrund der Verdunstung werden Organellen in den äußeren Vertiefungen zu anderen Bedingungen als denen in der Mitte, die wahrscheinlich deren Wachstum und Differenzierung auswirken wird, ausgesetzt werden. Bitte berücksichtigen Sie dies bei der Planung der Zahl der Organellen, die für Experimente benötigt werden. Darüber hinaus startet Organellen der 96-Well-Format nach etwa 30 Tagen überwuchern die aufgrund der Verfärbung des Kulturmediums sichtbar sein wird. Wenn die Planung auf die Organellen letzte 30 Tage, empfiehlt es sich, die Organellen auf eine ULA-24-Well-Platte zu übertragen. Um die Übertragung durchführen zu können, mit einer Schere eine P1000 Spitze abgeschnitten, so dass die Öffnung viel größer als die Organellen selbst ist und übertragen Sie die Organellen durch pipettieren.
Menschlichen zerebrale Organellen halten großes Potenzial in dem Gebiet Verständnis der neuronalen Entwicklung und Krankheit. Forscher sind aufgefordert, das Protokoll nach Bedarf ändern. Zum Beispiel könnte eine Musterung Faktoren zur Verbesserung der Effizienz der Differenzierung gegenüber bestimmten Zelltypen, so dass sie die virale Auswirkungen auf bestimmte anatomischen Regionen erkunden einsetzen. Die Neurodevelopmental Auswirkungen der ZIKV sind noch kaum erforscht, aber dieses neuen Ansatzes geben Forscher eine zugänglich, schnelle und Hochdurchsatz-Art der Untersuchung der Mechanismen der Infektion.
The authors have nothing to disclose.
Die Autoren danken für Hilfe mit ersten Ausbreitung und Quantifizierung von ZIKV Priscilla L. Yang und Dominique J. Burri der Harvard Medical School. Wir möchten auch Nathaniel D. Kirkpatrick für bildgebende Unterstützung danken. K.E wurde von Stanley Zentrum für psychiatrische Forschung und Harvard Stem Cell Institute unterstützt.
Xeno-Free Stem Cell Maintenance Media (SCMM), TeSR-E8 | StemCell Technologies | 5940 | Use for stem cell maintenance and early stages of organoid formaiton. Store at 4 ᵒC for up to two weeks after prepared from individual components |
Enzyme-Free Detachment Reagent, ReLeSR | StemCell Technologies | 5873 | |
Enzymatic Detachment Reagent, Accutase | Gibco | A11105-01 | Store aliquoted at -20 ᵒC, do not keep thawed for longer than necessary |
Y-27632 | Selleck Chem | S1049 | Reconstitute to 50mM in DMSO, and keep at -20 ᵒC in 50µL aliquots. |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
Glutamate-supplemented DMEM/F12 (1X) | Gibco | 10565-018 | (+)2.438 g/L sodium bicarbonate, (+)sodium pyruvate |
N-2 Supplement (100X) | Gibco | 17502-048 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (MEM-NEAA) | Gibco | 11140-050 | |
Heparin | Sigma-Adrich | H4784-1G | Reconstitute to 2 mg/mL in sterile DI water and store at -20 ᵒC in 250µL aliquots |
Earle's Balanced Salt Solution (EBSS) | GE Healthcare Life Sciences | SH30029.02 | |
Stericup Filter (500mL) | Millipore | 220009-140 | |
Costar Ultra-Low Attachment Plate, 96-Well, Round Bottom | Corning | 7007 | |
Low Residual Volume Reagent Reservoir (25mL) | Integra | 4312 | |
Pipet-Lite Multi Pipette L12-200XLS+ | Rainin | 17013810 | |
Large Centrifuge, Culture Plate-Compatible | Thermo Scientific | 75007210 | |
Culture Plate Centrifuge Rotor | Thermo Scientific | 75005706 | |
Vero Cells | ATCC | CCL-81 | For virus expansion, if necessary |
Zika Virus (Uganda Strain) | ATCC | VR-1838 | Other strains may be used |
Zika Virus (Puerto Rico Strain) | ATCC | VR-1843 | Other strains may be used |
phospho-vimentin | MBL | D076-3 | mouse polyclonal, 1:250 dilution |
TBR2 | Abcam | ab23345 | rabbit polyclonal, 1:300 dilution |
MAP2 | Novus | NB300-213 | chicken polyclonal, 1:1500 dilution |
GFAP | Cell Signaling Technologies | CST12389S | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
D1-4G2 flavivirus envelope protein | EMD Millipore | MAB10216 | mouse monoclonal, 1:500 dilution |
cleaved caspase-3 | Cell Signaling Technologies | 9661 | rabbit polyclonal, 1:200 dilution |
488 anti-mouse IgG | Thermo Fisher | A-11001 | goat polyclonal, 1:1000 |
594 anti-rabbit IgG | Thermo Fisher | A-11037 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |
647 anti-chicken IgY | Thermo Fisher | A-21449 | goat polyclonal, 1:1000 dilution |