Summary

Генерация IPSC, полученные из органоидов человеческого мозга Модели раннего развития нервной системы Расстройства

Published: April 14, 2017
doi:

Summary

Modeling human brain development has been hindered due to the unprecedented complexity of neural epithelial tissue. Here, a method for the robust generation of brain organoids to delineate early events of human brain development and to model microcephaly in vitro is described.

Abstract

The restricted availability of suitable in vitro models that can reliably represent complex human brain development is a significant bottleneck that limits the translation of basic brain research into clinical application. While induced pluripotent stem cells (iPSCs) have replaced the ethically questionable human embryonic stem cells, iPSC-based neuronal differentiation studies remain descriptive at the cellular level but fail to adequately provide the details that could be derived from a complex, 3D human brain tissue.

This gap is now filled through the application of iPSC-derived, 3D brain organoids, “Brains in a dish,” that model many features of complex human brain development. Here, a method for generating iPSC-derived, 3D brain organoids is described. The organoids can help with modeling autosomal recessive primary microcephaly (MCPH), a rare human neurodevelopmental disorder. A widely accepted explanation for the brain malformation in MCPH is a depletion of the neural stem cell pool during the early stages of human brain development, a developmental defect that is difficult to recreate or prove in vitro.

To study MCPH, we generated iPSCs from patient-derived fibroblasts carrying a mutation in the centrosomal protein CPAP. By analyzing the ventricular zone of microcephaly 3D brain organoids, we showed the premature differentiation of neural progenitors. These 3D brain organoids are a powerful in vitro system that will be instrumental in modeling congenital brain disorders induced by neurotoxic chemicals, neurotrophic viral infections, or inherited genetic mutations.

Introduction

Человеческие развитие нервной системы расстройство, такие как микроцефалия, может быть плохо изучено только на животных моделей из-за того, что мозг человека имеет расширенную корковую поверхность, уникальную особенность, отличающуюся от животных, кроме человека.

Этот аспект делает развитие мозга человеческим сложный процесс , который не может быть достаточно изучен в 2D, в пробирке системы культивирования клеток. Новые методы 3D культур позволяют генерировать подобные ткани органоидов из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК). Дифференцировки в пробирке плюрипотентных стволовых клеток в 3D культуры подвески допускает образование различных типов клеток в области своевременного и конкретным образом, что приводит к организованной, стратифицированной ткани 1, 2, 3. Благодаря лаборатории, пионеры технологии 3D культур и демистифицировали сложность формирования органов, начиная от стволовых клеток,мы разработали надежный метод генерации органоиды мозга разграничить ранние события развития человеческого мозга и смоделировать микроцефалия в пробирке 1, 2, 3. Следует отметить , что мы адаптировали оригинальный метод , разработанный Lancaster и др. генерировать церебральных органоиды 1. Этот метод был модифицирован в соответствии с нашими экспериментальными требованиями.

Целью исследования с Габриэль и соавт. был проанализировать клеточные и молекулярные механизмы нейронального поддержания стволовых клеток в процессе развития мозга. Для того чтобы сделать это, механистическое исследование проводили с помощью анализа нейронных клеток – предшественников (НПС) в 3D органоидов головного мозга , полученных от пациента 4 микроцефалии. Этот пациент нес мутацию в ППДЕ, законсервированный центросомном белок , необходимый для центросом биогенеза 5. Широко принято гипо-тезис , что микроцефалия является результатом истощения пула NPC, и это может быть обусловлено либо к гибели клеток или к преждевременной дифференцировке 1, 6, 7, 8, 9.

Путем анализа желудочковых зон (VZS) микроцефалия органоидов мозга, было показано , что значительное число НПСА подвергается асимметричному делению клеток, в отличии от органоидов мозга , полученных от здорового донора 4. Обширные микроскопические и биохимические анализы микроцефальных органоидов мозга выявили неожиданную роль для ППДА в своевременной ресничек разборке 4. В частности, мутировали CPAP связано с запаздывающим реснички разборки и отсроченной клеточного цикла повторного входа, что приводит к преждевременному дифференциации РНУ 4. Эти результаты указывают на роль ресничек в микроцефалии и йEIR участие в процессе нейрогенеза и размера мозга управления 10.

Первая часть этого протокола является описанием способа трехступенчатого для создания однородных органоидов мозга. Как упоминалось ранее, оригинальный протокол Lancaster был адаптирован и изменен в соответствии с нашей цели 1. Во-первых, человеческие иПСК культивируют в определенном без фидерного слоя условие на матрице Engelbreth-Холм-рой (ГЭП). Этот шаг позволяет избежать вариаций фидерных-зависимых культур плюрипотентных стволовых клеток. В этом протоколе, индукция дифференцировки нервной с образованием нейронной эпителии начинается непосредственно из ИПСКА. Путем пропуска шага эмбриоидного тела (EB) образования, нейронная дифференциация протекает в более контролируемый и направленный образе. Этот подход ограничивает спонтанное и неориентированное образование других слоев зародышевых клеток, такие как мезодермы и энтодерма. Применяя этот протокол, нейросферы содержащие нейронные розетки могут быть собраны на 5-й день для EHS матрицы вложение и стационарные суспензионной культуры. Органоид среда, используемая для третьего этапа нашего протокола дополняется dorsomorphin и SB431542. Dorsomorphin является ингибитором малых молекул костного морфогенетического белка (BMP), и SB431542 ингибирует / активин / узловой сигнальный путь TGF-beta. Сочетание этих факторов может способствовать нейронной дифференциации более эффективны , чем в одиночку 11, 12, 13, 14 ретиноевой кислоте.

В целом, эти модификации позволяют воспроизводимое поколение органоидов мозга, с минимальными различиями между органоидами. Важно отметить, что этот метод был применен для генерации энергично микроцефальных органоидов мозга от ИПСКА пациентов, которые несут мутации в генах, которые влияют на центросомы и динамику клеточного цикла.

Вторая часть этого протокола дает указание по подготовке брAin органоиды для анализа и интерпретации клеточных дефектов в микроцефалии. Это включает в себя фиксацию, cryosectioning, иммунофлуоресцентное окрашивание и конфокальной микроскопический анализ. Этот протокол обеспечит читатель с подробным описанием ожидаемых результатов и руководством для интерпретации.

Protocol

1. Генерация мозга органоиды (23 дней) Инициирование нейроэктодермы (5 дней) Примечание: Следующие пункты должны быть рассмотрены до начала дифференцировки. Метод перепрограммирования (lentiviral-, Сендайте-проявления вирусного, episomal- или микроРНК основы и т.д.) для полу…

Representative Results

Поколение органоидов мозга требует , по крайней мере , три недели непрерывного культивирования (рис 1А). Для достижения воспроизводимых результатов, мы рекомендуем, чтобы исследователь документы каждый шаг и, что немаловажно, позволяют избежать каких-либо изм…

Discussion

MCPH является сложным человеком психомоторного расстройства , которое не может быть обобщенно на животных моделей в естественных условиях или в простой культуре клеток человека подходов в пробирке. Клиническое проявление MCPH начинает появляться в течение первого триместра бе?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Эта работа была поддержана Фриц Тиссен фондом (Az.10.14.2.152). Мы благодарны ткани вложения объекта и основной микроскоп объект в CMMC. Мы благодарны за обсуждения и технической поддержки, предоставляемой членами Лаборатории Центросома и цитоскелета биологии. Мы благодарим Ли Мин Gooi за вычитку рукописи.

Materials

Anti-mouse 488 Invitrogen A-11001 Goat anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 488
Anti-rabbit 647 Invitrogen A-21245 Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 647
Arl13b proteintech 17711-1-AP ARL13B rabbit polyclonal antibody 
CELLSPIN system IBS Integra Bioscience 183001
DAPI Sigma-Aldrich, US 32670 4′,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride; multiple suppliers
DMEM/F-12 Gibco, US 31331093 Dulbecco's Modified Eagle Medium: Nutrient Mixture F-12 
Dorsomorphin Sigma-Aldrich, US P5499 Compound C; multiple suppliers
Embedding medium AppliChem A9011, 0100 Mowiol; embedding medium; multiple suppliers
Engelbreth-Holm-Swarm (EHS) matrix Corning 354277 Matrigel hESC-qualified matrix; important: hESC qualified
Fish gelatin  Sigma-Aldrich, US G7765-250ML Gelatin from cold water fish skin; multiple suppliers; autoclave after adding to PBS to dissolve and sterilize, store at 4°C
Glycine AppliChem A1067,1000 Glycine for molecular biology; multiple suppliers 
Inoculation loop with needle, disposable (1 µl) Sigma Aldrich, US BR452201-1000EA multiple suppliers 
Insulin Sigma-Aldrich, US I3536-100MG multiple suppliers
L-glutamine Gibco, US 25030081 L-glutamine (200 mM)
Medium A Stem cell technologies #05850 mTeSR1 (hiPSC medium)
Medium B Stem cell technologies #05835 Neural induction medium (NIM); neural differentiation medium
Medium C Gibco, US 21103049 Neural Basal Medium
MEM Gibco, US 11140035 MEM non-essential amino acids solution (100x)
MycoAlert Mycoplasma Detection Kit Lonza, Switzerland #LT07-218 Mycoplasma detection kit; multiple suppliers
Nestin Novus biologicals NBP1-92717 Nestin mouse monoclonal antibody (4D11)
Paraformaldehyde (PFA) AppliChem A3813, 0500 4% in PBS, store solution at -20°C; caution: wear skin and eye protection and work under hood 
PBS tablets Gibco, US 18912014 See manufacturer´s instructions; multiple suppliers
Penicillin-Streptomycin (10.000 U/ml) Gibco, US 15140122 Multiple suppliers
Poly-L-lysine solution (PLL) Sigma-Aldrich, US P8920-100ML Multiple suppliers
pVim MBL D076-3S Phospho-Vimentin (Ser55) mAb
Reagent A  Stem cell technologies # 05872 Note to Protocol 1.1.1.2; ReLSR (Enzyme-free human ES and iPS cell selection and passaging reagent); please follow manufactorer´s protocol; alternative products from muliple suppliers available
Reagent B  Sigma-Aldrich, US A6964-100ML Accutase solution is an enzymatic solution for single cell dissociation; multiple suppliers; protocol 1.1.2 "enzymatic cell dissociation solution” 
Research Cryostat Leica CM3050 S Leica biosystems CM3050 S Multiple suppliers
SB431542 Selleckchem.com S1067 Multiple suppliers
Spinner flask 250 ml IBS Integra Bioscience 182026
Sucrose AppliChem A4734, 1000 Multiple suppliers
Superfrost ultra plus microscope slides Thermo scientific, US J3800AMNZ Slides should be labeled with a "+" and positively charged
Supplement 1 Gibco, US 17502048 N-2 supplement (100x)
Supplement 2 w/o Vitamin A Gibco, US 12587010 B-27 supplement (50x), minus vitamin A; multiple suppliers
Tissue-Tek Cryomold Sakura, NL 4565 Multiple suppliers
Tissue-Tek O.C.T. compound Sakura, NL 4583 Multiple suppliers
Triton X-100 AppliChem A1388,0500 Multiple suppliers multiple suppliers
TUJ1 Sigma-Aldrich, US T2200 β-Tubulin III (rabbit polyclonal)
TUNEL assay Promega, US G3250 DeadEnd Fluorometric TUNEL system; multiple suppliers
Tween 20 for molecular biology AppliChem A4974,0500 Multiple suppliers
waterproof sheet BEMIS company, inc. PM996 Parafilm “M”; multiple suppliers
Y-27632  Selleckchem.com S1049 ROCK-inhibitor (Y-27632 2HCL); multiple suppliers
β-mercaptoethanol Gibco, US 31350010 2-mercaptoethanol (50 mM); multiple suppliers

References

  1. Lancaster, M. A., et al. Cerebral organoids model human brain development and microcephaly. Nature. 501, 373-379 (2013).
  2. Eiraku, M., Sasai, Y. Mouse embryonic stem cell culture for generation of three-dimensional retinal and cortical tissues. Nat Protoc. 7, 69-79 (2012).
  3. Nakano, T., et al. Self-formation of optic cups and storable stratified neural retina from human ESCs. Cell Stem Cell. 10, 771-785 (2012).
  4. Gabriel, E., et al. CPAP promotes timely cilium disassembly to maintain neural progenitor pool. EMBO J. 35 (8), 803-819 (2016).
  5. Al-Dosari, M. S., Shaheen, R., Colak, D., Alkuraya, F. S. Novel CENPJ mutation causes Seckel syndrome. J Med Genet. 47, 411-414 (2010).
  6. Wollnik, B. A common mechanism for microcephaly. Nat Genet. 42, 923-924 (2010).
  7. Thornton, G. K., Woods, C. G. Primary microcephaly: do all roads lead to Rome?. Trends Genet. 25, 501-510 (2009).
  8. Barbelanne, M., Tsang, W. Y. Molecular and cellular basis of autosomal recessive primary microcephaly. Biomed Res Int. 2014, 547986 (2014).
  9. Homem, C. C., Repic, M., Knoblich, J. A. Proliferation control in neural stem and progenitor cells. Nat. Rev. Neurosci. 16, 647-659 (2015).
  10. Gabriel, E., et al. CPAP promotes timely cilium disassembly to maintain neural progenitor pool. EMBO J. 35, 803-819 (2016).
  11. Mak, S. K., et al. Small molecules greatly improve conversion of human-induced pluripotent stem cells to the neuronal lineage. Stem Cells Int. , (2012).
  12. Morizane, A., Doi, D., Kikuchi, T., Nishimura, K., Takahashi, J. Small-molecule inhibitors of bone morphogenic protein and activin/nodal signals promote highly efficient neural induction from human pluripotent stem cells. J. Neurosci. Res. 89, 117-126 (2011).
  13. Shi, Y., Kirwan, P., Livesey, F. J. Directed differentiation of human pluripotent stem cells to cerebral cortex neurons and neural networks. Nat Protoc. 7, 1836-1846 (2012).
  14. Zhou, J., et al. High-efficiency induction of neural conversion in human ESCs and human induced pluripotent stem cells with a single chemical inhibitor of transforming growth factor beta superfamily receptors. Stem Cells. 28, 1741-1750 (2010).
  15. Takahashi, K., et al. Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell. 131, 861-872 (2007).
  16. Okita, K., et al. A more efficient method to generate integration-free human iPS cells. Nat Methods. 8, 409-412 (2011).
  17. Yu, J., et al. Human induced pluripotent stem cells free of vector and transgene sequences. Science. 324, 797-801 (2009).
  18. Lieu, P. T., Fontes, A., Vemuri, M. C., Macarthur, C. C. Generation of induced pluripotent stem cells with CytoTune, a non-integrating Sendai virus. Methods Mol. Biol. 997, 45-56 (2013).
  19. Bai, Q., et al. Temporal analysis of genome alterations induced by single-cell passaging in human embryonic stem cells. Stem Cells Dev. 24, 653-662 (2015).
  20. Garitaonandia, I., et al. Increased risk of genetic and epigenetic instability in human embryonic stem cells associated with specific culture conditions. PLoS One. 10, e0118307 (2015).
  21. Ohnuma, K., et al. Enzyme-free passage of human pluripotent stem cells by controlling divalent cations. Sci. Rep. 4, 4646 (2014).
  22. Currle, D. S., Monuki, E. S. Flash freezing and cryosectioning E12.5 mouse brain. J Vis Exp. , (2007).
  23. Yingling, J., et al. Neuroepithelial stem cell proliferation requires LIS1 for precise spindle orientation and symmetric division. Cell. 132, 474-486 (2008).
  24. Rakic, P. A small step for the cell, a giant leap for mankind: a hypothesis of neocortical expansion during evolution. Trends Neurosci. 18, 383-388 (1995).
  25. Hu, B. Y., et al. Neural differentiation of human induced pluripotent stem cells follows developmental principles but with variable potency. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107, 4335-4340 (2010).
  26. Wilson, P. G., Stice, S. S. Development and differentiation of neural rosettes derived from human embryonic stem cells. Stem Cell Reviews. 2, 67-77 (2006).
  27. Dhara, S. K., Stice, S. L. Neural differentiation of human embryonic stem cells. J. Cell Biochem. 105, 633-640 (2008).
  28. Christie, V. B., et al. Synthesis and evaluation of synthetic retinoid derivatives as inducers of stem cell differentiation. Org Biomol Chem. 6, 3497-3507 (2008).
  29. Kim, D. S., et al. Robust enhancement of neural differentiation from human ES and iPS cells regardless of their innate difference in differentiation propensity. Stem Cell Reviews. 6, 270-281 (2010).
  30. Gabriel, E., et al. Recent Zika Virus Isolates Induce Premature Differentiation of Neural Progenitors in Human Brain Organoids. Cell stem cell. , (2017).
  31. Wu, J., Hunt, S. D., Xue, H., Liu, Y., Darabi, R. Generation and Characterization of a MYF5 Reporter Human iPS Cell Line Using CRISPR/Cas9 Mediated Homologous Recombination. Sci. Rep. 6, 18759 (2016).
  32. Li, H. L., Gee, P., Ishida, K., Hotta, A. Efficient genomic correction methods in human iPS cells using CRISPR-Cas9 system. Methods. 101, 27-35 (2016).
  33. Grobarczyk, B., Franco, B., Hanon, K., Malgrange, B. Generation of Isogenic Human iPS Cell Line Precisely Corrected by Genome Editing Using the CRISPR/Cas9 System. Stem Cell Reviews. 11, 774-787 (2015).
  34. Camp, J. G., et al. Human cerebral organoids recapitulate gene expression programs of fetal neocortex development. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112, 15672-15677 (2015).
  35. Qian, X., et al. Brain-Region-Specific Organoids Using Mini-bioreactors for Modeling ZIKV Exposure. Cell. 165, 1238-1254 (2016).
  36. Jo, J., et al. Midbrain-like Organoids from Human Pluripotent Stem Cells Contain Functional Dopaminergic and Neuromelanin-Producing Neurons. Cell Stem Cell. 19, 248-257 (2016).
  37. Mariani, J., et al. FOXG1-Dependent Dysregulation of GABA/Glutamate Neuron Differentiation in Autism Spectrum Disorders. Cell. 162, 375-390 (2015).
  38. D’Avanzo, C., et al. Alzheimer’s in 3D culture: challenges and perspectives. Bioessays. 37, 1139-1148 (2015).
check_url/55372?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Gabriel, E., Gopalakrishnan, J. Generation of iPSC-derived Human Brain Organoids to Model Early Neurodevelopmental Disorders. J. Vis. Exp. (122), e55372, doi:10.3791/55372 (2017).

View Video