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Estrazione euristica di genotipi gerarchici e loci genomici accessori in popolazioni batteriche
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Genetics
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JoVE Journal Genetics
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations

Estrazione euristica di genotipi gerarchici e loci genomici accessori in popolazioni batteriche

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08:03 min

December 07, 2021

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08:03 min
December 07, 2021

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Questa piattaforma computazionale analitica fornisce una guida pratica per microbiologi, ecologi ed epidemiologi interessati alla genomica delle popolazioni batteriche. Nello specifico, il lavoro qui presentato ha dimostrato come eseguire: i) mappatura filogenetica di genotipi gerarchici; ii) analisi dei genotipi basata sulla frequenza; iii) analisi di parentela e clonalità; iv) identificazione del lignaggio differenziando i loci accessori.

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