Journal
/
/
Heuristische mijnbouw van hiërarchische genotypen en accessoire genoom loci in bacteriële populaties
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations

Heuristische mijnbouw van hiërarchische genotypen en accessoire genoom loci in bacteriële populaties

1,875 Views

08:03 min

December 07, 2021

DOI:

08:03 min
December 07, 2021

3 Views
, ,

Summary

Automatically generated

Dit analytische computationele platform biedt praktische richtlijnen voor microbiologen, ecologen en epidemiologen die geïnteresseerd zijn in bacteriële populatiegenomica. In het bijzonder demonstreerde het hier gepresenteerde werk hoe uit te voeren: i) fylogenie-geleide mapping van hiërarchische genotypen; ii) op frequentie gebaseerde analyse van genotypen; iii) verwantschaps- en klonaliteitsanalyses; iv) identificatie van afstammingsonderscheidende accessoire loci.

Read Article