Exploration heuristique des génotypes hiérarchiques et des loci du génome accessoire dans les populations bactériennes

Cette plate-forme informatique analytique fournit des conseils pratiques aux microbiologistes, aux écologistes et aux épidémiologistes intéressés par la génomique des populations bactériennes. Plus précisément, les travaux présentés ici ont démontré comment effectuer: i) une cartographie guidée par la phylogénie des génotypes hiérarchiques; ii) l’analyse des génotypes fondée sur la fréquence; iii) analyses de la parenté et de la clonalité; iv) l’identification des loci accessoires différenciant la lignée.