Summary

核酸比の迅速な探索のための最適化されたマウス胚性幹細胞ベースのリバースポリトランスフェクション技術(英語)

Published: December 08, 2023
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Summary

本プロトコルは、2iおよびLIF培地による培養中のマウス胚性幹細胞の逆ポリトランスフェクションの方法を記述する。この分析法は、従来のフォワードトランスフェクションプロトコルよりも高い生存率と効率をもたらすと同時に、プラスミド比のワンポット最適化も可能にします。

Abstract

哺乳類細胞株の核酸による一過性トランスフェクションは、その比較的簡便さと使いやすさから、生物医学研究の主力となっています。最も広く使用されている細胞株には、接着性二次元培養におけるトランスフェクションのための堅牢なプロトコルがありますが、これらのプロトコルは、あまり研究されていない細胞株や、非定型でトランスフェクションが困難な形態を持つ細胞株にはうまく変換されないことがよくあります。この分析法は、再生医療に広く使用されている培養モデルである2i/LIF培地で増殖させたマウス多能性幹細胞を用いて、より高いトランスフェクション効率を達成できる最適化された迅速なリバーストランスフェクションプロトコルの概要を示しています。このプロトコルを活用して、3プラスミドのポリトランスフェクションを行い、プラスミド送達の通常よりも高い効率を利用して、より広い範囲のプラスミド化学量論を研究します。このリバースポリトランスフェクションプロトコルにより、ワンポット実験法が可能になり、複数のコトランスフェクションではなく、単一のウェルでプラスミド比を最適化できます。このプロトコルは、送達された遺伝子回路の全面的な機能に対するDNA化学量論の効果の急速な調査を促進することによって、胚性幹細胞のtransfectionの時間そして費用を最小にする。

Introduction

哺乳類細胞へのDNAとRNAの送達は、生物医学研究の中核的な柱として機能します1。外因性核酸(NA)を哺乳類細胞に導入する一般的な方法は、一過性トランスフェクション2,3です。この技術は、NAをレシピエント細胞に送達できる市販のトランスフェクション試薬と混合することに依存しています。通常、NAはフォワードトランスフェクションを介して送達され、2次元表面に接着した細胞がトランスフェクション複合体を受け取ります。最も一般的な確立された細胞株のフォワードトランスフェクションは頑健であり、プロトコルは十分に公開されていますが、非単層形態のよりニッチな細胞タイプではトランスフェクションが容易ではなく、送達できるNAの量とそれを受け取る細胞の数が制限されます。

多能性幹細胞(PSC)は、無限に分裂し、あらゆる種類の体細胞を産生する能力があるため、発生を理解するための魅力的なモデルとして、また再生医療のツールとして機能します。マウスPSC(mPSC)の場合、2つの阻害剤とLIF(2i/LIF)を用いたルーチンのin vitro培養条件では、ドーム状のコロニー形態が維持され、フォワードトランスフェクションに曝露される細胞の数が直接制限されます4,5,6。これに対処するために、接着細胞にトランスフェクション試薬を添加するのではなく、培地とトランスフェクション試薬を含むディッシュに細胞を添加するリバーストランスフェクションを実施することができます7。これにより、試薬に曝露される細胞の数が増加しますが、細胞の継代とトランスフェクションを同時に行う必要もあります。

研究者は、単純な単一NAトランスフェクションを超えて、複数のNAコンストラクトをin vitroの細胞集団に導入することをしばしば目指します。これは典型的には、NAを所定の比率(1:1、9:1など)で混合し、次に選択したトランスフェクション試薬と組み合わせるコトランスフェクションによって達成される8。これにより、NAと試薬の混合物が得られ、NAの元の比率が互いに維持されます – 処理中の細胞は、この混合物の異なる量を受け取る可能性がありますが、それらはすべて同じ比率を受け取ります9。これは、部品の所望の比率がわかっている場合に有利ですが、この比率を事前に決定することは、各比率が異なる条件を構成するため、労働集約的になる可能性があります。1つの代替案は、個々のNAをトランスフェクション試薬と互いに独立して混合する「ポリトランスフェクション」を行うことである9。個々のNAを含むトランスフェクション複合体を組み合わせることにより(複合体を作成する前にNAを組み合わせるのではなく)、研究者は1回のトランスフェクション実験で幅広いNA化学量論を調べることができます9。これは、誘導可能な転写系や1,10,11にフィードバックが組み込まれたシステムなど、複数のNAの産物が互いに相互作用することが予想される場合に特に価値があります。しかし、これを効果的に行うには、高いトランスフェクション効率が必要です。実際、トランスフェクションされた一意のNAの数が増加すると、特定の細胞が所望のNAのすべてを受け取る確率は指数関数的に減少します9,12

以下の報告では、カチオン性脂質ベースのトランスフェクション試薬を用いたmPS細胞のリバーストランスフェクションプロトコルについて説明しており、細胞を試薬とNAの混合物に最大5分間曝露することで、生存率を最大化し、通常の培養条件以外での時間を最小限に抑えます。このプロトコルをこれらの細胞の標準的な前方トランスフェクションと比較すると、トランスフェクション効率が高く、トランスフェクションされた細胞の総数が増加していることが実証されます。このリバーストランスフェクションを、単純な蛍光レポーターを用いた3プラスミドポリトランスフェクションと組み合わせることで、高いトランスフェクション効率でNA比をスクリーニングする可能性が広がります。

Protocol

1. mPSC培養用試薬の調製 N2サプリメントを準備します。非滅菌状態で、以下の原液(ステップ1.1.1.1)を化学的安全ドラフトで調製します。各化学物質の固体粉末を、事前に計量した50 mLのコニカルチューブに加えます。粉末を添加した後、各チューブの重量を量り、適切な量の溶媒を加えて以下の濃度にします。メディアの 1 バッチについては、記載されている最小量?…

Representative Results

順方向トランスフェクションと逆方向トランスフェクションはどちらも、細胞膜と入ってくるトランスフェクション試薬-DNA複合体との相互作用に依存し、レシピエント細胞へのNAの送達を可能にします。従来のフォワードトランスフェクションでは、DNAは通常、接着細胞単層に送達されますが、リバーストランスフェクションでは、シングルセル懸濁液中で試薬とDNA複合体を細胞に接触させ?…

Discussion

トランスフェクションプロトコルが広く採用されている主な理由は、その再現性とアクセス性です。ただし、これらのプロトコルには、実験コンテキスト全体での最適化が必要です。上記には記載されていませんが、新しい細胞株を初めてトランスフェクションしようとするときに必要な標準的な試験です。まず、市販の試薬は万能ではなく、NA送達の効率は細胞タイプによって異なるため?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、スペースの都合上、本研究で引用しなかったこの分野への多くの貢献と、この機会を提供してくれた資金提供機関に感謝したい。著者らは、この研究を支援したカナダ自然科学・工学研究評議会(NSERC)とカナダ衛生研究所(CIHR)からの資金提供を認めている。K.M.は、NSERCからCGS-M奨学金を、ブリティッシュコロンビア大学からキラム博士奨学金を受給しています。N.S.は、Michael Smith Health Research BC Scholar Awardを受賞しています。

Materials

Accutase  MilliporeSigma SCR005
Apotransferrin  MilliporeSigma T1147-500MG
B27 supplement  ThermoFisher Scientific  17504044
Beta-mercaptoethanol ThermoFisher Scientific  21985023
BSA fraction V (7.5%) Gibco 15260-037
CHIR99021  MilliporeSigma SML1046-25MG
DMEM-F12 MilliporeSigma D6421-24X500ML
Flow cytometry standardization beads Spherotech URCP-38-2K
Gelatin  MilliporeSigma G1890
GlutaMAX supplement  ThermoFisher Scientific  35050061
Insulin  Gibco 12585-0014
Lipofectamine 2000  Invitrogen 11668-019 Transfection reagent
Neurobasal media ThermoFisher Scientific  21103049
OptiMEM  Invitrogen 31985-070
PD0325901  MilliporeSigma PZ0162-25MG
Progesterone MilliporeSigma P8783 Chemical hazard – consult local safety guidelines, ensure proper PPE is worn, and work with the solid powder form only in a chemical fume hood
Putrescine MilliporeSigma P6780 Chemical hazard – consult local safety guidelines, ensure proper PPE is worn, and work with the solid powder form only in a chemical fume hood
Recombinant mLIF  BioTechne 8878-LF-500/CF
Sodium selenite  MilliporeSigma S5261-25G Chemical hazard – consult local safety guidelines, ensure proper PPE is worn, and work with the solid powder form only in a chemical fume hood
Trypsin-EDTA ThermoFisher Scientific  25200056

References

  1. Shakiba, N., Jones, R. D., Weiss, R., Del Vecchio, D. Context-aware synthetic biology by controller design: Engineering the mammalian cell. Cell Systems. 12 (6), 561-592 (2021).
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  3. FAU, K. T. K., Eberwine, J. H. Mammalian cell transfection: the present and the future. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 397 (8), 3173-3178 (2010).
  4. Tamm, C., Galitó, S. P., Annerén, C. A comparative study of protocols for mouse embryonic stem cell culturing. PLoS One. 8 (12), 81156 (2013).
  5. Morgani, S., Nichols, J., Hadjantonakis, A. K. The many faces of pluripotency: in vitro adaptations of a continuum of in vivo states. BMC Developmental Biology. 17 (1), (2017).
  6. Mulas, C., et al. Defined conditions for propagation and manipulation of mouse embryonic stem cells. Development. 146 (6), 173146 (2019).
  7. Tamm, C., Kadekar, S., Pijuan-Galitó, S., Annerén, C. Fast and efficient transfection of mouse embryonic stem cells using non-viral reagents. Stem Cell Reviews and Reports. 12 (5), 584-591 (2016).
  8. Chong, Z. X., Yeap, S. K., Ho, W. Y. Transfection types, methods and strategies: A technical review. PeerJ. 9, 11165 (2021).
  9. Gam, J. J., DiAndreth, B., Jones, R. D., Huh, J., Weiss, R. A "poly-transfection" method for rapid, one-pot characterization and optimization of genetic systems. Nucleic Acids Research. 47 (18), 106 (2019).
  10. Jones, R. D., et al. An endoribonuclease-based feedforward controller for decoupling resource-limited genetic modules in mammalian cells. Nature Communications. 11 (1), 5690 (2020).
  11. Wauford, N., Jones, R., Van De Mark, C., Weiss, R. Rapid development of cell state identification circuits with poly-transfection. Journal of Visualized Experiments. (192), e64793 (2023).
  12. Hori, Y., Kantak, C., Murray, R. M., Abate, A. R. Cell-free extract based optimization of biomolecular circuits with droplet microfluidics. Lab on a Chip. 17 (18), 3037-3042 (2017).
  13. Teague, B. Cytoflow: A python toolbox for flow cytometry. bioRxiv. , (2023).
  14. Qin, J. Y., et al. Systematic comparison of constitutive promoters and the doxycycline-inducible promoter. PLoS One. 5 (5), 0010611 (2010).

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Cite This Article
Maheden, K., Hwang, K., Egilmez, I., Shakiba, N. An Optimized Mouse Embryonic Stem Cell Based Reverse Poly-Transfection Technique for Rapid Exploration of Nucleic Acid Ratios. J. Vis. Exp. (202), e65766, doi:10.3791/65766 (2023).

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