Dieser Artikel stellt einen optimierte Hefe Östrogen Bildschirm zur Quantifizierung der Liganden in Körperpflegeprodukten (PCP), die Östrogen-Rezeptoren Alpha (ERα) und/oder Beta (ERβ) binden. Die Methode umfasst zwei farbmetrischen Substrat Optionen einer sechstägigen gekühlten Inkubation für den Einsatz in grundständige Studiengänge und statistische Werkzeuge zur Datenanalyse.
Die Hefe Östrogen Bildschirm (ja) wird verwendet, um Östrogene Liganden in Umweltproben zu erkennen und im großen und ganzen in Studien von endokrinen Störungen angewendet wurde. Östrogene Liganden sind natürliche und künstliche “Environmental Östrogene” (EBS) in vielen Konsumgütern wie Körperpflegeprodukte (PCP), Kunststoffe, Pestizide und Lebensmitteln gefunden. EBS stören Hormon Signalisierung bei Menschen und anderen Tieren, potenziell Fruchtbarkeit reduzieren und erhöhen Erkrankungsrisiko. Trotz der Bedeutung der EBS und andere endokrine Störung Chemikalien (EDZ) für die öffentliche Gesundheit endokrine Störung nicht in der Regel Bachelor Curricula gehört. Dieses Manko ist teilweise ein Mangel an entsprechenden Labor-Aktivitäten, die die Grundsätze zu veranschaulichen beteiligt, aber auch für Studenten zugänglich. Dieser Artikel stellt eine optimierte ja zur Quantifizierung der Liganden in Körperpflegeprodukten, die Östrogen-Rezeptoren Alpha (ERα) und/oder Beta (ERβ) binden. Die Methode beinhaltet eines der beiden farbmetrischen Substrate (ortho– Nitrophenyl-β-D-Galactopyranoside (ONPG) oder Chlorphenol rot-β-D-Galactopyranoside (CPRG)), die durch β-Galaktosidase gespalten sind, treten Sie einer 6-tägigen gekühlten Inkubation erleichtern Sie Einsatz in undergraduate Laborübungen, eine automatisierte Anwendung für LacZ Berechnungen und R-Code für die damit verbundenen 4-Parameter logistische Regressionsanalyse. Das Protokoll wurde entwickelt, um Studenten zu entwickeln und führen Experimente, in denen sie Produkte ihrer Wahl für Östrogen imitiert Bildschirm, zu ermöglichen. Sie lernen dabei endokrine, Zellkultur, Rezeptorbindung, Enzymaktivität, Gentechnik, Statistik und Versuchsplanung. Gleichzeitig, sie auch üben Labor für grundlegende und breit anwendbar, wie z. B.: Berechnung der Konzentrationen; Herstellung von Lösungen; sterilen Technik demonstrieren; seriell verdünnen Normen; Bau und Interpolation Standardkurven; Ermittlung von Variablen und Kontrollen; sammeln, organisieren und analysieren von Daten; Aufbau und Interpretation der Graphen; und mit gemeinsamen Laborgeräte wie Mikroliterpipetten und Spektralphotometer. So fördert die Umsetzung dieser Assay Studenten in Inquiry-based Learning™ beim erkunden von neuen Themen in Umweltwissenschaften und Gesundheit engagieren.
Die Hefe Östrogen Bildschirm (ja) ist weit verbreitet, Liganden zu quantifizieren, die Estradiol (E2 oder 17β-Estradiol) in einer Vielzahl von Matrizen, einschließlich Wasser, Pflanzengewebe, Konsumgüter und Lebensmittel1,2,3zu imitieren, 4. Gemeinsam werden solche Liganden bezeichnet “Environmental Östrogene (EBS).” Die ja ursprünglich als eine niedrige Kosten, in-vitro- Alternative zu in-Vivo -Tests wie die Nager Uterotropher assay5,6 und die Regenbogenforelle Fütterung Assay7entwickelt. Das Ziel dieser Tests ist es, festzustellen, ob ein Produkt enthält Chemikalien, die stimulieren oder blockieren Östrogen-abhängigen Mechanismen. Erkennung von EBS ist kritisch, weil sie die normale körpereigene Östrogen Signaltechnik, besonders während der fetalen Entwicklung beeinträchtigen können. Diese Störung beeinträchtigt Gesundheit erhöht Risiko für Fettleibigkeit, Unfruchtbarkeit, Krebs und kognitive Verlust8.
Trotz der Bedeutung der EBS und andere endokrine Disruptoren für die öffentliche Gesundheit endokrine Störung nicht allgemein Bachelor Curricula gehört. Dieser Mangel ist zum Teil auf einen Mangel an Aktivitäten, die die Grundsätze zu veranschaulichen beteiligt, aber auch für Studenten zugänglich. Darüber hinaus mehrere Varianten des Protokolls ja gibt es9,10,11,12,13, und diese Vielfalt macht Assay Optimierung für zeitaufwendig Labor-Koordinatoren nicht speziell in den relevanten Techniken geschult. Schließlich sind ja Assays in der Regel über 1 langen Tag oder 2 aufeinander folgenden Tagen mit einer O/N Inkubation abgeschlossen. Dieses Timing ist nicht kompatibel mit dem Format der Bachelor Laborübungen, entsprechen in der Regel einmal / Woche für mehrere Stunden.
In Reaktion auf diese Bedürfnisse berichtet dieses Manuskript eine optimierte 96-Well-ja-Protokoll, die ethanolische Extraktionsmethoden für Körperpflegeprodukte (PCP)3 und eine 6-Tage-Kältetechnik Schritt, wöchentliche Labor treffen unterzubringen umfasst. Absoluter Ethanol ist eine vielseitige organischen Lösungsmittel, das eine Vielzahl von polaren und unpolaren solute auflösen kann. Darüber hinaus ist es geeignet für grundständige Studiengänge, weil es leicht verfügbar, relativ ungiftig, erschwinglich und mit Wasser mischbar ist; Es verdunstet auch leicht ohne spezielle Ausrüstung. Allerdings Ethanol eignet sich nicht für das Extrahieren von stark hydrophobe endokrine Disruptoren oder viele Öle und Wachse, die beiden letzteren werden häufige Zutaten in PCPs. schlechte Extraktionseffizienz erhöht das Risiko von falsch negativen Befund. Mit dieser Einschränkung im Auge sollte Ermittler wählen Sie Extraktionsverfahren (z.B., ethanolische Extraktion oder Festphasenextraktion), dass Adresse Probe Merkmale und Ziele der Studie (Forschung versus Bachelor Anleitung).
Das ja setzt auf rekombinante Saccharomyces Cerevisiae ursprünglich von Dr. Charles Miller an der Tulane University. Bitte siehe Miller Et al. (2010) für eine komplette Karte von veränderter Plasmid-14. Hefe verwandelt sich diese Plasmide konstitutiv Ausdruck menschlichen nukleare ERα und ERβ (auch genannt ESR1 und ESR2, beziehungsweise) Wenn Sie in Medien, die Galaktose (für ERα) oder Glukose oder Galaktose (für ERβ) angebaut. Wenn Östrogene Chemikalien in den Medien präsent sind, binden sie an die Rezeptoren, Erstellen von Ligand-Rezeptor-komplexe, die β-Galaktosidase (LacZ) Ausdruck auf eine Ebene proportional zur Konzentration von Östrogenen Chemikalien zu aktivieren. Hefezellen sind dann lysiert, um die angesammelten β-Galaktosidase zu lösen. Der Lyse Puffer enthält entweder ONPG oder CPRG, die durch β-Galaktosidase zu gelben oder roten Produkten, bzw. gespalten werden. Farbmetrische Produkte können durch Messung der Extinktion mit einer Microwell Platte Spektralphotometer quantifiziert werden. Der Grad der Farbwechsel ist proportional zur Konzentration der Östrogene Liganden, die die Hefe ausgesetzt war.
Die Wahl des Substrats (CPRG oder ONPG) hängt das Potenzial für Hintergrund-Absorption aus den Proben. Z. B. Pflanzenextrakte werden oft hinzufügen einen gelben Farbton auf die Medien, die künstlich Östrogenität Maßnahmen wenn bläst ONPG (quantifiziert bei 405 nm) dient als Substrat für β-Galaktosidase. Mit Pflanzenextrakte, CPRG (quantifiziert auf 574 nm) möglicherweise eine geeignetere farbmetrischen Substrat. CPRG ist teurer als ONPG sondern dient bei einem Zehntel der Molarity. Dieser Artikel stellt Estrogenicities von PCP Extrakte quantifiziert mit ONPG und CPRG.
Quantifizierung der Östrogenität von Umweltproben mit ERα und ERβ ist ein umfassender Ansatz als mit nur einer dieser Rezeptoren. Bei Tieren weisen diese Rezeptoren differential Gewebeverteilung, Regulierungstätigkeiten und verbindliche Affinitäten für Östrogene und Anti-Östrogene Liganden15. Zum Beispiel binden pflanzliche Phytoöstrogene in der Regel ERβ mehr stark2, während synthetische Chemikalien Vorliebe für ERα und ERβ zeigen können oder beide Rezeptoren gleichermaßen gut15binden können. Daher Vorhersagen Bindung an einem Östrogen-Rezeptor nicht notwendigerweise, Bindung an das andere.
Obwohl die EBS in viele Consumer-Produkte (z.B., Pestizide, Waschmittel, Klebstoffe, Schmierstoffe, Kunststoffe, Nahrungsmittel und Pharma) sowie Pflanzen zu finden sind, stammen die dargestellten Daten mit einer Auswahl an PCP. PCPs sind überzeugend, leicht zur Verfügung, Budget-freundlichen und umweltrelevanten für Studierende. Studenten können eingeladen werden, bringen Sie ihre Lieblings PCPs von zu Hause, im Labor zu testen. Sie können auch suchen die Skin Deep Datenbank zu generieren Hypothese-driven Vergleiche von PCP mit hoher und geringer Toxizität Partituren von der Environmental Working Group16 entwickelt. Auf diese Weise können Schüler gleichzeitig erweiterte Labor Fähigkeiten entwickeln; Tätigung von selbstgesteuertes, Anfrage-basierten Lernens; und entdecken Sie neue Fragen in Umweltwissenschaften und Gesundheit.
Das ja ist eine kostengünstige Methode um Östrogene Liganden in Umweltproben, wie Wasser, Nahrung, Pflanzengewebe oder Körperpflege-Produkte zu erkennen. Daten hier vorgestellten vergleichen 2 Östrogen-Rezeptoren (ERα und ERβ), 2 Substrate (ONPG und CPRG) und 2 Fristen (2 d Protokoll ohne Kühlung) und sieben-Tage-Protokoll mit Kühlung für die Messung von Östrogenität in Körperpflegeprodukten über ja-Assay. Die 7D, gekühlte Protokoll mit CPRG und Hefe mit dem Ausdruck ERα und ERβ am besten quantifiziert EEQs, während auch kompatibel mit dem Zeitdruck durch Bachelor Laborkursen aufgezwungen, die nur einmal erfüllen / Woche für mehrere Stunden. In der Tat war im Vergleich zu den 2 d-Assay ohne Kühlung, die siebentägige gekühlte Assay verbunden mit geringeren Varianz über Platte repliziert. Darüber hinaus wurde der lineare Teil der Standardkurve für Daten, die mit der gekühlten Test leicht erweitert. Die lineare Teil der Standardkurve Assay Erfassungsbereich definiert und ist der einzige Teil der Standardkurve, die verwendet werden kann, zum Beispiel EEQs zu interpolieren.
Alles in allem aber eines der getesteten Proben waren EEQs CPRG anhand niedriger als die mit ONPG quantifiziert. Mit einem höheren Aussterben Koeffizienten und untere Km und Vmaxist CPRG zehnmal empfindlicher als ONPG17. So CPRG bei niedrigeren Konzentrationen eingesetzt werden und kann verwendet werden, um geringere Mengen an β-Galaktosidase zu erkennen. Aus diesen Gründen ist ONPG18,19CPRG in der Regel vorzuziehen. Mehr Substrat Sensibilität erklärt jedoch nicht die niedrigeren EEQ-Werten mit CPRG erkannt. Die höheren EEQ Werte erkannt mit ONPG könnte aufgrund einer Störung der Matrix mit dem Assay, wie bereits von anderen Autoren2,18. Gelbe Pigmente aus Körperpflege Produkt Extrakte konnte EEQ Werte erkannt mit ONPG aufzublasen. Andere haben dieses Problem umgangen, indem einschließlich der Pigment-Kontrollen in ihrer experimentellen Design2, ein Ansatz, der die Anzahl der Platten in einem Experiment verdoppelt. Wenn Matrix Störungen problematisch sein kann, möglicherweise CPRG vorzuziehen Substrat für die ja-Assay, obwohl es teurer und längere Inkubationszeiten als ONPG erfordert. Darüber hinaus ist der Farbwechsel, induziert durch die Spaltung des Substrats durch β-Galaktosidase dramatischer mit CPRG, machen es einfacher für Studenten, Ergebnisse zu visualisieren.
Miller Et al. (2010), wer entwickelt, die in diesem Protokoll verwendeten Hefe, zur Kenntnis genommen, dass Hefe mit dem Ausdruck ERβ 30 X empfindlicher auf 17β-Estradiol als Hefe ERα, untermauert durch unsere Daten14Feststellung zum Ausdruck zu bringen waren. Abgesehen von möglichen Nuancen im Plasmid Bau, Miller Et al. (2010) konnte nicht erklären, dass dieser Unterschied in der Empfindlichkeit14. Ein Unterschied zwischen den beiden Plasmid-Konstrukte ist, dass Galaktose, ERα Ausdruck geregelt ist, ERβ Ausdruck von Glukose oder Galaktose geregelt ist. Die Hefe in den ja-Assay verwendet werden in Glukose Medien kultiviert und Galaktose nur gegeben, wenn sie zu Beginn des Tests verdünnt werden. Hefe mit dem Ausdruck ERβ könnte daher höhere Heftnummern der Rezeptor-Proteine vor Beginn des Tests, dadurch höhere Empfindlichkeit gegenüber Östrogenen Liganden konferieren ansammeln.
Die geringere Empfindlichkeit des ERα exprimierenden Hefe mag erklären, die höheren Preise der nicht-Erkennung von Östrogenität in Proben mit ERα im Vergleich zu ERβ. Um die Wahrscheinlichkeit zu erhöhen wird, die Probe EEQs erkannt, Benutzer beschäftigen verschiedene Extraktionslösungsmittel und Methoden oder die Hefe höhere Volumen der Probe hinzufügen könnte. Wenn höhere Probenvolumina verwendet werden, sollte die Konzentrationen von E2-Standards angepasst werden, so dass die gleiche Menge an Standards und Proben im Test verwendet werden kann. Eine Einschränkung der Zugabe mehr Probe ist, dass Hefe nur 6-10 % Ethanol, mit besseren Verträglichkeit bei Inkubation Temperaturen von 30 Vs. 35 ° C20tolerieren kann. Um Effekte von Ethanol auf Hefe zu steuern, sollte Ermittler die Platte Layout dreifacher “Hefe nur” Quellen hinzufügen und bestätigen, dass der OD-610 “Hefe nur” Brunnen vergleichbar mit der OD-610 von Fahrzeug-Kontroll-Vertiefungen sofort nach der Zugabe des LacZ-Puffers. Alternativ können Proben in Ethanol gelöst hinzugefügt werden, zu den trockenen Microwell-Platten und das Ethanol verdampft ausschalten bevor Hefe hinzugefügt. Dimethylsulfoxide (DMSO) dient auch als Probe Lösungsmittel in ja Tests, aber die Endkonzentration Arbeiten von DMSO mit Hefe auf 1 %12beschränkt werden sollte.
Die ja-Assay ist ein leistungsfähiges Screening-Instrument zur Erfassung von Östrogenität in Umweltproben. Insbesondere erkennt das ja Liganden, die nukleare Östrogen-Rezeptoren binden, die mit Östrogen-Response-Elemente gen Ausdruck14direkt interagieren. Allerdings hat das ja auch wichtige Einschränkungen. Das ja erkennt keine EBS, die Arbeiten durch nicht-nuklearen Mechanismen wie Membran Östrogen-Rezeptoren oder Mechanismen, bei denen zusätzliche Elemente wie Transkriptionsfaktoren Activator Protein 1 (AP-1). Darüber hinaus da Hefe haben nicht die gleichen metabolische Kapazität als Säugerzellen, kann das ja Liganden nicht erkennen, die Stoffwechselaktivierung Östrogene zu erfordern.
Darüber hinaus kann nicht der Test ja Östrogene und Anti-Östrogene Liganden in komplexen Proben leicht unterscheiden. Stattdessen misst es net Östrogenität, die Summe der Östrogene und Anti-Östrogene Liganden bewirkt. Um die Konzentration von ER-Antagonisten zu quantifizieren oder bewerten der inhibitorischen Aktivität von Mischungen, kann der Test durch Inkubation Hefe mit der standard-Agonist (17β-Estradiol) und eine Reihe von Test Probe Konzentrationen12geändert werden. Dieser Prozess stellt fest, ob Antagonisten in den Proben Reporter Agonist-induzierte Aktivität vermindern können und bietet eine nützliche-Bildschirm für das Vorhandensein von ER-Antagonisten in Proben zu identifizieren.
Die hier vorgestellten Protokoll kann eine Vielzahl von Probenarten, unterbringen, obwohl einige Proben Änderungen an die Extraktion und Probe Vorbereitungsschritte erfordern. Beispielsweise EEQs sehr unterschiedlich zu der einige Körperpflegeprodukte repliziert. Variablen Proben tendenziell Öltröpfchen enthalten oder anderweitig nicht völlig homogen ist, darauf hinweist, dass mehr lipophilen Lösungsmittel wie Diethylether hilfreich wäre. Alternativ könnten Ölen und Wachs in Körperpflege-Produkten ausgeschlossen werden, durch die Gewinnung von Proben mit 50 % Ethanol anstelle von 100 % igem Ethanol.Eine 50 %-Ethanol-Extraktion wird auch mehr Wasser lösliche Östrogene Liganden (z.B. einige Pigmente) erfassen. Allerdings 50 % Ethanol langsamer als 100 % Ethanol verdampft und somit Extraktionszeit verlängern kann. Darüber hinaus wurden einige Proben (z. B. Seifen) zytotoxische, Hefe, was zu reduzierten Zelle Dichtemessungen (OD610). Fox Et al. (2008) deuten darauf hin, dass solche Proben sollten verdünnt und erneut getestet, wenn Zelle Dichteunterschiede mehr 30 als % im Vergleich zum Fahrzeug Kontrolle Brunnen12.
Wenn ja-Assay für analytische Zwecke verwendet wird, können Kurven Verdünnung der Probe Pools getestet werden soll präventiv entsprechende Mengen an Extrakt, Hefe im Schritt 4.5 hinzugefügt werden soll. Alternativ können Auszüge gleichzeitig auf mehrere Volumes (z.B., 5 µL und 20 µL Extrakt, Hefe im Schritt 4.5 hinzugefügt) getestet oder Verdünnungen, die Größenordnungen (z.B., 0,2 µL 2 µL und 20 µL) umfassen. “Angemessen” Bände des Extraktes sind diejenigen, die Östrogenität zu identifizieren, indem passende LacZ Werte entlang den linearen Teil der Standardkurve. Optimierung wird verhindert, dass Probleme, die durch Zugabe von zu viel oder zu wenig Probe auf der Hefe, wie Zytotoxizität, falsche negative oder Östrogenität, die die Standardkurve überschreitet. Wie oben erwähnt, sollte die Volumen der Proben und E2 Standards angepasst werden, wenn unterschiedliche Mengen an Liganden verwendet werden, so dass Hefe ausgesetzt sind eine einheitliche Lautstärke und Konzentration von Ethanol oder ein anderes Fahrzeug auf den Teller legen.
Trotz des Potenzials für falsche negative wurde ja Assay als einem Tier 3-Test-Tool für endokrine Disruptoren durch Schug Et Al. identifiziert (2013), entwickelt, die eine umfassende Tiered Protokoll für endokrine Störungen (TiPED)21. Für undergraduate-Ausbildung ist der Test für Unterrichtskonzepte im Zusammenhang mit endokrinen Störungen, Zellkultur, Rezeptorbindung, Enzymaktivität, Gentechnik, Statistik und Versuchsplanung. Studierende, die den Test verwenden üben auch grundlegende und breit anwendbar Labor wie seriell verdünnen Normen; Gewinnung von Proben; Herstellung von Lösungen; Bau und Interpolation Standardkurven; Berechnung der Konzentrationen; Herstellung von Lösungen; sterilen Technik demonstrieren; Kultivierung von Zellen; Ermittlung von Variablen und Kontrollen; sammeln, organisieren und analysieren von Daten; Aufbau und Interpretation der Graphen; und mit gemeinsamen Laborgeräte wie Mikroliterpipetten und Spektralphotometer.
The authors have nothing to disclose.
Dieses Projekt wurde durch Anschubfinanzierung TME und AMR aus Louisiana Tech University und Furman University bzw. finanziert. Zusätzliche Mittel durch einen 2015 Fakultät Förderung Zuschuss an AMR und TME von The Associated Colleges des Südens, ein Stipendium TME von der National Science Foundation und des Louisiana Board of Regents und ein Reisestipendium zu TME aus Louisiana EPSCoR Pfund zur Verfügung gestellt wurde die University of the South. Wir danken Dr. David Eubanks (Furman) für die Unterstützung bei statistischen Analysen und Mr. Christopher Moore für”uns eine Hand” während der Dreharbeiten.
Equipment | |||
Vortex Mixer (for single or multiple tubes) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-215-365 | Any mixer will suffice. |
Bucket centrifuge | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 75-063-839 | Any bucket centrifuge will suffice if it is capable of centrifuging conical tubes at 4000 rpm. |
Bunsen burner | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 17-012-823 | Any Bunsen burner will suffice, or an alcohol burner (Fisher Scientific 04-245-1) can be used instead. |
Incubator | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 50125590H | Any incubator will suffice if it is capable of maintaining 30 °C. |
Microplate reader | BioTek (www.biotek.com) | EPOCH2 | A different brand of plate reader will suffice if it can measure absorbance at wavelengths of 405, 574, and 610 nm. |
Gen5 microplate reader and imager software | BioTek (www.biotek.com) | GEN5 | Software required depends on make and model of plate reader; GEN5 software is intended for use with BioTek plate reader. |
Refrigerator | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 05LREEFSA | Any refrigerator will suffice if it is capable of maintaining 4 °C. |
Pipettor or PipetAid compatible with 1-10 ml serological pipets | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-681-15E | Any pipettors will suffice if they are compatible with 1- and 10-ml serological pipets. |
P10 micropipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F144562G | Any micropipettor will suffice if it is capable of dispensing 5 µl. |
P200 micropipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F144565G | Any micropipettor will suffice if it is capable of dispensing up to 200 µl. |
P300 multichannel pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FBE1200300 | Any multichannel pipettor will suffice if it is capable of dispensing 50 to 205 µl. |
Repeating pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F164001G | Must be able to deliver 100-320 µl; this pipettor is optional because a multichannel pipettor can be used instead. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Supplies | |||
Sterile 15-ml conical tubes with caps | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 05-539-801 | |
Glass scintillation vials | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 03-337-4 | |
Polystyrene 96-well, flat-bottom microplates with lid (non-sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 12565501 | |
Polypropylene 96-well, flat-bottom microplates without lid | Cole-Parmer (www.coleparmer.com) | EW-01728-81 | |
100 ml glass beakers | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-539H | Any glass beakers will suffice if they are autoclavable. |
250 ml glass Erlenmeyer flasks | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FB500250 | Any glass Erlenmeyer flasks will suffice if they are autoclavable. |
Sterile, adhesive, porous film | VWR (www.vwr.com) | 60941-086 | |
Metal forceps | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 12-000-157 | Any metal forceps will suffice. |
Reagent reservoir | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 07-200-127 | |
Filtration units (0.2 µm) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 09-761-52 | |
Squirt bottle (for ethanol) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-897-10 | Any laboratory squirt bottles will suffice. |
Autoclavable storage bottles | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 06-414-1D | Any autoclavable glass storage bottles will suffice. |
10 ml glass serological pipets (sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-678-27F | Any glass serological pipets will suffice. |
1 ml glass serological pipets (sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-678-27C | Any glass serological pipets will suffice. |
P10 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-3810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
P200 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-8810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
P300 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-9810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
Syringe tips for repeating pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F164150G | Only required if a repeating pipettor is used. |
Sterile petri dishes | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FB0875712 | Any sterile petri dishes will suffice. |
Parafilm | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | S37440 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Yeast | |||
Saccharomyces cerevisiae strains that lack the TRP1 gene product (e.g. W303a) | American Type Culture Company (ATCC) (www.ATCC.org) | MYA-151 | Recombinant yeast are also available upon request from the authors. |
Receptor/reporter plasmid for ERα | Addgene (www.addgene.org) | pRR-ERalpha-5Z (Plasmid #23061) | |
Receptor/reporter plasmid for ERβ | Addgene (www.addgene.org) | pRR-ERbeta-5Z (Plasmid #23062) | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Chemicals | |||
Difco agar | BD (www.bd.com) | 214530 | |
Dithiothreitol | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | D0632 | CAUTION: Dithiothreitol is an acute skin and eye irritant. Use appropriate personal protection equipment (gloves, fume hood, dust mask) to avoid skin and eye contact, inhalation and ingestion. |
Ortho-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | N1127 | |
Chlorophenol red-β-D-galactopyranoside | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | 10884308001 | |
Yeast nitrogen base | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | Y0626 | |
Glucose | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | G8270 | |
Galactose | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | G5388 | |
Adenine sulfate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | A9126 | |
Uracil | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | U0750 | |
Leucine | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | L8000 | |
Histidine | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | H8000 | |
17 β-Estradiol | Sigma (www.sigmaaldrich.com) MP Biomedicals | E8875-250 mg 0219456401 – 1 mg | CAUTION: Estradiol is a suspected carcinogen and reproductive toxicant. It is harmful if inhaled, swallowed, or absorbed through skin. Estradiol may cause harm to breast-fed children and fetuses. Estradiol is very toxic to aquatic life. Use appropriate personal protection (gloves, fume hood, dust mask) and avoid exposure during pregnancy and lactation. Estradiol should be disposed of as hazardous waste and not released to the environment. |
100% ethanol | Pharmco-Aaper (www.pharmcoaaper.com) | 111000200 | |
Sodium phosphate monobasic monohydrate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S9638 | |
Sodium phosphate dibasic (anhydrous) | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S0876 | |
Magnesium chloride | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | M8266 | |
Potassium chloride | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | P9333 | |
Sarkosyl (N-lauroylsarcosine sodium salt) | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | L5125 | |
Sodium carbonate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S7795 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Software | |||
Excel spreadsheet software | Microsoft | Excel is convenient spreadsheet software for managing data outputs and generating .csv files for R analysis. | |
Java software (required for Appendix 1 application) | Oracle Corporation | To calculate LacZ values using the application in Appendix 1, first download free Java software (https://www.java.com/en/download/), then open the LacZ application in Appendix 1. LacZ results created by the application can be copied by pressing "control (ctrl) + c" on PC keyboards, or "command + c" on Mac keyboards. | |
JMP statistical software version 13.0.0 | SAS Institute | Appendix 2 includes directions on using JMP to fit LacZ data to a four-parameter logistic regression curve. The curve is used to interpolate test sample estradiol equivalents (EEQs), relative to the estradiol standard curve. | |
R statistical computing and graphics software | R Foundation | Free R software can be downloaded from https://www.r-project.org/. Directions and code for using R to fit LacZ data to a four-parameter logistic regression curve are given in Appendix 2. |