Este artículo presenta una pantalla de estrógeno levadura optimizado para la cuantificación de ligandos en productos de Cuidado Personal (PCP) que se unen de estrógenos receptores alfa (ERα) o beta (ERβ). El método incorpora dos opciones de sustrato colorimétrico, una incubación refrigerada de seis días para su uso en cursos de pregrado y herramientas estadísticas para análisis de datos.
La pantalla de estrógeno de levadura (YES) se utiliza para detectar ligands estrogénicas en muestras ambientales y ha sido ampliamente aplicado en los estudios de disrupción endocrina. Ligandos estrogénicos incluyen tanto naturales como provocados por el hombre “los estrógenos medioambientales” (EEE) en muchos bienes de consumo, incluyendo productos de Cuidado Personal (PCP), plásticos, plaguicidas y alimentos. EEs interrumpen hormona de señalización en los seres humanos y otros animales, potencialmente reduciendo la fertilidad y aumento de riesgo de la enfermedad. A pesar de la importancia de EEs y otros químicos interrupción endocrina (EDCs) para la salud pública, disrupción endocrina por lo general no está incluido en los programas de pregrado. Esta deficiencia en parte debido a la falta de actividades de laboratorio relevantes que ilustran los principios participa al mismo tiempo accesible a estudiantes de pregrado. Este artículo presenta una optimizada sí para la cuantificación de ligandos en productos de cuidado personal que se unen de estrógenos receptores alfa (ERα) o beta (ERβ). El método incorpora uno de los dos sustratos colorimétricos (Orto– nitrofenil-β-D-galactopiranosida (ONPG) o clorofenol rojo-β-D-galactopiranosida (CPRG)) que están divididos por β-galactosidasa, una incubación de 6 días refrigerada paso a facilitar el uso en cursos de pregrado laboratorio, una aplicación automatizada para cálculos de LacZ y código de R para el análisis de regresión logística de 4 parámetros asociados. El protocolo ha sido diseñado para permitir a estudiantes a desarrollar y llevar a cabo experimentos en que pantalla de productos de su elección para imitadores de estrógeno. En el proceso, aprenden sobre la disrupción endocrina, cultivo celular, atascamiento del receptor, la actividad enzimática, genética, estadística y diseño experimental. Al mismo tiempo, también practican destrezas de laboratorio fundamental y ampliamente aplicables, tales como: cálculo de concentraciones; fabricación de soluciones; demostrando una técnica estéril; dilución en serie de normas; construcción e interpolando curvas estándar; identificación de variables y controles; recoger, organizar y analizar datos; construir e interpretar gráficos; y el uso de equipo de laboratorio común como micropipettors y espectrofotómetros. Por lo tanto, aplicar este ensayo anima a los estudiantes a participar en el aprendizaje basado en la investigación mientras que la exploración de cuestiones emergentes en ciencias ambientales y salud.
La pantalla de estrógeno de levadura (YES) es ampliamente utilizado para cuantificar ligandos que imitan el estradiol (E2 o 17β-estradiol) en una variedad de matrices, incluyendo agua, tejidos vegetales, productos de consumo y alimentos1,2,3, 4. Colectivamente, estos ligandos se llaman “Los estrógenos medioambientales (EEs).” El sí fue desarrollado originalmente como un bajo costo, alternativa en vitro en vivo pruebas como análisis de lo roedor uterotrophic5,6 y la trucha de arco iris alimentación ensayo7. El objetivo de estas pruebas es determinar si un producto contiene sustancias químicas que estimulan o bloquean mecanismos dependientes de estrógenos. Detección de EEs es crítica, ya que pueden interferir con estrógenos endógenos normales de señalización, especialmente durante el desarrollo fetal. Esta interferencia compromete salud aumentando el riesgo de obesidad, infertilidad, cáncer y pérdida cognitiva8.
A pesar de la importancia de EEs y otros interruptores endocrinos a la salud pública, disrupción endocrina no es comúnmente incluido en los programas de pregrado. Esta deficiencia en parte debido a la escasez de actividades que ilustran los principios participa al mismo tiempo accesible a estudiantes de pregrado. Además, existen varias variantes del protocolo sí9,10,11,12,13, y esta diversidad hace optimización de análisis desperdiciador de tiempo para coordinadores de laboratorio no específicamente capacitados en las técnicas pertinentes. Finalmente, sí ensayos se suelen realizar más de 1 día o 2 días consecutivos con una incubación de O/N. Este momento no es compatible con el formato de cursos de pregrado laboratorio, que suelen quedar una vez / semana durante varias horas.
En respuesta a estas necesidades, este manuscrito informa un protocolo de sí 96-bien optimizado que incluye métodos de extracción de etanol para productos de Cuidado Personal (PCP)3 y a un paso de refrigeración de 6 días para acomodar reuniones semanales de laboratorio. Etanol absoluto es un solvente orgánico versátil que puede disolver una gran variedad de solutos polares y no polares. Por otra parte, es adecuado para cursos de graduación porque es fácilmente disponible, relativamente no tóxico, asequible y miscible con agua; también se evapora fácilmente sin un equipo especial. Sin embargo, el etanol no es ideal para la extracción de disruptores endocrinos fuertemente hidrofóbicas o muchos aceites y ceras, estos dos últimos ingredientes comunes en PCP. eficiencia de extracción pobre aumenta el riesgo de resultados negativos falsos. Con esta limitación en mente, investigadores deben elegir procedimientos de extracción (p. ej., extracción de etanol o extracción en fase sólida) características de la muestra de dirección y cumplir objetivos del estudio (investigación versus instrucción de pregrado).
El sí depende recombinante Saccharomyces cerevisiae creado originalmente por el Dr. Charles Miller en la Universidad de Tulane. Véase Miller et al. (2010) para un completo mapa del plásmido ingeniería14. Levadura transformada con estos plásmidos constitutivamente expresan humano ERα nuclear o ERβ (también llamado ESR1 y ESR2, respectivamente) cuando se cultiva en medios que contienen galactosa (de ERα) o glucosa o galactosa (de ERβ). Si productos químicos estrogénicos están presentes en los medios de comunicación, se unen a los receptores, creando complejos ligando-receptor que activan la expresión de β-galactosidasa (lacZ) a un nivel proporcional a la concentración de productos químicos estrogénicos. Las células de levadura son entonces lisis para liberar el β-galactosidase acumulado. El tampón de lisis contiene ONPG o CPRG, que están divididos por β-galactosidasa para producir productos de amarillos o rojos, respectivamente. Productos colorimétricos pueden cuantificarse midiendo absorbancia con un espectrofotómetro de la placa de micropocillos. El grado de cambio de color es proporcional a la concentración de ligandos estrogénicas a que estuvo expuesta la levadura.
La elección del sustrato (CPRG o ONPG) depende de las posibilidades de absorción de fondo derivados de las muestras. Por ejemplo, extractos de plantas a menudo agregará un tono amarillo a los medios de comunicación que inflan artificialmente las medidas estrogenicity si ONPG (cuantificado a 405 nm) se utiliza como sustrato para la β-galactosidasa. Con planta de extractos, CPRG (cuantificado en 574 nm) puede ser un sustrato colorimétrico más apropiado. CPRG es más caro que el ONPG pero se utiliza en una décima la molaridad. Este artículo presenta estrogenicities de PCP extractos cuantificados utilizando ONPG y CPRG.
Cuantificación de estrogenicity de muestras ambientales mediante ERα y ERβ es un enfoque más amplio que el uso de sólo uno de estos receptores. En animales, estos receptores exhiben afinidades de Unión para ligandos estrogénicos y anti-estrogénicos15, actividades reglamentarias y distribución diferencial del tejido. Por ejemplo, fitoestrógenos vegetales típicamente enlazar ERβ más fuertemente2, considerando que los productos químicos sintéticos pueden mostrar preferencia por ERα o ERβ o pueden enlazar ambos receptores igualmente bien15. Por lo tanto, atar a receptor del uno estrógeno no predice necesariamente obligatorio a la otra.
Aunque EEs se encuentran en muchos productos de consumo (p. ej., pesticidas, detergentes, adhesivos, lubricantes, plásticos, alimentos y productos farmacéuticos), así como las plantas, los datos presentados se obtuvieron mediante una selección de PCP. PCP son convincentes, fácilmente disponible, económico y ambientalmente relevantes para estudiantes de pregrado. Los estudiantes pueden invitados a traer su PCP favorito de su casa para probar en el laboratorio. También puede buscar la base de datos profunda de la piel desarrollado por el grupo de trabajo ambiental16 para generar comparaciones basadas en la hipótesis de PCP con alta y baja puntuación de toxicidad. De esta manera, los estudiantes pueden simultáneamente habilidades avanzados de laboratorio; participar en el aprendizaje autodirigido, basado en la investigación; y temas emergentes en ciencias ambientales y salud.
El sí es un método de bajo costo para detectar ligands estrogénicas en muestras ambientales, tales como agua, alimentos, tejidos vegetales o productos de cuidado personal. Datos presentados aquí compara 2 receptores de estrógeno (ERα y ERβ), 2 soportes (ONPG y CPRG) y líneas de 2 tiempo (d 2 protocolo sin refrigeración) y Protocolo de siete días con refrigeración para medir estrogenicity en productos de cuidado personal mediante el análisis de sí. 7 d, protocolo refrigerado utilizando CPRG y levaduras expresando ERα y ERβ mejor cuantifica EEQs mientras que también siendo compatible con las limitaciones de tiempo impuestas por cursos de laboratorio de pregrado que cumplen sólo una vez / semana durante varias horas. De hecho, en comparación con el ensayo de 2 d sin refrigeración, se asoció con menor varianza el ensayo refrigerado de siete días a través de réplicas de la placa. Además, la parte lineal de la curva estándar se amplió levemente para datos recopilados usando el ensayo refrigerado. La parte lineal de la curva estándar define el rango de detección del ensayo y es la única porción de la curva estándar que puede utilizarse para interpolar muestras EEQs.
En todos sino una de las muestras en examen, EEQs con CPRG fueron menores a los cuantificados con ONPG. Con un mayor coeficiente de extinción y baja Km y Vmax, CPRG es diez veces más sensible que el ONPG17. Así, CPRG puede ser utilizado en concentraciones más bajas y puede utilizarse para detectar cantidades menores de la β-galactosidasa. Por estas razones, CPRG se prefiere generalmente sobre ONPG18,19. Sin embargo, una mayor sensibilidad de sustrato no explica los valores más bajos de la EEQ detectaron en la CPRG. Los valores más altos de la EEQ con ONPG podrían ser debido a interferencia de la matriz con el análisis, según lo observado por otros autores2,18. Pigmentos amarillos de extractos de productos de cuidado personal podrían inflar valores EEQ con ONPG. Otros han eludido este problema al incluir controles de pigmento en su diseño experimental2, un enfoque que duplica el número de placas en un experimento. Cuando interferencia de matriz puede ser problemático, CPRG puede ser un sustrato preferible para el análisis de sí, aunque es más caro y requiere tiempos de incubación más largo que el ONPG. Además, el cambio de color inducido por el clivaje del sustrato por β-galactosidasa es más dramático con CPRG, haciéndolo más fácil para los estudiantes a visualizar los resultados.
Miller et al. (2010), que la levadura utilizada en el presente Protocolo de ingeniería, señaló que la levadura que ERβ fueron más sensibles al 17β-estradiol que levadura expresión ERα, una constatación verificada por nuestros datos14x 30. Aparte de posibles matices en la construcción de plásmidos, Miller et al. (2010) no podría explicar esta diferencia en sensibilidad14. Una diferencia entre las dos construcciones de plásmido es que la expresión ERα es regulada por galactosa, mientras que ERβ expresión está regulada por glucosa o galactosa. La levadura utilizada en el ensayo sí son cultivadas en medios de la glucosa y sólo galactosa diluyendo al comienzo del ensayo. Por lo tanto, levadura expresando ERβ podría acumular más altos números de copia de proteínas del receptor antes del inicio de la prueba, de tal modo que confiere mayor sensibilidad a ligandos estrogénicas.
La menor sensibilidad de levaduras expresando ERα puede explicar las tasas más altas de la no detección de estrogenicity en muestras con ERα comparado con ERβ. Para aumentar la probabilidad muestra EEQs se detectarán, los usuarios podrían emplear métodos y disolventes de extracción diferentes o añadir mayores volúmenes de muestra a la levadura. Si se utilizan volúmenes mayores de muestra, las concentraciones de E2 normas deben ajustarse tal que el mismo volumen de muestras y estándares se puede utilizar en el ensayo. Una limitación de la adición de la muestra más es que la levadura puede tolerar solamente 6-10% de etanol, con mejor tolerancia a temperaturas de incubación de 30 y 35 ° C20. Para controlar para los efectos del etanol en levadura, los investigadores deben añadir pozos “de la levadura sólo” por triplicado para el diseño de la placa y confirmar que OD610 de estos pozos “de la levadura sólo” es comparable a OD610 de pozos de control de vehículo inmediatamente después de la adición de tampón de LacZ. Alternativamente, las muestras disueltas en etanol pueden añadirse para placas de pocillos seco y etanol evaporado apagado antes de añadir la levadura. Dimetilsulfóxido (DMSO) se utiliza también como ensayos de un solvente de la muestra en sí, pero la concentración final de trabajo de DMSO con levadura debe ser limitada a 1%12.
El ensayo sí es una herramienta de detección de gran alcance para la detección de estrogenicity en muestras ambientales. Específicamente, el sí detecta ligandos que se unen a los receptores estrogénicos nucleares que interactúan con elementos de la respuesta de estrógeno a gene expresión14. Sin embargo, sí tiene importantes limitaciones. El sí no detecta EEs que funcionan a través de mecanismos no nucleares como receptores de estrógeno de la membrana o mecanismos que involucran elementos adicionales tales como factores de transcripción activador de proteína 1 (AP-1). Por otra parte, porque la levadura no tienen la misma capacidad metabólica como células de mamífero, el sí no puede detectar ligands que requieren activación metabólica para ser estrogénico.
Además, el análisis de sí no puede fácilmente distinguir entre ligandos estrogénicos y anti-estrogenic en muestras complejas. En cambio, mide estrogenicity neto , que es el efecto de la suma de los ligandos estrogénicos y anti-estrogénicos. Para cuantificar la concentración de los antagonistas de la ER o evaluar la actividad inhibitoria de las mezclas, el ensayo puede ser modificado por incubación de levadura con el agonista estándar (17β-estradiol) y una gama de prueba muestra concentraciones12. Este proceso determina si los antagonistas en las muestras pueden disminuir la actividad de reportero inducida por el agonista y proporciona una pantalla útil para identificar la presencia de antagonistas de la ER en las muestras.
El protocolo presentado aquí puede acomodar una variedad de tipos de muestra, aunque algunas muestras pueden requerir modificaciones en los pasos de preparación de la muestra y extracción. Por ejemplo, EEQs variadas ampliamente entre réplicas de algunos productos de cuidado personal. Las muestras más variables tienden a contener las gotitas de aceite o de lo contrario no eran completamente homogéneas, lo que indica que un disolvente más lipofílico como el éter dietílico sería útil. Por otra parte, los aceites y la cera en productos de cuidado personal podrían ser excluidos mediante la extracción de las muestras con etanol al 50% en lugar de etanol 100%.Una extracción de etanol 50% también capturará más ligandos estrogénicos solubles en agua (por ejemplo, algunos pigmentos). Sin embargo, 50% de etanol se evapora más lentamente que el 100% de etanol y así puede extender el tiempo de extracción. Además, algunas muestras (por ejemplo jabones) fueron citotóxicos para levaduras, dando como resultado mediciones de densidad celular reducida (OD610). Fox et al. (2008) sugieren que dichas muestras deben ser diluidos y a analizar si las diferencias de densidad celular superan 30% en comparación con el vehículo de pozos de control12.
Si el ensayo sí es usado para fines de investigación analítica, curvas de dilución de pooles pueden probarse para determinar preventivamente adecuados volúmenes de extracto que se añade a la levadura en el paso 4.5. Por otra parte, extractos se pueden probar simultáneamente en múltiples volúmenes (p. ej., 5 μl y 20 μl extracto agregado a la levadura en el paso 4.5) o diluciones que abarcan órdenes de magnitud (por ejemplo, 0,2 μl, 2 μl y 20 μl). «Apropiados» volúmenes de extracto son los que identifican estrogenicity haciendo coincidir valores de LacZ a lo largo de la parte lineal de la curva estándar. Optimización previene problemas causados por la adición de la muestra demasiado o demasiado poco a la levadura, como citotoxicidad, falsos negativos o estrogenicity que supere la curva estándar. Como se mencionó anteriormente, los volúmenes de las muestras y estándares E2 deben ser ajustados cuando se utilizan diferentes cantidades de ligando que levadura están expuestos a un volumen constante y la concentración de etanol o en otros vehículos a través de la placa.
A pesar de la posibilidad de falsos negativos, el ensayo sí se ha identificado como una herramienta de prueba de nivel 3 para los disruptores endocrinos por Schug et al. (2013), que desarrolló un protocolo integral en niveles de disrupción endocrina (tipo)21. Para la educación universitaria, el ensayo es valioso para la enseñanza de conceptos relacionados con la disrupción endocrina, cultivo celular, atascamiento del receptor, la actividad enzimática, genética, estadística y diseño experimental. Estudiantes que usan el ensayo también practican habilidades de laboratorio fundamental y ampliamente aplicables como la dilución en serie de normas; extracción de muestras; fabricación de soluciones; construcción e interpolando curvas estándar; cálculo de concentraciones; fabricación de soluciones; demostrando una técnica estéril; cultivo de células; identificación de variables y controles; recoger, organizar y analizar datos; construir e interpretar gráficos; y el uso de equipo de laboratorio común como micropipettors y espectrofotómetros.
The authors have nothing to disclose.
Este proyecto fue financiado por la puesta en marcha fondos a TME y AMR de Louisiana Tech University y la Universidad de Furman, respectivamente. Financiación adicional fue proporcionada por una beca de adelanto Facultad de 2015 a AMR y TME de la universidades asociadas del sur, una beca de Luisiana EPSCoR Pfund de TME de la National Science Foundation y el tablero de Luisiana de regentes y un premio de viaje a TME de la Universidad del sur. Agradecemos Dr. David Eubanks (Furman) ayuda con análisis estadísticos y el Sr. Christopher Moore para “que nos da una mano” durante el rodaje.
Equipment | |||
Vortex Mixer (for single or multiple tubes) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-215-365 | Any mixer will suffice. |
Bucket centrifuge | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 75-063-839 | Any bucket centrifuge will suffice if it is capable of centrifuging conical tubes at 4000 rpm. |
Bunsen burner | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 17-012-823 | Any Bunsen burner will suffice, or an alcohol burner (Fisher Scientific 04-245-1) can be used instead. |
Incubator | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 50125590H | Any incubator will suffice if it is capable of maintaining 30 °C. |
Microplate reader | BioTek (www.biotek.com) | EPOCH2 | A different brand of plate reader will suffice if it can measure absorbance at wavelengths of 405, 574, and 610 nm. |
Gen5 microplate reader and imager software | BioTek (www.biotek.com) | GEN5 | Software required depends on make and model of plate reader; GEN5 software is intended for use with BioTek plate reader. |
Refrigerator | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 05LREEFSA | Any refrigerator will suffice if it is capable of maintaining 4 °C. |
Pipettor or PipetAid compatible with 1-10 ml serological pipets | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-681-15E | Any pipettors will suffice if they are compatible with 1- and 10-ml serological pipets. |
P10 micropipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F144562G | Any micropipettor will suffice if it is capable of dispensing 5 µl. |
P200 micropipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F144565G | Any micropipettor will suffice if it is capable of dispensing up to 200 µl. |
P300 multichannel pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FBE1200300 | Any multichannel pipettor will suffice if it is capable of dispensing 50 to 205 µl. |
Repeating pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F164001G | Must be able to deliver 100-320 µl; this pipettor is optional because a multichannel pipettor can be used instead. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Supplies | |||
Sterile 15-ml conical tubes with caps | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 05-539-801 | |
Glass scintillation vials | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 03-337-4 | |
Polystyrene 96-well, flat-bottom microplates with lid (non-sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 12565501 | |
Polypropylene 96-well, flat-bottom microplates without lid | Cole-Parmer (www.coleparmer.com) | EW-01728-81 | |
100 ml glass beakers | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-539H | Any glass beakers will suffice if they are autoclavable. |
250 ml glass Erlenmeyer flasks | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FB500250 | Any glass Erlenmeyer flasks will suffice if they are autoclavable. |
Sterile, adhesive, porous film | VWR (www.vwr.com) | 60941-086 | |
Metal forceps | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 12-000-157 | Any metal forceps will suffice. |
Reagent reservoir | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 07-200-127 | |
Filtration units (0.2 µm) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 09-761-52 | |
Squirt bottle (for ethanol) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 02-897-10 | Any laboratory squirt bottles will suffice. |
Autoclavable storage bottles | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 06-414-1D | Any autoclavable glass storage bottles will suffice. |
10 ml glass serological pipets (sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-678-27F | Any glass serological pipets will suffice. |
1 ml glass serological pipets (sterile) | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | 13-678-27C | Any glass serological pipets will suffice. |
P10 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-3810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
P200 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-8810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
P300 micropipettor tips | USA Scientific (www.usascientific.com) | 1120-9810 | Any tips will suffice if they are compatible with the micropipettor above. |
Syringe tips for repeating pipettor | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | F164150G | Only required if a repeating pipettor is used. |
Sterile petri dishes | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | FB0875712 | Any sterile petri dishes will suffice. |
Parafilm | Fisher Scientific (www.fishersci.com) | S37440 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Yeast | |||
Saccharomyces cerevisiae strains that lack the TRP1 gene product (e.g. W303a) | American Type Culture Company (ATCC) (www.ATCC.org) | MYA-151 | Recombinant yeast are also available upon request from the authors. |
Receptor/reporter plasmid for ERα | Addgene (www.addgene.org) | pRR-ERalpha-5Z (Plasmid #23061) | |
Receptor/reporter plasmid for ERβ | Addgene (www.addgene.org) | pRR-ERbeta-5Z (Plasmid #23062) | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Chemicals | |||
Difco agar | BD (www.bd.com) | 214530 | |
Dithiothreitol | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | D0632 | CAUTION: Dithiothreitol is an acute skin and eye irritant. Use appropriate personal protection equipment (gloves, fume hood, dust mask) to avoid skin and eye contact, inhalation and ingestion. |
Ortho-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | N1127 | |
Chlorophenol red-β-D-galactopyranoside | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | 10884308001 | |
Yeast nitrogen base | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | Y0626 | |
Glucose | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | G8270 | |
Galactose | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | G5388 | |
Adenine sulfate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | A9126 | |
Uracil | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | U0750 | |
Leucine | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | L8000 | |
Histidine | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | H8000 | |
17 β-Estradiol | Sigma (www.sigmaaldrich.com) MP Biomedicals | E8875-250 mg 0219456401 – 1 mg | CAUTION: Estradiol is a suspected carcinogen and reproductive toxicant. It is harmful if inhaled, swallowed, or absorbed through skin. Estradiol may cause harm to breast-fed children and fetuses. Estradiol is very toxic to aquatic life. Use appropriate personal protection (gloves, fume hood, dust mask) and avoid exposure during pregnancy and lactation. Estradiol should be disposed of as hazardous waste and not released to the environment. |
100% ethanol | Pharmco-Aaper (www.pharmcoaaper.com) | 111000200 | |
Sodium phosphate monobasic monohydrate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S9638 | |
Sodium phosphate dibasic (anhydrous) | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S0876 | |
Magnesium chloride | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | M8266 | |
Potassium chloride | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | P9333 | |
Sarkosyl (N-lauroylsarcosine sodium salt) | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | L5125 | |
Sodium carbonate | Sigma (www.sigmaaldrich.com) | S7795 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Software | |||
Excel spreadsheet software | Microsoft | Excel is convenient spreadsheet software for managing data outputs and generating .csv files for R analysis. | |
Java software (required for Appendix 1 application) | Oracle Corporation | To calculate LacZ values using the application in Appendix 1, first download free Java software (https://www.java.com/en/download/), then open the LacZ application in Appendix 1. LacZ results created by the application can be copied by pressing "control (ctrl) + c" on PC keyboards, or "command + c" on Mac keyboards. | |
JMP statistical software version 13.0.0 | SAS Institute | Appendix 2 includes directions on using JMP to fit LacZ data to a four-parameter logistic regression curve. The curve is used to interpolate test sample estradiol equivalents (EEQs), relative to the estradiol standard curve. | |
R statistical computing and graphics software | R Foundation | Free R software can be downloaded from https://www.r-project.org/. Directions and code for using R to fit LacZ data to a four-parameter logistic regression curve are given in Appendix 2. |