Cet article décrit la vidéo pipeline à haut débit qui a été mis en place avec succès pour infecter et d'analyser un grand nombre d'embryons de poisson zèbre qui fournissent un nouvel outil puissant pour les essais en enclos et la découverte de médicaments à l'aide d'un organisme entier de animaux vertébrés.
Poisson zèbre sont de plus en un outil précieux dans la phase préclinique de projections de découverte de médicaments comme un modèle animal entier avec possibilités de criblage à haut débit. Ils peuvent être utilisés pour combler l'écart entre les essais à base de cellules à des stades précoces et à la validation in vivo dans des modèles mammifères, ce qui réduit, de cette manière, le nombre de composés à l'essai en passant par les modèles beaucoup plus coûteux de rongeurs. Dans cette lumière, dans le présent manuscrit est décrit un nouveau pipeline à haut débit en utilisant le poisson zèbre comme in vivo système modèle pour l'étude de Staphylococcus epidermidis et infection de Mycobacterium marinum. Cette configuration permet la génération et l'analyse d'un grand nombre d'embryons synchrones homogène infectés. En outre, la flexibilité de la canalisation permet à l'utilisateur de mettre en œuvre facilement d'autres plates-formes pour améliorer la résolution de l'analyse en cas de besoin. La combinaison de l'ensemble poisson-zèbre avec te innovant à haut débitchnologies ouvre le domaine du dépistage des drogues et de la découverte de nouvelles possibilités, non seulement en raison de la force de l'aide d'un modèle animal entier mais aussi en raison du grand nombre de lignées transgéniques disponibles qui peuvent être utilisés pour déchiffrer le mode d'action des nouveaux composés.
À ce jour, le poisson zèbre (Danio rerio) a été établie avec succès comme un modèle efficace pour étudier une variété de maladies infectieuses 1. L'embryon de poisson zèbre offre unique dans les possibilités d'imagerie in vivo en raison de leur transparence et le grand nombre de lignes de journaliste transgéniques exprimant des protéines fluorescentes existantes. Cette puissante combinaison permet de suivre différents types de cellules immunitaires dans le temps tout en interagissant avec des agents pathogènes comme Mycobacterium marinum, le plus proche parent de M. la tuberculose 2, ou Staphylococcus epidermidis, le responsable principal de biomatériau infection associée 3-5. Différentes voies d'infection peuvent être utilisés dans embryons de poissons zèbres en fonction des besoins de l'étude 6.
L'une de ces voies d'infection est injection jaune des bactéries. Le principal avantage de cette méthode par rapport aux autres est que le jaune infectile peut être effectuée automatiquement par l'intermédiaire d'injection de robot, ce qui réduit considérablement le temps d'injection et qui permet une grande reproductibilité de l'infection 7, 8.
Des travaux antérieurs, en utilisant le poisson zèbre comme un débit élevé dans un système de modèle in vivo pour l'étude de S. epidermidis et M. infection marinum a montré pour réussir 7, 8. Ce système est capable de dépister la progression de la maladie par injection de jaune de robot d'embryons précoces et lecture en utilisant la fluorescence comme mesure de la charge bactérienne. En accord avec cette notion, cette configuration a été optimisé et mis en place un pipeline à haut débit très efficace avec le potentiel de générer un grand nombre d'embryons infectés de façon homogène et suivre la progression de l'infection pendant le temps après le traitement d'un certain nombre de composés. Avec la configuration établie, il est possible de générer jusqu'à 8.000 embryons synchrones à l'écranpour la progression de la maladie, le traitement de cette façon jusqu'à 2500 embryons par heure. Les embryons sont triées en fonction de leur charge bactérienne à l'aide d'un système automatisé, assurant groupes homogènes de larves infectées. En outre, afin de valider la configuration, les effets de référence connus pour empêcher la progression de la tuberculose chez des mammifères ont été testés sur des embryons infectés par M. souche E11 marinum ou la souche plus virulente M 9.
Cette étude décrit en détail le pipeline à haut débit qui a été mis en place pour être en mesure de générer un grand nombre d'embryons infectés et l'analyse ultérieure de la progression bactérienne au cours du développement et après traitement avec le composé.
La méthode à haut débit décrit dans le présent document fournit un pipeline efficace rapide et économique pour dépister nombre élevé d'embryons et larves de poissons avec différents types d'infections. Utilisation de la grande cuve de reproduction au lieu de réservoirs traditionnels simples ou familiales reproduction facilité le contrôle du processus de ponte et la production d'un plus grand nombre d'œufs synchrones. Avec une version améliorée du système de micro-injection automatique 7, il est possible d'injecter jusqu'à 2500 oeufs presque tous dans le même étage de la cellule à l'intérieur de 1 h. Avec ces mises à jour et l'amélioration de logiciel, il est possible d'injecter plus d'œufs qu'auparavant qui peuvent être utilisés pour effectuer de grands écrans de la drogue à la prolifération bactérienne comme à lire. Cependant, cette méthode est encore limité au jaune injection, d'autres voies d'injection, décrits par exemple par Benard et al. (2012) 6, nous l'espérons, être incorporés dans le système de micro-injection automatique dans un proche avenir.
<p class = "jove_content"> Bien que ces méthodes sont étalonnées pour le criblage de poisson zèbre, il serait utile pour les applications avec d'autres espèces de poissons ainsi. Par exemple, la carpe commune a été indiqué d'avoir des avantages pour les écrans de drogue. Comme le poisson-zèbre, ovules et embryons à un stade précoce de la carpe commune sont transparentes mais avec le principal avantage de la taille importante du frai de centaines de milliers d'œufs et de la disponibilité des lignes pures qui offrent un fond génétique plus constante 16.L'analyse de grandes quantités d'embryons infectés se fait avec le grand flux de particules à haut débit cytomètre. Cet appareil peut trier les embryons analysés en plaques à puits multiples ou une boîte de Pétri qui le rend particulièrement adapté pour tester un grand nombre de composés. Si une résolution d'image plus élevée est nécessaire, que la configuration est adaptée de manière à ce que l'écoulement des particules de grande cytomètre technologie peut être utilisée pour le pré-criblage et d'analyser ensuite les échantillons à travers un milieumettre à une résolution plus élevée. Cela peut être fait en utilisant la technologie de contrôle automatisé des vertébrés 17, 18. Ce dispositif peut recueillir automatiquement des embryons vivants ou fixes entre 2 et 7 jours après la fécondation d'une plaque multi-puits ou conteneur de vrac, l'image de 360 ° à travers un capillaire en utilisant CLSM ou microscopie stéréo et de disposer à nouveau dans deux conteneurs de vrac permettant le tri manuel des embryons sur la base sur les images microscopiques. Les améliorations futures permettront le tri de l'embryon après l'imagerie dans la plaque à plusieurs puits, rendant ainsi possible de filtrer automatiquement grand nombre d'embryons individuels au fil du temps avec CLSM. En supposant que dans les applications futures du système de technologie de contrôle automatisé des vertébrés peut également être connecté à l'écoulement de particules à grande cytomètre technologie sans la nécessité de larves de distribution avant en plaques à puits multiples, va conduire à un tri plus avancé.
Ce document décrit l'un d'établissementd optimisation d'une installation à haut débit pour étudier S. epidermidis et M. marinum infection comme un modèle pour la découverte de médicaments. Elle montre que le résultat de ces bactéries injectées dans le jaune dépend du stade de développement des œufs au moment de l'injection. Injection de M. marinum E11 à l'étape 16 à 128 de la cellule ou de la souche M à 16-64 stade cellulaire conduit au même schéma que les infections injection dans la veine caudale de 2, 6. Cependant cette configuration n'est pas limitée à la prolifération des bactéries pathogènes seulement. Il a été démontré auparavant qu'il est possible d'injecter de manière robotisée solutions contenant de l'ADN, de l'ARN ou morpholinos pour la transgenèse, sur-expression et le gène knock-down études, respectivement 13. En outre, il a été montré que cette configuration est également utile pour l'étude de la prolifération de cellules cancéreuses et de migration. Par conséquent, cette canalisation présente un procédé polyvalent pour le criblages à haut débit d'une variété de mécanismes de signal dans le contextede l'immunité innée, appliqué aux maladies infectieuses et le développement du cancer. Ces écrans peuvent être combinés à d'autres pour la découverte de médicaments, mais également à l'analyse des effets toxiques possibles des médicaments applicables identifiées.
The authors have nothing to disclose.
Nous sommes reconnaissants à Léonie de Boer et Bas Zaat (Academic Medical Centre) pour nous fournir le S. epidermidis souche O-47. Nous remercions Rico Bongaarts, Francis Smet et Angela Comas (Union Biometrica) de l'aide et des conseils à la COPAS XL et l'analyse de BioImager VAST. Nous remercions Davy de Witt, Ulrike Nehrdich, et Laura van Hulst, de gardiennage de poissons, et d'autres collègues de l'Université de Leiden aux discussions utiles. Cette recherche s'inscrit dans le cadre du projet P5.03 IBIZA du programme de l'Institut des matériaux biomédicaux, co-financé par le ministère néerlandais des Affaires économiques la recherche, et du Programme Mix (Smart NWOA_6QY9BM) du ministère néerlandais des Affaires économiques et du Le ministère néerlandais de l'Education, de la Culture et de la Science. Un soutien supplémentaire a été obtenu à partir du projet de l'UE ZF-Santé (FP7-HEALTH-2009-242048), et a été soutenue par RMJ bourse Marie Curie comme chercheur expérimenté dans l'UE initiale de formation du réseau FishForPharma (PITN-GA-2011-289209). SJR a reçu un financement de l'entreprise commune Initiative médicaments innovants vertu d'un accord de subvention n ° 115337, les ressources qui sont composés de la contribution financière du Programme de l'Union européenne septième programme-cadre (FP7/2007-2013) et les sociétés de l'EFPIA en auteurs de contribution.The aimables reconnaître davantage le soutien financier du Fonds de l'Université de Leiden (LUF) pour la robotique et de Cyttron, dans le programme des subventions Investeringen Kennisinfrastructuur Besluit, qui à son tour est soutenu financièrement par l'Organisation néerlandaise pour la recherche scientifique pour les installations d'imagerie. L'acquisition du système COPAS a été partiellement financé par la Division de la Terre et sciences de la vie (ALW) avec l'aide financière de l'Organisation néerlandaise pour la recherche scientifique (NWO, 834.10.004).
Middlebrook 7H10 agar | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 262710 | |
Middlebrook 7H9 broth | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 271310 | |
BBL Middlebrook oleic acid albumin dextrose catalase (OADC) enrichment | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 211886 | |
BBL Middlebrook albumin dextrose catalase (ADC) enrichment | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 211887 | |
LB agar | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | L5542 | Multiple suppliers |
LB broth | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | L3022 | Multiple suppliers |
Chloramphenicol | Bio-connect, Huissen, the Netherlands | 16785.03 | Multiple suppliers |
Hygromycin | Bio-connect, Huissen, the Netherlands | 25966.01 | Multiple suppliers |
Tween-80 | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | P1754 | Multiple suppliers |
Polyvinylpyrrolidone40 | Calbiochem, San Diego, California, USA | 529504 | Multiple suppliers |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate salt (Tricaine) | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | A5040 | |
Agarose | Sphaero-Q, Gorinchem, the Netherlands | S103 | Multiple suppliers |
Instant ocean sea salt | Sera Marin, Heinsberg, Germany | 5460 | |
iSPAWN | Techniplast, Buguggiate, Italy | iSPAWN | |
Automated microinjection system | Life Science Methods BV, Leiden, the Netherlands | Automated microinjection system | |
Complex Object Particle Analyzer and Sorter XL (COPAS XL) | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | COPAS XL | |
Vertebrate Automated Screening Technology BioImager (VAST BioImager) | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | VAST BioImager | |
LP Sampler | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | LP Sampler | |
Confocal laser scanning microscope | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | TCS SL | |
Injection needle 10 µm inner diameter | Qvotek, Mississauga, Canada |