Deze video artikel beschrijft de high throughput pijpleiding die is met succes tot infectie en analyseren van grote aantallen zebravis embryo's die een nieuw krachtig hulpmiddel voor beproeving en drug discovery met geheel gewerveld organisme.
Zebravis worden steeds een waardevol instrument in de preklinische fase van drug discovery screenings als geheel diermodel met high throughput screening mogelijkheden. Ze kunnen worden gebruikt om de afstand tussen celgebaseerde proeven eerdere fasen en in vivo validatie overbruggen zoogdiermodellen, verminderen, aldus, het aantal verbindingen dat door het testen op de veel duurdere diermodellen. In dit licht in dit manuscript wordt beschreven een nieuwe high throughput pijpleiding zebravis als in vivo model voor de studie van Staphylococcus epidermidis en Mycobacterium marinum infectie. Daarmee kan het genereren en analyseren van grote aantallen synchrone embryo homogeen geïnfecteerd. Bovendien is de flexibiliteit van de leiding kan de gebruiker gemakkelijk te implementeren andere platformen om de resolutie van de analyse te verbeteren wanneer nodig. De combinatie van de zebravis, samen met innovatieve high throughput technologies opent het veld testen van geneesmiddelen en ontdekking van nieuwe mogelijkheden niet alleen vanwege de sterkte van het gebruik geheel diermodel maar ook vanwege het grote aantal transgene lijnen die kunnen worden gebruikt om het werkingsmechanisme van nieuwe samenstellingen ontcijferen.
De zebravis heden (Danio rerio) werd met succes een efficiënt model van verschillende infectieziekten 1 bestuderen. De zebravis embryo biedt uniek in vivo beeldvorming mogelijkheden vanwege hun transparantie en het grote aantal bestaande transgene reporter lijnen uiten van fluorescerende eiwitten. Deze krachtige combinatie maakt het mogelijk verschillende immuunceltypen volgen in de tijd tijdens de interactie met pathogenen, zoals Mycobacterium marinum, de naaste verwant van M. tuberculose 2 of Staphylococcus epidermidis, de belangrijkste veroorzaker van biomateriaal geassocieerde infectie 3-5. Verschillende routes van infectie kan worden gebruikt in zebravis embryo afhankelijk van het doel van het onderzoek 6.
Een van deze infectie routes dooier injectie van de bacteriën. Het belangrijkste voordeel van deze methode ten opzichte van de anderen is dat dooier infectiop automatisch via robot injectie worden uitgevoerd, omdat er minder injectietijd en waardoor hoge reproduceerbaarheid van de infectie 7, 8.
Contract, met de zebravis als hoge doorvoer in vivo model voor de studie van S. epidermidis en M. marinum infectie toonden de succesvolle 7, 8 te zijn. Dit systeem is in staat om te screenen op ziekteprogressie via robotachtige dooier injectie van vroege embryo's en met behulp van fluorescentie uitlezing als maat voor de bacteriële verontreiniging. In overeenstemming met deze gedachte is deze opstelling geoptimaliseerd en is een zeer efficiënte high throughput leiding met de mogelijkheid om grote aantallen homogeen geïnfecteerde embryo genereren en bijhouden van de progressie van de infectie in de tijd na behandeling met verschillende verbindingen. Met de vastgestelde opstelling is het mogelijk genereren tot 8000 synchrone embryo screenenziekteprogressie, verwerking op deze manier tot 2500 embryo's per uur. Embryo's worden gesorteerd op basis van hun bacteriële verontreiniging een geautomatiseerd systeem, zodat homogene groepen geïnfecteerde larven. Teneinde voorts de installatie valideren effecten verwijzing bekende tuberculose progressie bij zoogdieren voorkomen getest op embryo's geïnfecteerd met M. marinum E11 stam of de meer virulente stam M 9.
Deze studie beschrijft in detail de high throughput pijpleiding deze bestaat kunnen grote aantallen geïnfecteerde embryo en de daaropvolgende analyse van de bacteriële progressie tijdens de ontwikkeling en na behandeling met verbinding genereren.
De in dit document beschreven high throughput methode biedt een snelle en kosteneffectieve pijpleiding naar grote aantal vissen embryo's en larven screenen met verschillende soorten infecties. Met behulp van de grote fokkerij vaartuig in plaats van traditionele single of familie kweekbakken vergemakkelijkt de controle van de paai-proces en het genereren van een groter aantal synchrone eieren. Met een verbeterde versie van de geautomatiseerde micro-injectiesysteem 7, is het mogelijk te injecteren tot 2500 eieren bijna allemaal in dezelfde cel stadium binnen 1 uur. Met deze updates en verbeterde software is het mogelijk om meer eieren dan voorheen mogelijk was die kan worden gebruikt om grote drugschermen voeren met bacteriële proliferatie als uitgelezen injecteren. Maar deze methode is nog steeds beperkt tot de injectie, andere injectie routes bijvoorbeeld beschreven door Benard et al. dooier. (2012) 6, zal hopelijk in de geautomatiseerde micro-injectie systeem worden opgenomen in de nabije toekomst.
<p class = "jove_content"> Hoewel deze methoden worden vergeleken voor het screenen van de zebravis, zou het nuttig zijn voor toepassingen met andere vissoorten als goed. Zo heeft de karper is aangegeven om voordelen voor drug-schermen. Zoals zebravis, eieren en jonge embryo's van karper zijn transparant, maar met het belangrijkste voordeel van de grote kuit omvang van honderdduizenden eieren en de beschikbaarheid van inteelt lijnen die een meer constante genetische achtergrond 16 bieden.De analyse van grote hoeveelheden van geïnfecteerde embryo gebeurt met hoge doorvoer grote deeltjes flowcytometer. Dit apparaat kan sorteren geanalyseerd embryo's in multi-well platen of een petrischaal waardoor het bijzonder geschikt voor het testen van grote aantallen verbindingen. Indien een hogere beeldresolutie nodig dan de installatie is aangepast zodanig dat de grote deeltjes flowcytometer technologie kan worden gebruikt voor pre-screening en vervolgens analyseren van de monsters op een mediumzetten met een hogere resolutie. Dit kan gedaan worden met behulp van de gewervelde Automated Screening Technology 17, 18. Dit apparaat kan automatisch verzamelen live-of vaste embryo's tussen 2 en 7 dagen na de bevruchting van een multi-well plaat of bulkgoederen, van het 360 ° door een capillaire behulp CLSM of stereo-microscopie en gooi opnieuw in 2 bulkcontainers waardoor handmatig sorteren van de embryo's op basis de microscopische beelden. Toekomstige verbeteringen het sorteren van het embryo na de beeldvorming in de multi well plaat mogelijk, waardoor het dus mogelijk om automatisch groot aantal individuele embryo scherm tijd met CLSM. Ervan uitgaande dat toekomstige toepassingen de gewervelde Automatische Screening technologie kan ook worden aangesloten op de grote deeltjes flowcytometer technologie zonder voorafgaande afgifte larven in multi putjes, zal leiden tot een meer geavanceerde sortering.
Dit document beschrijft de totstandkoming van eend optimalisatie van een high throughput setup om S. studeren epidermidis en M. marinum infectie als model voor drug discovery. Het toont aan dat de resultaten van deze bacteriën geïnjecteerd in de dooier afhankelijk van het ontwikkelingsstadium van de eieren op het moment van injectie. Het injecteren van M. marinum E11 bij 16-128 cel podium of de M spanning bij 16-64 cel stadium leidt tot dezelfde infectie patroon als staartveine injectie 2, 6. Deze opstelling is echter niet beperkt tot de verspreiding van enige bacteriële pathogenen. Het is eerder aangetoond dat het mogelijk is om een robot te injecteren oplossingen die DNA, RNA of morpholinos voor transgenese, over-expressie en gen knock-down studies, respectievelijk 13. Verder werd aangetoond dat deze opstelling is ook nuttig voor het bestuderen van kanker celproliferatie en migratie. Daarom is deze pijpleiding presenteert een veelzijdige werkwijze voor high throughput screens van verschillende signaal mechanismen in de contextvan aangeboren immuniteit, toegepast infectieziekten en de ontwikkeling van kanker. Deze schermen kunnen worden gecombineerd met anderen geneesmiddel ontdekking maar ook analyse van mogelijke toxische effecten van geïdentificeerde toepassing drugs.
The authors have nothing to disclose.
We zijn dankbaar voor Leonie de Boer en Bas Zaat (Academisch Medisch Centrum) voor het verstrekken van ons met de S. epidermidis O-47 stam. Wij danken Rico Bongaarts, Francis Smet en Angela Comas (Union Biometrica) voor hulp en advies bij de COPAS XL en VAST BioImager analyse. Wij danken Davy de Witt, Ulrike Nehrdich en Laura van Hulst voor vissen conciërges, en andere collega's van de Universiteit Leiden voor nuttige discussies. Dit onderzoek maakt deel uit van het Project P5.03 IBIZA van het onderzoeksprogramma van het BioMedical Materials instituut, mede gefinancierd door het Nederlandse Ministerie van Economische Zaken, en van de Smart Mix-programma (NWOA_6QY9BM) van Nederland Ministerie van Economische Zaken en van De Nederland Ministerie van Onderwijs, Cultuur en Wetenschap. Extra steun werd verkregen van het EU-project ZF-Health (Gezondheid FP7-2009-242048), en RMJ werd ondersteund door Marie Curie-beurs als voor ervaren onderzoekers in de EU Initial Training Network FishForPharma (PITN-GA-2011-289209). SJR ontving gelden van het Innovative Medicines Initiative gemeenschappelijke onderneming onder subsidieovereenkomst nr. 115.337, middelen van die zijn samengesteld uit de financiële bijdrage van het zevende kaderprogramma van de Europese Unie (FP7/2007-2013) en EFPIA bedrijven in natura contribution.The auteurs erkent verder financiële steun van het Leids Universiteits Fonds (LUF) voor robotica en uit Cyttron, in het Besluit Subsidies Investeringen Kennisinfrastructuur programma, dat op zijn beurt wordt financieel ondersteund door de Nederland Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek voor imaging faciliteiten. De COPAS systeem overname werd gedeeltelijk ondersteund door het gebied Aard-en Levenswetenschappen (ALW) met financiële steun van de Nederland Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO, 834.10.004).
Middlebrook 7H10 agar | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 262710 | |
Middlebrook 7H9 broth | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 271310 | |
BBL Middlebrook oleic acid albumin dextrose catalase (OADC) enrichment | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 211886 | |
BBL Middlebrook albumin dextrose catalase (ADC) enrichment | BD Bioscience, Franklin Lakes, New Jersey, USA | 211887 | |
LB agar | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | L5542 | Multiple suppliers |
LB broth | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | L3022 | Multiple suppliers |
Chloramphenicol | Bio-connect, Huissen, the Netherlands | 16785.03 | Multiple suppliers |
Hygromycin | Bio-connect, Huissen, the Netherlands | 25966.01 | Multiple suppliers |
Tween-80 | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | P1754 | Multiple suppliers |
Polyvinylpyrrolidone40 | Calbiochem, San Diego, California, USA | 529504 | Multiple suppliers |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate salt (Tricaine) | Sigma-Aldrich, Saint Louis, Missouri, USA | A5040 | |
Agarose | Sphaero-Q, Gorinchem, the Netherlands | S103 | Multiple suppliers |
Instant ocean sea salt | Sera Marin, Heinsberg, Germany | 5460 | |
iSPAWN | Techniplast, Buguggiate, Italy | iSPAWN | |
Automated microinjection system | Life Science Methods BV, Leiden, the Netherlands | Automated microinjection system | |
Complex Object Particle Analyzer and Sorter XL (COPAS XL) | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | COPAS XL | |
Vertebrate Automated Screening Technology BioImager (VAST BioImager) | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | VAST BioImager | |
LP Sampler | Union BioMetrica Inc., Holliston, Massachusetts, USA | LP Sampler | |
Confocal laser scanning microscope | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | TCS SL | |
Injection needle 10 µm inner diameter | Qvotek, Mississauga, Canada |