Wir beschreiben ein Verfahren zum Verfolgen der endomembrane Bruch hervorgerufen durch die intrazelluläre Bakterien<em> Shigella flexneri<em></em</em> Und<em<em><em> Mycobacterium tuberculosis</em></em</em> Auf Wirtszelle Invasion. Unsere Assay nutzt CCF4 FRET ein Host zytoplasmatischen Sonde in lebenden oder fixierten Zellen. Dieser Reporter abgebaut wird durch ein Enzym-Aktivität, die auf der bakteriellen Oberfläche.
Shigella flexneri sind pathogene Bakterien, die Wirtszellen Eingehen einer endozytischen Vakuole eindringen. Anschließend kann der Bruch dieser Membran umschlossenen Kammer Bakterien im Cytosol zu bewegen, vermehren und weiter einzudringen Nachbarzellen. Mycobacterium tuberculosis durch Immunzellen phagozytiert, und vor kurzem zum Bruch phagosomalen Membran in Makrophagen gezeigt. Wir entwickelten einen robusten Assay zur Verfolgung phagosomalen Membranzerstörung nach Wirtszelle Eintrag von Shigella flexneri oder Mycobacterium tuberculosis. Der Ansatz nutzt CCF4 ein FRET Reporter empfindlich auf β-Lactamase, die in das Cytosol der Wirtszelle ausgleicht. Beim Eindringen von Wirtszellen, die durch bakterielle Pathogene, bleibt die Sonde intakt, solange die Bakterien in der Membran-Kompartimente befinden. Nach Unterbrechung der Vakuole, β-Lactamase-Aktivität auf der Oberfläche der intrazellulären Erregers spaltet CCF4 sofort führenING zu einem Verlust von FRET-Signals und der Umstellung seiner Emissionsspektrum. Diese robuste ratiometrischen Assay liefert genaue Informationen über den Zeitpunkt der Vakuole Bruch durch die eindringenden Bakterien induziert, und es kann zu automatisierten Mikroskopie und Bildverarbeitung durch spezialisierte Algorithmen für die Erkennung der Signale der Emission gekoppelt werden FRET-Donor und Akzeptor. Darüber hinaus ermöglicht es die Untersuchung der Dynamik der Vakuole Störungen, hervorgerufen durch intrazelluläre Bakterien in Echtzeit in einzelne Zellen. Schließlich ist es perfekt für das Hochdurchsatz-Analyse mit einer räumlich-zeitlichen Auflösung als bisherige Methoden geeignet. Hier bieten wir die experimentellen Details beispielhafter Protokolle für die CCF4 vacuolar Bruch Assay auf HeLa-Zellen und THP-1 Makrophagen für Zeitraffer-Experimente oder Endpunkte Experimente mit Shigella flexneri sowie mehrere Mykobakterienstämme wie Mycobacterium marinum, Mycobacterium bovis, und Mycobacterium tuberculosis.
Zahlreiche bakterielle Krankheitserreger sind in Membran-Kompartimente von eukaryotischen Zellen während ihrer Verlauf der Infektion verinnerlicht. Eintritt in die Zelle erfolgt entweder durch Phagozytose durch spezialisierte Wirtszellen, wie es der Fall für Mycobacterium tuberculosis, die von Makrophagen aufgenommen werden, oder die Erreger aktiv induzieren ihre Aufnahme in der Regel nicht Fresszellen. Bei der induzierten Aufnahme, beispielsweise zum Shigella flexneri, spritzt das Pathogen Effektorproteinen in den Wirt Cytosol, die unter anderem die Zellfunktionen streng reguliert endomembrane Sortiermaschinen was bakteriellen Lokalisierung innerhalb einer Endosomen 1,2 entführen. Anschließend stört Shigella das umschließende Membran führt zu vacuolar Bruch und cytosolischen Zugang des Erregers stören Wirtmembran Menschenhandel und die Vermeidung Lieferung an den Lysosomen. In jüngerer Zeit hat phagolysosomale Bruch auch als Infektion str gefundenategy von Mycobacterium tuberculosis, dass ein Erreger für eine lange Zeit, um ausschließlich innerhalb eines membrangebundenen Kompartiment 3,17 lokalisiert gedacht wurde.
Um die Dynamik der subzellulären Membran Menschenhandel invasiver Krankheitserreger zu untersuchen, haben große Verbesserungen seit der Transmissions-Elektronenmikroskopie (TEM) basiert Studien der späten 1980er Jahre 4,5 erreicht worden. Zum Beispiel, Fluoreszenzmikroskopie Methoden unter Verwendung von Farbstoffen, nahm Antikörper gegen bakterielle Oberfläche Komponenten oder Marker für die Co-Lokalisation mit subzellulären Kompartimenten über 6,7. Doch sie immer noch nicht erhalten genaue raumzeitliche Auflösung und Robustheit vacuolar Bruch durch bakterielle Erreger quantitativ zu messen.
Diese Hürde wurde mit einem Test auf der Grundlage der Cephalosporin CCF4-AM FRET abgeleitet Reporter, die zum ersten Mal verwendet wurde, um die Genexpression studieren 8 angesprochen. Dann wurde sie in Zusammenhang mit der verwendeten infection Biologie zu untersuchen Effektor-Sekretion und um die Aufnahme von Neisseria in Wirtszellen 9,10,11 folgen. Wir entwickelten einen Test unter Ausnutzung dieser Reporter für das Studium vacuolar Bruch durch Shigella flexneri 12 und Mycobacterium tuberculosis 17 induziert. Das Prinzip unserer Methode ist in Abbildung 1 beschrieben mit Shigella flexneri. Zuerst werden Wirtszellen mit dem FRET CCF4-AM Substrat, das innerhalb des Zytoplasmas nach Abspaltung der Uhr Estereinheiten eingefangen geladen. Dann werden die Zellen mit Shigella flexneri infiziert. β-Lactamase, die auf der Oberfläche der Bakterien kann zur Spaltung des Substrats CCF4 sobald vacuolar Bruch auftritt. Dies führt zu einem Verlust des FRET-Signals Umschalten des Emissionsmaximum von 535 nm bis 450 nm bei Anregung von der Probe bei 405 nm. Die Quotientenmeßschaltung der 450/535 nm Intensitäten hebt vacuolar Integrität: niedrige Verhältnisse widerspiegeln Membran-engeschlossenen oder extrazellulären Bakterien während hohe Verhältnisse widerspiegeln Kontakt zwischen den Bakterien und dem Host Cytosol. Wir berichten auch über eine Anpassung dieser Methode zur Untersuchung phagosomalen Bruch von Mycobacterium tuberculosis in THP-1 Makrophagen induziert. Die experimentellen Prinzipien bleiben die gleichen, obwohl die Reihenfolge umgekehrt, CCF4-AM Belastung erst nach bakterielle Infektion angewendet wird.
Somit kann durch quantitative ratiometrische Fluoreszenzmessungen an der Ebene einer einzelnen Zelle, kann die Vakuole Bruch Shigella flexneri in Echtzeit und in festen Proben aus verschiedenen Zelltypen 12,13,14 verfolgt werden. Darüber hinaus kann dieses Verfahren eine Reihe von anderen invasiven Krankheitserreger wie in dieser Studie mit Mycobacterium bovis und Mycobacterium tuberculosis gezeigt angepasst werden. Schließlich ermöglicht die Miniaturisierung der Protokoll mit 96 Vertiefungen (oder 384-Well-) Formate Screening von zahlreichen Bedingungen bei hohem Durchsatz.
Die CCF4-AM/β-lactamase Assay ist eine einfache Methode, um Störungen durch intrazelluläre vacuolar Shigella flexneri und Mykobakterien in verschiedenen Zelltypen induziert verfolgen. Es nutzt eine Lactamase empfindlich zytoplasmatischen FRET Reporter, die von einem aktiven Enzym auf der Oberfläche der Bakterien gespalten wird.
Verlust des CCF4-AM Substrat kann leicht durch Zugabe von Probenecid zu allen Lösungen nach dem Laden des Substrats vermieden werden. Wie gezeigt, kann der Test mehrere Zelltypen (Epithelzellen Phagozyten) und Formate (96 Vertiefungen, 35 mm Petrischalen mit Glasboden, 6/12/24 Well-Platten) angepasst werden. Für die Verwendung der 6/12/24 Well-Platte werden sterile Deckgläser am Boden jeder Vertiefung vor der Aussaat der Zellen verteilt. Am Ende des Versuches werden die Deckgläser auf Objektträger in Montage-Medium überführt, wie zum Beispiel Gold-Verlängern Antifade Reagent (Invitrogen). Auf diese Weise wird das Signal über einen längeren Zeitraum stabil nach dem Testim Vergleich zu den Vertiefungen 96 in dem Format Proben in PBS nach Fixierung erhalten bleiben. Die hohen Kosten der CCF4-AM Substrat sollte berücksichtigt vor der Bestimmung des Volumens der Probe zu entnehmen. Das ist, warum wir Verkleinern sind zu empfehlen. Experimente sind teurer in 6/12/24 Well-Format, aber die Signale sind seit Tagen stabil. Im Gegenteil, sind Versuche billiger in der 96-Well-Format, aber sind die Proben am Tag des Experiments analysiert werden. Bemerkenswert ist, daß Live-Experimente auch an der 96-Well oder 384-Well-Format durchgeführt werden. Dies ermöglicht die Durchführung Live-Experiment mit Dutzenden von Bedingungen zur gleichen Zeit (Bakterienmutanten, MOI, Plasmid oder siRNA-Transfektion, Chemikalien usw.) mit einer Anzahl von Positionen pro Vertiefung. Obwohl für Shigella flexneri geeignet, markieren wir, dass "echte" Echtzeit oder Zeitraffer-Experimente sind nicht für Mykobakterien Studien möglich, da die Infektion Zyklus übersteigt messbaren Konzentrationen von CCF4, die im Cytosol zurückgehalten werden kann. FürAus diesem Grund ist die CCF4-AM Substrat auf Zellen angewendet erst nach Einfall erreicht wird.
Bei MetaMorph Software für die Erfassung und Analyse verwendet wird, empfehlen wir die Verwendung des Moduls "Bildschirm Übernahme", die den Erwerb eines ganzen 96/384 Well-Platte mit einer bestimmten Anzahl von Bildern pro Vertiefung ermöglicht. Ferner sind die Module "Beurteilung Bildschirm Daten" können (i) die Visualisierung der Stickbild Mosaik von jeweils gut für jeden Kanal zur gleichen Zeit auf einem großen "Plakat" und (ii) eine spezielle Looping Algorithmus zur Messung der Intensitäten in der 535 und die 450 nm-Kanälen. Auch wenn wir in der Lage gewesen zu vacuolar Bruch durch einzelne Bakterien mit Zeitraffer-Mikroskopie zu messen, möchten wir darauf hinweisen, dass die enzymatische Aktivität auf der Oberfläche der einzelnen Bakterien Rendering variiert es schwierig, genau zu korrelieren Anzahl der intrazellulären Bakterien und Wirksamkeit der Vakuole Bruch.
Aufgrund der Robustheit des Assays ist es für h geeignetoch Durchsatz nähert sich in 96 oder 384 Well Format. Wir haben auch erfolgreich dieses Protokoll für die FACS-Analyse, um die Infektion von Zellen in Suspension 16 studieren angepasst. Der Assay kann auch zur Untersuchung anderer Bakterien oder Träger präsentiert Lactamase auf ihrer Oberfläche, die zu einer Vielzahl von Anwendungen verwendet werden. Zum Beispiel kann dieser Ansatz verwendet werden, um vacuolar Bruch durch andere Erreger wie β-Lactamase exprimieren, Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes und Salmonella typhimurium 12 induziert untersuchen. Da Listeria monocytogenes hat einen kurzen Zyklus Infektion vergleichbar mit Shigella flexneri sind Zeitraffer-Experimente möglich. Im Gegensatz dazu, weil Legionella pneumophila und Salmonella typhimurium Display lange Zyklen Infektion, empfehlen wir Ihnen Endpunkt Experimente durchzuführen.
Die Vielfalt der möglichen Anwendungen macht das CCF4-AM/β-lactamase Assay eininteressant fluorometrische Verfahren zur Verfolgung vacuolar Bruch durch intrazelluläre Erreger in fixierten Proben oder in Echtzeit induziert.
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde von der Agence Nationale pour la Recherche und durch den European Research Council finanziert.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
LiveBlazer FRET-B/G Loading Kit (CCF4-AM) | Invitrogen | K1089 | Protect from light, stock in – 80 ° aliquots |
Draq5 | Biostatus | DR50050 | |
Poly-L-lysine | Sigma | P9155 | |
μCLEAR-PLATE, BLACK, 96 well | Greiner Bio-One | 655090 | |
35 mm glass bottom dishes | MatTek corp. | P35G-1.5-10-C | |
Probenecid | Sigma | P8761 | |
β-lactamase | Sigma | P0389 |