Si descrive un metodo per l'inseguimento della rottura endomembrane suscitato dai batteri intracellulari<em> Shigella flexneri<em></em</em> E<em<em><em> Mycobacterium tuberculosis</em></em</em> Su di invasione della cellula ospite. La nostra analisi si avvale di CCF4, un host citoplasmatica sonda FRET in cellule vive o fisso. Questo reporter è degradata da una attività dell'enzima presente sulla superficie batterica.
Shigella flexneri sono batteri patogeni che invadono le cellule ospiti che entrano in un vacuolo endocitico. Successivamente, la rottura di questo compartimento di membrana-incluso permette ai batteri di muoversi all'interno del citoplasma, proliferare e invadere ulteriormente le cellule vicine. Mycobacterium tuberculosis viene fagocitato da cellule del sistema immunitario, ed è stato recentemente dimostrato che la rottura della membrana phagosomal nei macrofagi. Abbiamo sviluppato un test affidabile per il monitoraggio phagosomal interruzione della membrana dopo l'entrata della cellula ospite di Shigella flexneri o Mycobacterium tuberculosis. L'approccio fa uso di CCF4, un FRET giornalista sensibile alla β-lattamasi che equilibra nel citosol delle cellule ospiti. Upon invasione delle cellule ospiti da batteri patogeni, la sonda rimane intatto finché i batteri risiedono in compartimenti membrana chiusi. Dopo interruzione del vacuolo, l'attività β-lattamasi sulla superficie dei patogeni intracellulari fende CCF4 istantaneamente portarerelativa ad una perdita di segnale FRET e della commutazione suo spettro di emissione. Questo robusto saggio raziometrica produce informazioni accurate sulla tempistica di rottura vacuolare indotta dai batteri invasori, e può essere accoppiata alla microscopia automatizzata ed elaborazione immagini con algoritmi specializzati per la rilevazione dei segnali di emissione FRET donatore e accettore. Inoltre, permette investigare le dinamiche di disgregazione vacuolare provocata da batteri intracellulari in tempo reale in cellule singole. Infine, è perfettamente adatto per l'analisi ad alta produttività con una risoluzione spazio-temporale superiore a metodi precedenti. Qui, forniamo i dettagli sperimentali di protocolli di esemplari per il vacuolare saggio CCF4 rottura su cellule HeLa e THP-1 dai macrofagi per esperimenti di time-lapse o finali esperimenti usando Shigella flexneri e più ceppi di micobatteri come il Mycobacterium marinum, Mycobacterium bovis, e Mycobacterium tuberculosis.
Numerosi agenti patogeni batterici sono internalizzati in compartimenti di membrana recintato di cellule eucariotiche durante il loro corso di infezione. Immissione di cella avviene tramite fagocitosi di cellule ospiti specializzate, come è il caso per Mycobacterium tuberculosis che vengono ingeriti dai macrofagi, o gli agenti patogeni inducono attivamente il loro assorbimento nelle cellule tipicamente non fagocitiche. Nel caso di assorbimento indotto, per esempio per Shigella flexneri, il patogeno inietta proteine effettrici nel citosol host che dirottare tra le altre funzioni cellulari del macchinario smistamento endomembrane strettamente regolata conseguente localizzazione batterica all'interno di un compartimento 1,2 endosomiale. Successivamente, Shigella sconvolge la membrana che racchiude porta alla rottura vacuolare e accesso citosolica del patogeno interferire con il traffico di membrana ospitante ed evitare la consegna al lisosoma. Più di recente, la rottura fagolisosomale è stata trovata anche come infezione strategy utilizzati dal Mycobacterium tuberculosis, un agente patogeno che è stato pensato per un lungo tempo per essere localizzati esclusivamente all'interno di un compartimento di membrana 3,17.
Per studiare la dinamica del traffico di membrana subcellulare di agenti patogeni invasivi, grandi miglioramenti sono stati compiuti dopo la microscopia elettronica a trasmissione (TEM) studi alla fine del 1980 4,5 base. Per esempio, i metodi basati microscopia a fluorescenza con coloranti, anticorpi contro i componenti della superficie batterica, o marcatori per la co-localizzazione con compartimenti subcellulari ha assunto 6,7. Tuttavia, ancora non diano precise risoluzione spazio-temporale e la robustezza per misurare la rottura vacuolare da batteri patogeni quantitativamente.
Questo ostacolo è stato affrontato con un metodo basato sul derivato CCF4-AM FRET giornalista cefalosporina che è stato prima utilizzato per studiare l'espressione genica 8. Poi, è stato utilizzato nel contesto di infbiologia ezione di indagare secrezione effettrici e di seguire l'assorbimento di Neisseria nelle cellule ospiti 9,10,11. Abbiamo sviluppato un saggio approfittando di questo reporter per lo studio di rottura vacuolare indotto da Shigella flexneri 12 e Mycobacterium tuberculosis 17. Il principio del nostro metodo è descritto in Figura 1 utilizzando Shigella flexneri. In primo luogo, le cellule ospiti vengono caricati con il FRET substrato CCF4-AM che viene intrappolato all'interno del citoplasma dopo fendendo largo delle frazioni AM estere. Successivamente, le cellule sono infettate con Shigella flexneri. β-lattamasi presente sulla superficie dei batteri è in grado di scindere il substrato CCF4 appena si verifica la rottura vacuolare. Questo porta ad una perdita di FRET segnale di commutazione del picco di emissione da 535 nm a 450 nm su di eccitazione della sonda a 405 nm. La misura ratiometrica dei 450/535 nm intensità evidenzia integrità vacuolare: bassi rapporti riflettono membrana-enbatteri chiusi o extracellulare, mentre alti rapporti riflettono il contatto tra i batteri e il citosol host. Segnaliamo anche un adattamento di questo metodo per studiare la rottura phagosomal indotta da Mycobacterium tuberculosis in THP-1 macrofagi. I principi sperimentali rimangono gli stessi anche se la sequenza è invertita, CCF4-AM carico è applicato solo dopo infezione batterica.
Così, da misure di fluorescenza raziometrici quantitativi a livello di singola cellula, la rottura vacuolare di Shigella flexneri possono essere monitorati in tempo reale e in campioni fissi da diversi tipi cellulari 12,13,14. Inoltre, questo metodo può essere adattato ad una serie di altri patogeni invasivi come mostrato in questo studio utilizzando Mycobacterium bovis e Mycobacterium tuberculosis. Infine, la miniaturizzazione del nostro protocollo a 96 bene (o 384 anche) formati consente lo screening di numerose condizioni a elevato throughput.
Il saggio CCF4-AM/β-lactamase è un metodo semplice per rintracciare perturbazione vacuolare intracellulare indotto da Shigella flexneri e micobatteri in diversi tipi cellulari. Si fa uso di una lattamasi sensibili citoplasmatica FRET reporter che viene scisso da un enzima attivo sulla superficie dei batteri.
Perdita del substrato CCF4-AM può essere facilmente evitato aggiungendo probenecid a tutte le soluzioni dopo il caricamento del substrato. Come dimostrato, il dosaggio può essere adattato a diversi tipi di cellule (cellule epiteliali, cellule fagocitarie) e formati (ben 96, 35 millimetri di vetro piatti peggiori, 6/12/24 piastre a pozzetti). Per l'uso della piastra ben 6/12/24, coprioggetto sterili sono distribuiti sul fondo di ciascun pozzetto prima della semina delle cellule. Alla fine dell'esperimento, coprioggetto vengono trasferiti su vetrini in mezzo di montaggio, come Prolong Oro Antifade Reagent (Invitrogen). Questo modo il segnale è stabile per periodi di tempo più lunghi dopo il dosaggiorispetto al formato a 96 pozzetti in cui i campioni sono conservati in PBS dopo la fissazione. L'elevato costo del substrato CCF4-AM dovrebbe essere preso in considerazione prima di determinare il volume del campione. Questo è il motivo per cui si consiglia di scalare verso il basso. Gli esperimenti sono più costosi in formato ben 6/12/24 ma i segnali sono stabili per giorni. Al contrario, gli esperimenti sono più economici nel formato ben 96, ma i campioni devono essere analizzati il giorno dell'esperimento. È interessante notare che gli esperimenti dal vivo possono essere eseguite anche a 96 o formato ben 384. Questo permette di eseguire esperimento vivo utilizzando dozzine di condizioni contemporaneamente (batteri mutanti, MOI, trasfezione plasmide o siRNA, sostanze chimiche ecc) con numeri di posizioni per pozzetto. Anche adatto per Shigella flexneri, si evidenzia che "vero" tempo reale o esperimenti di time-lapse non sono fattibili per gli studi di micobatteri in quanto il ciclo di infezione supera concentrazioni misurabili di CCF4 che possono essere conservati nel citosol. PerPertanto, il substrato CCF4-AM è applicato su cellule solo dopo invasione è raggiunto.
Nel caso in cui viene utilizzato il software MetaMorph per l'acquisizione e l'analisi, si consiglia di utilizzare il modulo "acquisizione schermo" che permette l'acquisizione di un intero 96/384 pozzetti con un determinato numero di immagini per bene. Inoltre, i dati di schermata del modulo "recensione" permette (i) visualizzando l'immagine cucita mosaico di ogni pozzetto per qualsiasi canale contemporaneamente su un grande "poster" e (ii) il ciclo di un algoritmo specializzato per misurare le intensità nel 535 e i 450 canali nm. Anche se, siamo stati in grado di misurare la rottura vacuolare da batteri singoli usando la microscopia time-lapse, vorremmo mettere in guardia che l'attività enzimatica sulla superficie dei singoli batteri varia rendendolo difficile da correlare con precisione il numero di batteri intracellulari e l'efficacia delle vacuolare rottura.
Data la robustezza del test, esso è adatto per hil throughput igh avvicina a 96 o 384 formati pure. Inoltre abbiamo adattato con successo questo protocollo per l'analisi FACS per studiare l'infezione di cellule in sospensione 16. Il saggio può essere utilizzato anche per la ricerca di altri batteri o di vettori lattamasi che presentano sulla loro superficie, portando ad una vasta gamma di applicazioni. Ad esempio, questo approccio può essere utilizzato per studiare rottura vacuolare indotta da altri agenti patogeni come β-lattamasi esprimendo Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes o Salmonella typhimurium 12. Dal momento che la Listeria monocytogenes è un breve ciclo di infezione paragonabili a Shigella flexneri, esperimenti di time-lapse sono possibili. Al contrario, perché Legionella pneumophila e Salmonella typhimurium cicli di infezione lunghi di visualizzazione, si consiglia di effettuare esperimenti di punto finale.
La varietà di applicazioni possibili consente un dosaggio CCF4-AM/β-lactamaseinteressante metodo fluorimetrico per il monitoraggio rottura vacuolare indotta da patogeni intracellulari in campioni fissi o in tempo reale.
The authors have nothing to disclose.
Questo lavoro è stato finanziato dalla Agence Nationale pour la Recherche e dal Consiglio europeo della ricerca.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
LiveBlazer FRET-B/G Loading Kit (CCF4-AM) | Invitrogen | K1089 | Protect from light, stock in – 80 ° aliquots |
Draq5 | Biostatus | DR50050 | |
Poly-L-lysine | Sigma | P9155 | |
μCLEAR-PLATE, BLACK, 96 well | Greiner Bio-One | 655090 | |
35 mm glass bottom dishes | MatTek corp. | P35G-1.5-10-C | |
Probenecid | Sigma | P8761 | |
β-lactamase | Sigma | P0389 |