We beschrijven een werkwijze voor het volgen van de endomembraan scheuren opgewekt door de intracellulaire bacteriën<em> Shigella flexneri<em></em</em> En<em<em><em> Mycobacterium tuberculosis</em></em</em> Upon gastheercel invasie. Onze assay maakt gebruik van CCF4, een gastheer cytoplasmatische FRET sonde in levende of vaste cellen. Deze reporter wordt afgebroken door een enzymactiviteit aanwezig op het bacteriële oppervlak.
Shigella flexneri zijn pathogene bacteriën die gastheercellen aangaan van een endocytische vacuole binnenvallen. Vervolgens, de breuk van het membraan-omsloten ruimte laat bacteriën om binnen het cytosol, prolifereren en verdere naburig cellen. Mycobacterium tuberculosis wordt gefagocyteerd door immuuncellen, en is onlangs aangetoond breuk phagosomal membraan macrofagen. We ontwikkelden een stevige test voor het bijhouden phagosomal membraanverstoring na gastheercel binnenkomst van Shigella flexneri of Mycobacterium tuberculosis. De aanpak maakt gebruik van CCF4, een FRET reporter gevoelig β-lactamase dat evenwicht bereikt in het cytosol van gastheercellen. Bij invasie van gastheercellen door bacteriële pathogenen, de probe intact blijft zolang de bacteriën bevinden in membraan-omsloten compartimenten. Na onderbreking van de vacuole, β-lactamase activiteit op het oppervlak van het intracellulaire pathogeen splitst CCF4 direct leidenING een verlies van FRET signaal en schakelen haar emissiespectrum. Deze robuuste ratiometric assay levert nauwkeurige informatie over de timing in vacuolen breuk veroorzaakt door binnendringende bacteriën, en het kan worden gekoppeld met automatische microscopie en beeldverwerking door gespecialiseerde algoritmen voor de detectie van de emissiesignalen van de FRET donor en acceptor. Verder staat het onderzoeken van de dynamica in vacuolen onderbreking opgewekt door intracellulaire bacteriën in real time in enkele cellen. Ten slotte is het uitermate geschikt voor high-throughput analyse met een ruimtelijke resolutie dan eerdere methodes. Hier bieden wij de experimentele gegevens van voorbeeldige protocollen voor de CCF4 vacuole breuk assay op HeLa-cellen en THP-1 macrofagen voor time-lapse experimenten of eindpunten experimenten met Shigella flexneri evenals meerdere mycobacteriële stammen zoals Mycobacterium marinum, Mycobacterium bovis, en Mycobacterium tuberculosis.
Tal van bacteriële pathogenen worden geïnternaliseerd in de membraan-ingesloten compartimenten van eukaryote cellen tijdens hun verloop van de infectie. Celinvoer wordt hetzij via fagocytose door gespecialiseerde gastheercellen, zoals het geval is voor Mycobacterium tuberculosis die worden opgenomen door macrofagen, of pathogenen actief hun opname induceren in het algemeen niet-fagocytische cellen. Bij geïnduceerde opname, bijvoorbeeld Shigella flexneri, het pathogeen injecteert effector eiwitten in de gastheer cytosol dat kapen onder andere celfuncties het strikt gereguleerde endomembraan sortering machines resulteert in bacteriële binding met een endosomale compartiment 1,2. Vervolgens, Shigella verstoort de omsluitende membraan leidt tot vacuole scheuren en cytosole toegang van het pathogeen bemoeien met gastheer membraan mensenhandel en het vermijden van levering aan het lysosoom. Meer recent heeft phagolysosomal breuk ook gevonden als infectie strategie gebruikt door Mycobacterium tuberculosis, een pathogeen die is dacht lange tijd uitsluitend gelokaliseerd in een membraangebonden compartimenten 3,17.
Om dynamische subcellulaire membraantransport van invasieve pathogenen te onderzoeken, hebben grote verbeteringen bereikt, aangezien de transmissie elektronenmicroscopie (TEM) studies op basis van de late jaren 1980 4,5. Bijvoorbeeld, fluorescentie microscopie gebaseerde methoden met behulp van kleurstoffen, antilichamen tegen bacteriële oppervlakte-onderdelen, of markers voor co-localisatie met subcellulaire compartimenten overnam 6,7. Echter, ze nog steeds niet toegeven precieze tijd-ruimtelijke resolutie en de robuustheid te vacuolaire breuk kwantitatief te meten door bacteriële pathogenen.
Deze hindernis is aangepakt met een test gebaseerd op de verkregen cefalosporine CCF4-AM FRET reporter die werd gebruikt om genexpressie te bestuderen 8. Vervolgens werd in het kader van infeel biologie tot effector secretie onderzoeken en om de opname van Neisseria volgen in gastheercellen 9,10,11. We ontwikkelden een test te maken van deze reporter voor het bestuderen vacuole breuk veroorzaakt door Shigella flexneri 12 en Mycobacterium tuberculosis 17. Het principe van onze werkwijze is beschreven in figuur 1 met Shigella flexneri. Eerst worden gastheercellen geladen met de FRET CCF4-AM substraat dat wordt gevangen in het cytoplasma na het afsplitsen van de AM esterresten. Vervolgens worden cellen geïnfecteerd met Shigella flexneri. β-lactamase op het oppervlak van de bacteriën kan splitsen de CCF4 substraat zodra vacuolaire breuk optreedt. Dit leidt tot een verlies aan FRET signaalschakeling de emissie piek van 535 nm tot 450 nm na excitatie van de probe bij 405 nm. De ratiometrische meting van de 450/535 nm intensiteiten belicht vacuole integriteit: lage ratio's weerspiegelen membraan-engesloten of extracellulaire bacteriën terwijl hoge verhoudingen weerspiegelen contact tussen bacteriën en de gastheer cytosol. Wij rapporteren tevens een aanpassing van deze methode voor het bestuderen phagosomal breuk veroorzaakt door Mycobacterium tuberculosis in THP-1 macrofagen. De experimentele principes blijven hetzelfde maar de volgorde omgekeerd, CCF4-AM belasting wordt aangebracht na bacteriële infectie.
Dus door kwantitatieve ratiometric fluorescentiemetingen op enkele cel niveau, de vacuolaire breuk van Shigella flexneri kan worden gevolgd in real time en vaste monsters afkomstig van verschillende celtypen 12,13,14. Bovendien kan deze methode worden aangepast om een aantal andere invasieve pathogenen in deze studie met Mycobacterium bovis en Mycobacterium tuberculosis. Ten slotte is de miniaturisering van ons protocol tot 96 goed (of 384 goed) formaat maakt screening van tal van omstandigheden bij hoge doorvoer.
De CCF4-AM/β-lactamase assay is een eenvoudige methode om vacuole verstoring veroorzaakt door intracellulaire Shigella flexneri en mycobacteriën in verschillende celtypen volgen. Het maakt gebruik van een cytoplasmatisch lactamase gevoelige FRET reporter die wordt gekliefd door een enzym actief op het oppervlak van de bacteriën.
Verlies van de CCF4-AM substraat gemakkelijk worden vermeden door toevoeging probenecid alle oplossingen na het laden van het substraat. Zoals aangetoond, kan de test worden aangepast aan meerdere celtypen (epitheelcellen, fagocytcellen) en formaten (96 goed, 35 mm glazen bodem gerechten, 6/12/24 putjes). Voor het gebruik van de 6/12/24 putjesplaat worden steriele dekglaasjes verdeeld onderaan elk putje voor het zaaien van de cellen. Aan het einde van het experiment worden dekglaasjes overgebracht objectglaasjes in fixeermiddel zoals verlengt Gold Antifade Reagent (Invitrogen). Zo het signaal stabiel langere perioden na de assayvergeleken met de 96 wells formaat waar monsters worden bewaard in PBS na fixatie. De hoge kosten van de CCF4-AM substraten dienen voor de bepaling van het monstervolume in aanmerking genomen. Daarom raden wij schaalvergroting ze naar beneden. Experimenten zijn duurder in 6/12/24 goed formaat, maar de signalen zijn stabiel gedurende dagen. Integendeel, experimenten goedkoper in de 96 putjes, maar monsters worden geanalyseerd op de dag van het experiment. Het is opmerkelijk dat live-experimenten ook bij de 96 goed of 384 goed formaat kan worden uitgevoerd. Dit maakt het uitvoeren levend experiment met tientallen condities tegelijkertijd (mutante bacteriën, MOI, plasmide of siRNA transfectie, chemicaliën etc.) met aantal posities per putje. Hoewel geschikt voor Shigella flexneri, we benadrukken dat "echte" real time of time-lapse experimenten zijn niet haalbaar voor mycobacteriën studies sinds de infectie cyclus overschrijdt meetbare concentraties van CCF4 die in het cytosol kan worden vastgehouden. VoorDaarom wordt het CCF4-AM substraat aangebracht op cellen na invasie bereikt.
In het geval MetaMorph software wordt gebruikt voor het verzamelen en analyseren, adviseren wij het gebruik van de module "scherm overname" die het mogelijk maakt het verwerven van een volledige 96/384 wells plaat met een gespecificeerde aantal beelden per put. Verder is de module "review screen data" maakt (i) het visualiseren van de gestikte beeld mozaïek van elk goed voor elk kanaal op hetzelfde moment op een grote "poster" en (ii) een lus een gespecialiseerde algoritme voor het meten van de intensiteiten in de 535 en de 450 nm kanalen. Ook al hebben we in staat om vacuole scheuren te meten door enkele bacteriën met behulp van time-lapse microscopie geweest, zouden we graag waarschuwen dat de enzymatische activiteit op het oppervlak van de individuele bacteriën varieert waardoor het moeilijk om precies aantal intracellulaire bacteriën en de effectiviteit van de vacuole correleren breuk.
Gezien de robuustheid van de test, is het geschikt voor hoge throughput benadert in 96 of 384 goed formats. We hebben ook met succes aangepast dit protocol voor FACS-analyse om de infectie van cellen te bestuderen in suspensie 16. De test kan ook worden gebruikt voor de behandeling van andere bacteriën of dragers lactamase presenteren op hun oppervlak, waardoor een breed scala van toepassingen. Bijvoorbeeld kan deze benadering worden gebruikt om vacuole scheuren veroorzaakt door andere pathogenen zoals β-lactamase tot expressie Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes of Salmonella typhimurium 12 bestuderen. Sinds Listeria monocytogenes heeft een korte infectiecyclus vergelijkbaar met Shigella flexneri, time-lapse experimenten mogelijk zijn. In tegenstelling, omdat Legionella pneumophila en Salmonella typhimurium beeldscherm lang infectie cycli, raden wij u aan het eindpunt experimenten uit te voeren.
De verscheidenheid aan mogelijke toepassingen maakt het CCF4-AM/β-lactamase assay eeninteressant fluorimetrische wijze van volgen vacuole breuk veroorzaakt door intracellulaire pathogenen in vaste monsters of in real time.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gefinancierd door het Agence Nationale pour la Recherche en door de European Research Council.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
LiveBlazer FRET-B/G Loading Kit (CCF4-AM) | Invitrogen | K1089 | Protect from light, stock in – 80 ° aliquots |
Draq5 | Biostatus | DR50050 | |
Poly-L-lysine | Sigma | P9155 | |
μCLEAR-PLATE, BLACK, 96 well | Greiner Bio-One | 655090 | |
35 mm glass bottom dishes | MatTek corp. | P35G-1.5-10-C | |
Probenecid | Sigma | P8761 | |
β-lactamase | Sigma | P0389 |