Nous décrivons une méthode pour le suivi de la rupture endomembranaire provoquée par les bactéries intracellulaires<em> Shigella flexneri<em></em</em> Et<em<em><em> Mycobacterium tuberculosis</em></em</em> De l'invasion de la cellule hôte. Notre analyse fait usage de CCF4, une foule cytoplasmique FRET sonde dans des cellules vivantes ou fixe. Ce rapporteur est dégradée par une activité enzymatique présente sur la surface bactérienne.
Shigella flexneri sont des bactéries pathogènes qui envahissent les cellules hôtes qui entrent dans une vacuole d'endocytose. Par la suite, la rupture de ce compartiment membrane-clos permet aux bactéries de se déplacer dans le cytosol, proliférer et envahir davantage les cellules voisines. Mycobacterium tuberculosis est phagocyté par les cellules immunitaires, et a récemment été démontré que la rupture membrane du phagosome dans les macrophages. Nous avons développé un test robuste pour le suivi de rupture de la membrane du phagosome après l'entrée de la cellule hôte de Shigella flexneri ou Mycobacterium tuberculosis. L'approche fait usage de CCF4, un journaliste FRET sensibles aux β-lactamase qui s'équilibre dans le cytosol des cellules hôtes. Lors de l'invasion de cellules hôtes par les bactéries pathogènes, la sonde reste intact aussi longtemps que les bactéries se trouvent dans les compartiments de la membrane à l'état libre. Après interruption de l'activité vacuole, β-lactamase à la surface des clive pathogène intracellulaire CCF4 entraîner instantanémentrelative à une perte de signal de commutation FRET et son spectre d'émission. Ce test quotientométrique robuste donne des informations précises sur le moment de la rupture vacuolaire induite par les bactéries envahissantes, et il peut être couplé à la microscopie automatisée et traitement de l'image par des algorithmes spécialisés pour la détection des signaux d'émission du FRET donneur et accepteur. En outre, il permet l'étude des dynamiques de perturbation vacuolar provoquée par des bactéries intracellulaires en temps réel dans des cellules individuelles. Enfin, il est parfaitement adapté à l'analyse à haut débit avec une résolution spatio-temporelle dépassant les méthodes précédentes. Ici, nous fournissons les détails expérimentaux de protocoles exemplaires pour le test de rupture CCF4 vacuole des cellules HeLa et THP-1 macrophages pour des expériences time-lapse ou des points d'expériences finaux utilisant Shigella flexneri ainsi que de multiples souches mycobactériennes telles que Mycobacterium marinum, Mycobacterium bovis, et Mycobacterium tuberculosis.
De nombreux agents pathogènes bactériens sont internalisés dans les compartiments membraneux des cellules eucaryotes au cours de leur évolution de l'infection. entrée cellulaire se produit soit par phagocytose par les cellules hôtes spécialisées, comme c'est le cas pour Mycobacterium tuberculosis qui sont ingérés par les macrophages ou les agents pathogènes induisent activement leur absorption dans les cellules généralement non-phagocytaires. Dans le cas de l'absorption induite, par exemple pour Shigella flexneri, l'agent pathogène injecte des protéines effectrices dans le cytosol hôte que détourner parmi d'autres fonctions cellulaires de la machines de tri endomembranaire étroitement régulée résultant de la localisation bactérienne dans un 1,2 compartiment endosomal. Par la suite, Shigella perturbe la membrane enfermant conduisant à une rupture vacuolaire et l'accès cytosolique de l'agent pathogène interférer avec le trafic membranaire d'accueil et d'éviter la livraison vers le lysosome. Plus récemment, la rupture phagolysosomique a également été constaté que str infectionatégie utilisé par Mycobacterium tuberculosis, un agent pathogène que l'on croyait depuis longtemps d'être localisée exclusivement dans un compartiment membranaire 3,17.
Pour étudier la dynamique du trafic membranaire subcellulaire des agents pathogènes envahissants, de grands progrès ont été accomplis depuis la microscopie électronique en transmission (TEM) sur la base des études de la fin des années 1980 4,5. Par exemple, les méthodes à base de microscopie par fluorescence utilisant des colorants, des anticorps contre les composants de surface des bactéries ou des marqueurs de co-localisation avec des compartiments sous-cellulaires ont repris 6,7. Cependant, ils n'ont toujours pas donné la résolution et la robustesse de mesurer rupture vacuolar par des pathogènes bactériens quantitative spatio-temporel précis.
Cet obstacle a été traitée avec un dosage basé sur le journaliste dérivé CCF4-AM FRET céphalosporines qui a été d'abord utilisé pour étudier l'expression des gènes 8. Ensuite, il a été utilisé dans le contexte de infbiologie ection d'enquêter sécrétion effecteur et de suivre l'adoption de Neisseria dans des cellules hôtes 9,10,11. Nous avons développé un test en profitant de ce journaliste pour l'étude de la rupture vacuolaire induite par Shigella flexneri 12 et Mycobacterium tuberculosis 17. Le principe de notre méthode est décrite dans la figure 1 à l'aide Shigella flexneri. Tout d'abord, les cellules hôtes sont chargés avec le substrat CCF4-AM FRET qui est piégée à l'intérieur du cytoplasme après on élimine les groupements de type ester AM. Ensuite, les cellules sont infectées par Shigella flexneri. β-lactamase présente sur la surface de la bactérie est capable de cliver le substrat dès que la rupture se produit CCF4 vacuolaire. Cela conduit à une perte de signal de FRET de commutation du pic d'émission de 535 nm à 450 nm lors de l'excitation de la sonde à 405 nm. La mesure de quotient des intensités 450/535 nm met en évidence l'intégrité vacuolar: faibles ratios reflètent membrane-enbactéries fermés ou extracellulaire, alors que des ratios élevés reflètent contact entre les bactéries et le cytosol hôte. Nous présentons également une adaptation de cette méthode pour l'étude de rupture du phagosome induite par Mycobacterium tuberculosis dans les macrophages THP-1. Les principes expérimentaux restent les mêmes, mais la séquence est inversée, CCF4-AM chargement est appliqué seulement après l'infection bactérienne.
Ainsi, par des mesures de fluorescence ratiométriques quantitatives au niveau de la cellule unique, la rupture vacuolaire de Shigella flexneri peut être suivi en temps réel et dans des échantillons fixes de différents types de cellules 12,13,14. En outre, cette méthode peut être adaptée à un certain nombre d'autres agents pathogènes envahissants comme le montre cette étude en utilisant Mycobacterium bovis et Mycobacterium tuberculosis. Enfin, la miniaturisation de notre protocole de 96 puits (ou 384 puits) formats permet le criblage de nombreuses conditions à haut débit.
Le test CCF4-AM/β-lactamase est une méthode simple pour suivre les perturbations vacuolaire induite par Shigella flexneri intracellulaire et les mycobactéries dans différents types cellulaires. On fait usage d'une lactamase sensible cytoplasmique reporter FRET qui est clivé par une enzyme active à la surface de la bactérie.
Perte du substrat CCF4-AM peut facilement être évité en ajoutant probénécide à toutes les solutions après le chargement du substrat. Comme l'a démontré, le dosage peut être adapté à plusieurs types de cellules (cellules épithéliales, les cellules phagocytaires) et des formats (96 puits, 35 mm plats à fond de verre, plaques 6/12/24 puits). Pour l'utilisation de la plaque de puits 12/06/24, lamelles stériles sont distribués au fond de chaque puits avant l'ensemencement des cellules. A la fin de l'expérience, les lamelles sont transférées sur des lames en milieu de montage, comme Prolongez réactif Antifade Gold (Invitrogen). Le signal de cette façon est stable pour des périodes de temps plus longues après le testpar rapport au format 96 puits où les échantillons sont conservés dans du PBS après fixation. Le coût élevé du substrat CCF4-AM doit être pris en compte avant de déterminer le volume de l'échantillon. C'est pourquoi nous vous recommandons de les réduisant. Les expériences sont plus chers en 6/12/24 format bien mais les signaux sont stables pendant des jours. Au contraire, les expériences sont moins chers dans le format 96 puits, mais les échantillons doivent être analysés le jour de l'expérience. Il est à noter que les expériences vivantes peuvent également être effectués au puits format 96 ou 384 puits. Ceci permet d'effectuer l'expérience en direct à l'aide des dizaines de conditions en même temps (bactéries mutantes, IAM, la transfection du plasmide ou siRNA, les produits chimiques, etc) avec les nombres de positions par puits. Bien adapté à Shigella flexneri, nous soulignons que le temps «vrai» réel ou expériences time-lapse sont pas réalisables pour des études mycobactéries depuis le cycle d'infection dépasse concentrations mesurables de CCF4 qui peuvent être retenus dans le cytosol. PourC'est pourquoi, le substrat CCF4-AM est appliquée sur les cellules seulement après l'invasion est atteint.
Dans le cas où le logiciel MetaMorph est utilisé pour l'acquisition et l'analyse, nous recommandons d'utiliser le module "acquisition de l'écran» qui permet l'acquisition de l'ensemble d'une plaque et 96/384 avec un certain nombre de photos par puits. En outre, les «données d'écran d'examen" module permet (i) la visualisation de l'image mosaïque cousu de chaque bien pour n'importe quel canal en même temps sur un grand "poster" et (ii) en boucle un algorithme spécialisé pour mesurer les intensités dans le 535 et les canaux à 450 nm. Même si, nous avons pu mesurer rupture vacuolar par des bactéries simples en utilisant la microscopie time-lapse, nous tenons à mettre en garde que l'activité enzymatique à la surface des bactéries individuelles varie rend difficile de corréler précisément nombre de bactéries et l'efficacité des vacuoles intracellulaires rupture.
Compte tenu de la robustesse de l'analyse, il est adapté pour hdébit d'aute approches dans 96 ou 384 formats ainsi. Nous avons également réussi à adapter ce protocole pour l'analyse FACS pour étudier l'infection de cellules en suspension 16. Le test peut également être utilisé pour l'étude d'autres bactéries ou des supports présentant lactamase à leur surface, ce qui conduit à un large éventail d'applications. Par exemple, cette approche peut être utilisée pour étudier la rupture vacuolaire induite par d'autres agents pathogènes tels que les β-lactamase exprimer Legionella pneumophila, la bactérie Listeria monocytogenes ou Salmonella typhimurium 12. Depuis Listeria monocytogenes a un cycle d'infection court comparable à Shigella flexneri, des expériences time-lapse sont possibles. En revanche, parce que Legionella pneumophila et Salmonella typhimurium affichage cycles d'infection longs, nous vous suggérons de réaliser des expériences sur le point final.
La variété des applications possibles rend le dosage CCF4-AM/β-lactamase uneméthode fluorimétrique intéressant pour le suivi rupture vacuolaire induite par des agents pathogènes intracellulaires dans des échantillons fixes ou en temps réel.
The authors have nothing to disclose.
Ce travail a été financé par l'Agence Nationale pour la Recherche et par le Conseil européen de la recherche.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
LiveBlazer FRET-B/G Loading Kit (CCF4-AM) | Invitrogen | K1089 | Protect from light, stock in – 80 ° aliquots |
Draq5 | Biostatus | DR50050 | |
Poly-L-lysine | Sigma | P9155 | |
μCLEAR-PLATE, BLACK, 96 well | Greiner Bio-One | 655090 | |
35 mm glass bottom dishes | MatTek corp. | P35G-1.5-10-C | |
Probenecid | Sigma | P8761 | |
β-lactamase | Sigma | P0389 |