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박테리아의 RIBO-seq: NGS 시퀀싱을 위한 샘플 수집 및 라이브러리 준비 프로토콜
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JoVE 신문 생화학
RIBO-seq in Bacteria: a Sample Collection and Library Preparation Protocol for NGS Sequencing
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박테리아의 RIBO-seq: NGS 시퀀싱을 위한 샘플 수집 및 라이브러리 준비 프로토콜

DOI:
10.3791/62544-v

•

12:05 min

•

August 07, 2021

•

, , , ,
1Laboratory of Gene Expression, ECOTECH-Complex,Maria Curie-Sklodowska University, 2Department of Molecular Biology, Institute of Biological Sciences,Maria Curie-Sklodowska University, 3Faculty of Information Technology,Polish-Japanese Academy of Information Technology

Chapters

  • 00:00Introduciton
  • 00:54Cell Harvesting and Lysis
  • 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
  • 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
  • 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
  • 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
  • 11:31Conclusion

Summary

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여기에서 우리는 박테리아에 있는 RIBO-seq를 위한 견본 수집 및 준비의 단계를 기술합니다. 이러한 지침에 따라 준비된 라이브러리의 시퀀싱은 포괄적인 생물정보 분석을 위한 충분한 데이터를 생성합니다. 우리가 제시하는 프로토콜은 간단하고 표준 실험실 장비를 사용하며 리시스에서 라이브러리 획득까지 7 일이 걸립니다.

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RIBO-seqRibosome ProfilingProtein SynthesisTranslationRNA SequencingBacterial CultureSample CollectionLibrary PreparationNGS Sequencing

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