Journal
/
유전학
/
Mass Spectrometry-baserad proteomik analyser med hjälp av databasen OpenProt att avslöja nya proteiner översatt från icke-kanoniska öppen läsning ramar
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Mass Spectrometry-baserad proteomik analyser med hjälp av databasen OpenProt att avslöja nya proteiner översatt från icke-kanoniska öppen läsning ramar

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min

•

April 11, 2019

•

,
1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

OpenProt är en fritt tillgänglig databas som verkställer en polycistronic modell av eukaryota genom. Här presenterar vi ett protokoll för användning av OpenProt databaser när förhör masspektrometri datamängder. Använda OpenProt möjliggör databas för analys av proteomiska experiment upptäckten av romanen och tidigare omätbara proteiner.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsOpenProt DatabaseNon-canonical Open Reading FramesNovel ProteinsProteomeProteomic AnalysesDatabase HandlingMS Convert ToolMzML File Format

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

subtypning av<em> Campylobacter jejuni</em> Ssp.<em> doylei</em> Isolat genom masspektrometri-baserade PhyloProteomics (MSPP)

Nya RNA-bindande proteiner Isolering av den snabba Methodology

Konjugativ Parning Analyser för sekvensspecifik analys av Transfer proteiner involverade i konjugation

Från en naturlig produkt till dess biosyntes Gene Cluster: En demonstration Använda Polyketomycin från<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028

Bestämning av optimala kromosomala belägenheten för ett DNA-Element i Escherichia coli använder en ny metod för Transposon-medierad

Anpassning av hybridisering fånga av kromatin-associerade proteiner för proteomik för att däggdjursceller

Använda mus oocyter att bedöma mänskliga geners funktion under meios jag

En snabb och kvantitativ metod för posttranslationella modifieringen och Variant aktiverad mappning av peptider till genomen

Utforska den effekter av rymdfarkosten på mus fysiologi med hjälp av Open Access NASA GeneLab plattformen

Använda i Vitro och i cell form att undersöka småmolekylära inducerad Pre-mRNA strukturella förändringar

Read Article