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Espectrometria de massa-baseado Proteomics análises usando banco de dados OpenProt para desvendar novas proteínas traduzidas de Frames de leitura abertos não-canônicos
Chapters
- 00:04Title
- 00:52OpenProt Database Download
- 01:53Database Handling
- 02:41Mass Spectrometry File Preparation
- 03:13Protein Quantification
- 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
- 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
- 06:40Conclusion
OpenProt é um banco de dados livremente acessível que impõe um modelo policistrônico de genomas eucarióticos. Aqui, apresentamos um protocolo para o uso de bancos de dados OpenProt quando interrogando datasets de espectrometria de massa. Usando o OpenProt banco de dados para análise de experimentos de proteomic permite a descoberta do romance e proteínas anteriormente indetectáveis.
