Journal
/
유전학
/
ניתוחים פרוטאומיקס מבוססי ספקטרומטר מסה משימוש במסד הנתונים OpenProt לחשוף את הרומן חלבונים מתורגם ממסגרות קאנונית קריאה פתוחה
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ניתוחים פרוטאומיקס מבוססי ספקטרומטר מסה משימוש במסד הנתונים OpenProt לחשוף את הרומן חלבונים מתורגם ממסגרות קאנונית קריאה פתוחה

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min

•

April 11, 2019

•

,
1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

OpenProt הוא מסד נתונים ונגיש באופן חופשי אוכף דגם polycistronic של הגנום האיקריוטים. כאן, אנו מציגים פרוטוקול לשימוש של מסדי נתונים OpenProt כשחוקרים datasets ספקטרומטר מסה. שימוש OpenProt מסד נתונים לניתוח של ניסויים פרוטיאומיה מבנית מאפשרת גילוי של הרומן וחלבונים בעבר לגילוי.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsOpenProt DatabaseNon-canonical Open Reading FramesNovel ProteinsProteomeProteomic AnalysesDatabase HandlingMS Convert ToolMzML File Format

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

תת-סוגים של<em> Jejuni קמפילובקטר</em> SSP.<em> doylei</em> המבודד באמצעות ספקטרומטריית מסה מבוססת PhyloProteomics (MSPP)

RNA מחייב רומן בידוד חלבונים לפי שיטת RAPID

מבחני מזווג Conjugative עבור ניתוח רצף ספציפי של חלבוני העברה מעורבים קוניוגציה

ממוצר טבעי כדי המצרר שלו biosynthetic ג'ין: הפגנה שימוש Polyketomycin מ<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028

קביעת Location(s) כרומוזומלית האופטימלית עבור רכיב ה-DNA ב- Escherichia coli באמצעות גישה מוזרה בתיווך Transposon

עיבוד של הכלאה צלמו של חלבונים הקשורים כרומטין פרוטאומיקס בתרבית של תאים

באמצעות העכבר Oocytes כדי להעריך תפקוד הגן האנושי במהלך המיוזה אני

שיטה כמותית ומהירה השינוי Post-translational וגרסא מופעלת מיפוי של פפטידים כדי הגנום

לחקור את ההשפעות של שיגור לחלל על הפיזיולוגיה של העכבר באמצעות הפלטפורמה הפתוחה של GeneLab נאס א גישה

שימוש בחוץ גופית וצורה בתא לחקור מולקולה קטנה המושרה שינויים מבניים Pre-mRNA

Read Article